post-assemble~dotplot-by-minimap2

compare large genomes by dot plot using minimap2

input_1:FASTA (x axis)

input_1/final.fasta

>ls1
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN

input_2:FASTA (y axis)

input_2/final.fasta

>ls1
ACACATCCAGCGCCCCTTTAAATGCCGATGGTGCGTTCAATGGTGGAGCGACTGCGCGCATGCATCTGATTGAATAAAACTCCTGTGGAGTCTGAGGGTTGGTCAGTGGTGTCAACAACCAGGGAGCCAGGGCATATCCTCGATCCCCTAATAAAATAAATCAAGATAAAATCAAATAAAAAGACAGTTTTGGCATGGTTTCCAATTTGGTTGATTAATGTTAAGTCATTGGCACATTTACGTAATTTTAAAATTCTCCGTAAATCACCAAAAATAGGAAATAAACAAATAAATAAATAAATATGACAGAATTATCATTGTAATATTGAATTTTATTGAACTGCACAAGAGAAGAAAACCCAACCATGCCAACATGTCGGCACTGAAATGTGCGCAAGAGTACTCCTGAGTGTTCGTAGGATTTGTTCTTACCTACGCATAAATCCAGGATAAGAAGAAATTGGTGAATGCCACAATCTTCAAAAAATGTTCGTAAGTGGGACTTAAGAACAAATTTGTTCGTAAGAACGTTTCGTGAATCTGGCCCAATAATGTTCCTTGGTCAAAGAGTTGCTGCAGAAGAGGAGGAGTTTACGCAAATTGGGATCTTGTTCGCGAGGGATTGGGGAAAAAAAGGTTTCGGGAGATTGACATTATAAGCAGTGCCTGCAGTACTGCGGATCATCAACACCGTTAAGCCAGTGCAATAGCAACATATATGAGTAATTCTACACAGAAAGTGTATTGAAGTCTGTAGCACCAGGCTAAATTTCAGTAAAAATAAATGCTAACATAAGCATGCAGTTTGTAGGAGGCTAAGCACCTATATCCAGATCAATTTCCTAGCAGCAAGTGAGACATATAATAATACCATTAAAAAAGGCAGCATTAGCAGTGATAATAATCAAACTGATTTGGGTTAAATAGTCTTGTGCTATTACGCCTCTTGGAGCAGAACCTTGTTTTCATAAATACTCAGGTGTGTACCTAACCACTATTTGATGGCAGTATTACAGTGAAATAAATGTTTTTGAGGTTCCATCAACGCAGTAAGATTTCCTTTGTGGTTCTTTCCAAGATGTGTGCTACCTCATCCTATGCTGGTGTGTCATCCACCATTATTCAAAGCAAAGGCAAGAGTATTCCAACCCGTTCTCTTGAGCGCACTCGCTCTTTGTGACTAATCCAATCCCCTGATTCCAATCCCAGGAGGAACGTGCCATGGTTACTGCAAAGTCACTCCAAAACACTTTAAATAACTTAGTATTGATGACAGGGGAACTGGAGTGCATACTCCATCTTGGTCTAAACAGGACAATTTGAACAATGACCCCAATTCTAGTCTGAAAATGAAGCTGTCTTCAGTATTGGCTGGTGTCAACATCCAGCTTGACTTTTGCTTTGATGCTTTGCATGAACAAAAGCAATACGGTTTGATTTTTGATGTTTCATTCCGACAAGTGCTGAGTGGATGAAAACATGAAGATTTGTTCATTCATCAATGTGTTACATACTGACAGCTAGGGAAAAATGTTAACAGTTTGTTATAACTCAGCAAATATCCTAAAATAATAAGATTATGACACTTGTCTGATGAATACTGATTGGCATTAGCAGCGGCCTGGCACCAGTCACGAACATATGCTAACAAGATACCTTAAAGTTTAACCAGATTTGCTATTTGGGTAGTCTCTGAATAGTTCTTAATGTGCTTAGGGTTCCAGAGTTCCTAACATTTGTGTTGTCAGACAAGCTTTAGCTCATACTTGTAGCGTACGATGGATTGTTTTATTCATGCAAATAATGTTCGTGGTTACAAGCCTGTATTAATCCAATCAGATTTATTACCTCCGCCAAGAAGGTTATGGGACTGCTGGTGTCTGTCTGTTGGCAAAATACAAACATTACGATCGGAATTTAATGAAATTTCCAGGAAATGTTGATAATAGGCCAAGAGATAGATGAGGGACTTTGACCTCTAAAACAACCTATGGTTTTATGTAGCCTGGCATTACCACAGTTATACACCTTATATACTCTACTACAGGTGTGTCCCAATATGTGGGGAACCATGCTTGCCGATGTCTGAGCTCTCCAGTTAAGTGATGGACATATCTGATACTGGATAAAATGCATCCCCCAACACACACACACACATTTTATACTGATTAGTGAATGTTTATAAAATATATTAGTGATGTAATGATATAAGACACATTGAAGACTTCTGACTTTTGATAATAGATCAGAAAAAATAGTTCGACTCACAGCATAAAACAACTCCATCCATGACTCTGTTCCATGAATTTCTGCAGAATCATGAGCTGCACATCACCACCGGTGCTCTTCTGGTTTGGGCGGAAGCACCAGAGGCCTCTCAGTGACATTATTTTTCTTGGCAGCAGCGTGTCCCAATATGAACAGATTTGCATCAAATGACAGTCAGGCTTTTTTTCTACGATTTCACTAAACTGGGTATTGACTGAGAATCCCAAAATAACTATTTTAGCATTTTTTTTCCAGTTAAAATCCTGCTTGTCACATCCGAGATTTGGCTGAACTTTTGCTCGATGATATGACACTTTGCGATCGATTTCTGTCACGTTATCATTTACGAATTTAGACATGCCAATGCTGAAAAATACTATTTGCATCCATACTTAAAAGATTGATTTGCATGTGGTGCAAACTAACCTGGCAAGTTAAATGTGACATTAACACATATAAAATACAACTCAATGATTACATCCAGCAATTACACTAAGCAAGAGGGAAAAAGAGACATTTCTGTAGACCAGAACGCACACAGAAGCACACGCATGTGAGTAGGCAGCTACATAAAGTCCCCAGTTAATATCAATCCTGTGCTCAAAAATAAGACCCTTCTTCAAATAATTTCTGTGCTGACAAGAAAATTCTTCCAAGAGAATCACACTGTTGTAACGATATTAGAGAGTATTTTTCTCCGTCTTGCAGGGGGTGTATTACATGTACA

Option

-c "8" -m "64"

Output

final.fasta-final.fasta.paf.png

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