[1] # (a,c,g,t)= (0.299, 0.201, 0.201, 0.299) # # Probabilities file for the intergenic region model # # k = 4 # The P_l's [P_ls] # l= 0 # Values A 0.324 C 0.176 G 0.176 T 0.324 # l= 1 # Values AA 0.118 AC 0.0512 AG 0.0559 AT 0.0985 CA 0.0622 CC 0.0331 CG 0.025 CT 0.0559 GA 0.0583 GC 0.0336 GG 0.0331 GT 0.0512 TA 0.0851 TC 0.0583 TG 0.0622 TT 0.118 # l= 2 # Values AAA 0.0433 AAC 0.0172 AAG 0.0198 AAT 0.0379 ACA 0.0171 ACC 0.00957 ACG 0.00743 ACT 0.0171 AGA 0.018 AGC 0.0103 AGG 0.0105 AGT 0.0171 ATA 0.0268 ATC 0.0158 ATG 0.0181 ATT 0.0379 CAA 0.022 CAC 0.0114 CAG 0.0108 CAT 0.0181 CCA 0.0121 CCC 0.00639 CCG 0.0041 CCT 0.0105 CGA 0.00855 CGC 0.00494 CGG 0.0041 CGT 0.00743 CTA 0.0139 CTC 0.0114 CTG 0.0108 CTT 0.0198 GAA 0.022 GAC 0.00908 GAG 0.0114 GAT 0.0158 GCA 0.0121 GCC 0.00621 GCG 0.00494 GCT 0.0103 GGA 0.0109 GGC 0.00621 GGG 0.00639 GGT 0.00957 GTA 0.0135 GTC 0.00908 GTG 0.0114 GTT 0.0173 TAA 0.031 TAC 0.0135 TAG 0.0139 TAT 0.0268 TCA 0.0209 TCC 0.0109 TCG 0.00855 TCT 0.018 TGA 0.0209 TGC 0.0121 TGG 0.0121 TGT 0.0171 TTA 0.031 TTC 0.022 TTG 0.0219 TTT 0.0433 # l= 3 # Values AAAA 0.0147 AAAC 0.00623 AAAG 0.00719 AAAT 0.0152 AACA 0.00582 AACC 0.00307 AACG 0.00261 AACT 0.00575 AAGA 0.00609 AAGC 0.00369 AAGG 0.00374 AAGT 0.00626 AATA 0.0111 AATC 0.00578 AATG 0.00729 AATT 0.0138 ACAA 0.00603 ACAC 0.0031 ACAG 0.00315 ACAT 0.00484 ACCA 0.00352 ACCC 0.00169 ACCG 0.00132 ACCT 0.00304 ACGA 0.00247 ACGC 0.00155 ACGG 0.0012 ACGT 0.0022 ACTA 0.0042 ACTC 0.00313 ACTG 0.00348 ACTT 0.00626 AGAA 0.00665 AGAC 0.00279 AGAG 0.00374 AGAT 0.0048 AGCA 0.00381 AGCC 0.0019 AGCG 0.00152 AGCT 0.00312 AGGA 0.00343 AGGC 0.00204 AGGG 0.00198 AGGT 0.00304 AGTA 0.00466 AGTC 0.00287 AGTG 0.0038 AGTT 0.00575 ATAA 0.00973 ATAC 0.00385 ATAG 0.00426 ATAT 0.00894 ATCA 0.00572 ATCC 0.00271 ATCG 0.00254 ATCT 0.0048 ATGA 0.00612 ATGC 0.00362 ATGG 0.00351 ATGT 0.00484 ATTA 0.00974 ATTC 0.00636 ATTG 0.00664 ATTT 0.0152 CAAA 0.00835 CAAC 0.00347 CAAG 0.00349 CAAT 0.00664 CACA 0.00381 CACC 0.00223 CACG 0.00153 CACT 0.0038 CAGA 0.00355 CAGC 0.002 CAGG 0.00173 CAGT 0.00348 CATA 0.00451 CATC 0.00313 CATG 0.00315 CATT 0.0073 CCAA 0.00431 CCAC 0.00243 CCAG 0.00185 CCAT 0.00351 CCCA 0.00222 CCCC 0.00154 CCCG 0.000661 CCCT 0.00198 CCGA 0.00145 CCGC 0.000844 CCGG 0.000608 CCGT 0.00121 CCTA 0.0025 CCTC 0.00251 CCTG 0.00173 CCTT 0.00374 CGAA 0.00321 CGAC 0.00132 CGAG 0.00148 CGAT 0.00254 CGCA 0.00172 CGCC 0.000991 CGCG 0.000713 CGCT 0.00152 CGGA 0.00134 CGGC 0.000779 CGGG 0.000661 CGGT 0.00132 CGTA 0.00189 CGTC 0.00139 CGTG 0.00153 CGTT 0.00261 CTAA 0.00492 CTAC 0.00257 CTAG 0.00216 CTAT 0.00426 CTCA 0.00374 CTCC 0.00247 CTCG 0.00148 CTCT 0.00374 CTGA 0.00359 CTGC 0.00218 CTGG 0.00184 CTGT 0.00315 CTTA 0.00486 CTTC 0.00425 CTTG 0.00349 CTTT 0.00719 GAAA 0.00839 GAAC 0.00301 GAAG 0.00425 GAAT 0.00636 GACA 0.00314 GACC 0.00167 GACG 0.00139 GACT 0.00287 GAGA 0.00389 GAGC 0.0019 GAGG 0.00251 GAGT 0.00313 GATA 0.00443 GATC 0.00244 GATG 0.00313 GATT 0.00578 GCAA 0.00415 GCAC 0.00215 GCAG 0.00218 GCAT 0.00362 GCCA 0.0024 GCCC 0.000999 GCCG 0.000779 GCCT 0.00204 GCGA 0.00155 GCGC 0.001 GCGG 0.000843 GCGT 0.00155 GCTA 0.00276 GCTC 0.00189 GCTG 0.002 GCTT 0.00369 GGAA 0.00424 GGAC 0.00148 GGAG 0.00247 GGAT 0.00271 GGCA 0.00227 GGCC 0.00106 GGCG 0.000992 GGCT 0.0019 GGGA 0.00216 GGGC 0.000999 GGGG 0.00154 GGGT 0.00169 GGTA 0.0026 GGTC 0.00168 GGTG 0.00223 GGTT 0.00307 GTAA 0.00492 GTAC 0.00216 GTAG 0.00257 GTAT 0.00385 GTCA 0.00349 GTCC 0.00148 GTCG 0.00132 GTCT 0.00279 GTGA 0.00369 GTGC 0.00215 GTGG 0.00243 GTGT 0.00311 GTTA 0.00454 GTTC 0.00301 GTTG 0.00347 GTTT 0.00623 TAAA 0.0118 TAAC 0.00454 TAAG 0.00486 TAAT 0.00974 TACA 0.00434 TACC 0.0026 TACG 0.00189 TACT 0.00466 TAGA 0.00444 TAGC 0.00276 TAGG 0.0025 TAGT 0.0042 TATA 0.00677 TATC 0.00443 TATG 0.00451 TATT 0.0111 TCAA 0.00746 TCAC 0.0037 TCAG 0.00359 TCAT 0.00612 TCCA 0.00396 TCCC 0.00216 TCCG 0.00134 TCCT 0.00343 TCGA 0.00308 TCGC 0.00155 TCGG 0.00145 TCGT 0.00247 TCTA 0.00444 TCTC 0.00389 TCTG 0.00355 TCTT 0.0061 TGAA 0.00791 TGAC 0.00349 TGAG 0.00374 TGAT 0.00573 TGCA 0.00431 TGCC 0.00227 TGCG 0.00172 TGCT 0.00381 TGGA 0.00396 TGGC 0.0024 TGGG 0.00222 TGGT 0.00352 TGTA 0.00434 TGTC 0.00314 TGTG 0.00381 TGTT 0.00582 TTAA 0.0114 TTAC 0.00492 TTAG 0.00492 TTAT 0.00973 TTCA 0.00791 TTCC 0.00424 TTCG 0.00321 TTCT 0.00665 TTGA 0.00746 TTGC 0.00415 TTGG 0.00431 TTGT 0.00603 TTTA 0.0118 TTTC 0.00839 TTTG 0.00835 TTTT 0.0147 # l= 4 # Values AAAAA 0.00467 AAAAC 0.00215 AAAAG 0.00248 AAAAT 0.00542 AAACA 0.00218 AAACC 0.00109 AAACG 0.00105 AAACT 0.00191 AAAGA 0.00216 AAAGC 0.00137 AAAGG 0.00136 AAAGT 0.0023 AAATA 0.00464 AAATC 0.00226 AAATG 0.00304 AAATT 0.00523 AACAA 0.00206 AACAC 0.00103 AACAG 0.00114 AACAT 0.0016 AACCA 0.00117 AACCC 0.000543 AACCG 0.000468 AACCT 0.000885 AACGA 0.000882 AACGC 0.00055 AACGG 0.000452 AACGT 0.00073 AACTA 0.0015 AACTC 0.00105 AACTG 0.00122 AACTT 0.00197 AAGAA 0.00228 AAGAC 0.000946 AAGAG 0.00126 AAGAT 0.00161 AAGCA 0.00137 AAGCC 0.000687 AAGCG 0.00057 AAGCT 0.00106 AAGGA 0.00122 AAGGC 0.000761 AAGGG 0.000686 AAGGT 0.00108 AAGTA 0.00178 AAGTC 0.00107 AAGTG 0.00145 AAGTT 0.00197 AATAA 0.00421 AATAC 0.00155 AATAG 0.00182 AATAT 0.00348 AATCA 0.00216 AATCC 0.000993 AATCG 0.00098 AATCT 0.00164 AATGA 0.0025 AATGC 0.00147 AATGG 0.00142 AATGT 0.00192 AATTA 0.00379 AATTC 0.00231 AATTG 0.00244 AATTT 0.00523 ACAAA 0.00241 ACAAC 0.000939 ACAAG 0.000956 ACAAT 0.00173 ACACA 0.00112 ACACC 0.000579 ACACG 0.000446 ACACT 0.000957 ACAGA 0.00108 ACAGC 0.000611 ACAGG 0.000507 ACAGT 0.00095 ACATA 0.00122 ACATC 0.00086 ACATG 0.000847 ACATT 0.00192 ACCAA 0.00129 ACCAC 0.000715 ACCAG 0.000548 ACCAT 0.000961 ACCCA 0.000638 ACCCC 0.000348 ACCCG 0.000205 ACCCT 0.0005 ACCGA 0.000467 ACCGC 0.000273 ACCGG 0.000204 ACCGT 0.000378 ACCTA 0.000731 ACCTC 0.000707 ACCTG 0.000522 ACCTT 0.00108 ACGAA 0.000952 ACGAC 0.000385 ACGAG 0.000445 ACGAT 0.000691 ACGCA 0.000546 ACGCC 0.000305 ACGCG 0.000238 ACGCT 0.00046 ACGGA 0.000401 ACGGC 0.000241 ACGGG 0.000185 ACGGT 0.000378 ACGTA 0.00056 ACGTC 0.000433 ACGTG 0.000479 ACGTT 0.00073 ACTAA 0.00155 ACTAC 0.000748 ACTAG 0.000677 ACTAT 0.00123 ACTCA 0.00111 ACTCC 0.000615 ACTCG 0.000454 ACTCT 0.000951 ACTGA 0.00122 ACTGC 0.000705 ACTGG 0.000612 ACTGT 0.00095 ACTTA 0.00156 ACTTC 0.00129 ACTTG 0.00111 ACTTT 0.0023 AGAAA 0.00255 AGAAC 0.000922 AGAAG 0.00134 AGAAT 0.00184 AGACA 0.001 AGACC 0.000503 AGACG 0.000467 AGACT 0.000814 AGAGA 0.00133 AGAGC 0.000616 AGAGG 0.000836 AGAGT 0.000951 AGATA 0.0014 AGATC 0.00074 AGATG 0.00102 AGATT 0.00164 AGCAA 0.00135 AGCAC 0.000663 AGCAG 0.000715 AGCAT 0.00108 AGCCA 0.000745 AGCCC 0.000321 AGCCG 0.000232 AGCCT 0.000597 AGCGA 0.000492 AGCGC 0.000298 AGCGG 0.000268 AGCGT 0.00046 AGCTA 0.000886 AGCTC 0.000566 AGCTG 0.00061 AGCTT 0.00106 AGGAA 0.00137 AGGAC 0.00048 AGGAG 0.000783 AGGAT 0.000797 AGGCA 0.000761 AGGCC 0.000337 AGGCG 0.000342 AGGCT 0.000597 AGGGA 0.00069 AGGGC 0.000326 AGGGG 0.000459 AGGGT 0.0005 AGGTA 0.000882 AGGTC 0.000555 AGGTG 0.000718 AGGTT 0.000885 AGTAA 0.00174 AGTAC 0.000742 AGTAG 0.00093 AGTAT 0.00125 AGTCA 0.00115 AGTCC 0.000466 AGTCG 0.000439 AGTCT 0.000814 AGTGA 0.00128 AGTGC 0.000722 AGTGG 0.000844 AGTGT 0.000957 AGTTA 0.00161 AGTTC 0.00101 AGTTG 0.00122 AGTTT 0.00191 ATAAA 0.00389 ATAAC 0.00136 ATAAG 0.00154 ATAAT 0.00295 ATACA 0.00129 ATACC 0.000717 ATACG 0.000598 ATACT 0.00125 ATAGA 0.0014 ATAGC 0.000837 ATAGG 0.000798 ATAGT 0.00123 ATATA 0.0025 ATATC 0.00143 ATATG 0.00153 ATATT 0.00348 ATCAA 0.0021 ATCAC 0.00102 ATCAG 0.00104 ATCAT 0.00157 ATCCA 0.00103 ATCCC 0.000497 ATCCG 0.000388 ATCCT 0.000797 ATCGA 0.000964 ATCGC 0.000457 ATCGG 0.00043 ATCGT 0.000691 ATCTA 0.0012 ATCTC 0.00101 ATCTG 0.000971 ATCTT 0.00161 ATGAA 0.00237 ATGAC 0.00107 ATGAG 0.00111 ATGAT 0.00157 ATGCA 0.00134 ATGCC 0.000663 ATGCG 0.000541 ATGCT 0.00108 ATGGA 0.00118 ATGGC 0.000724 ATGGG 0.000651 ATGGT 0.000961 ATGTA 0.00129 ATGTC 0.000892 ATGTG 0.00106 ATGTT 0.0016 ATTAA 0.00367 ATTAC 0.0015 ATTAG 0.00163 ATTAT 0.00295 ATTCA 0.00235 ATTCC 0.00117 ATTCG 0.001 ATTCT 0.00184 ATTGA 0.00226 ATTGC 0.00126 ATTGG 0.0014 ATTGT 0.00173 ATTTA 0.00409 ATTTC 0.00283 ATTTG 0.00282 ATTTT 0.00542 CAAAA 0.00288 CAAAC 0.00126 CAAAG 0.00139 CAAAT 0.00282 CAACA 0.00111 CAACC 0.000651 CAACG 0.000489 CAACT 0.00122 CAAGA 0.00107 CAAGC 0.00064 CAAGG 0.000663 CAAGT 0.00111 CAATA 0.00186 CAATC 0.00113 CAATG 0.00121 CAATT 0.00244 CACAA 0.00131 CACAC 0.000767 CACAG 0.000671 CACAT 0.00106 CACCA 0.000783 CACCC 0.000444 CACCG 0.000282 CACCT 0.000718 CACGA 0.000491 CACGC 0.00033 CACGG 0.000228 CACGT 0.000479 CACTA 0.000852 CACTC 0.000757 CACTG 0.000749 CACTT 0.00145 CAGAA 0.0013 CAGAC 0.000588 CAGAG 0.000694 CAGAT 0.000971 CAGCA 0.000721 CAGCC 0.000395 CAGCG 0.000273 CAGCT 0.00061 CAGGA 0.000561 CAGGC 0.000358 CAGGG 0.000293 CAGGT 0.000522 CAGTA 0.000899 CAGTC 0.000612 CAGTG 0.000749 CAGTT 0.00122 CATAA 0.00157 CATAC 0.000714 CATAG 0.000701 CATAT 0.00153 CATCA 0.00108 CATCC 0.000556 CATCG 0.000468 CATCT 0.00102 CATGA 0.00104 CATGC 0.000651 CATGG 0.000615 CATGT 0.000847 CATTA 0.00174 CATTC 0.0013 CATTG 0.00121 CATTT 0.00304 CCAAA 0.00153 CCAAC 0.000727 CCAAG 0.000656 CCAAT 0.0014 CCACA 0.000742 CCACC 0.000529 CCACG 0.000312 CCACT 0.000844 CCAGA 0.000604 CCAGC 0.000327 CCAGG 0.000302 CCAGT 0.000612 CCATA 0.000834 CCATC 0.000643 CCATG 0.000615 CCATT 0.00142 CCCAA 0.000747 CCCAC 0.000479 CCCAG 0.000339 CCCAT 0.000651 CCCCA 0.000437 CCCCC 0.000518 CCCCG 0.000122 CCCCT 0.000459 CCCGA 0.00025 CCCGC 0.000132 CCCGG 9.42e-05 CCCGT 0.000185 CCCTA 0.000438 CCCTC 0.000557 CCCTG 0.000293 CCCTT 0.000686 CCGAA 0.000544 CCGAC 0.000237 CCGAG 0.000235 CCGAT 0.00043 CCGCA 0.00028 CCGCC 0.000191 CCGCG 0.000105 CCGCT 0.000268 CCGGA 0.000201 CCGGC 0.00011 CCGGG 9.42e-05 CCGGT 0.000204 CCGTA 0.000298 CCGTC 0.000228 CCGTG 0.000228 CCGTT 0.000452 CCTAA 0.000836 CCTAC 0.000478 CCTAG 0.000385 CCTAT 0.000798 CCTCA 0.000744 CCTCC 0.000632 CCTCG 0.000295 CCTCT 0.000836 CCTGA 0.000573 CCTGC 0.000352 CCTGG 0.000302 CCTGT 0.000507 CCTTA 0.000877 CCTTC 0.000844 CCTTG 0.000663 CCTTT 0.00136 CGAAA 0.00118 CGAAC 0.00044 CGAAG 0.000587 CGAAT 0.001 CGACA 0.000428 CGACC 0.00026 CGACG 0.000197 CGACT 0.000439 CGAGA 0.000483 CGAGC 0.000243 CGAGG 0.000295 CGAGT 0.000454 CGATA 0.000688 CGATC 0.000404 CGATG 0.000468 CGATT 0.00098 CGCAA 0.000535 CGCAC 0.000362 CGCAG 0.00028 CGCAT 0.000541 CGCCA 0.000362 CGCCC 0.000168 CGCCG 0.000121 CGCCT 0.000342 CGCGA 0.000211 CGCGC 0.000159 CGCGG 0.000105 CGCGT 0.000238 CGCTA 0.000377 CGCTC 0.000299 CGCTG 0.000273 CGCTT 0.00057 CGGAA 0.000491 CGGAC 0.000192 CGGAG 0.000272 CGGAT 0.000388 CGGCA 0.000278 CGGCC 0.000149 CGGCG 0.000121 CGGCT 0.000232 CGGGA 0.000214 CGGGC 0.00012 CGGGG 0.000122 CGGGT 0.000205 CGGTA 0.000338 CGGTC 0.000234 CGGTG 0.000282 CGGTT 0.000468 CGTAA 0.000645 CGTAC 0.000311 CGTAG 0.000338 CGTAT 0.000598 CGTCA 0.000495 CGTCC 0.000234 CGTCG 0.000197 CGTCT 0.000467 CGTGA 0.000477 CGTGC 0.000293 CGTGG 0.000312 CGTGT 0.000446 CGTTA 0.000626 CGTTC 0.000451 CGTTG 0.000489 CGTTT 0.00105 CTAAA 0.00171 CTAAC 0.000808 CTAAG 0.000772 CTAAT 0.00163 CTACA 0.00075 CTACC 0.00055 CTACG 0.000338 CTACT 0.00093 CTAGA 0.000695 CTAGC 0.000407 CTAGG 0.000385 CTAGT 0.000677 CTATA 0.000954 CTATC 0.000786 CTATG 0.000701 CTATT 0.00182 CTCAA 0.00129 CTCAC 0.000698 CTCAG 0.000642 CTCAT 0.00111 CTCCA 0.000826 CTCCC 0.000586 CTCCG 0.000272 CTCCT 0.000783 CTCGA 0.000532 CTCGC 0.000264 CTCGG 0.000235 CTCGT 0.000445 CTCTA 0.000873 CTCTC 0.000909 CTCTG 0.000694 CTCTT 0.00126 CTGAA 0.00131 CTGAC 0.000602 CTGAG 0.000642 CTGAT 0.00104 CTGCA 0.000738 CTGCC 0.000451 CTGCG 0.00028 CTGCT 0.000715 CTGGA 0.000608 CTGGC 0.00035 CTGGG 0.000339 CTGGT 0.000548 CTGTA 0.00072 CTGTC 0.00062 CTGTG 0.000671 CTGTT 0.00114 CTTAA 0.00173 CTTAC 0.000814 CTTAG 0.000772 CTTAT 0.00154 CTTCA 0.00143 CTTCC 0.000883 CTTCG 0.000587 CTTCT 0.00134 CTTGA 0.00124 CTTGC 0.000643 CTTGG 0.000656 CTTGT 0.000956 CTTTA 0.00184 CTTTC 0.00148 CTTTG 0.00139 CTTTT 0.00248 GAAAA 0.00294 GAAAC 0.00113 GAAAG 0.00148 GAAAT 0.00283 GAACA 0.00107 GAACC 0.000479 GAACG 0.000451 GAACT 0.00101 GAAGA 0.00141 GAAGC 0.000701 GAAGG 0.000844 GAAGT 0.00129 GAATA 0.00186 GAATC 0.000887 GAATG 0.0013 GAATT 0.00231 GACAA 0.0011 GACAC 0.000526 GACAG 0.00062 GACAT 0.000892 GACCA 0.000626 GACCC 0.00026 GACCG 0.000234 GACCT 0.000555 GACGA 0.00047 GACGC 0.000264 GACGG 0.000228 GACGT 0.000433 GACTA 0.000721 GACTC 0.000468 GACTG 0.000612 GACTT 0.00107 GAGAA 0.00143 GAGAC 0.000538 GAGAG 0.000909 GAGAT 0.00101 GAGCA 0.000731 GAGCC 0.0003 GAGCG 0.000299 GAGCT 0.000566 GAGGA 0.000838 GAGGC 0.000406 GAGGG 0.000557 GAGGT 0.000707 GAGTA 0.000853 GAGTC 0.000468 GAGTG 0.000757 GAGTT 0.00105 GATAA 0.00161 GATAC 0.000608 GATAG 0.000786 GATAT 0.00143 GATCA 0.000918 GATCC 0.000375 GATCG 0.000404 GATCT 0.00074 GATGA 0.00108 GATGC 0.000546 GATGG 0.000643 GATGT 0.00086 GATTA 0.00151 GATTC 0.000887 GATTG 0.00113 GATTT 0.00226 GCAAA 0.00164 GCAAC 0.000616 GCAAG 0.000643 GCAAT 0.00126 GCACA 0.000763 GCACC 0.00037 GCACG 0.000293 GCACT 0.000722 GCAGA 0.000749 GCAGC 0.000378 GCAGG 0.000352 GCAGT 0.000705 GCATA 0.000957 GCATC 0.000546 GCATG 0.000651 GCATT 0.00147 GCCAA 0.000908 GCCAC 0.000417 GCCAG 0.00035 GCCAT 0.000724 GCCCA 0.000383 GCCCC 0.00017 GCCCG 0.00012 GCCCT 0.000326 GCCGA 0.000277 GCCGC 0.000151 GCCGG 0.00011 GCCGT 0.000241 GCCTA 0.000512 GCCTC 0.000406 GCCTG 0.000358 GCCTT 0.000761 GCGAA 0.000601 GCGAC 0.000227 GCGAG 0.000264 GCGAT 0.000457 GCGCA 0.000371 GCGCC 0.000171 GCGCG 0.000159 GCGCT 0.000298 GCGGA 0.000287 GCGGC 0.000151 GCGGG 0.000132 GCGGT 0.000273 GCGTA 0.000405 GCGTC 0.000264 GCGTG 0.00033 GCGTT 0.00055 GCTAA 0.00101 GCTAC 0.000509 GCTAG 0.000407 GCTAT 0.000837 GCTCA 0.000678 GCTCC 0.000359 GCTCG 0.000243 GCTCT 0.000616 GCTGA 0.000683 GCTGC 0.000378 GCTGG 0.000327 GCTGT 0.000611 GCTTA 0.000972 GCTTC 0.000701 GCTTG 0.00064 GCTTT 0.00137 GGAAA 0.00165 GGAAC 0.000537 GGAAG 0.000883 GGAAT 0.00117 GGACA 0.000563 GGACC 0.000214 GGACG 0.000234 GGACT 0.000466 GGAGA 0.000861 GGAGC 0.000359 GGAGG 0.000632 GGAGT 0.000615 GGATA 0.000783 GGATC 0.000375 GGATG 0.000556 GGATT 0.000993 GGCAA 0.000812 GGCAC 0.000341 GGCAG 0.000451 GGCAT 0.000663 GGCCA 0.000434 GGCCC 0.000139 GGCCG 0.000149 GGCCT 0.000337 GGCGA 0.000324 GGCGC 0.000171 GGCGG 0.000191 GGCGT 0.000305 GGCTA 0.000513 GGCTC 0.0003 GGCTG 0.000395 GGCTT 0.000687 GGGAA 0.000818 GGGAC 0.000259 GGGAG 0.000586 GGGAT 0.000497 GGGCA 0.00037 GGGCC 0.000139 GGGCG 0.000168 GGGCT 0.000321 GGGGA 0.0005 GGGGC 0.00017 GGGGG 0.000518 GGGGT 0.000348 GGGTA 0.000444 GGGTC 0.00026 GGGTG 0.000444 GGGTT 0.000543 GGTAA 0.000965 GGTAC 0.000369 GGTAG 0.00055 GGTAT 0.000717 GGTCA 0.000697 GGTCC 0.000214 GGTCG 0.00026 GGTCT 0.000503 GGTGA 0.00075 GGTGC 0.00037 GGTGG 0.000529 GGTGT 0.000579 GGTTA 0.000845 GGTTC 0.000479 GGTTG 0.000651 GGTTT 0.00109 GTAAA 0.00193 GTAAC 0.000672 GTAAG 0.000814 GTAAT 0.0015 GTACA 0.000736 GTACC 0.000369 GTACG 0.000311 GTACT 0.000742 GTAGA 0.000834 GTAGC 0.000509 GTAGG 0.000478 GTAGT 0.000748 GTATA 0.000974 GTATC 0.000608 GTATG 0.000714 GTATT 0.00155 GTCAA 0.00123 GTCAC 0.000586 GTCAG 0.000602 GTCAT 0.00107 GTCCA 0.000546 GTCCC 0.000259 GTCCG 0.000192 GTCCT 0.00048 GTCGA 0.000475 GTCGC 0.000227 GTCGG 0.000237 GTCGT 0.000385 GTCTA 0.000714 GTCTC 0.000538 GTCTG 0.000588 GTCTT 0.000946 GTGAA 0.00139 GTGAC 0.000586 GTGAG 0.000698 GTGAT 0.00102 GTGCA 0.000782 GTGCC 0.000341 GTGCG 0.000362 GTGCT 0.000663 GTGGA 0.000815 GTGGC 0.000417 GTGGG 0.000479 GTGGT 0.000715 GTGTA 0.000781 GTGTC 0.000526 GTGTG 0.000767 GTGTT 0.00103 GTTAA 0.00169 GTTAC 0.000672 GTTAG 0.000808 GTTAT 0.00136 GTTCA 0.00112 GTTCC 0.000537 GTTCG 0.00044 GTTCT 0.000922 GTTGA 0.00119 GTTGC 0.000616 GTTGG 0.000727 GTTGT 0.000939 GTTTA 0.00168 GTTTC 0.00113 GTTTG 0.00126 GTTTT 0.00215 TAAAA 0.00423 TAAAC 0.00168 TAAAG 0.00184 TAAAT 0.00409 TAACA 0.00146 TAACC 0.000845 TAACG 0.000626 TAACT 0.00161 TAAGA 0.00144 TAAGC 0.000972 TAAGG 0.000877 TAAGT 0.00156 TAATA 0.0027 TAATC 0.00151 TAATG 0.00174 TAATT 0.00379 TACAA 0.00155 TACAC 0.000781 TACAG 0.00072 TACAT 0.00129 TACCA 0.000939 TACCC 0.000444 TACCG 0.000338 TACCT 0.000882 TACGA 0.000629 TACGC 0.000405 TACGG 0.000298 TACGT 0.00056 TACTA 0.00113 TACTC 0.000853 TACTG 0.000899 TACTT 0.00178 TAGAA 0.00165 TAGAC 0.000714 TAGAG 0.000873 TAGAT 0.0012 TAGCA 0.000986 TAGCC 0.000513 TAGCG 0.000377 TAGCT 0.000886 TAGGA 0.000817 TAGGC 0.000512 TAGGG 0.000438 TAGGT 0.000731 TAGTA 0.00113 TAGTC 0.000721 TAGTG 0.000852 TAGTT 0.0015 TATAA 0.00234 TATAC 0.000974 TATAG 0.000954 TATAT 0.0025 TATCA 0.00156 TATCC 0.000783 TATCG 0.000688 TATCT 0.0014 TATGA 0.0015 TATGC 0.000957 TATGG 0.000834 TATGT 0.00122 TATTA 0.0027 TATTC 0.00186 TATTG 0.00186 TATTT 0.00464 TCAAA 0.00278 TCAAC 0.00119 TCAAG 0.00124 TCAAT 0.00226 TCACA 0.00119 TCACC 0.00075 TCACG 0.000477 TCACT 0.00128 TCAGA 0.00112 TCAGC 0.000683 TCAGG 0.000573 TCAGT 0.00122 TCATA 0.0015 TCATC 0.00108 TCATG 0.00104 TCATT 0.0025 TCCAA 0.00136 TCCAC 0.000815 TCCAG 0.000608 TCCAT 0.00118 TCCCA 0.000758 TCCCC 0.0005 TCCCG 0.000214 TCCCT 0.00069 TCCGA 0.000453 TCCGC 0.000287 TCCGG 0.000201 TCCGT 0.000401 TCCTA 0.000817 TCCTC 0.000838 TCCTG 0.000561 TCCTT 0.00122 TCGAA 0.00111 TCGAC 0.000475 TCGAG 0.000532 TCGAT 0.000964 TCGCA 0.000521 TCGCC 0.000324 TCGCG 0.000211 TCGCT 0.000492 TCGGA 0.000453 TCGGC 0.000277 TCGGG 0.00025 TCGGT 0.000467 TCGTA 0.000629 TCGTC 0.00047 TCGTG 0.000491 TCGTT 0.000882 TCTAA 0.00152 TCTAC 0.000834 TCTAG 0.000695 TCTAT 0.0014 TCTCA 0.00121 TCTCC 0.000861 TCTCG 0.000483 TCTCT 0.00133 TCTGA 0.00112 TCTGC 0.000749 TCTGG 0.000604 TCTGT 0.00108 TCTTA 0.00144 TCTTC 0.00141 TCTTG 0.00107 TCTTT 0.00216 TGAAA 0.00301 TGAAC 0.00112 TGAAG 0.00143 TGAAT 0.00235 TGACA 0.00115 TGACC 0.000697 TGACG 0.000495 TGACT 0.00115 TGAGA 0.00121 TGAGC 0.000678 TGAGG 0.000744 TGAGT 0.00111 TGATA 0.00156 TGATC 0.000918 TGATG 0.00108 TGATT 0.00216 TGCAA 0.00146 TGCAC 0.000782 TGCAG 0.000738 TGCAT 0.00134 TGCCA 0.000859 TGCCC 0.00037 TGCCG 0.000278 TGCCT 0.000761 TGCGA 0.000521 TGCGC 0.000371 TGCGG 0.00028 TGCGT 0.000546 TGCTA 0.000986 TGCTC 0.000731 TGCTG 0.000721 TGCTT 0.00137 TGGAA 0.00156 TGGAC 0.000546 TGGAG 0.000826 TGGAT 0.00103 TGGCA 0.000859 TGGCC 0.000434 TGGCG 0.000362 TGGCT 0.000745 TGGGA 0.000758 TGGGC 0.000383 TGGGG 0.000437 TGGGT 0.000638 TGGTA 0.000939 TGGTC 0.000626 TGGTG 0.000783 TGGTT 0.00117 TGTAA 0.00156 TGTAC 0.000736 TGTAG 0.00075 TGTAT 0.00129 TGTCA 0.00115 TGTCC 0.000563 TGTCG 0.000428 TGTCT 0.001 TGTGA 0.00119 TGTGC 0.000763 TGTGG 0.000742 TGTGT 0.00112 TGTTA 0.00146 TGTTC 0.00107 TGTTG 0.00111 TGTTT 0.00218 TTAAA 0.00432 TTAAC 0.00169 TTAAG 0.00173 TTAAT 0.00367 TTACA 0.00156 TTACC 0.000965 TTACG 0.000645 TTACT 0.00174 TTAGA 0.00152 TTAGC 0.00101 TTAGG 0.000836 TTAGT 0.00155 TTATA 0.00234 TTATC 0.00161 TTATG 0.00157 TTATT 0.00421 TTCAA 0.00284 TTCAC 0.00139 TTCAG 0.00131 TTCAT 0.00237 TTCCA 0.00156 TTCCC 0.000818 TTCCG 0.000491 TTCCT 0.00137 TTCGA 0.00111 TTCGC 0.000601 TTCGG 0.000544 TTCGT 0.000952 TTCTA 0.00165 TTCTC 0.00143 TTCTG 0.0013 TTCTT 0.00228 TTGAA 0.00284 TTGAC 0.00123 TTGAG 0.00129 TTGAT 0.0021 TTGCA 0.00146 TTGCC 0.000812 TTGCG 0.000535 TTGCT 0.00135 TTGGA 0.00136 TTGGC 0.000908 TTGGG 0.000747 TTGGT 0.00129 TTGTA 0.00155 TTGTC 0.0011 TTGTG 0.00131 TTGTT 0.00206 TTTAA 0.00432 TTTAC 0.00193 TTTAG 0.00171 TTTAT 0.00389 TTTCA 0.00301 TTTCC 0.00165 TTTCG 0.00118 TTTCT 0.00255 TTTGA 0.00278 TTTGC 0.00164 TTTGG 0.00153 TTTGT 0.00241 TTTTA 0.00423 TTTTC 0.00294 TTTTG 0.00288 TTTTT 0.00467 [EMISSION] # Vector size (4^(k+1)) 1024 # Probabilities AAAAA 0.3174 AAAAC 0.1463 AAAAG 0.1682 AAAAT 0.3681 AAACA 0.3503 AAACC 0.175 AAACG 0.1682 AAACT 0.3064 AAAGA 0.3008 AAAGC 0.1907 AAAGG 0.189 AAAGT 0.3194 AAATA 0.3062 AAATC 0.1488 AAATG 0.2003 AAATT 0.3447 AACAA 0.3533 AACAC 0.177 AACAG 0.1949 AACAT 0.2748 AACCA 0.3815 AACCC 0.1771 AACCG 0.1526 AACCT 0.2889 AACGA 0.3374 AACGC 0.2106 AACGG 0.1727 AACGT 0.2794 AACTA 0.2617 AACTC 0.1828 AACTG 0.213 AACTT 0.3426 AAGAA 0.3735 AAGAC 0.1552 AAGAG 0.2069 AAGAT 0.2645 AAGCA 0.3723 AAGCC 0.1865 AAGCG 0.1546 AAGCT 0.2865 AAGGA 0.3249 AAGGC 0.2033 AAGGG 0.1833 AAGGT 0.2886 AAGTA 0.284 AAGTC 0.1705 AAGTG 0.2311 AAGTT 0.3144 AATAA 0.3809 AATAC 0.1401 AATAG 0.1641 AATAT 0.3148 AATCA 0.3743 AATCC 0.1719 AATCG 0.1697 AATCT 0.2841 AATGA 0.3422 AATGC 0.2009 AATGG 0.1943 AATGT 0.2625 AATTA 0.2751 AATTC 0.1681 AATTG 0.1773 AATTT 0.3795 ACAAA 0.3992 ACAAC 0.1557 ACAAG 0.1586 ACAAT 0.2864 ACACA 0.3618 ACACC 0.1866 ACACG 0.1436 ACACT 0.3081 ACAGA 0.3431 ACAGC 0.1941 ACAGG 0.1611 ACAGT 0.3018 ACATA 0.2514 ACATC 0.1778 ACATG 0.175 ACATT 0.3958 ACCAA 0.3679 ACCAC 0.2033 ACCAG 0.1559 ACCAT 0.273 ACCCA 0.3773 ACCCC 0.2058 ACCCG 0.1212 ACCCT 0.2958 ACCGA 0.3535 ACCGC 0.2065 ACCGG 0.1541 ACCGT 0.286 ACCTA 0.2404 ACCTC 0.2324 ACCTG 0.1717 ACCTT 0.3555 ACGAA 0.3849 ACGAC 0.1558 ACGAG 0.1799 ACGAT 0.2794 ACGCA 0.3524 ACGCC 0.1968 ACGCG 0.1537 ACGCT 0.2972 ACGGA 0.3327 ACGGC 0.2002 ACGGG 0.1535 ACGGT 0.3136 ACGTA 0.2543 ACGTC 0.1967 ACGTG 0.2174 ACGTT 0.3316 ACTAA 0.3696 ACTAC 0.178 ACTAG 0.1609 ACTAT 0.2915 ACTCA 0.3546 ACTCC 0.1965 ACTCG 0.1451 ACTCT 0.3038 ACTGA 0.3492 ACTGC 0.2023 ACTGG 0.1758 ACTGT 0.2726 ACTTA 0.2496 ACTTC 0.2056 ACTTG 0.1777 ACTTT 0.367 AGAAA 0.3835 AGAAC 0.1386 AGAAG 0.2014 AGAAT 0.2765 AGACA 0.3596 AGACC 0.1806 AGACG 0.1677 AGACT 0.292 AGAGA 0.357 AGAGC 0.1648 AGAGG 0.2237 AGAGT 0.2545 AGATA 0.2909 AGATC 0.1542 AGATG 0.213 AGATT 0.3418 AGCAA 0.3547 AGCAC 0.1741 AGCAG 0.1876 AGCAT 0.2836 AGCCA 0.393 AGCCC 0.1696 AGCCG 0.1223 AGCCT 0.3152 AGCGA 0.3241 AGCGC 0.1965 AGCGG 0.1763 AGCGT 0.3031 AGCTA 0.2842 AGCTC 0.1814 AGCTG 0.1957 AGCTT 0.3387 AGGAA 0.3997 AGGAC 0.1398 AGGAG 0.2282 AGGAT 0.2323 AGGCA 0.3735 AGGCC 0.1654 AGGCG 0.1677 AGGCT 0.2933 AGGGA 0.3493 AGGGC 0.1651 AGGGG 0.2323 AGGGT 0.2533 AGGTA 0.29 AGGTC 0.1825 AGGTG 0.2363 AGGTT 0.2913 AGTAA 0.3739 AGTAC 0.1592 AGTAG 0.1996 AGTAT 0.2673 AGTCA 0.4007 AGTCC 0.1625 AGTCG 0.1531 AGTCT 0.2837 AGTGA 0.3369 AGTGC 0.1898 AGTGG 0.2218 AGTGT 0.2515 AGTTA 0.2794 AGTTC 0.1758 AGTTG 0.2127 AGTTT 0.332 ATAAA 0.3993 ATAAC 0.1401 ATAAG 0.1579 ATAAT 0.3027 ATACA 0.3345 ATACC 0.1865 ATACG 0.1554 ATACT 0.3236 ATAGA 0.3279 ATAGC 0.1967 ATAGG 0.1876 ATAGT 0.2879 ATATA 0.2799 ATATC 0.1599 ATATG 0.1707 ATATT 0.3896 ATCAA 0.366 ATCAC 0.1785 ATCAG 0.1817 ATCAT 0.2737 ATCCA 0.3788 ATCCC 0.1835 ATCCG 0.1433 ATCCT 0.2944 ATCGA 0.3791 ATCGC 0.1797 ATCGG 0.1693 ATCGT 0.2719 ATCTA 0.2508 ATCTC 0.2112 ATCTG 0.2022 ATCTT 0.3358 ATGAA 0.3877 ATGAC 0.1752 ATGAG 0.1809 ATGAT 0.2562 ATGCA 0.3691 ATGCC 0.1832 ATGCG 0.1493 ATGCT 0.2984 ATGGA 0.3348 ATGGC 0.2061 ATGGG 0.1855 ATGGT 0.2736 ATGTA 0.2658 ATGTC 0.1842 ATGTG 0.2194 ATGTT 0.3306 ATTAA 0.3764 ATTAC 0.1536 ATTAG 0.1674 ATTAT 0.3025 ATTCA 0.3689 ATTCC 0.1845 ATTCG 0.1575 ATTCT 0.2891 ATTGA 0.3403 ATTGC 0.189 ATTGG 0.2107 ATTGT 0.26 ATTTA 0.2697 ATTTC 0.1869 ATTTG 0.186 ATTTT 0.3574 CAAAA 0.3446 CAAAC 0.1506 CAAAG 0.167 CAAAT 0.3378 CAACA 0.3195 CAACC 0.1874 CAACG 0.1409 CAACT 0.3522 CAAGA 0.3076 CAAGC 0.1835 CAAGG 0.19 CAAGT 0.3189 CAATA 0.2794 CAATC 0.1699 CAATG 0.1829 CAATT 0.3678 CACAA 0.3446 CACAC 0.201 CACAG 0.176 CACAT 0.2784 CACCA 0.3516 CACCC 0.1993 CACCG 0.1266 CACCT 0.3225 CACGA 0.3215 CACGC 0.216 CACGG 0.1492 CACGT 0.3133 CACTA 0.2239 CACTC 0.199 CACTG 0.1968 CACTT 0.3803 CAGAA 0.3659 CAGAC 0.1655 CAGAG 0.1953 CAGAT 0.2733 CAGCA 0.3605 CAGCC 0.1975 CAGCG 0.1367 CAGCT 0.3053 CAGGA 0.3234 CAGGC 0.2063 CAGGG 0.1693 CAGGT 0.301 CAGTA 0.258 CAGTC 0.1756 CAGTG 0.2149 CAGTT 0.3514 CATAA 0.348 CATAC 0.1583 CATAG 0.1554 CATAT 0.3383 CATCA 0.3459 CATCC 0.1777 CATCG 0.1496 CATCT 0.3268 CATGA 0.3291 CATGC 0.2068 CATGG 0.1952 CATGT 0.2689 CATTA 0.239 CATTC 0.1781 CATTG 0.1665 CATTT 0.4163 CCAAA 0.3542 CCAAC 0.1686 CCAAG 0.1524 CCAAT 0.3248 CCACA 0.3058 CCACC 0.2178 CCACG 0.1285 CCACT 0.3478 CCAGA 0.3274 CCAGC 0.177 CCAGG 0.1636 CCAGT 0.3319 CCATA 0.2377 CCATC 0.1833 CCATG 0.1751 CCATT 0.4039 CCCAA 0.337 CCCAC 0.2163 CCCAG 0.1529 CCCAT 0.2938 CCCCA 0.2846 CCCCC 0.3371 CCCCG 0.07959 CCCCT 0.2987 CCCGA 0.3779 CCCGC 0.1998 CCCGG 0.1425 CCCGT 0.2798 CCCTA 0.2217 CCCTC 0.2822 CCCTG 0.1486 CCCTT 0.3475 CCGAA 0.376 CCGAC 0.164 CCGAG 0.1626 CCGAT 0.2975 CCGCA 0.3319 CCGCC 0.2264 CCGCG 0.1243 CCGCT 0.3174 CCGGA 0.3304 CCGGC 0.1801 CCGGG 0.1548 CCGGT 0.3347 CCGTA 0.2471 CCGTC 0.1889 CCGTG 0.1893 CCGTT 0.3747 CCTAA 0.3348 CCTAC 0.1915 CCTAG 0.1541 CCTAT 0.3196 CCTCA 0.2966 CCTCC 0.2522 CCTCG 0.1178 CCTCT 0.3333 CCTGA 0.3302 CCTGC 0.2033 CCTGG 0.1741 CCTGT 0.2924 CCTTA 0.2343 CCTTC 0.2254 CCTTG 0.1771 CCTTT 0.3632 CGAAA 0.3673 CGAAC 0.1371 CGAAG 0.1831 CGAAT 0.3125 CGACA 0.3233 CGACC 0.1962 CGACG 0.1489 CGACT 0.3316 CGAGA 0.3273 CGAGC 0.1647 CGAGG 0.2003 CGAGT 0.3078 CGATA 0.2708 CGATC 0.1592 CGATG 0.1843 CGATT 0.3858 CGCAA 0.3117 CGCAC 0.2104 CGCAG 0.1632 CGCAT 0.3147 CGCCA 0.3648 CGCCC 0.169 CGCCG 0.1216 CGCCT 0.3445 CGCGA 0.2963 CGCGC 0.2229 CGCGG 0.147 CGCGT 0.3338 CGCTA 0.2481 CGCTC 0.1966 CGCTG 0.18 CGCTT 0.3754 CGGAA 0.3658 CGGAC 0.1427 CGGAG 0.2023 CGGAT 0.2891 CGGCA 0.3566 CGGCC 0.191 CGGCG 0.1548 CGGCT 0.2976 CGGGA 0.3235 CGGGC 0.1813 CGGGG 0.185 CGGGT 0.3102 CGGTA 0.2554 CGGTC 0.1774 CGGTG 0.2134 CGGTT 0.3538 CGTAA 0.3408 CGTAC 0.1643 CGTAG 0.1789 CGTAT 0.316 CGTCA 0.3553 CGTCC 0.1679 CGTCG 0.1415 CGTCT 0.3353 CGTGA 0.3124 CGTGC 0.1917 CGTGG 0.2042 CGTGT 0.2918 CGTTA 0.2395 CGTTC 0.1727 CGTTG 0.1871 CGTTT 0.4008 CTAAA 0.347 CTAAC 0.1643 CTAAG 0.157 CTAAT 0.3317 CTACA 0.2921 CTACC 0.2142 CTACG 0.1318 CTACT 0.3619 CTAGA 0.3212 CTAGC 0.1881 CTAGG 0.178 CTAGT 0.3127 CTATA 0.2241 CTATC 0.1846 CTATG 0.1647 CTATT 0.4266 CTCAA 0.3461 CTCAC 0.1865 CTCAG 0.1717 CTCAT 0.2957 CTCCA 0.3349 CTCCC 0.2375 CTCCG 0.1101 CTCCT 0.3175 CTCGA 0.3605 CTCGC 0.1786 CTCGG 0.1593 CTCGT 0.3015 CTCTA 0.2335 CTCTC 0.2434 CTCTG 0.1856 CTCTT 0.3374 CTGAA 0.3638 CTGAC 0.1677 CTGAG 0.1789 CTGAT 0.2897 CTGCA 0.3379 CTGCC 0.2066 CTGCG 0.1284 CTGCT 0.3272 CTGGA 0.3294 CTGGC 0.1898 CTGGG 0.1836 CTGGT 0.2972 CTGTA 0.2289 CTGTC 0.1971 CTGTG 0.2133 CTGTT 0.3607 CTTAA 0.3567 CTTAC 0.1677 CTTAG 0.159 CTTAT 0.3166 CTTCA 0.3378 CTTCC 0.2081 CTTCG 0.1383 CTTCT 0.3157 CTTGA 0.3541 CTTGC 0.184 CTTGG 0.188 CTTGT 0.2739 CTTTA 0.2564 CTTTC 0.2057 CTTTG 0.1938 CTTTT 0.3441 GAAAA 0.3508 GAAAC 0.1349 GAAAG 0.1765 GAAAT 0.3378 GAACA 0.3562 GAACC 0.159 GAACG 0.1497 GAACT 0.3352 GAAGA 0.3327 GAAGC 0.1652 GAAGG 0.1988 GAAGT 0.3032 GAATA 0.2927 GAATC 0.1393 GAATG 0.2042 GAATT 0.3638 GACAA 0.3515 GACAC 0.1675 GACAG 0.1973 GACAT 0.2837 GACCA 0.3735 GACCC 0.1554 GACCG 0.1399 GACCT 0.3311 GACGA 0.3369 GACGC 0.1892 GACGG 0.1633 GACGT 0.3107 GACTA 0.2514 GACTC 0.1632 GACTG 0.2132 GACTT 0.3722 GAGAA 0.3669 GAGAC 0.1384 GAGAG 0.2339 GAGAT 0.2608 GAGCA 0.3856 GAGCC 0.1584 GAGCG 0.1576 GAGCT 0.2985 GAGGA 0.3341 GAGGC 0.1617 GAGGG 0.2223 GAGGT 0.2818 GAGTA 0.2726 GAGTC 0.1497 GAGTG 0.2419 GAGTT 0.3358 GATAA 0.3628 GATAC 0.1373 GATAG 0.1773 GATAT 0.3226 GATCA 0.3766 GATCC 0.1539 GATCG 0.1659 GATCT 0.3036 GATGA 0.3451 GATGC 0.1744 GATGG 0.2056 GATGT 0.2749 GATTA 0.2608 GATTC 0.1535 GATTG 0.1952 GATTT 0.3905 GCAAA 0.3949 GCAAC 0.1482 GCAAG 0.1547 GCAAT 0.3022 GCACA 0.3553 GCACC 0.1722 GCACG 0.1363 GCACT 0.3362 GCAGA 0.3429 GCAGC 0.1732 GCAGG 0.1613 GCAGT 0.3226 GCATA 0.2643 GCATC 0.1508 GCATG 0.1799 GCATT 0.405 GCCAA 0.3784 GCCAC 0.174 GCCAG 0.146 GCCAT 0.3016 GCCCA 0.3829 GCCCC 0.1707 GCCCG 0.1199 GCCCT 0.3265 GCCGA 0.3552 GCCGC 0.1944 GCCGG 0.1406 GCCGT 0.3098 GCCTA 0.2515 GCCTC 0.1991 GCCTG 0.1756 GCCTT 0.3738 GCGAA 0.388 GCGAC 0.1468 GCGAG 0.1702 GCGAT 0.295 GCGCA 0.3711 GCGCC 0.1714 GCGCG 0.159 GCGCT 0.2985 GCGGA 0.3405 GCGGC 0.1795 GCGGG 0.1566 GCGGT 0.3235 GCGTA 0.2612 GCGTC 0.1703 GCGTG 0.2131 GCGTT 0.3554 GCTAA 0.3654 GCTAC 0.1842 GCTAG 0.1474 GCTAT 0.3031 GCTCA 0.3577 GCTCC 0.1892 GCTCG 0.1282 GCTCT 0.3249 GCTGA 0.3419 GCTGC 0.1893 GCTGG 0.1634 GCTGT 0.3055 GCTTA 0.2637 GCTTC 0.1903 GCTTG 0.1737 GCTTT 0.3723 GGAAA 0.3881 GGAAC 0.1267 GGAAG 0.2083 GGAAT 0.2769 GGACA 0.3809 GGACC 0.145 GGACG 0.1585 GGACT 0.3156 GGAGA 0.3491 GGAGC 0.1453 GGAGG 0.2563 GGAGT 0.2492 GGATA 0.2893 GGATC 0.1386 GGATG 0.2053 GGATT 0.3668 GGCAA 0.3582 GGCAC 0.1505 GGCAG 0.199 GGCAT 0.2924 GGCCA 0.4097 GGCCC 0.1317 GGCCG 0.1405 GGCCT 0.3182 GGCGA 0.3272 GGCGC 0.1728 GGCGG 0.1926 GGCGT 0.3074 GGCTA 0.2706 GGCTC 0.1584 GGCTG 0.2083 GGCTT 0.3627 GGGAA 0.3788 GGGAC 0.1199 GGGAG 0.2712 GGGAT 0.23 GGGCA 0.3707 GGGCC 0.1396 GGGCG 0.1678 GGGCT 0.3218 GGGGA 0.3253 GGGGC 0.111 GGGGG 0.3372 GGGGT 0.2265 GGGTA 0.2626 GGGTC 0.154 GGGTG 0.2625 GGGTT 0.321 GGTAA 0.3709 GGTAC 0.1419 GGTAG 0.2115 GGTAT 0.2757 GGTCA 0.4164 GGTCC 0.1279 GGTCG 0.1552 GGTCT 0.3006 GGTGA 0.3366 GGTGC 0.166 GGTGG 0.2373 GGTGT 0.2601 GGTTA 0.2758 GGTTC 0.1563 GGTTG 0.2123 GGTTT 0.3555 GTAAA 0.3932 GTAAC 0.1368 GTAAG 0.1657 GTAAT 0.3044 GTACA 0.3411 GTACC 0.1711 GTACG 0.1441 GTACT 0.3437 GTAGA 0.3246 GTAGC 0.198 GTAGG 0.1862 GTAGT 0.2913 GTATA 0.2533 GTATC 0.1581 GTATG 0.1856 GTATT 0.403 GTCAA 0.3528 GTCAC 0.1678 GTCAG 0.1725 GTCAT 0.307 GTCCA 0.3699 GTCCC 0.1754 GTCCG 0.1298 GTCCT 0.325 GTCGA 0.3585 GTCGC 0.1716 GTCGG 0.179 GTCGT 0.2908 GTCTA 0.2564 GTCTC 0.1932 GTCTG 0.2109 GTCTT 0.3395 GTGAA 0.3761 GTGAC 0.1585 GTGAG 0.1888 GTGAT 0.2765 GTGCA 0.364 GTGCC 0.1589 GTGCG 0.1683 GTGCT 0.3088 GTGGA 0.3359 GTGGC 0.172 GTGGG 0.1975 GTGGT 0.2947 GTGTA 0.2514 GTGTC 0.1696 GTGTG 0.247 GTGTT 0.332 GTTAA 0.373 GTTAC 0.1482 GTTAG 0.1781 GTTAT 0.3007 GTTCA 0.3699 GTTCC 0.1783 GTTCG 0.1459 GTTCT 0.3059 GTTGA 0.3429 GTTGC 0.1774 GTTGG 0.2093 GTTGT 0.2704 GTTTA 0.2706 GTTTC 0.1817 GTTTG 0.2019 GTTTT 0.3458 TAAAA 0.3569 TAAAC 0.1423 TAAAG 0.1557 TAAAT 0.3451 TAACA 0.3215 TAACC 0.1864 TAACG 0.138 TAACT 0.3541 TAAGA 0.2973 TAAGC 0.2001 TAAGG 0.1807 TAAGT 0.3219 TAATA 0.2774 TAATC 0.1547 TAATG 0.179 TAATT 0.3889 TACAA 0.3573 TACAC 0.18 TACAG 0.1661 TACAT 0.2967 TACCA 0.3608 TACCC 0.1707 TACCG 0.1297 TACCT 0.3388 TACGA 0.3327 TACGC 0.2139 TACGG 0.1574 TACGT 0.2961 TACTA 0.2419 TACTC 0.1832 TACTG 0.193 TACTT 0.382 TAGAA 0.3717 TAGAC 0.1608 TAGAG 0.1964 TAGAT 0.2711 TAGCA 0.357 TAGCC 0.1857 TAGCG 0.1364 TAGCT 0.3209 TAGGA 0.3271 TAGGC 0.205 TAGGG 0.1753 TAGGT 0.2925 TAGTA 0.268 TAGTC 0.1716 TAGTG 0.2026 TAGTT 0.3578 TATAA 0.3458 TATAC 0.1438 TATAG 0.1408 TATAT 0.3695 TATCA 0.3526 TATCC 0.1768 TATCG 0.1554 TATCT 0.3153 TATGA 0.3332 TATGC 0.2121 TATGG 0.185 TATGT 0.2697 TATTA 0.2443 TATTC 0.1684 TATTG 0.1677 TATTT 0.4196 TCAAA 0.3719 TCAAC 0.1595 TCAAG 0.1657 TCAAT 0.3028 TCACA 0.321 TCACC 0.2029 TCACG 0.1292 TCACT 0.3469 TCAGA 0.3115 TCAGC 0.1903 TCAGG 0.1594 TCAGT 0.3388 TCATA 0.2458 TCATC 0.1766 TCATG 0.1695 TCATT 0.4082 TCCAA 0.3435 TCCAC 0.206 TCCAG 0.1536 TCCAT 0.297 TCCCA 0.3506 TCCCC 0.2313 TCCCG 0.09894 TCCCT 0.3192 TCCGA 0.3377 TCCGC 0.2139 TCCGG 0.1497 TCCGT 0.2986 TCCTA 0.2381 TCCTC 0.2441 TCCTG 0.1634 TCCTT 0.3544 TCGAA 0.3606 TCGAC 0.1541 TCGAG 0.1726 TCGAT 0.3126 TCGCA 0.3366 TCGCC 0.2094 TCGCG 0.1364 TCGCT 0.3176 TCGGA 0.3133 TCGGC 0.1912 TCGGG 0.1726 TCGGT 0.3229 TCGTA 0.2546 TCGTC 0.19 TCGTG 0.1988 TCGTT 0.3567 TCTAA 0.3416 TCTAC 0.1877 TCTAG 0.1565 TCTAT 0.3142 TCTCA 0.3111 TCTCC 0.2215 TCTCG 0.1242 TCTCT 0.3431 TCTGA 0.315 TCTGC 0.2109 TCTGG 0.1701 TCTGT 0.304 TCTTA 0.2369 TCTTC 0.2318 TCTTG 0.1762 TCTTT 0.3551 TGAAA 0.3806 TGAAC 0.141 TGAAG 0.1814 TGAAT 0.297 TGACA 0.3293 TGACC 0.1997 TGACG 0.1418 TGACT 0.3291 TGAGA 0.3233 TGAGC 0.1812 TGAGG 0.1988 TGAGT 0.2966 TGATA 0.2728 TGATC 0.1604 TGATG 0.1891 TGATT 0.3777 TGCAA 0.3375 TGCAC 0.1813 TGCAG 0.1712 TGCAT 0.3099 TGCCA 0.3788 TGCCC 0.1633 TGCCG 0.1225 TGCCT 0.3355 TGCGA 0.3035 TGCGC 0.2159 TGCGG 0.1629 TGCGT 0.3177 TGCTA 0.2588 TGCTC 0.1918 TGCTG 0.1892 TGCTT 0.3602 TGGAA 0.394 TGGAC 0.1381 TGGAG 0.2088 TGGAT 0.2592 TGGCA 0.358 TGGCC 0.1808 TGGCG 0.1508 TGGCT 0.3104 TGGGA 0.342 TGGGC 0.1726 TGGGG 0.1974 TGGGT 0.288 TGGTA 0.2669 TGGTC 0.1779 TGGTG 0.2227 TGGTT 0.3325 TGTAA 0.3606 TGTAC 0.1697 TGTAG 0.173 TGTAT 0.2968 TGTCA 0.3659 TGTCC 0.179 TGTCG 0.1362 TGTCT 0.3189 TGTGA 0.3109 TGTGC 0.2 TGTGG 0.1945 TGTGT 0.2945 TGTTA 0.2504 TGTTC 0.1844 TGTTG 0.1905 TGTTT 0.3747 TTAAA 0.3786 TTAAC 0.1483 TTAAG 0.1518 TTAAT 0.3214 TTACA 0.3182 TTACC 0.1964 TTACG 0.1312 TTACT 0.3543 TTAGA 0.3087 TTAGC 0.2052 TTAGG 0.1701 TTAGT 0.316 TTATA 0.2407 TTATC 0.1651 TTATG 0.1613 TTATT 0.4329 TTCAA 0.3591 TTCAC 0.1758 TTCAG 0.1652 TTCAT 0.2999 TTCCA 0.3677 TTCCC 0.193 TTCCG 0.1158 TTCCT 0.3236 TTCGA 0.3464 TTCGC 0.1873 TTCGG 0.1695 TTCGT 0.2967 TTCTA 0.2481 TTCTC 0.2144 TTCTG 0.1953 TTCTT 0.3421 TTGAA 0.3805 TTGAC 0.1651 TTGAG 0.1735 TTGAT 0.2808 TTGCA 0.3503 TTGCC 0.1956 TTGCG 0.1289 TTGCT 0.3252 TTGGA 0.3155 TTGGC 0.2107 TTGGG 0.1734 TTGGT 0.3004 TTGTA 0.2571 TTGTC 0.1833 TTGTG 0.2181 TTGTT 0.3414 TTTAA 0.3646 TTTAC 0.1632 TTTAG 0.144 TTTAT 0.3282 TTTCA 0.3589 TTTCC 0.1963 TTTCG 0.1405 TTTCT 0.3043 TTTGA 0.3325 TTTGC 0.1965 TTTGG 0.1828 TTTGT 0.2882 TTTTA 0.2872 TTTTC 0.1999 TTTTG 0.1955 TTTTT 0.3174 [2] # (a,c,g,t)= (0.258, 0.242, 0.242, 0.258) # # Probabilities file for the intergenic region model # # k = 4 # The P_l's [P_ls] # l= 0 # Values A 0.323 C 0.177 G 0.177 T 0.323 # l= 1 # Values AA 0.117 AC 0.0514 AG 0.0561 AT 0.0978 CA 0.0624 CC 0.0335 CG 0.0253 CT 0.0561 GA 0.0585 GC 0.0339 GG 0.0335 GT 0.0514 TA 0.0844 TC 0.0585 TG 0.0624 TT 0.117 # l= 2 # Values AAA 0.0428 AAC 0.0173 AAG 0.0198 AAT 0.0375 ACA 0.0172 ACC 0.00968 ACG 0.00749 ACT 0.0171 AGA 0.018 AGC 0.0104 AGG 0.0106 AGT 0.0171 ATA 0.0264 ATC 0.0158 ATG 0.0181 ATT 0.0375 CAA 0.0219 CAC 0.0115 CAG 0.0109 CAT 0.0181 CCA 0.0122 CCC 0.00654 CCG 0.00417 CCT 0.0106 CGA 0.00863 CGC 0.00502 CGG 0.00417 CGT 0.00749 CTA 0.0139 CTC 0.0116 CTG 0.0109 CTT 0.0198 GAA 0.022 GAC 0.00916 GAG 0.0116 GAT 0.0158 GCA 0.0122 GCC 0.0063 GCG 0.00502 GCT 0.0104 GGA 0.011 GGC 0.0063 GGG 0.00655 GGT 0.00968 GTA 0.0135 GTC 0.00917 GTG 0.0115 GTT 0.0173 TAA 0.0306 TAC 0.0135 TAG 0.0139 TAT 0.0264 TCA 0.0209 TCC 0.011 TCG 0.00862 TCT 0.018 TGA 0.0208 TGC 0.0122 TGG 0.0122 TGT 0.0172 TTA 0.0306 TTC 0.022 TTG 0.0219 TTT 0.0428 # l= 3 # Values AAAA 0.0145 AAAC 0.0062 AAAG 0.00716 AAAT 0.0149 AACA 0.00581 AACC 0.00309 AACG 0.00263 AACT 0.00574 AAGA 0.00609 AAGC 0.00369 AAGG 0.00377 AAGT 0.00624 AATA 0.0109 AATC 0.00575 AATG 0.00726 AATT 0.0136 ACAA 0.00602 ACAC 0.00314 ACAG 0.00317 ACAT 0.00483 ACCA 0.00354 ACCC 0.00173 ACCG 0.00134 ACCT 0.00307 ACGA 0.00249 ACGC 0.00157 ACGG 0.00122 ACGT 0.00221 ACTA 0.00419 ACTC 0.00316 ACTG 0.00351 ACTT 0.00624 AGAA 0.00665 AGAC 0.00281 AGAG 0.00378 AGAT 0.00479 AGCA 0.00382 AGCC 0.00192 AGCG 0.00154 AGCT 0.00313 AGGA 0.00346 AGGC 0.00206 AGGG 0.00202 AGGT 0.00306 AGTA 0.00464 AGTC 0.00289 AGTG 0.00384 AGTT 0.00574 ATAA 0.00959 ATAC 0.00383 ATAG 0.00424 ATAT 0.00879 ATCA 0.00571 ATCC 0.00273 ATCG 0.00256 ATCT 0.00479 ATGA 0.0061 ATGC 0.00362 ATGG 0.00353 ATGT 0.00483 ATTA 0.00961 ATTC 0.00633 ATTG 0.00661 ATTT 0.0149 CAAA 0.00829 CAAC 0.00351 CAAG 0.00351 CAAT 0.00661 CACA 0.00386 CACC 0.00227 CACG 0.00155 CACT 0.00384 CAGA 0.00357 CAGC 0.00202 CAGG 0.00176 CAGT 0.00351 CATA 0.00449 CATC 0.00316 CATG 0.00316 CATT 0.00726 CCAA 0.00434 CCAC 0.00248 CCAG 0.00187 CCAT 0.00353 CCCA 0.00225 CCCC 0.0016 CCCG 0.000677 CCCT 0.00202 CCGA 0.00147 CCGC 0.000862 CCGG 0.000623 CCGT 0.00122 CCTA 0.00251 CCTC 0.00256 CCTG 0.00176 CCTT 0.00377 CGAA 0.00322 CGAC 0.00135 CGAG 0.0015 CGAT 0.00256 CGCA 0.00174 CGCC 0.00101 CGCG 0.000732 CGCT 0.00154 CGGA 0.00136 CGGC 0.000796 CGGG 0.000677 CGGT 0.00134 CGTA 0.0019 CGTC 0.00142 CGTG 0.00155 CGTT 0.00263 CTAA 0.0049 CTAC 0.0026 CTAG 0.00218 CTAT 0.00424 CTCA 0.00377 CTCC 0.00253 CTCG 0.0015 CTCT 0.00378 CTGA 0.00361 CTGC 0.00221 CTGG 0.00187 CTGT 0.00317 CTTA 0.00483 CTTC 0.00428 CTTG 0.00351 CTTT 0.00716 GAAA 0.00835 GAAC 0.00303 GAAG 0.00428 GAAT 0.00633 GACA 0.00316 GACC 0.0017 GACG 0.00142 GACT 0.00289 GAGA 0.00393 GAGC 0.00192 GAGG 0.00256 GAGT 0.00316 GATA 0.00441 GATC 0.00245 GATG 0.00316 GATT 0.00575 GCAA 0.00415 GCAC 0.00218 GCAG 0.00221 GCAT 0.00362 GCCA 0.00243 GCCC 0.00102 GCCG 0.000796 GCCT 0.00206 GCGA 0.00157 GCGC 0.00102 GCGG 0.000862 GCGT 0.00157 GCTA 0.00278 GCTC 0.00192 GCTG 0.00202 GCTT 0.00369 GGAA 0.00426 GGAC 0.0015 GGAG 0.00253 GGAT 0.00273 GGCA 0.00229 GGCC 0.00108 GGCG 0.00101 GGCT 0.00192 GGGA 0.0022 GGGC 0.00102 GGGG 0.0016 GGGT 0.00173 GGTA 0.00262 GGTC 0.0017 GGTG 0.00227 GGTT 0.00309 GTAA 0.00489 GTAC 0.00217 GTAG 0.0026 GTAT 0.00383 GTCA 0.00351 GTCC 0.0015 GTCG 0.00135 GTCT 0.00281 GTGA 0.00372 GTGC 0.00218 GTGG 0.00247 GTGT 0.00314 GTTA 0.00452 GTTC 0.00303 GTTG 0.00351 GTTT 0.0062 TAAA 0.0116 TAAC 0.00452 TAAG 0.00483 TAAT 0.00961 TACA 0.00433 TACC 0.00262 TACG 0.0019 TACT 0.00464 TAGA 0.00443 TAGC 0.00278 TAGG 0.00251 TAGT 0.00419 TATA 0.00665 TATC 0.00441 TATG 0.00449 TATT 0.0109 TCAA 0.00742 TCAC 0.00372 TCAG 0.00361 TCAT 0.0061 TCCA 0.00399 TCCC 0.0022 TCCG 0.00136 TCCT 0.00346 TCGA 0.0031 TCGC 0.00157 TCGG 0.00147 TCGT 0.00249 TCTA 0.00443 TCTC 0.00393 TCTG 0.00357 TCTT 0.00609 TGAA 0.00786 TGAC 0.00351 TGAG 0.00377 TGAT 0.00571 TGCA 0.0043 TGCC 0.00229 TGCG 0.00174 TGCT 0.00382 TGGA 0.00399 TGGC 0.00242 TGGG 0.00225 TGGT 0.00354 TGTA 0.00433 TGTC 0.00316 TGTG 0.00386 TGTT 0.00581 TTAA 0.0112 TTAC 0.00489 TTAG 0.0049 TTAT 0.00959 TTCA 0.00786 TTCC 0.00426 TTCG 0.00322 TTCT 0.00665 TTGA 0.00742 TTGC 0.00415 TTGG 0.00434 TTGT 0.00602 TTTA 0.0116 TTTC 0.00835 TTTG 0.0083 TTTT 0.0145 # l= 4 # Values AAAAA 0.00459 AAAAC 0.00214 AAAAG 0.00246 AAAAT 0.00531 AAACA 0.00217 AAACC 0.00109 AAACG 0.00105 AAACT 0.00189 AAAGA 0.00215 AAAGC 0.00137 AAAGG 0.00136 AAAGT 0.00228 AAATA 0.00455 AAATC 0.00223 AAATG 0.00301 AAATT 0.00513 AACAA 0.00205 AACAC 0.00104 AACAG 0.00114 AACAT 0.00159 AACCA 0.00117 AACCC 0.000553 AACCG 0.000474 AACCT 0.000891 AACGA 0.000885 AACGC 0.000555 AACGG 0.000455 AACGT 0.000731 AACTA 0.0015 AACTC 0.00106 AACTG 0.00123 AACTT 0.00196 AAGAA 0.00226 AAGAC 0.000948 AAGAG 0.00127 AAGAT 0.0016 AAGCA 0.00137 AAGCC 0.000692 AAGCG 0.000572 AAGCT 0.00105 AAGGA 0.00122 AAGGC 0.000766 AAGGG 0.000698 AAGGT 0.00108 AAGTA 0.00176 AAGTC 0.00107 AAGTG 0.00145 AAGTT 0.00196 AATAA 0.00414 AATAC 0.00154 AATAG 0.00181 AATAT 0.00341 AATCA 0.00215 AATCC 0.000996 AATCG 0.000982 AATCT 0.00163 AATGA 0.00248 AATGC 0.00146 AATGG 0.00142 AATGT 0.0019 AATTA 0.00372 AATTC 0.00229 AATTG 0.00242 AATTT 0.00513 ACAAA 0.00239 ACAAC 0.000946 ACAAG 0.000966 ACAAT 0.00172 ACACA 0.00114 ACACC 0.000591 ACACG 0.000454 ACACT 0.000961 ACAGA 0.00109 ACAGC 0.000615 ACAGG 0.000514 ACAGT 0.000955 ACATA 0.00121 ACATC 0.000868 ACATG 0.000851 ACATT 0.0019 ACCAA 0.0013 ACCAC 0.000726 ACCAG 0.000553 ACCAT 0.000962 ACCCA 0.000649 ACCCC 0.00036 ACCCG 0.00021 ACCCT 0.000509 ACCGA 0.000474 ACCGC 0.000278 ACCGG 0.000208 ACCGT 0.000381 ACCTA 0.000732 ACCTC 0.000721 ACCTG 0.000527 ACCTT 0.00108 ACGAA 0.000954 ACGAC 0.000391 ACGAG 0.000454 ACGAT 0.000693 ACGCA 0.00055 ACGCC 0.00031 ACGCG 0.000242 ACGCT 0.000465 ACGGA 0.000404 ACGGC 0.000247 ACGGG 0.000187 ACGGT 0.000381 ACGTA 0.00056 ACGTC 0.000438 ACGTG 0.000485 ACGTT 0.000731 ACTAA 0.00154 ACTAC 0.000753 ACTAG 0.00068 ACTAT 0.00122 ACTCA 0.00112 ACTCC 0.000626 ACTCG 0.000463 ACTCT 0.000955 ACTGA 0.00122 ACTGC 0.000714 ACTGG 0.00062 ACTGT 0.000955 ACTTA 0.00155 ACTTC 0.0013 ACTTG 0.00112 ACTTT 0.00228 AGAAA 0.00254 AGAAC 0.000926 AGAAG 0.00135 AGAAT 0.00183 AGACA 0.00101 AGACC 0.000509 AGACG 0.000475 AGACT 0.000817 AGAGA 0.00135 AGAGC 0.000619 AGAGG 0.000853 AGAGT 0.000955 AGATA 0.00139 AGATC 0.000743 AGATG 0.00103 AGATT 0.00163 AGCAA 0.00135 AGCAC 0.000671 AGCAG 0.000724 AGCAT 0.00108 AGCCA 0.000753 AGCCC 0.000327 AGCCG 0.000236 AGCCT 0.000603 AGCGA 0.000495 AGCGC 0.000303 AGCGG 0.000272 AGCGT 0.000465 AGCTA 0.000891 AGCTC 0.000571 AGCTG 0.000616 AGCTT 0.00105 AGGAA 0.00137 AGGAC 0.000486 AGGAG 0.000803 AGGAT 0.000801 AGGCA 0.000767 AGGCC 0.000342 AGGCG 0.000348 AGGCT 0.000603 AGGGA 0.000701 AGGGC 0.000331 AGGGG 0.000475 AGGGT 0.000509 AGGTA 0.000885 AGGTC 0.00056 AGGTG 0.00073 AGGTT 0.000891 AGTAA 0.00173 AGTAC 0.000744 AGTAG 0.000938 AGTAT 0.00124 AGTCA 0.00115 AGTCC 0.000473 AGTCG 0.000444 AGTCT 0.000817 AGTGA 0.00129 AGTGC 0.000729 AGTGG 0.000857 AGTGT 0.000961 AGTTA 0.00159 AGTTC 0.00101 AGTTG 0.00124 AGTTT 0.00189 ATAAA 0.00382 ATAAC 0.00135 ATAAG 0.00152 ATAAT 0.00289 ATACA 0.00128 ATACC 0.000717 ATACG 0.000598 ATACT 0.00124 ATAGA 0.00139 ATAGC 0.000838 ATAGG 0.000802 ATAGT 0.00122 ATATA 0.00245 ATATC 0.00142 ATATG 0.00151 ATATT 0.00341 ATCAA 0.00208 ATCAC 0.00102 ATCAG 0.00104 ATCAT 0.00156 ATCCA 0.00103 ATCCC 0.000503 ATCCG 0.000392 ATCCT 0.000801 ATCGA 0.000968 ATCGC 0.00046 ATCGG 0.000435 ATCGT 0.000693 ATCTA 0.00119 ATCTC 0.00102 ATCTG 0.000974 ATCTT 0.0016 ATGAA 0.00235 ATGAC 0.00107 ATGAG 0.00111 ATGAT 0.00156 ATGCA 0.00133 ATGCC 0.000665 ATGCG 0.000546 ATGCT 0.00108 ATGGA 0.00117 ATGGC 0.000731 ATGGG 0.000659 ATGGT 0.000962 ATGTA 0.00128 ATGTC 0.000893 ATGTG 0.00107 ATGTT 0.00159 ATTAA 0.0036 ATTAC 0.00149 ATTAG 0.00162 ATTAT 0.00289 ATTCA 0.00233 ATTCC 0.00117 ATTCG 0.00101 ATTCT 0.00183 ATTGA 0.00224 ATTGC 0.00125 ATTGG 0.00141 ATTGT 0.00172 ATTTA 0.004 ATTTC 0.00281 ATTTG 0.00279 ATTTT 0.00531 CAAAA 0.00285 CAAAC 0.00126 CAAAG 0.00139 CAAAT 0.00279 CAACA 0.00112 CAACC 0.000662 CAACG 0.000496 CAACT 0.00124 CAAGA 0.00108 CAAGC 0.000645 CAAGG 0.000671 CAAGT 0.00112 CAATA 0.00184 CAATC 0.00113 CAATG 0.00121 CAATT 0.00242 CACAA 0.00132 CACAC 0.000783 CACAG 0.00068 CACAT 0.00107 CACCA 0.000798 CACCC 0.000458 CACCG 0.000288 CACCT 0.00073 CACGA 0.000498 CACGC 0.000337 CACGG 0.000232 CACGT 0.000485 CACTA 0.000854 CACTC 0.000772 CACTG 0.000758 CACTT 0.00145 CAGAA 0.0013 CAGAC 0.000597 CAGAG 0.000699 CAGAT 0.000974 CAGCA 0.000726 CAGCC 0.000401 CAGCG 0.000278 CAGCT 0.000616 CAGGA 0.000567 CAGGC 0.000364 CAGGG 0.000299 CAGGT 0.000527 CAGTA 0.000905 CAGTC 0.000618 CAGTG 0.000758 CAGTT 0.00123 CATAA 0.00155 CATAC 0.000716 CATAG 0.000703 CATAT 0.00151 CATCA 0.00109 CATCC 0.000567 CATCG 0.000475 CATCT 0.00103 CATGA 0.00104 CATGC 0.000655 CATGG 0.000619 CATGT 0.000851 CATTA 0.00173 CATTC 0.00131 CATTG 0.00121 CATTT 0.00301 CCAAA 0.00153 CCAAC 0.00074 CCAAG 0.000664 CCAAT 0.00141 CCACA 0.000754 CCACC 0.000545 CCACG 0.000319 CCACT 0.000857 CCAGA 0.000611 CCAGC 0.000334 CCAGG 0.000308 CCAGT 0.00062 CCATA 0.000834 CCATC 0.000652 CCATG 0.000619 CCATT 0.00142 CCCAA 0.000756 CCCAC 0.000494 CCCAG 0.000346 CCCAT 0.000659 CCCCA 0.000451 CCCCC 0.000546 CCCCG 0.000126 CCCCT 0.000475 CCCGA 0.000256 CCCGC 0.000136 CCCGG 9.77e-05 CCCGT 0.000187 CCCTA 0.000445 CCCTC 0.000574 CCCTG 0.000299 CCCTT 0.000698 CCGAA 0.00055 CCGAC 0.000242 CCGAG 0.000241 CCGAT 0.000435 CCGCA 0.000286 CCGCC 0.000196 CCGCG 0.000108 CCGCT 0.000272 CCGGA 0.000205 CCGGC 0.000113 CCGGG 9.77e-05 CCGGT 0.000208 CCGTA 0.0003 CCGTC 0.000233 CCGTG 0.000232 CCGTT 0.000455 CCTAA 0.000836 CCTAC 0.000484 CCTAG 0.000391 CCTAT 0.000802 CCTCA 0.000753 CCTCC 0.000656 CCTCG 0.000302 CCTCT 0.000853 CCTGA 0.000577 CCTGC 0.000358 CCTGG 0.000308 CCTGT 0.000514 CCTTA 0.000878 CCTTC 0.00086 CCTTG 0.000671 CCTTT 0.00136 CGAAA 0.00118 CGAAC 0.000445 CGAAG 0.000596 CGAAT 0.00101 CGACA 0.000435 CGACC 0.000265 CGACG 0.000202 CGACT 0.000444 CGAGA 0.00049 CGAGC 0.000246 CGAGG 0.000302 CGAGT 0.000463 CGATA 0.000692 CGATC 0.000407 CGATG 0.000475 CGATT 0.000982 CGCAA 0.000538 CGCAC 0.00037 CGCAG 0.000287 CGCAT 0.000546 CGCCA 0.000368 CGCCC 0.000172 CGCCG 0.000124 CGCCT 0.000348 CGCGA 0.000216 CGCGC 0.000166 CGCGG 0.000108 CGCGT 0.000242 CGCTA 0.00038 CGCTC 0.000305 CGCTG 0.000278 CGCTT 0.000572 CGGAA 0.000495 CGGAC 0.000196 CGGAG 0.000276 CGGAT 0.000392 CGGCA 0.000283 CGGCC 0.000153 CGGCG 0.000124 CGGCT 0.000236 CGGGA 0.000218 CGGGC 0.000123 CGGGG 0.000126 CGGGT 0.00021 CGGTA 0.000339 CGGTC 0.000239 CGGTG 0.000288 CGGTT 0.000474 CGTAA 0.000643 CGTAC 0.000316 CGTAG 0.00034 CGTAT 0.000598 CGTCA 0.000499 CGTCC 0.00024 CGTCG 0.000202 CGTCT 0.000475 CGTGA 0.000481 CGTGC 0.000298 CGTGG 0.000319 CGTGT 0.000454 CGTTA 0.000626 CGTTC 0.000455 CGTTG 0.000496 CGTTT 0.00105 CTAAA 0.00169 CTAAC 0.00081 CTAAG 0.000775 CTAAT 0.00162 CTACA 0.000759 CTACC 0.00056 CTACG 0.00034 CTACT 0.000938 CTAGA 0.000698 CTAGC 0.000412 CTAGG 0.000391 CTAGT 0.00068 CTATA 0.000945 CTATC 0.000787 CTATG 0.000703 CTATT 0.00181 CTCAA 0.0013 CTCAC 0.000712 CTCAG 0.00065 CTCAT 0.00111 CTCCA 0.00084 CTCCC 0.000607 CTCCG 0.000276 CTCCT 0.000803 CTCGA 0.000537 CTCGC 0.00027 CTCGG 0.000241 CTCGT 0.000454 CTCTA 0.000877 CTCTC 0.000927 CTCTG 0.000699 CTCTT 0.00127 CTGAA 0.0013 CTGAC 0.00061 CTGAG 0.00065 CTGAT 0.00104 CTGCA 0.000742 CTGCC 0.000459 CTGCG 0.000287 CTGCT 0.000724 CTGGA 0.000618 CTGGC 0.000357 CTGGG 0.000346 CTGGT 0.000553 CTGTA 0.000721 CTGTC 0.000629 CTGTG 0.00068 CTGTT 0.00114 CTTAA 0.00172 CTTAC 0.000814 CTTAG 0.000775 CTTAT 0.00152 CTTCA 0.00144 CTTCC 0.000894 CTTCG 0.000596 CTTCT 0.00135 CTTGA 0.00124 CTTGC 0.000648 CTTGG 0.000664 CTTGT 0.000966 CTTTA 0.00182 CTTTC 0.00148 CTTTG 0.00139 CTTTT 0.00246 GAAAA 0.00292 GAAAC 0.00113 GAAAG 0.00148 GAAAT 0.00281 GAACA 0.00108 GAACC 0.000486 GAACG 0.000455 GAACT 0.00101 GAAGA 0.00142 GAAGC 0.000703 GAAGG 0.00086 GAAGT 0.0013 GAATA 0.00185 GAATC 0.00089 GAATG 0.00131 GAATT 0.00229 GACAA 0.00111 GACAC 0.000534 GACAG 0.000629 GACAT 0.000893 GACCA 0.000632 GACCC 0.000266 GACCG 0.000239 GACCT 0.00056 GACGA 0.000477 GACGC 0.000268 GACGG 0.000233 GACGT 0.000438 GACTA 0.000723 GACTC 0.000475 GACTG 0.000618 GACTT 0.00107 GAGAA 0.00144 GAGAC 0.000548 GAGAG 0.000927 GAGAT 0.00102 GAGCA 0.000738 GAGCC 0.000305 GAGCG 0.000305 GAGCT 0.000571 GAGGA 0.000854 GAGGC 0.000414 GAGGG 0.000574 GAGGT 0.000721 GAGTA 0.000854 GAGTC 0.000475 GAGTG 0.000772 GAGTT 0.00106 GATAA 0.00159 GATAC 0.000609 GATAG 0.000787 GATAT 0.00142 GATCA 0.000925 GATCC 0.000379 GATCG 0.000407 GATCT 0.000743 GATGA 0.00109 GATGC 0.00055 GATGG 0.000652 GATGT 0.000868 GATTA 0.0015 GATTC 0.00089 GATTG 0.00113 GATTT 0.00223 GCAAA 0.00163 GCAAC 0.000623 GCAAG 0.000648 GCAAT 0.00125 GCACA 0.000774 GCACC 0.000376 GCACG 0.000298 GCACT 0.000729 GCAGA 0.000756 GCAGC 0.000384 GCAGG 0.000358 GCAGT 0.000714 GCATA 0.000954 GCATC 0.00055 GCATG 0.000655 GCATT 0.00146 GCCAA 0.000911 GCCAC 0.000426 GCCAG 0.000357 GCCAT 0.000731 GCCCA 0.000387 GCCCC 0.000175 GCCCG 0.000123 GCCCT 0.000331 GCCGA 0.000282 GCCGC 0.000155 GCCGG 0.000113 GCCGT 0.000247 GCCTA 0.000517 GCCTC 0.000414 GCCTG 0.000364 GCCTT 0.000766 GCGAA 0.000606 GCGAC 0.000232 GCGAG 0.00027 GCGAT 0.00046 GCGCA 0.000379 GCGCC 0.000175 GCGCG 0.000166 GCGCT 0.000303 GCGGA 0.000294 GCGGC 0.000155 GCGGG 0.000136 GCGGT 0.000278 GCGTA 0.000407 GCGTC 0.000268 GCGTG 0.000337 GCGTT 0.000555 GCTAA 0.00101 GCTAC 0.000517 GCTAG 0.000412 GCTAT 0.000838 GCTCA 0.000688 GCTCC 0.000366 GCTCG 0.000246 GCTCT 0.000619 GCTGA 0.000689 GCTGC 0.000384 GCTGG 0.000334 GCTGT 0.000615 GCTTA 0.000972 GCTTC 0.000703 GCTTG 0.000645 GCTTT 0.00137 GGAAA 0.00165 GGAAC 0.000545 GGAAG 0.000894 GGAAT 0.00117 GGACA 0.00057 GGACC 0.000218 GGACG 0.00024 GGACT 0.000473 GGAGA 0.000878 GGAGC 0.000366 GGAGG 0.000656 GGAGT 0.000626 GGATA 0.000784 GGATC 0.000379 GGATG 0.000567 GGATT 0.000996 GGCAA 0.000817 GGCAC 0.000348 GGCAG 0.000459 GGCAT 0.000665 GGCCA 0.000442 GGCCC 0.000142 GGCCG 0.000153 GGCCT 0.000342 GGCGA 0.000331 GGCGC 0.000175 GGCGG 0.000196 GGCGT 0.00031 GGCTA 0.000521 GGCTC 0.000305 GGCTG 0.000401 GGCTT 0.000692 GGGAA 0.000827 GGGAC 0.000266 GGGAG 0.000607 GGGAT 0.000503 GGGCA 0.000376 GGGCC 0.000142 GGGCG 0.000172 GGGCT 0.000327 GGGGA 0.000516 GGGGC 0.000175 GGGGG 0.000546 GGGGT 0.00036 GGGTA 0.000451 GGGTC 0.000266 GGGTG 0.000458 GGGTT 0.000553 GGTAA 0.000966 GGTAC 0.000372 GGTAG 0.00056 GGTAT 0.000717 GGTCA 0.000706 GGTCC 0.000218 GGTCG 0.000265 GGTCT 0.000509 GGTGA 0.000761 GGTGC 0.000376 GGTGG 0.000545 GGTGT 0.000591 GGTTA 0.000848 GGTTC 0.000486 GGTTG 0.000662 GGTTT 0.00109 GTAAA 0.00191 GTAAC 0.000676 GTAAG 0.000814 GTAAT 0.00149 GTACA 0.000741 GTACC 0.000372 GTACG 0.000316 GTACT 0.000744 GTAGA 0.000842 GTAGC 0.000517 GTAGG 0.000484 GTAGT 0.000753 GTATA 0.000964 GTATC 0.000609 GTATG 0.000716 GTATT 0.00154 GTCAA 0.00123 GTCAC 0.000594 GTCAG 0.00061 GTCAT 0.00107 GTCCA 0.000553 GTCCC 0.000266 GTCCG 0.000196 GTCCT 0.000486 GTCGA 0.00048 GTCGC 0.000232 GTCGG 0.000242 GTCGT 0.000391 GTCTA 0.000718 GTCTC 0.000548 GTCTG 0.000597 GTCTT 0.000948 GTGAA 0.00139 GTGAC 0.000594 GTGAG 0.000712 GTGAT 0.00102 GTGCA 0.000788 GTGCC 0.000348 GTGCG 0.00037 GTGCT 0.000671 GTGGA 0.000829 GTGGC 0.000426 GTGGG 0.000494 GTGGT 0.000726 GTGTA 0.000786 GTGTC 0.000534 GTGTG 0.000783 GTGTT 0.00104 GTTAA 0.00168 GTTAC 0.000676 GTTAG 0.00081 GTTAT 0.00135 GTTCA 0.00112 GTTCC 0.000545 GTTCG 0.000445 GTTCT 0.000926 GTTGA 0.0012 GTTGC 0.000623 GTTGG 0.00074 GTTGT 0.000946 GTTTA 0.00167 GTTTC 0.00113 GTTTG 0.00126 GTTTT 0.00214 TAAAA 0.00414 TAAAC 0.00167 TAAAG 0.00182 TAAAT 0.004 TAACA 0.00145 TAACC 0.000848 TAACG 0.000626 TAACT 0.00159 TAAGA 0.00144 TAAGC 0.000972 TAAGG 0.000878 TAAGT 0.00155 TAATA 0.00266 TAATC 0.0015 TAATG 0.00173 TAATT 0.00372 TACAA 0.00154 TACAC 0.000786 TACAG 0.000721 TACAT 0.00128 TACCA 0.000941 TACCC 0.000451 TACCG 0.000339 TACCT 0.000885 TACGA 0.00063 TACGC 0.000407 TACGG 0.0003 TACGT 0.00056 TACTA 0.00112 TACTC 0.000854 TACTG 0.000905 TACTT 0.00176 TAGAA 0.00164 TAGAC 0.000718 TAGAG 0.000877 TAGAT 0.00119 TAGCA 0.000989 TAGCC 0.000521 TAGCG 0.00038 TAGCT 0.000891 TAGGA 0.00082 TAGGC 0.000517 TAGGG 0.000445 TAGGT 0.000732 TAGTA 0.00112 TAGTC 0.000723 TAGTG 0.000854 TAGTT 0.0015 TATAA 0.00229 TATAC 0.000964 TATAG 0.000945 TATAT 0.00245 TATCA 0.00155 TATCC 0.000784 TATCG 0.000692 TATCT 0.00139 TATGA 0.00149 TATGC 0.000954 TATGG 0.000834 TATGT 0.00121 TATTA 0.00266 TATTC 0.00185 TATTG 0.00184 TATTT 0.00455 TCAAA 0.00275 TCAAC 0.0012 TCAAG 0.00124 TCAAT 0.00224 TCACA 0.00119 TCACC 0.000761 TCACG 0.000481 TCACT 0.00129 TCAGA 0.00112 TCAGC 0.000689 TCAGG 0.000577 TCAGT 0.00122 TCATA 0.00149 TCATC 0.00109 TCATG 0.00104 TCATT 0.00248 TCCAA 0.00136 TCCAC 0.000829 TCCAG 0.000618 TCCAT 0.00117 TCCCA 0.000768 TCCCC 0.000516 TCCCG 0.000218 TCCCT 0.000701 TCCGA 0.000457 TCCGC 0.000294 TCCGG 0.000205 TCCGT 0.000404 TCCTA 0.00082 TCCTC 0.000854 TCCTG 0.000567 TCCTT 0.00122 TCGAA 0.00111 TCGAC 0.00048 TCGAG 0.000537 TCGAT 0.000968 TCGCA 0.000526 TCGCC 0.000331 TCGCG 0.000216 TCGCT 0.000495 TCGGA 0.000457 TCGGC 0.000282 TCGGG 0.000256 TCGGT 0.000474 TCGTA 0.00063 TCGTC 0.000477 TCGTG 0.000498 TCGTT 0.000885 TCTAA 0.00151 TCTAC 0.000842 TCTAG 0.000698 TCTAT 0.00139 TCTCA 0.00122 TCTCC 0.000878 TCTCG 0.00049 TCTCT 0.00135 TCTGA 0.00112 TCTGC 0.000756 TCTGG 0.000611 TCTGT 0.00109 TCTTA 0.00144 TCTTC 0.00142 TCTTG 0.00108 TCTTT 0.00215 TGAAA 0.00298 TGAAC 0.00112 TGAAG 0.00144 TGAAT 0.00233 TGACA 0.00115 TGACC 0.000706 TGACG 0.000499 TGACT 0.00115 TGAGA 0.00122 TGAGC 0.000688 TGAGG 0.000753 TGAGT 0.00112 TGATA 0.00155 TGATC 0.000925 TGATG 0.00109 TGATT 0.00215 TGCAA 0.00145 TGCAC 0.000788 TGCAG 0.000742 TGCAT 0.00133 TGCCA 0.000862 TGCCC 0.000376 TGCCG 0.000283 TGCCT 0.000767 TGCGA 0.000526 TGCGC 0.000379 TGCGG 0.000286 TGCGT 0.00055 TGCTA 0.000989 TGCTC 0.000738 TGCTG 0.000726 TGCTT 0.00137 TGGAA 0.00156 TGGAC 0.000553 TGGAG 0.00084 TGGAT 0.00103 TGGCA 0.000862 TGGCC 0.000442 TGGCG 0.000368 TGGCT 0.000753 TGGGA 0.000768 TGGGC 0.000387 TGGGG 0.000451 TGGGT 0.000649 TGGTA 0.000941 TGGTC 0.000632 TGGTG 0.000798 TGGTT 0.00117 TGTAA 0.00155 TGTAC 0.000741 TGTAG 0.000759 TGTAT 0.00128 TGTCA 0.00115 TGTCC 0.00057 TGTCG 0.000435 TGTCT 0.00101 TGTGA 0.00119 TGTGC 0.000774 TGTGG 0.000754 TGTGT 0.00114 TGTTA 0.00145 TGTTC 0.00108 TGTTG 0.00112 TGTTT 0.00217 TTAAA 0.00423 TTAAC 0.00168 TTAAG 0.00172 TTAAT 0.0036 TTACA 0.00155 TTACC 0.000966 TTACG 0.000643 TTACT 0.00173 TTAGA 0.00151 TTAGC 0.00101 TTAGG 0.000836 TTAGT 0.00154 TTATA 0.00229 TTATC 0.00159 TTATG 0.00155 TTATT 0.00414 TTCAA 0.00281 TTCAC 0.00139 TTCAG 0.0013 TTCAT 0.00235 TTCCA 0.00156 TTCCC 0.000827 TTCCG 0.000495 TTCCT 0.00137 TTCGA 0.00111 TTCGC 0.000606 TTCGG 0.00055 TTCGT 0.000954 TTCTA 0.00164 TTCTC 0.00144 TTCTG 0.0013 TTCTT 0.00226 TTGAA 0.00281 TTGAC 0.00123 TTGAG 0.0013 TTGAT 0.00208 TTGCA 0.00145 TTGCC 0.000817 TTGCG 0.000538 TTGCT 0.00135 TTGGA 0.00136 TTGGC 0.000911 TTGGG 0.000756 TTGGT 0.0013 TTGTA 0.00154 TTGTC 0.00111 TTGTG 0.00132 TTGTT 0.00205 TTTAA 0.00423 TTTAC 0.00191 TTTAG 0.00169 TTTAT 0.00382 TTTCA 0.00298 TTTCC 0.00165 TTTCG 0.00118 TTTCT 0.00254 TTTGA 0.00275 TTTGC 0.00163 TTTGG 0.00153 TTTGT 0.00239 TTTTA 0.00414 TTTTC 0.00292 TTTTG 0.00285 TTTTT 0.00459 [EMISSION] # Vector size (4^(k+1)) 1024 # Probabilities AAAAA 0.3174 AAAAC 0.1463 AAAAG 0.1682 AAAAT 0.3681 AAACA 0.3503 AAACC 0.175 AAACG 0.1682 AAACT 0.3064 AAAGA 0.3008 AAAGC 0.1907 AAAGG 0.189 AAAGT 0.3194 AAATA 0.3062 AAATC 0.1488 AAATG 0.2003 AAATT 0.3447 AACAA 0.3533 AACAC 0.177 AACAG 0.1949 AACAT 0.2748 AACCA 0.3815 AACCC 0.1771 AACCG 0.1526 AACCT 0.2889 AACGA 0.3374 AACGC 0.2106 AACGG 0.1727 AACGT 0.2794 AACTA 0.2617 AACTC 0.1828 AACTG 0.213 AACTT 0.3426 AAGAA 0.3735 AAGAC 0.1552 AAGAG 0.2069 AAGAT 0.2645 AAGCA 0.3723 AAGCC 0.1865 AAGCG 0.1546 AAGCT 0.2865 AAGGA 0.3249 AAGGC 0.2033 AAGGG 0.1833 AAGGT 0.2886 AAGTA 0.284 AAGTC 0.1705 AAGTG 0.2311 AAGTT 0.3144 AATAA 0.3809 AATAC 0.1401 AATAG 0.1641 AATAT 0.3148 AATCA 0.3743 AATCC 0.1719 AATCG 0.1697 AATCT 0.2841 AATGA 0.3422 AATGC 0.2009 AATGG 0.1943 AATGT 0.2625 AATTA 0.2751 AATTC 0.1681 AATTG 0.1773 AATTT 0.3795 ACAAA 0.3992 ACAAC 0.1557 ACAAG 0.1586 ACAAT 0.2864 ACACA 0.3618 ACACC 0.1866 ACACG 0.1436 ACACT 0.3081 ACAGA 0.3431 ACAGC 0.1941 ACAGG 0.1611 ACAGT 0.3018 ACATA 0.2514 ACATC 0.1778 ACATG 0.175 ACATT 0.3958 ACCAA 0.3679 ACCAC 0.2033 ACCAG 0.1559 ACCAT 0.273 ACCCA 0.3773 ACCCC 0.2058 ACCCG 0.1212 ACCCT 0.2958 ACCGA 0.3535 ACCGC 0.2065 ACCGG 0.1541 ACCGT 0.286 ACCTA 0.2404 ACCTC 0.2324 ACCTG 0.1717 ACCTT 0.3555 ACGAA 0.3849 ACGAC 0.1558 ACGAG 0.1799 ACGAT 0.2794 ACGCA 0.3524 ACGCC 0.1968 ACGCG 0.1537 ACGCT 0.2972 ACGGA 0.3327 ACGGC 0.2002 ACGGG 0.1535 ACGGT 0.3136 ACGTA 0.2543 ACGTC 0.1967 ACGTG 0.2174 ACGTT 0.3316 ACTAA 0.3696 ACTAC 0.178 ACTAG 0.1609 ACTAT 0.2915 ACTCA 0.3546 ACTCC 0.1965 ACTCG 0.1451 ACTCT 0.3038 ACTGA 0.3492 ACTGC 0.2023 ACTGG 0.1758 ACTGT 0.2726 ACTTA 0.2496 ACTTC 0.2056 ACTTG 0.1777 ACTTT 0.367 AGAAA 0.3835 AGAAC 0.1386 AGAAG 0.2014 AGAAT 0.2765 AGACA 0.3596 AGACC 0.1806 AGACG 0.1677 AGACT 0.292 AGAGA 0.357 AGAGC 0.1648 AGAGG 0.2237 AGAGT 0.2545 AGATA 0.2909 AGATC 0.1542 AGATG 0.213 AGATT 0.3418 AGCAA 0.3547 AGCAC 0.1741 AGCAG 0.1876 AGCAT 0.2836 AGCCA 0.393 AGCCC 0.1696 AGCCG 0.1223 AGCCT 0.3152 AGCGA 0.3241 AGCGC 0.1965 AGCGG 0.1763 AGCGT 0.3031 AGCTA 0.2842 AGCTC 0.1814 AGCTG 0.1957 AGCTT 0.3387 AGGAA 0.3997 AGGAC 0.1398 AGGAG 0.2282 AGGAT 0.2323 AGGCA 0.3735 AGGCC 0.1654 AGGCG 0.1677 AGGCT 0.2933 AGGGA 0.3493 AGGGC 0.1651 AGGGG 0.2323 AGGGT 0.2533 AGGTA 0.29 AGGTC 0.1825 AGGTG 0.2363 AGGTT 0.2913 AGTAA 0.3739 AGTAC 0.1592 AGTAG 0.1996 AGTAT 0.2673 AGTCA 0.4007 AGTCC 0.1625 AGTCG 0.1531 AGTCT 0.2837 AGTGA 0.3369 AGTGC 0.1898 AGTGG 0.2218 AGTGT 0.2515 AGTTA 0.2794 AGTTC 0.1758 AGTTG 0.2127 AGTTT 0.332 ATAAA 0.3993 ATAAC 0.1401 ATAAG 0.1579 ATAAT 0.3027 ATACA 0.3345 ATACC 0.1865 ATACG 0.1554 ATACT 0.3236 ATAGA 0.3279 ATAGC 0.1967 ATAGG 0.1876 ATAGT 0.2879 ATATA 0.2799 ATATC 0.1599 ATATG 0.1707 ATATT 0.3896 ATCAA 0.366 ATCAC 0.1785 ATCAG 0.1817 ATCAT 0.2737 ATCCA 0.3788 ATCCC 0.1835 ATCCG 0.1433 ATCCT 0.2944 ATCGA 0.3791 ATCGC 0.1797 ATCGG 0.1693 ATCGT 0.2719 ATCTA 0.2508 ATCTC 0.2112 ATCTG 0.2022 ATCTT 0.3358 ATGAA 0.3877 ATGAC 0.1752 ATGAG 0.1809 ATGAT 0.2562 ATGCA 0.3691 ATGCC 0.1832 ATGCG 0.1493 ATGCT 0.2984 ATGGA 0.3348 ATGGC 0.2061 ATGGG 0.1855 ATGGT 0.2736 ATGTA 0.2658 ATGTC 0.1842 ATGTG 0.2194 ATGTT 0.3306 ATTAA 0.3764 ATTAC 0.1536 ATTAG 0.1674 ATTAT 0.3025 ATTCA 0.3689 ATTCC 0.1845 ATTCG 0.1575 ATTCT 0.2891 ATTGA 0.3403 ATTGC 0.189 ATTGG 0.2107 ATTGT 0.26 ATTTA 0.2697 ATTTC 0.1869 ATTTG 0.186 ATTTT 0.3574 CAAAA 0.3446 CAAAC 0.1506 CAAAG 0.167 CAAAT 0.3378 CAACA 0.3195 CAACC 0.1874 CAACG 0.1409 CAACT 0.3522 CAAGA 0.3076 CAAGC 0.1835 CAAGG 0.19 CAAGT 0.3189 CAATA 0.2794 CAATC 0.1699 CAATG 0.1829 CAATT 0.3678 CACAA 0.3446 CACAC 0.201 CACAG 0.176 CACAT 0.2784 CACCA 0.3516 CACCC 0.1993 CACCG 0.1266 CACCT 0.3225 CACGA 0.3215 CACGC 0.216 CACGG 0.1492 CACGT 0.3133 CACTA 0.2239 CACTC 0.199 CACTG 0.1968 CACTT 0.3803 CAGAA 0.3659 CAGAC 0.1655 CAGAG 0.1953 CAGAT 0.2733 CAGCA 0.3605 CAGCC 0.1975 CAGCG 0.1367 CAGCT 0.3053 CAGGA 0.3234 CAGGC 0.2063 CAGGG 0.1693 CAGGT 0.301 CAGTA 0.258 CAGTC 0.1756 CAGTG 0.2149 CAGTT 0.3514 CATAA 0.348 CATAC 0.1583 CATAG 0.1554 CATAT 0.3383 CATCA 0.3459 CATCC 0.1777 CATCG 0.1496 CATCT 0.3268 CATGA 0.3291 CATGC 0.2068 CATGG 0.1952 CATGT 0.2689 CATTA 0.239 CATTC 0.1781 CATTG 0.1665 CATTT 0.4163 CCAAA 0.3542 CCAAC 0.1686 CCAAG 0.1524 CCAAT 0.3248 CCACA 0.3058 CCACC 0.2178 CCACG 0.1285 CCACT 0.3478 CCAGA 0.3274 CCAGC 0.177 CCAGG 0.1636 CCAGT 0.3319 CCATA 0.2377 CCATC 0.1833 CCATG 0.1751 CCATT 0.4039 CCCAA 0.337 CCCAC 0.2163 CCCAG 0.1529 CCCAT 0.2938 CCCCA 0.2846 CCCCC 0.3371 CCCCG 0.07959 CCCCT 0.2987 CCCGA 0.3779 CCCGC 0.1998 CCCGG 0.1425 CCCGT 0.2798 CCCTA 0.2217 CCCTC 0.2822 CCCTG 0.1486 CCCTT 0.3475 CCGAA 0.376 CCGAC 0.164 CCGAG 0.1626 CCGAT 0.2975 CCGCA 0.3319 CCGCC 0.2264 CCGCG 0.1243 CCGCT 0.3174 CCGGA 0.3304 CCGGC 0.1801 CCGGG 0.1548 CCGGT 0.3347 CCGTA 0.2471 CCGTC 0.1889 CCGTG 0.1893 CCGTT 0.3747 CCTAA 0.3348 CCTAC 0.1915 CCTAG 0.1541 CCTAT 0.3196 CCTCA 0.2966 CCTCC 0.2522 CCTCG 0.1178 CCTCT 0.3333 CCTGA 0.3302 CCTGC 0.2033 CCTGG 0.1741 CCTGT 0.2924 CCTTA 0.2343 CCTTC 0.2254 CCTTG 0.1771 CCTTT 0.3632 CGAAA 0.3673 CGAAC 0.1371 CGAAG 0.1831 CGAAT 0.3125 CGACA 0.3233 CGACC 0.1962 CGACG 0.1489 CGACT 0.3316 CGAGA 0.3273 CGAGC 0.1647 CGAGG 0.2003 CGAGT 0.3078 CGATA 0.2708 CGATC 0.1592 CGATG 0.1843 CGATT 0.3858 CGCAA 0.3117 CGCAC 0.2104 CGCAG 0.1632 CGCAT 0.3147 CGCCA 0.3648 CGCCC 0.169 CGCCG 0.1216 CGCCT 0.3445 CGCGA 0.2963 CGCGC 0.2229 CGCGG 0.147 CGCGT 0.3338 CGCTA 0.2481 CGCTC 0.1966 CGCTG 0.18 CGCTT 0.3754 CGGAA 0.3658 CGGAC 0.1427 CGGAG 0.2023 CGGAT 0.2891 CGGCA 0.3566 CGGCC 0.191 CGGCG 0.1548 CGGCT 0.2976 CGGGA 0.3235 CGGGC 0.1813 CGGGG 0.185 CGGGT 0.3102 CGGTA 0.2554 CGGTC 0.1774 CGGTG 0.2134 CGGTT 0.3538 CGTAA 0.3408 CGTAC 0.1643 CGTAG 0.1789 CGTAT 0.316 CGTCA 0.3553 CGTCC 0.1679 CGTCG 0.1415 CGTCT 0.3353 CGTGA 0.3124 CGTGC 0.1917 CGTGG 0.2042 CGTGT 0.2918 CGTTA 0.2395 CGTTC 0.1727 CGTTG 0.1871 CGTTT 0.4008 CTAAA 0.347 CTAAC 0.1643 CTAAG 0.157 CTAAT 0.3317 CTACA 0.2921 CTACC 0.2142 CTACG 0.1318 CTACT 0.3619 CTAGA 0.3212 CTAGC 0.1881 CTAGG 0.178 CTAGT 0.3127 CTATA 0.2241 CTATC 0.1846 CTATG 0.1647 CTATT 0.4266 CTCAA 0.3461 CTCAC 0.1865 CTCAG 0.1717 CTCAT 0.2957 CTCCA 0.3349 CTCCC 0.2375 CTCCG 0.1101 CTCCT 0.3175 CTCGA 0.3605 CTCGC 0.1786 CTCGG 0.1593 CTCGT 0.3015 CTCTA 0.2335 CTCTC 0.2434 CTCTG 0.1856 CTCTT 0.3374 CTGAA 0.3638 CTGAC 0.1677 CTGAG 0.1789 CTGAT 0.2897 CTGCA 0.3379 CTGCC 0.2066 CTGCG 0.1284 CTGCT 0.3272 CTGGA 0.3294 CTGGC 0.1898 CTGGG 0.1836 CTGGT 0.2972 CTGTA 0.2289 CTGTC 0.1971 CTGTG 0.2133 CTGTT 0.3607 CTTAA 0.3567 CTTAC 0.1677 CTTAG 0.159 CTTAT 0.3166 CTTCA 0.3378 CTTCC 0.2081 CTTCG 0.1383 CTTCT 0.3157 CTTGA 0.3541 CTTGC 0.184 CTTGG 0.188 CTTGT 0.2739 CTTTA 0.2564 CTTTC 0.2057 CTTTG 0.1938 CTTTT 0.3441 GAAAA 0.3508 GAAAC 0.1349 GAAAG 0.1765 GAAAT 0.3378 GAACA 0.3562 GAACC 0.159 GAACG 0.1497 GAACT 0.3352 GAAGA 0.3327 GAAGC 0.1652 GAAGG 0.1988 GAAGT 0.3032 GAATA 0.2927 GAATC 0.1393 GAATG 0.2042 GAATT 0.3638 GACAA 0.3515 GACAC 0.1675 GACAG 0.1973 GACAT 0.2837 GACCA 0.3735 GACCC 0.1554 GACCG 0.1399 GACCT 0.3311 GACGA 0.3369 GACGC 0.1892 GACGG 0.1633 GACGT 0.3107 GACTA 0.2514 GACTC 0.1632 GACTG 0.2132 GACTT 0.3722 GAGAA 0.3669 GAGAC 0.1384 GAGAG 0.2339 GAGAT 0.2608 GAGCA 0.3856 GAGCC 0.1584 GAGCG 0.1576 GAGCT 0.2985 GAGGA 0.3341 GAGGC 0.1617 GAGGG 0.2223 GAGGT 0.2818 GAGTA 0.2726 GAGTC 0.1497 GAGTG 0.2419 GAGTT 0.3358 GATAA 0.3628 GATAC 0.1373 GATAG 0.1773 GATAT 0.3226 GATCA 0.3766 GATCC 0.1539 GATCG 0.1659 GATCT 0.3036 GATGA 0.3451 GATGC 0.1744 GATGG 0.2056 GATGT 0.2749 GATTA 0.2608 GATTC 0.1535 GATTG 0.1952 GATTT 0.3905 GCAAA 0.3949 GCAAC 0.1482 GCAAG 0.1547 GCAAT 0.3022 GCACA 0.3553 GCACC 0.1722 GCACG 0.1363 GCACT 0.3362 GCAGA 0.3429 GCAGC 0.1732 GCAGG 0.1613 GCAGT 0.3226 GCATA 0.2643 GCATC 0.1508 GCATG 0.1799 GCATT 0.405 GCCAA 0.3784 GCCAC 0.174 GCCAG 0.146 GCCAT 0.3016 GCCCA 0.3829 GCCCC 0.1707 GCCCG 0.1199 GCCCT 0.3265 GCCGA 0.3552 GCCGC 0.1944 GCCGG 0.1406 GCCGT 0.3098 GCCTA 0.2515 GCCTC 0.1991 GCCTG 0.1756 GCCTT 0.3738 GCGAA 0.388 GCGAC 0.1468 GCGAG 0.1702 GCGAT 0.295 GCGCA 0.3711 GCGCC 0.1714 GCGCG 0.159 GCGCT 0.2985 GCGGA 0.3405 GCGGC 0.1795 GCGGG 0.1566 GCGGT 0.3235 GCGTA 0.2612 GCGTC 0.1703 GCGTG 0.2131 GCGTT 0.3554 GCTAA 0.3654 GCTAC 0.1842 GCTAG 0.1474 GCTAT 0.3031 GCTCA 0.3577 GCTCC 0.1892 GCTCG 0.1282 GCTCT 0.3249 GCTGA 0.3419 GCTGC 0.1893 GCTGG 0.1634 GCTGT 0.3055 GCTTA 0.2637 GCTTC 0.1903 GCTTG 0.1737 GCTTT 0.3723 GGAAA 0.3881 GGAAC 0.1267 GGAAG 0.2083 GGAAT 0.2769 GGACA 0.3809 GGACC 0.145 GGACG 0.1585 GGACT 0.3156 GGAGA 0.3491 GGAGC 0.1453 GGAGG 0.2563 GGAGT 0.2492 GGATA 0.2893 GGATC 0.1386 GGATG 0.2053 GGATT 0.3668 GGCAA 0.3582 GGCAC 0.1505 GGCAG 0.199 GGCAT 0.2924 GGCCA 0.4097 GGCCC 0.1317 GGCCG 0.1405 GGCCT 0.3182 GGCGA 0.3272 GGCGC 0.1728 GGCGG 0.1926 GGCGT 0.3074 GGCTA 0.2706 GGCTC 0.1584 GGCTG 0.2083 GGCTT 0.3627 GGGAA 0.3788 GGGAC 0.1199 GGGAG 0.2712 GGGAT 0.23 GGGCA 0.3707 GGGCC 0.1396 GGGCG 0.1678 GGGCT 0.3218 GGGGA 0.3253 GGGGC 0.111 GGGGG 0.3372 GGGGT 0.2265 GGGTA 0.2626 GGGTC 0.154 GGGTG 0.2625 GGGTT 0.321 GGTAA 0.3709 GGTAC 0.1419 GGTAG 0.2115 GGTAT 0.2757 GGTCA 0.4164 GGTCC 0.1279 GGTCG 0.1552 GGTCT 0.3006 GGTGA 0.3366 GGTGC 0.166 GGTGG 0.2373 GGTGT 0.2601 GGTTA 0.2758 GGTTC 0.1563 GGTTG 0.2123 GGTTT 0.3555 GTAAA 0.3932 GTAAC 0.1368 GTAAG 0.1657 GTAAT 0.3044 GTACA 0.3411 GTACC 0.1711 GTACG 0.1441 GTACT 0.3437 GTAGA 0.3246 GTAGC 0.198 GTAGG 0.1862 GTAGT 0.2913 GTATA 0.2533 GTATC 0.1581 GTATG 0.1856 GTATT 0.403 GTCAA 0.3528 GTCAC 0.1678 GTCAG 0.1725 GTCAT 0.307 GTCCA 0.3699 GTCCC 0.1754 GTCCG 0.1298 GTCCT 0.325 GTCGA 0.3585 GTCGC 0.1716 GTCGG 0.179 GTCGT 0.2908 GTCTA 0.2564 GTCTC 0.1932 GTCTG 0.2109 GTCTT 0.3395 GTGAA 0.3761 GTGAC 0.1585 GTGAG 0.1888 GTGAT 0.2765 GTGCA 0.364 GTGCC 0.1589 GTGCG 0.1683 GTGCT 0.3088 GTGGA 0.3359 GTGGC 0.172 GTGGG 0.1975 GTGGT 0.2947 GTGTA 0.2514 GTGTC 0.1696 GTGTG 0.247 GTGTT 0.332 GTTAA 0.373 GTTAC 0.1482 GTTAG 0.1781 GTTAT 0.3007 GTTCA 0.3699 GTTCC 0.1783 GTTCG 0.1459 GTTCT 0.3059 GTTGA 0.3429 GTTGC 0.1774 GTTGG 0.2093 GTTGT 0.2704 GTTTA 0.2706 GTTTC 0.1817 GTTTG 0.2019 GTTTT 0.3458 TAAAA 0.3569 TAAAC 0.1423 TAAAG 0.1557 TAAAT 0.3451 TAACA 0.3215 TAACC 0.1864 TAACG 0.138 TAACT 0.3541 TAAGA 0.2973 TAAGC 0.2001 TAAGG 0.1807 TAAGT 0.3219 TAATA 0.2774 TAATC 0.1547 TAATG 0.179 TAATT 0.3889 TACAA 0.3573 TACAC 0.18 TACAG 0.1661 TACAT 0.2967 TACCA 0.3608 TACCC 0.1707 TACCG 0.1297 TACCT 0.3388 TACGA 0.3327 TACGC 0.2139 TACGG 0.1574 TACGT 0.2961 TACTA 0.2419 TACTC 0.1832 TACTG 0.193 TACTT 0.382 TAGAA 0.3717 TAGAC 0.1608 TAGAG 0.1964 TAGAT 0.2711 TAGCA 0.357 TAGCC 0.1857 TAGCG 0.1364 TAGCT 0.3209 TAGGA 0.3271 TAGGC 0.205 TAGGG 0.1753 TAGGT 0.2925 TAGTA 0.268 TAGTC 0.1716 TAGTG 0.2026 TAGTT 0.3578 TATAA 0.3458 TATAC 0.1438 TATAG 0.1408 TATAT 0.3695 TATCA 0.3526 TATCC 0.1768 TATCG 0.1554 TATCT 0.3153 TATGA 0.3332 TATGC 0.2121 TATGG 0.185 TATGT 0.2697 TATTA 0.2443 TATTC 0.1684 TATTG 0.1677 TATTT 0.4196 TCAAA 0.3719 TCAAC 0.1595 TCAAG 0.1657 TCAAT 0.3028 TCACA 0.321 TCACC 0.2029 TCACG 0.1292 TCACT 0.3469 TCAGA 0.3115 TCAGC 0.1903 TCAGG 0.1594 TCAGT 0.3388 TCATA 0.2458 TCATC 0.1766 TCATG 0.1695 TCATT 0.4082 TCCAA 0.3435 TCCAC 0.206 TCCAG 0.1536 TCCAT 0.297 TCCCA 0.3506 TCCCC 0.2313 TCCCG 0.09894 TCCCT 0.3192 TCCGA 0.3377 TCCGC 0.2139 TCCGG 0.1497 TCCGT 0.2986 TCCTA 0.2381 TCCTC 0.2441 TCCTG 0.1634 TCCTT 0.3544 TCGAA 0.3606 TCGAC 0.1541 TCGAG 0.1726 TCGAT 0.3126 TCGCA 0.3366 TCGCC 0.2094 TCGCG 0.1364 TCGCT 0.3176 TCGGA 0.3133 TCGGC 0.1912 TCGGG 0.1726 TCGGT 0.3229 TCGTA 0.2546 TCGTC 0.19 TCGTG 0.1988 TCGTT 0.3567 TCTAA 0.3416 TCTAC 0.1877 TCTAG 0.1565 TCTAT 0.3142 TCTCA 0.3111 TCTCC 0.2215 TCTCG 0.1242 TCTCT 0.3431 TCTGA 0.315 TCTGC 0.2109 TCTGG 0.1701 TCTGT 0.304 TCTTA 0.2369 TCTTC 0.2318 TCTTG 0.1762 TCTTT 0.3551 TGAAA 0.3806 TGAAC 0.141 TGAAG 0.1814 TGAAT 0.297 TGACA 0.3293 TGACC 0.1997 TGACG 0.1418 TGACT 0.3291 TGAGA 0.3233 TGAGC 0.1812 TGAGG 0.1988 TGAGT 0.2966 TGATA 0.2728 TGATC 0.1604 TGATG 0.1891 TGATT 0.3777 TGCAA 0.3375 TGCAC 0.1813 TGCAG 0.1712 TGCAT 0.3099 TGCCA 0.3788 TGCCC 0.1633 TGCCG 0.1225 TGCCT 0.3355 TGCGA 0.3035 TGCGC 0.2159 TGCGG 0.1629 TGCGT 0.3177 TGCTA 0.2588 TGCTC 0.1918 TGCTG 0.1892 TGCTT 0.3602 TGGAA 0.394 TGGAC 0.1381 TGGAG 0.2088 TGGAT 0.2592 TGGCA 0.358 TGGCC 0.1808 TGGCG 0.1508 TGGCT 0.3104 TGGGA 0.342 TGGGC 0.1726 TGGGG 0.1974 TGGGT 0.288 TGGTA 0.2669 TGGTC 0.1779 TGGTG 0.2227 TGGTT 0.3325 TGTAA 0.3606 TGTAC 0.1697 TGTAG 0.173 TGTAT 0.2968 TGTCA 0.3659 TGTCC 0.179 TGTCG 0.1362 TGTCT 0.3189 TGTGA 0.3109 TGTGC 0.2 TGTGG 0.1945 TGTGT 0.2945 TGTTA 0.2504 TGTTC 0.1844 TGTTG 0.1905 TGTTT 0.3747 TTAAA 0.3786 TTAAC 0.1483 TTAAG 0.1518 TTAAT 0.3214 TTACA 0.3182 TTACC 0.1964 TTACG 0.1312 TTACT 0.3543 TTAGA 0.3087 TTAGC 0.2052 TTAGG 0.1701 TTAGT 0.316 TTATA 0.2407 TTATC 0.1651 TTATG 0.1613 TTATT 0.4329 TTCAA 0.3591 TTCAC 0.1758 TTCAG 0.1652 TTCAT 0.2999 TTCCA 0.3677 TTCCC 0.193 TTCCG 0.1158 TTCCT 0.3236 TTCGA 0.3464 TTCGC 0.1873 TTCGG 0.1695 TTCGT 0.2967 TTCTA 0.2481 TTCTC 0.2144 TTCTG 0.1953 TTCTT 0.3421 TTGAA 0.3805 TTGAC 0.1651 TTGAG 0.1735 TTGAT 0.2808 TTGCA 0.3503 TTGCC 0.1956 TTGCG 0.1289 TTGCT 0.3252 TTGGA 0.3155 TTGGC 0.2107 TTGGG 0.1734 TTGGT 0.3004 TTGTA 0.2571 TTGTC 0.1833 TTGTG 0.2181 TTGTT 0.3414 TTTAA 0.3646 TTTAC 0.1632 TTTAG 0.144 TTTAT 0.3282 TTTCA 0.3589 TTTCC 0.1963 TTTCG 0.1405 TTTCT 0.3043 TTTGA 0.3325 TTTGC 0.1965 TTTGG 0.1828 TTTGT 0.2882 TTTTA 0.2872 TTTTC 0.1999 TTTTG 0.1955 TTTTT 0.3174 [3] # (a,c,g,t)= (0.217, 0.283, 0.283, 0.217) # # Probabilities file for the intergenic region model # # k = 4 # The P_l's [P_ls] # l= 0 # Values A 0.324 C 0.176 G 0.176 T 0.324 # l= 1 # Values AA 0.119 AC 0.0511 AG 0.0557 AT 0.0989 CA 0.0621 CC 0.0328 CG 0.0249 CT 0.0557 GA 0.0582 GC 0.0335 GG 0.0328 GT 0.0511 TA 0.0855 TC 0.0582 TG 0.0621 TT 0.119 # l= 2 # Values AAA 0.0436 AAC 0.0172 AAG 0.0198 AAT 0.0381 ACA 0.0171 ACC 0.00952 ACG 0.00739 ACT 0.0171 AGA 0.0179 AGC 0.0103 AGG 0.0104 AGT 0.0171 ATA 0.0269 ATC 0.0158 ATG 0.0181 ATT 0.0381 CAA 0.022 CAC 0.0113 CAG 0.0107 CAT 0.0181 CCA 0.012 CCC 0.00631 CCG 0.00407 CCT 0.0104 CGA 0.00852 CGC 0.0049 CGG 0.00407 CGT 0.0074 CTA 0.0139 CTC 0.0113 CTG 0.0107 CTT 0.0198 GAA 0.022 GAC 0.00904 GAG 0.0113 GAT 0.0158 GCA 0.0121 GCC 0.00617 GCG 0.0049 GCT 0.0103 GGA 0.0108 GGC 0.00617 GGG 0.00632 GGT 0.00952 GTA 0.0135 GTC 0.00904 GTG 0.0113 GTT 0.0172 TAA 0.0312 TAC 0.0135 TAG 0.0139 TAT 0.0269 TCA 0.0209 TCC 0.0108 TCG 0.00852 TCT 0.018 TGA 0.0209 TGC 0.0121 TGG 0.012 TGT 0.0171 TTA 0.0312 TTC 0.022 TTG 0.022 TTT 0.0436 # l= 3 # Values AAAA 0.0148 AAAC 0.00624 AAAG 0.00721 AAAT 0.0153 AACA 0.00583 AACC 0.00305 AACG 0.00261 AACT 0.00576 AAGA 0.00609 AAGC 0.00368 AAGG 0.00373 AAGT 0.00627 AATA 0.0111 AATC 0.00579 AATG 0.00731 AATT 0.0139 ACAA 0.00603 ACAC 0.00309 ACAG 0.00313 ACAT 0.00484 ACCA 0.0035 ACCC 0.00168 ACCG 0.00131 ACCT 0.00303 ACGA 0.00247 ACGC 0.00154 ACGG 0.0012 ACGT 0.0022 ACTA 0.0042 ACTC 0.00311 ACTG 0.00348 ACTT 0.00627 AGAA 0.00666 AGAC 0.00277 AGAG 0.00372 AGAT 0.0048 AGCA 0.0038 AGCC 0.00188 AGCG 0.00151 AGCT 0.00311 AGGA 0.00342 AGGC 0.00202 AGGG 0.00196 AGGT 0.00303 AGTA 0.00466 AGTC 0.00286 AGTG 0.00379 AGTT 0.00576 ATAA 0.0098 ATAC 0.00385 ATAG 0.00426 ATAT 0.00902 ATCA 0.00573 ATCC 0.0027 ATCG 0.00253 ATCT 0.0048 ATGA 0.00612 ATGC 0.00362 ATGG 0.0035 ATGT 0.00484 ATTA 0.00981 ATTC 0.00638 ATTG 0.00665 ATTT 0.0153 CAAA 0.00837 CAAC 0.00346 CAAG 0.00348 CAAT 0.00665 CACA 0.0038 CACC 0.00221 CACG 0.00152 CACT 0.00379 CAGA 0.00354 CAGC 0.00199 CAGG 0.00172 CAGT 0.00348 CATA 0.00452 CATC 0.00312 CATG 0.00314 CATT 0.00731 CCAA 0.00429 CCAC 0.0024 CCAG 0.00183 CCAT 0.0035 CCCA 0.0022 CCCC 0.00151 CCCG 0.000655 CCCT 0.00196 CCGA 0.00144 CCGC 0.000835 CCGG 0.000604 CCGT 0.0012 CCTA 0.00249 CCTC 0.00248 CCTG 0.00172 CCTT 0.00373 CGAA 0.0032 CGAC 0.00132 CGAG 0.00146 CGAT 0.00253 CGCA 0.00171 CGCC 0.000982 CGCG 0.000704 CGCT 0.00151 CGGA 0.00133 CGGC 0.000772 CGGG 0.000655 CGGT 0.00131 CGTA 0.00189 CGTC 0.00138 CGTG 0.00152 CGTT 0.00261 CTAA 0.00492 CTAC 0.00255 CTAG 0.00215 CTAT 0.00426 CTCA 0.00373 CTCC 0.00244 CTCG 0.00146 CTCT 0.00372 CTGA 0.00359 CTGC 0.00217 CTGG 0.00183 CTGT 0.00313 CTTA 0.00487 CTTC 0.00423 CTTG 0.00348 CTTT 0.00721 GAAA 0.00841 GAAC 0.00301 GAAG 0.00423 GAAT 0.00638 GACA 0.00313 GACC 0.00166 GACG 0.00138 GACT 0.00286 GAGA 0.00387 GAGC 0.00188 GAGG 0.00248 GAGT 0.00311 GATA 0.00444 GATC 0.00243 GATG 0.00312 GATT 0.00579 GCAA 0.00416 GCAC 0.00213 GCAG 0.00217 GCAT 0.00362 GCCA 0.00239 GCCC 0.000989 GCCG 0.000772 GCCT 0.00202 GCGA 0.00154 GCGC 0.000989 GCGG 0.000834 GCGT 0.00154 GCTA 0.00275 GCTC 0.00188 GCTG 0.00199 GCTT 0.00368 GGAA 0.00423 GGAC 0.00147 GGAG 0.00244 GGAT 0.0027 GGCA 0.00226 GGCC 0.00105 GGCG 0.000982 GGCT 0.00188 GGGA 0.00214 GGGC 0.000989 GGGG 0.00151 GGGT 0.00168 GGTA 0.00259 GGTC 0.00166 GGTG 0.00221 GGTT 0.00305 GTAA 0.00493 GTAC 0.00215 GTAG 0.00255 GTAT 0.00385 GTCA 0.00348 GTCC 0.00147 GTCG 0.00132 GTCT 0.00277 GTGA 0.00368 GTGC 0.00213 GTGG 0.0024 GTGT 0.00309 GTTA 0.00454 GTTC 0.00301 GTTG 0.00346 GTTT 0.00624 TAAA 0.0119 TAAC 0.00454 TAAG 0.00487 TAAT 0.00981 TACA 0.00434 TACC 0.00259 TACG 0.00189 TACT 0.00466 TAGA 0.00445 TAGC 0.00275 TAGG 0.00249 TAGT 0.0042 TATA 0.00682 TATC 0.00444 TATG 0.00452 TATT 0.0112 TCAA 0.00748 TCAC 0.00368 TCAG 0.00359 TCAT 0.00612 TCCA 0.00395 TCCC 0.00214 TCCG 0.00133 TCCT 0.00342 TCGA 0.00307 TCGC 0.00154 TCGG 0.00144 TCGT 0.00247 TCTA 0.00445 TCTC 0.00387 TCTG 0.00354 TCTT 0.00609 TGAA 0.00793 TGAC 0.00348 TGAG 0.00373 TGAT 0.00573 TGCA 0.00431 TGCC 0.00226 TGCG 0.00171 TGCT 0.0038 TGGA 0.00395 TGGC 0.00239 TGGG 0.0022 TGGT 0.0035 TGTA 0.00434 TGTC 0.00313 TGTG 0.0038 TGTT 0.00583 TTAA 0.0115 TTAC 0.00493 TTAG 0.00492 TTAT 0.0098 TTCA 0.00793 TTCC 0.00423 TTCG 0.0032 TTCT 0.00666 TTGA 0.00748 TTGC 0.00416 TTGG 0.00429 TTGT 0.00603 TTTA 0.0119 TTTC 0.00841 TTTG 0.00838 TTTT 0.0148 # l= 4 # Values AAAAA 0.00472 AAAAC 0.00216 AAAAG 0.00248 AAAAT 0.00548 AAACA 0.00219 AAACC 0.00109 AAACG 0.00105 AAACT 0.00192 AAAGA 0.00217 AAAGC 0.00137 AAAGG 0.00136 AAAGT 0.00231 AAATA 0.00469 AAATC 0.00227 AAATG 0.00305 AAATT 0.00528 AACAA 0.00206 AACAC 0.00103 AACAG 0.00113 AACAT 0.0016 AACCA 0.00117 AACCC 0.000539 AACCG 0.000465 AACCT 0.000883 AACGA 0.000882 AACGC 0.000548 AACGG 0.000449 AACGT 0.00073 AACTA 0.00151 AACTC 0.00105 AACTG 0.00122 AACTT 0.00198 AAGAA 0.00228 AAGAC 0.000942 AAGAG 0.00125 AAGAT 0.00162 AAGCA 0.00137 AAGCC 0.000685 AAGCG 0.000568 AAGCT 0.00106 AAGGA 0.00121 AAGGC 0.000758 AAGGG 0.000681 AAGGT 0.00108 AAGTA 0.00178 AAGTC 0.00107 AAGTG 0.00144 AAGTT 0.00198 AATAA 0.00425 AATAC 0.00156 AATAG 0.00182 AATAT 0.00352 AATCA 0.00217 AATCC 0.000992 AATCG 0.000979 AATCT 0.00165 AATGA 0.0025 AATGC 0.00147 AATGG 0.00142 AATGT 0.00192 AATTA 0.00382 AATTC 0.00233 AATTG 0.00245 AATTT 0.00528 ACAAA 0.00241 ACAAC 0.000935 ACAAG 0.000951 ACAAT 0.00173 ACACA 0.00112 ACACC 0.000575 ACACG 0.000442 ACACT 0.000954 ACAGA 0.00108 ACAGC 0.000607 ACAGG 0.000504 ACAGT 0.000948 ACATA 0.00122 ACATC 0.000856 ACATG 0.000844 ACATT 0.00192 ACCAA 0.00129 ACCAC 0.000709 ACCAG 0.000545 ACCAT 0.000959 ACCCA 0.000633 ACCCC 0.000343 ACCCG 0.000203 ACCCT 0.000497 ACCGA 0.000464 ACCGC 0.00027 ACCGG 0.000201 ACCGT 0.000375 ACCTA 0.00073 ACCTC 0.0007 ACCTG 0.000519 ACCTT 0.00108 ACGAA 0.000952 ACGAC 0.000384 ACGAG 0.000441 ACGAT 0.00069 ACGCA 0.000543 ACGCC 0.000303 ACGCG 0.000235 ACGCT 0.000459 ACGGA 0.000399 ACGGC 0.000238 ACGGG 0.000183 ACGGT 0.000375 ACGTA 0.000558 ACGTC 0.000431 ACGTG 0.000476 ACGTT 0.00073 ACTAA 0.00156 ACTAC 0.000744 ACTAG 0.000674 ACTAT 0.00123 ACTCA 0.00111 ACTCC 0.000609 ACTCG 0.00045 ACTCT 0.000949 ACTGA 0.00122 ACTGC 0.000703 ACTGG 0.000609 ACTGT 0.000948 ACTTA 0.00157 ACTTC 0.00128 ACTTG 0.00111 ACTTT 0.00231 AGAAA 0.00256 AGAAC 0.000922 AGAAG 0.00133 AGAAT 0.00185 AGACA 0.000998 AGACC 0.000499 AGACG 0.000464 AGACT 0.00081 AGAGA 0.00133 AGAGC 0.000614 AGAGG 0.000827 AGAGT 0.000949 AGATA 0.0014 AGATC 0.000739 AGATG 0.00102 AGATT 0.00165 AGCAA 0.00135 AGCAC 0.000659 AGCAG 0.000711 AGCAT 0.00108 AGCCA 0.000741 AGCCC 0.000319 AGCCG 0.00023 AGCCT 0.000594 AGCGA 0.00049 AGCGC 0.000295 AGCGG 0.000266 AGCGT 0.000459 AGCTA 0.000883 AGCTC 0.000563 AGCTG 0.000607 AGCTT 0.00106 AGGAA 0.00137 AGGAC 0.000477 AGGAG 0.000775 AGGAT 0.000796 AGGCA 0.000757 AGGCC 0.000333 AGGCG 0.000339 AGGCT 0.000594 AGGGA 0.000684 AGGGC 0.000324 AGGGG 0.000452 AGGGT 0.000497 AGGTA 0.000879 AGGTC 0.000551 AGGTG 0.000714 AGGTT 0.000883 AGTAA 0.00175 AGTAC 0.000738 AGTAG 0.000925 AGTAT 0.00125 AGTCA 0.00115 AGTCC 0.000464 AGTCG 0.000437 AGTCT 0.00081 AGTGA 0.00128 AGTGC 0.000718 AGTGG 0.000837 AGTGT 0.000954 AGTTA 0.00161 AGTTC 0.00101 AGTTG 0.00122 AGTTT 0.00192 ATAAA 0.00392 ATAAC 0.00137 ATAAG 0.00154 ATAAT 0.00297 ATACA 0.00129 ATACC 0.000717 ATACG 0.000597 ATACT 0.00125 ATAGA 0.0014 ATAGC 0.000837 ATAGG 0.000797 ATAGT 0.00123 ATATA 0.00253 ATATC 0.00143 ATATG 0.00153 ATATT 0.00352 ATCAA 0.0021 ATCAC 0.00102 ATCAG 0.00104 ATCAT 0.00157 ATCCA 0.00102 ATCCC 0.000494 ATCCG 0.000386 ATCCT 0.000796 ATCGA 0.000962 ATCGC 0.000455 ATCGG 0.000428 ATCGT 0.00069 ATCTA 0.00121 ATCTC 0.00101 ATCTG 0.00097 ATCTT 0.00162 ATGAA 0.00238 ATGAC 0.00107 ATGAG 0.0011 ATGAT 0.00157 ATGCA 0.00134 ATGCC 0.000662 ATGCG 0.000538 ATGCT 0.00108 ATGGA 0.00118 ATGGC 0.000719 ATGGG 0.000647 ATGGT 0.000959 ATGTA 0.00129 ATGTC 0.000891 ATGTG 0.00106 ATGTT 0.0016 ATTAA 0.0037 ATTAC 0.0015 ATTAG 0.00163 ATTAT 0.00297 ATTCA 0.00236 ATTCC 0.00117 ATTCG 0.001 ATTCT 0.00185 ATTGA 0.00227 ATTGC 0.00126 ATTGG 0.0014 ATTGT 0.00173 ATTTA 0.00413 ATTTC 0.00285 ATTTG 0.00284 ATTTT 0.00548 CAAAA 0.00289 CAAAC 0.00126 CAAAG 0.00139 CAAAT 0.00284 CAACA 0.0011 CAACC 0.000646 CAACG 0.000486 CAACT 0.00122 CAAGA 0.00107 CAAGC 0.000637 CAAGG 0.000659 CAAGT 0.00111 CAATA 0.00186 CAATC 0.00112 CAATG 0.00121 CAATT 0.00245 CACAA 0.00131 CACAC 0.000759 CACAG 0.000667 CACAT 0.00106 CACCA 0.000777 CACCC 0.000439 CACCG 0.000279 CACCT 0.000714 CACGA 0.000488 CACGC 0.000327 CACGG 0.000226 CACGT 0.000476 CACTA 0.000849 CACTC 0.00075 CACTG 0.000745 CACTT 0.00144 CAGAA 0.0013 CAGAC 0.000583 CAGAG 0.000689 CAGAT 0.00097 CAGCA 0.000716 CAGCC 0.000391 CAGCG 0.00027 CAGCT 0.000607 CAGGA 0.000558 CAGGC 0.000355 CAGGG 0.000291 CAGGT 0.000519 CAGTA 0.000896 CAGTC 0.000609 CAGTG 0.000745 CAGTT 0.00122 CATAA 0.00158 CATAC 0.000711 CATAG 0.0007 CATAT 0.00153 CATCA 0.00108 CATCC 0.000552 CATCG 0.000466 CATCT 0.00102 CATGA 0.00103 CATGC 0.000648 CATGG 0.000611 CATGT 0.000844 CATTA 0.00175 CATTC 0.0013 CATTG 0.00121 CATTT 0.00305 CCAAA 0.00153 CCAAC 0.000722 CCAAG 0.000652 CCAAT 0.0014 CCACA 0.000736 CCACC 0.00052 CCACG 0.000309 CCACT 0.000837 CCAGA 0.0006 CCAGC 0.000323 CCAGG 0.000298 CCAGT 0.000609 CCATA 0.000834 CCATC 0.00064 CCATG 0.000611 CCATT 0.00142 CCCAA 0.000743 CCCAC 0.000472 CCCAG 0.000335 CCCAT 0.000647 CCCCA 0.000432 CCCCC 0.000505 CCCCG 0.000121 CCCCT 0.000452 CCCGA 0.000248 CCCGC 0.00013 CCCGG 9.32e-05 CCCGT 0.000183 CCCTA 0.000435 CCCTC 0.000549 CCCTG 0.000291 CCCTT 0.000681 CCGAA 0.000541 CCGAC 0.000235 CCGAG 0.000233 CCGAT 0.000428 CCGCA 0.000277 CCGCC 0.000189 CCGCG 0.000104 CCGCT 0.000266 CCGGA 0.0002 CCGGC 0.000109 CCGGG 9.32e-05 CCGGT 0.000201 CCGTA 0.000296 CCGTC 0.000225 CCGTG 0.000226 CCGTT 0.000449 CCTAA 0.000835 CCTAC 0.000475 CCTAG 0.000383 CCTAT 0.000797 CCTCA 0.000739 CCTCC 0.000623 CCTCG 0.000292 CCTCT 0.000827 CCTGA 0.000571 CCTGC 0.00035 CCTGG 0.000298 CCTGT 0.000504 CCTTA 0.000875 CCTTC 0.000836 CCTTG 0.000659 CCTTT 0.00136 CGAAA 0.00118 CGAAC 0.000438 CGAAG 0.000583 CGAAT 0.001 CGACA 0.000426 CGACC 0.000258 CGACG 0.000195 CGACT 0.000437 CGAGA 0.000479 CGAGC 0.000241 CGAGG 0.000292 CGAGT 0.00045 CGATA 0.000687 CGATC 0.000403 CGATG 0.000466 CGATT 0.000979 CGCAA 0.000534 CGCAC 0.000356 CGCAG 0.000279 CGCAT 0.000538 CGCCA 0.000359 CGCCC 0.000165 CGCCG 0.000119 CGCCT 0.000339 CGCGA 0.000209 CGCGC 0.000156 CGCGG 0.000104 CGCGT 0.000235 CGCTA 0.000375 CGCTC 0.000296 CGCTG 0.00027 CGCTT 0.000568 CGGAA 0.000489 CGGAC 0.00019 CGGAG 0.000269 CGGAT 0.000386 CGGCA 0.000276 CGGCC 0.000147 CGGCG 0.000119 CGGCT 0.00023 CGGGA 0.000212 CGGGC 0.000119 CGGGG 0.000121 CGGGT 0.000203 CGGTA 0.000336 CGGTC 0.000232 CGGTG 0.000279 CGGTT 0.000465 CGTAA 0.000645 CGTAC 0.000308 CGTAG 0.000337 CGTAT 0.000597 CGTCA 0.000493 CGTCC 0.000232 CGTCG 0.000195 CGTCT 0.000464 CGTGA 0.000475 CGTGC 0.00029 CGTGG 0.000309 CGTGT 0.000442 CGTTA 0.000625 CGTTC 0.000449 CGTTG 0.000486 CGTTT 0.00105 CTAAA 0.00171 CTAAC 0.000806 CTAAG 0.00077 CTAAT 0.00163 CTACA 0.000747 CTACC 0.000544 CTACG 0.000337 CTACT 0.000925 CTAGA 0.000693 CTAGC 0.000405 CTAGG 0.000383 CTAGT 0.000674 CTATA 0.000956 CTATC 0.000784 CTATG 0.0007 CTATT 0.00182 CTCAA 0.00129 CTCAC 0.000691 CTCAG 0.00064 CTCAT 0.0011 CTCCA 0.000821 CTCCC 0.000577 CTCCG 0.000269 CTCCT 0.000775 CTCGA 0.000528 CTCGC 0.00026 CTCGG 0.000233 CTCGT 0.000441 CTCTA 0.00087 CTCTC 0.000902 CTCTG 0.000689 CTCTT 0.00125 CTGAA 0.00131 CTGAC 0.000599 CTGAG 0.00064 CTGAT 0.00104 CTGCA 0.000736 CTGCC 0.000447 CTGCG 0.000279 CTGCT 0.000711 CTGGA 0.000603 CTGGC 0.000348 CTGGG 0.000335 CTGGT 0.000545 CTGTA 0.000719 CTGTC 0.000617 CTGTG 0.000667 CTGTT 0.00113 CTTAA 0.00174 CTTAC 0.000813 CTTAG 0.00077 CTTAT 0.00154 CTTCA 0.00143 CTTCC 0.000878 CTTCG 0.000583 CTTCT 0.00133 CTTGA 0.00124 CTTGC 0.00064 CTTGG 0.000652 CTTGT 0.000951 CTTTA 0.00185 CTTTC 0.00148 CTTTG 0.00139 CTTTT 0.00248 GAAAA 0.00296 GAAAC 0.00113 GAAAG 0.00148 GAAAT 0.00285 GAACA 0.00107 GAACC 0.000477 GAACG 0.000449 GAACT 0.00101 GAAGA 0.00141 GAAGC 0.000699 GAAGG 0.000836 GAAGT 0.00128 GAATA 0.00187 GAATC 0.000886 GAATG 0.0013 GAATT 0.00233 GACAA 0.0011 GACAC 0.000523 GACAG 0.000617 GACAT 0.000891 GACCA 0.000621 GACCC 0.000257 GACCG 0.000232 GACCT 0.000551 GACGA 0.000467 GACGC 0.000261 GACGG 0.000225 GACGT 0.000431 GACTA 0.000718 GACTC 0.000465 GACTG 0.000609 GACTT 0.00107 GAGAA 0.00142 GAGAC 0.000533 GAGAG 0.000902 GAGAT 0.00101 GAGCA 0.000728 GAGCC 0.000298 GAGCG 0.000296 GAGCT 0.000563 GAGGA 0.000831 GAGGC 0.000401 GAGGG 0.000549 GAGGT 0.0007 GAGTA 0.000851 GAGTC 0.000465 GAGTG 0.00075 GAGTT 0.00105 GATAA 0.00161 GATAC 0.000607 GATAG 0.000784 GATAT 0.00143 GATCA 0.000916 GATCC 0.000373 GATCG 0.000403 GATCT 0.000739 GATGA 0.00108 GATGC 0.000543 GATGG 0.00064 GATGT 0.000856 GATTA 0.00151 GATTC 0.000886 GATTG 0.00112 GATTT 0.00227 GCAAA 0.00165 GCAAC 0.000612 GCAAG 0.00064 GCAAT 0.00126 GCACA 0.000758 GCACC 0.000366 GCACG 0.00029 GCACT 0.000718 GCAGA 0.000746 GCAGC 0.000375 GCAGG 0.00035 GCAGT 0.000703 GCATA 0.000959 GCATC 0.000543 GCATG 0.000648 GCATT 0.00147 GCCAA 0.000905 GCCAC 0.000414 GCCAG 0.000348 GCCAT 0.000719 GCCCA 0.000378 GCCCC 0.000168 GCCCG 0.000119 GCCCT 0.000324 GCCGA 0.000275 GCCGC 0.00015 GCCGG 0.000109 GCCGT 0.000238 GCCTA 0.000509 GCCTC 0.000401 GCCTG 0.000355 GCCTT 0.000758 GCGAA 0.000599 GCGAC 0.000225 GCGAG 0.00026 GCGAT 0.000455 GCGCA 0.000368 GCGCC 0.00017 GCGCG 0.000156 GCGCT 0.000295 GCGGA 0.000285 GCGGC 0.00015 GCGGG 0.00013 GCGGT 0.00027 GCGTA 0.000403 GCGTC 0.000261 GCGTG 0.000327 GCGTT 0.000548 GCTAA 0.00101 GCTAC 0.000504 GCTAG 0.000405 GCTAT 0.000837 GCTCA 0.000676 GCTCC 0.000354 GCTCG 0.000241 GCTCT 0.000614 GCTGA 0.00068 GCTGC 0.000375 GCTGG 0.000323 GCTGT 0.000607 GCTTA 0.000971 GCTTC 0.000699 GCTTG 0.000637 GCTTT 0.00137 GGAAA 0.00164 GGAAC 0.000534 GGAAG 0.000878 GGAAT 0.00117 GGACA 0.00056 GGACC 0.000212 GGACG 0.000232 GGACT 0.000464 GGAGA 0.000856 GGAGC 0.000354 GGAGG 0.000623 GGAGT 0.000609 GGATA 0.000782 GGATC 0.000373 GGATG 0.000552 GGATT 0.000992 GGCAA 0.00081 GGCAC 0.000338 GGCAG 0.000447 GGCAT 0.000662 GGCCA 0.000429 GGCCC 0.000138 GGCCG 0.000147 GGCCT 0.000333 GGCGA 0.000321 GGCGC 0.00017 GGCGG 0.000189 GGCGT 0.000303 GGCTA 0.00051 GGCTC 0.000298 GGCTG 0.000391 GGCTT 0.000685 GGGAA 0.000813 GGGAC 0.000257 GGGAG 0.000577 GGGAT 0.000494 GGGCA 0.000367 GGGCC 0.000138 GGGCG 0.000165 GGGCT 0.000319 GGGGA 0.000493 GGGGC 0.000168 GGGGG 0.000505 GGGGT 0.000343 GGGTA 0.000441 GGGTC 0.000257 GGGTG 0.000439 GGGTT 0.000539 GGTAA 0.000964 GGTAC 0.000367 GGTAG 0.000544 GGTAT 0.000717 GGTCA 0.000692 GGTCC 0.000212 GGTCG 0.000258 GGTCT 0.000499 GGTGA 0.000746 GGTGC 0.000366 GGTGG 0.00052 GGTGT 0.000575 GGTTA 0.000843 GGTTC 0.000477 GGTTG 0.000646 GGTTT 0.00109 GTAAA 0.00194 GTAAC 0.000671 GTAAG 0.000813 GTAAT 0.0015 GTACA 0.000734 GTACC 0.000367 GTACG 0.000308 GTACT 0.000738 GTAGA 0.000831 GTAGC 0.000504 GTAGG 0.000475 GTAGT 0.000744 GTATA 0.000978 GTATC 0.000607 GTATG 0.000711 GTATT 0.00156 GTCAA 0.00123 GTCAC 0.000583 GTCAG 0.000599 GTCAT 0.00107 GTCCA 0.000545 GTCCC 0.000257 GTCCG 0.00019 GTCCT 0.000477 GTCGA 0.000472 GTCGC 0.000225 GTCGG 0.000235 GTCGT 0.000384 GTCTA 0.000711 GTCTC 0.000533 GTCTG 0.000583 GTCTT 0.000942 GTGAA 0.00139 GTGAC 0.000583 GTGAG 0.000691 GTGAT 0.00102 GTGCA 0.000779 GTGCC 0.000338 GTGCG 0.000356 GTGCT 0.000659 GTGGA 0.000808 GTGGC 0.000414 GTGGG 0.000472 GTGGT 0.000709 GTGTA 0.00078 GTGTC 0.000523 GTGTG 0.000759 GTGTT 0.00103 GTTAA 0.0017 GTTAC 0.000671 GTTAG 0.000806 GTTAT 0.00137 GTTCA 0.00111 GTTCC 0.000534 GTTCG 0.000438 GTTCT 0.000922 GTTGA 0.00119 GTTGC 0.000612 GTTGG 0.000722 GTTGT 0.000935 GTTTA 0.00169 GTTTC 0.00113 GTTTG 0.00126 GTTTT 0.00216 TAAAA 0.00427 TAAAC 0.00169 TAAAG 0.00185 TAAAT 0.00413 TAACA 0.00146 TAACC 0.000843 TAACG 0.000625 TAACT 0.00161 TAAGA 0.00145 TAAGC 0.000971 TAAGG 0.000875 TAAGT 0.00157 TAATA 0.00273 TAATC 0.00151 TAATG 0.00175 TAATT 0.00382 TACAA 0.00155 TACAC 0.00078 TACAG 0.000719 TACAT 0.00129 TACCA 0.000936 TACCC 0.000441 TACCG 0.000336 TACCT 0.000879 TACGA 0.000629 TACGC 0.000403 TACGG 0.000296 TACGT 0.000558 TACTA 0.00113 TACTC 0.000851 TACTG 0.000896 TACTT 0.00178 TAGAA 0.00166 TAGAC 0.000711 TAGAG 0.00087 TAGAT 0.00121 TAGCA 0.000985 TAGCC 0.00051 TAGCG 0.000375 TAGCT 0.000883 TAGGA 0.000816 TAGGC 0.000509 TAGGG 0.000435 TAGGT 0.00073 TAGTA 0.00113 TAGTC 0.000718 TAGTG 0.000849 TAGTT 0.00151 TATAA 0.00236 TATAC 0.000978 TATAG 0.000956 TATAT 0.00253 TATCA 0.00157 TATCC 0.000782 TATCG 0.000687 TATCT 0.0014 TATGA 0.00151 TATGC 0.000959 TATGG 0.000834 TATGT 0.00122 TATTA 0.00273 TATTC 0.00187 TATTG 0.00186 TATTT 0.00469 TCAAA 0.00279 TCAAC 0.00119 TCAAG 0.00124 TCAAT 0.00227 TCACA 0.00118 TCACC 0.000746 TCACG 0.000475 TCACT 0.00128 TCAGA 0.00112 TCAGC 0.00068 TCAGG 0.000571 TCAGT 0.00122 TCATA 0.00151 TCATC 0.00108 TCATG 0.00103 TCATT 0.0025 TCCAA 0.00136 TCCAC 0.000808 TCCAG 0.000603 TCCAT 0.00118 TCCCA 0.000753 TCCCC 0.000493 TCCCG 0.000212 TCCCT 0.000684 TCCGA 0.000451 TCCGC 0.000285 TCCGG 0.0002 TCCGT 0.000399 TCCTA 0.000816 TCCTC 0.000831 TCCTG 0.000558 TCCTT 0.00121 TCGAA 0.00111 TCGAC 0.000472 TCGAG 0.000528 TCGAT 0.000962 TCGCA 0.00052 TCGCC 0.000321 TCGCG 0.000209 TCGCT 0.00049 TCGGA 0.000451 TCGGC 0.000275 TCGGG 0.000248 TCGGT 0.000464 TCGTA 0.000629 TCGTC 0.000467 TCGTG 0.000488 TCGTT 0.000882 TCTAA 0.00152 TCTAC 0.000831 TCTAG 0.000693 TCTAT 0.0014 TCTCA 0.00121 TCTCC 0.000856 TCTCG 0.000479 TCTCT 0.00133 TCTGA 0.00112 TCTGC 0.000746 TCTGG 0.0006 TCTGT 0.00108 TCTTA 0.00145 TCTTC 0.00141 TCTTG 0.00107 TCTTT 0.00217 TGAAA 0.00303 TGAAC 0.00111 TGAAG 0.00143 TGAAT 0.00236 TGACA 0.00115 TGACC 0.000692 TGACG 0.000493 TGACT 0.00115 TGAGA 0.00121 TGAGC 0.000676 TGAGG 0.000739 TGAGT 0.00111 TGATA 0.00157 TGATC 0.000916 TGATG 0.00108 TGATT 0.00217 TGCAA 0.00146 TGCAC 0.000779 TGCAG 0.000736 TGCAT 0.00134 TGCCA 0.000856 TGCCC 0.000367 TGCCG 0.000276 TGCCT 0.000757 TGCGA 0.00052 TGCGC 0.000368 TGCGG 0.000277 TGCGT 0.000543 TGCTA 0.000985 TGCTC 0.000728 TGCTG 0.000716 TGCTT 0.00137 TGGAA 0.00156 TGGAC 0.000545 TGGAG 0.000821 TGGAT 0.00102 TGGCA 0.000856 TGGCC 0.000429 TGGCG 0.000359 TGGCT 0.000741 TGGGA 0.000753 TGGGC 0.000378 TGGGG 0.000432 TGGGT 0.000633 TGGTA 0.000936 TGGTC 0.000621 TGGTG 0.000777 TGGTT 0.00117 TGTAA 0.00157 TGTAC 0.000734 TGTAG 0.000747 TGTAT 0.00129 TGTCA 0.00115 TGTCC 0.00056 TGTCG 0.000426 TGTCT 0.000998 TGTGA 0.00118 TGTGC 0.000758 TGTGG 0.000736 TGTGT 0.00112 TGTTA 0.00146 TGTTC 0.00107 TGTTG 0.0011 TGTTT 0.00219 TTAAA 0.00437 TTAAC 0.0017 TTAAG 0.00174 TTAAT 0.0037 TTACA 0.00157 TTACC 0.000964 TTACG 0.000645 TTACT 0.00175 TTAGA 0.00152 TTAGC 0.00101 TTAGG 0.000835 TTAGT 0.00156 TTATA 0.00236 TTATC 0.00161 TTATG 0.00158 TTATT 0.00425 TTCAA 0.00286 TTCAC 0.00139 TTCAG 0.00131 TTCAT 0.00238 TTCCA 0.00156 TTCCC 0.000813 TTCCG 0.000489 TTCCT 0.00137 TTCGA 0.00111 TTCGC 0.000599 TTCGG 0.000541 TTCGT 0.000952 TTCTA 0.00166 TTCTC 0.00142 TTCTG 0.0013 TTCTT 0.00228 TTGAA 0.00286 TTGAC 0.00123 TTGAG 0.00129 TTGAT 0.0021 TTGCA 0.00146 TTGCC 0.00081 TTGCG 0.000534 TTGCT 0.00135 TTGGA 0.00136 TTGGC 0.000905 TTGGG 0.000743 TTGGT 0.00129 TTGTA 0.00155 TTGTC 0.0011 TTGTG 0.00131 TTGTT 0.00206 TTTAA 0.00437 TTTAC 0.00194 TTTAG 0.00171 TTTAT 0.00392 TTTCA 0.00303 TTTCC 0.00164 TTTCG 0.00118 TTTCT 0.00256 TTTGA 0.00279 TTTGC 0.00165 TTTGG 0.00153 TTTGT 0.00241 TTTTA 0.00427 TTTTC 0.00296 TTTTG 0.00289 TTTTT 0.00472 [EMISSION] # Vector size (4^(k+1)) 1024 # Probabilities AAAAA 0.3174 AAAAC 0.1463 AAAAG 0.1682 AAAAT 0.3681 AAACA 0.3503 AAACC 0.175 AAACG 0.1682 AAACT 0.3064 AAAGA 0.3008 AAAGC 0.1907 AAAGG 0.189 AAAGT 0.3194 AAATA 0.3062 AAATC 0.1488 AAATG 0.2003 AAATT 0.3447 AACAA 0.3533 AACAC 0.177 AACAG 0.1949 AACAT 0.2748 AACCA 0.3815 AACCC 0.1771 AACCG 0.1526 AACCT 0.2889 AACGA 0.3374 AACGC 0.2106 AACGG 0.1727 AACGT 0.2794 AACTA 0.2617 AACTC 0.1828 AACTG 0.213 AACTT 0.3426 AAGAA 0.3735 AAGAC 0.1552 AAGAG 0.2069 AAGAT 0.2645 AAGCA 0.3723 AAGCC 0.1865 AAGCG 0.1546 AAGCT 0.2865 AAGGA 0.3249 AAGGC 0.2033 AAGGG 0.1833 AAGGT 0.2886 AAGTA 0.284 AAGTC 0.1705 AAGTG 0.2311 AAGTT 0.3144 AATAA 0.3809 AATAC 0.1401 AATAG 0.1641 AATAT 0.3148 AATCA 0.3743 AATCC 0.1719 AATCG 0.1697 AATCT 0.2841 AATGA 0.3422 AATGC 0.2009 AATGG 0.1943 AATGT 0.2625 AATTA 0.2751 AATTC 0.1681 AATTG 0.1773 AATTT 0.3795 ACAAA 0.3992 ACAAC 0.1557 ACAAG 0.1586 ACAAT 0.2864 ACACA 0.3618 ACACC 0.1866 ACACG 0.1436 ACACT 0.3081 ACAGA 0.3431 ACAGC 0.1941 ACAGG 0.1611 ACAGT 0.3018 ACATA 0.2514 ACATC 0.1778 ACATG 0.175 ACATT 0.3958 ACCAA 0.3679 ACCAC 0.2033 ACCAG 0.1559 ACCAT 0.273 ACCCA 0.3773 ACCCC 0.2058 ACCCG 0.1212 ACCCT 0.2958 ACCGA 0.3535 ACCGC 0.2065 ACCGG 0.1541 ACCGT 0.286 ACCTA 0.2404 ACCTC 0.2324 ACCTG 0.1717 ACCTT 0.3555 ACGAA 0.3849 ACGAC 0.1558 ACGAG 0.1799 ACGAT 0.2794 ACGCA 0.3524 ACGCC 0.1968 ACGCG 0.1537 ACGCT 0.2972 ACGGA 0.3327 ACGGC 0.2002 ACGGG 0.1535 ACGGT 0.3136 ACGTA 0.2543 ACGTC 0.1967 ACGTG 0.2174 ACGTT 0.3316 ACTAA 0.3696 ACTAC 0.178 ACTAG 0.1609 ACTAT 0.2915 ACTCA 0.3546 ACTCC 0.1965 ACTCG 0.1451 ACTCT 0.3038 ACTGA 0.3492 ACTGC 0.2023 ACTGG 0.1758 ACTGT 0.2726 ACTTA 0.2496 ACTTC 0.2056 ACTTG 0.1777 ACTTT 0.367 AGAAA 0.3835 AGAAC 0.1386 AGAAG 0.2014 AGAAT 0.2765 AGACA 0.3596 AGACC 0.1806 AGACG 0.1677 AGACT 0.292 AGAGA 0.357 AGAGC 0.1648 AGAGG 0.2237 AGAGT 0.2545 AGATA 0.2909 AGATC 0.1542 AGATG 0.213 AGATT 0.3418 AGCAA 0.3547 AGCAC 0.1741 AGCAG 0.1876 AGCAT 0.2836 AGCCA 0.393 AGCCC 0.1696 AGCCG 0.1223 AGCCT 0.3152 AGCGA 0.3241 AGCGC 0.1965 AGCGG 0.1763 AGCGT 0.3031 AGCTA 0.2842 AGCTC 0.1814 AGCTG 0.1957 AGCTT 0.3387 AGGAA 0.3997 AGGAC 0.1398 AGGAG 0.2282 AGGAT 0.2323 AGGCA 0.3735 AGGCC 0.1654 AGGCG 0.1677 AGGCT 0.2933 AGGGA 0.3493 AGGGC 0.1651 AGGGG 0.2323 AGGGT 0.2533 AGGTA 0.29 AGGTC 0.1825 AGGTG 0.2363 AGGTT 0.2913 AGTAA 0.3739 AGTAC 0.1592 AGTAG 0.1996 AGTAT 0.2673 AGTCA 0.4007 AGTCC 0.1625 AGTCG 0.1531 AGTCT 0.2837 AGTGA 0.3369 AGTGC 0.1898 AGTGG 0.2218 AGTGT 0.2515 AGTTA 0.2794 AGTTC 0.1758 AGTTG 0.2127 AGTTT 0.332 ATAAA 0.3993 ATAAC 0.1401 ATAAG 0.1579 ATAAT 0.3027 ATACA 0.3345 ATACC 0.1865 ATACG 0.1554 ATACT 0.3236 ATAGA 0.3279 ATAGC 0.1967 ATAGG 0.1876 ATAGT 0.2879 ATATA 0.2799 ATATC 0.1599 ATATG 0.1707 ATATT 0.3896 ATCAA 0.366 ATCAC 0.1785 ATCAG 0.1817 ATCAT 0.2737 ATCCA 0.3788 ATCCC 0.1835 ATCCG 0.1433 ATCCT 0.2944 ATCGA 0.3791 ATCGC 0.1797 ATCGG 0.1693 ATCGT 0.2719 ATCTA 0.2508 ATCTC 0.2112 ATCTG 0.2022 ATCTT 0.3358 ATGAA 0.3877 ATGAC 0.1752 ATGAG 0.1809 ATGAT 0.2562 ATGCA 0.3691 ATGCC 0.1832 ATGCG 0.1493 ATGCT 0.2984 ATGGA 0.3348 ATGGC 0.2061 ATGGG 0.1855 ATGGT 0.2736 ATGTA 0.2658 ATGTC 0.1842 ATGTG 0.2194 ATGTT 0.3306 ATTAA 0.3764 ATTAC 0.1536 ATTAG 0.1674 ATTAT 0.3025 ATTCA 0.3689 ATTCC 0.1845 ATTCG 0.1575 ATTCT 0.2891 ATTGA 0.3403 ATTGC 0.189 ATTGG 0.2107 ATTGT 0.26 ATTTA 0.2697 ATTTC 0.1869 ATTTG 0.186 ATTTT 0.3574 CAAAA 0.3446 CAAAC 0.1506 CAAAG 0.167 CAAAT 0.3378 CAACA 0.3195 CAACC 0.1874 CAACG 0.1409 CAACT 0.3522 CAAGA 0.3076 CAAGC 0.1835 CAAGG 0.19 CAAGT 0.3189 CAATA 0.2794 CAATC 0.1699 CAATG 0.1829 CAATT 0.3678 CACAA 0.3446 CACAC 0.201 CACAG 0.176 CACAT 0.2784 CACCA 0.3516 CACCC 0.1993 CACCG 0.1266 CACCT 0.3225 CACGA 0.3215 CACGC 0.216 CACGG 0.1492 CACGT 0.3133 CACTA 0.2239 CACTC 0.199 CACTG 0.1968 CACTT 0.3803 CAGAA 0.3659 CAGAC 0.1655 CAGAG 0.1953 CAGAT 0.2733 CAGCA 0.3605 CAGCC 0.1975 CAGCG 0.1367 CAGCT 0.3053 CAGGA 0.3234 CAGGC 0.2063 CAGGG 0.1693 CAGGT 0.301 CAGTA 0.258 CAGTC 0.1756 CAGTG 0.2149 CAGTT 0.3514 CATAA 0.348 CATAC 0.1583 CATAG 0.1554 CATAT 0.3383 CATCA 0.3459 CATCC 0.1777 CATCG 0.1496 CATCT 0.3268 CATGA 0.3291 CATGC 0.2068 CATGG 0.1952 CATGT 0.2689 CATTA 0.239 CATTC 0.1781 CATTG 0.1665 CATTT 0.4163 CCAAA 0.3542 CCAAC 0.1686 CCAAG 0.1524 CCAAT 0.3248 CCACA 0.3058 CCACC 0.2178 CCACG 0.1285 CCACT 0.3478 CCAGA 0.3274 CCAGC 0.177 CCAGG 0.1636 CCAGT 0.3319 CCATA 0.2377 CCATC 0.1833 CCATG 0.1751 CCATT 0.4039 CCCAA 0.337 CCCAC 0.2163 CCCAG 0.1529 CCCAT 0.2938 CCCCA 0.2846 CCCCC 0.3371 CCCCG 0.07959 CCCCT 0.2987 CCCGA 0.3779 CCCGC 0.1998 CCCGG 0.1425 CCCGT 0.2798 CCCTA 0.2217 CCCTC 0.2822 CCCTG 0.1486 CCCTT 0.3475 CCGAA 0.376 CCGAC 0.164 CCGAG 0.1626 CCGAT 0.2975 CCGCA 0.3319 CCGCC 0.2264 CCGCG 0.1243 CCGCT 0.3174 CCGGA 0.3304 CCGGC 0.1801 CCGGG 0.1548 CCGGT 0.3347 CCGTA 0.2471 CCGTC 0.1889 CCGTG 0.1893 CCGTT 0.3747 CCTAA 0.3348 CCTAC 0.1915 CCTAG 0.1541 CCTAT 0.3196 CCTCA 0.2966 CCTCC 0.2522 CCTCG 0.1178 CCTCT 0.3333 CCTGA 0.3302 CCTGC 0.2033 CCTGG 0.1741 CCTGT 0.2924 CCTTA 0.2343 CCTTC 0.2254 CCTTG 0.1771 CCTTT 0.3632 CGAAA 0.3673 CGAAC 0.1371 CGAAG 0.1831 CGAAT 0.3125 CGACA 0.3233 CGACC 0.1962 CGACG 0.1489 CGACT 0.3316 CGAGA 0.3273 CGAGC 0.1647 CGAGG 0.2003 CGAGT 0.3078 CGATA 0.2708 CGATC 0.1592 CGATG 0.1843 CGATT 0.3858 CGCAA 0.3117 CGCAC 0.2104 CGCAG 0.1632 CGCAT 0.3147 CGCCA 0.3648 CGCCC 0.169 CGCCG 0.1216 CGCCT 0.3445 CGCGA 0.2963 CGCGC 0.2229 CGCGG 0.147 CGCGT 0.3338 CGCTA 0.2481 CGCTC 0.1966 CGCTG 0.18 CGCTT 0.3754 CGGAA 0.3658 CGGAC 0.1427 CGGAG 0.2023 CGGAT 0.2891 CGGCA 0.3566 CGGCC 0.191 CGGCG 0.1548 CGGCT 0.2976 CGGGA 0.3235 CGGGC 0.1813 CGGGG 0.185 CGGGT 0.3102 CGGTA 0.2554 CGGTC 0.1774 CGGTG 0.2134 CGGTT 0.3538 CGTAA 0.3408 CGTAC 0.1643 CGTAG 0.1789 CGTAT 0.316 CGTCA 0.3553 CGTCC 0.1679 CGTCG 0.1415 CGTCT 0.3353 CGTGA 0.3124 CGTGC 0.1917 CGTGG 0.2042 CGTGT 0.2918 CGTTA 0.2395 CGTTC 0.1727 CGTTG 0.1871 CGTTT 0.4008 CTAAA 0.347 CTAAC 0.1643 CTAAG 0.157 CTAAT 0.3317 CTACA 0.2921 CTACC 0.2142 CTACG 0.1318 CTACT 0.3619 CTAGA 0.3212 CTAGC 0.1881 CTAGG 0.178 CTAGT 0.3127 CTATA 0.2241 CTATC 0.1846 CTATG 0.1647 CTATT 0.4266 CTCAA 0.3461 CTCAC 0.1865 CTCAG 0.1717 CTCAT 0.2957 CTCCA 0.3349 CTCCC 0.2375 CTCCG 0.1101 CTCCT 0.3175 CTCGA 0.3605 CTCGC 0.1786 CTCGG 0.1593 CTCGT 0.3015 CTCTA 0.2335 CTCTC 0.2434 CTCTG 0.1856 CTCTT 0.3374 CTGAA 0.3638 CTGAC 0.1677 CTGAG 0.1789 CTGAT 0.2897 CTGCA 0.3379 CTGCC 0.2066 CTGCG 0.1284 CTGCT 0.3272 CTGGA 0.3294 CTGGC 0.1898 CTGGG 0.1836 CTGGT 0.2972 CTGTA 0.2289 CTGTC 0.1971 CTGTG 0.2133 CTGTT 0.3607 CTTAA 0.3567 CTTAC 0.1677 CTTAG 0.159 CTTAT 0.3166 CTTCA 0.3378 CTTCC 0.2081 CTTCG 0.1383 CTTCT 0.3157 CTTGA 0.3541 CTTGC 0.184 CTTGG 0.188 CTTGT 0.2739 CTTTA 0.2564 CTTTC 0.2057 CTTTG 0.1938 CTTTT 0.3441 GAAAA 0.3508 GAAAC 0.1349 GAAAG 0.1765 GAAAT 0.3378 GAACA 0.3562 GAACC 0.159 GAACG 0.1497 GAACT 0.3352 GAAGA 0.3327 GAAGC 0.1652 GAAGG 0.1988 GAAGT 0.3032 GAATA 0.2927 GAATC 0.1393 GAATG 0.2042 GAATT 0.3638 GACAA 0.3515 GACAC 0.1675 GACAG 0.1973 GACAT 0.2837 GACCA 0.3735 GACCC 0.1554 GACCG 0.1399 GACCT 0.3311 GACGA 0.3369 GACGC 0.1892 GACGG 0.1633 GACGT 0.3107 GACTA 0.2514 GACTC 0.1632 GACTG 0.2132 GACTT 0.3722 GAGAA 0.3669 GAGAC 0.1384 GAGAG 0.2339 GAGAT 0.2608 GAGCA 0.3856 GAGCC 0.1584 GAGCG 0.1576 GAGCT 0.2985 GAGGA 0.3341 GAGGC 0.1617 GAGGG 0.2223 GAGGT 0.2818 GAGTA 0.2726 GAGTC 0.1497 GAGTG 0.2419 GAGTT 0.3358 GATAA 0.3628 GATAC 0.1373 GATAG 0.1773 GATAT 0.3226 GATCA 0.3766 GATCC 0.1539 GATCG 0.1659 GATCT 0.3036 GATGA 0.3451 GATGC 0.1744 GATGG 0.2056 GATGT 0.2749 GATTA 0.2608 GATTC 0.1535 GATTG 0.1952 GATTT 0.3905 GCAAA 0.3949 GCAAC 0.1482 GCAAG 0.1547 GCAAT 0.3022 GCACA 0.3553 GCACC 0.1722 GCACG 0.1363 GCACT 0.3362 GCAGA 0.3429 GCAGC 0.1732 GCAGG 0.1613 GCAGT 0.3226 GCATA 0.2643 GCATC 0.1508 GCATG 0.1799 GCATT 0.405 GCCAA 0.3784 GCCAC 0.174 GCCAG 0.146 GCCAT 0.3016 GCCCA 0.3829 GCCCC 0.1707 GCCCG 0.1199 GCCCT 0.3265 GCCGA 0.3552 GCCGC 0.1944 GCCGG 0.1406 GCCGT 0.3098 GCCTA 0.2515 GCCTC 0.1991 GCCTG 0.1756 GCCTT 0.3738 GCGAA 0.388 GCGAC 0.1468 GCGAG 0.1702 GCGAT 0.295 GCGCA 0.3711 GCGCC 0.1714 GCGCG 0.159 GCGCT 0.2985 GCGGA 0.3405 GCGGC 0.1795 GCGGG 0.1566 GCGGT 0.3235 GCGTA 0.2612 GCGTC 0.1703 GCGTG 0.2131 GCGTT 0.3554 GCTAA 0.3654 GCTAC 0.1842 GCTAG 0.1474 GCTAT 0.3031 GCTCA 0.3577 GCTCC 0.1892 GCTCG 0.1282 GCTCT 0.3249 GCTGA 0.3419 GCTGC 0.1893 GCTGG 0.1634 GCTGT 0.3055 GCTTA 0.2637 GCTTC 0.1903 GCTTG 0.1737 GCTTT 0.3723 GGAAA 0.3881 GGAAC 0.1267 GGAAG 0.2083 GGAAT 0.2769 GGACA 0.3809 GGACC 0.145 GGACG 0.1585 GGACT 0.3156 GGAGA 0.3491 GGAGC 0.1453 GGAGG 0.2563 GGAGT 0.2492 GGATA 0.2893 GGATC 0.1386 GGATG 0.2053 GGATT 0.3668 GGCAA 0.3582 GGCAC 0.1505 GGCAG 0.199 GGCAT 0.2924 GGCCA 0.4097 GGCCC 0.1317 GGCCG 0.1405 GGCCT 0.3182 GGCGA 0.3272 GGCGC 0.1728 GGCGG 0.1926 GGCGT 0.3074 GGCTA 0.2706 GGCTC 0.1584 GGCTG 0.2083 GGCTT 0.3627 GGGAA 0.3788 GGGAC 0.1199 GGGAG 0.2712 GGGAT 0.23 GGGCA 0.3707 GGGCC 0.1396 GGGCG 0.1678 GGGCT 0.3218 GGGGA 0.3253 GGGGC 0.111 GGGGG 0.3372 GGGGT 0.2265 GGGTA 0.2626 GGGTC 0.154 GGGTG 0.2625 GGGTT 0.321 GGTAA 0.3709 GGTAC 0.1419 GGTAG 0.2115 GGTAT 0.2757 GGTCA 0.4164 GGTCC 0.1279 GGTCG 0.1552 GGTCT 0.3006 GGTGA 0.3366 GGTGC 0.166 GGTGG 0.2373 GGTGT 0.2601 GGTTA 0.2758 GGTTC 0.1563 GGTTG 0.2123 GGTTT 0.3555 GTAAA 0.3932 GTAAC 0.1368 GTAAG 0.1657 GTAAT 0.3044 GTACA 0.3411 GTACC 0.1711 GTACG 0.1441 GTACT 0.3437 GTAGA 0.3246 GTAGC 0.198 GTAGG 0.1862 GTAGT 0.2913 GTATA 0.2533 GTATC 0.1581 GTATG 0.1856 GTATT 0.403 GTCAA 0.3528 GTCAC 0.1678 GTCAG 0.1725 GTCAT 0.307 GTCCA 0.3699 GTCCC 0.1754 GTCCG 0.1298 GTCCT 0.325 GTCGA 0.3585 GTCGC 0.1716 GTCGG 0.179 GTCGT 0.2908 GTCTA 0.2564 GTCTC 0.1932 GTCTG 0.2109 GTCTT 0.3395 GTGAA 0.3761 GTGAC 0.1585 GTGAG 0.1888 GTGAT 0.2765 GTGCA 0.364 GTGCC 0.1589 GTGCG 0.1683 GTGCT 0.3088 GTGGA 0.3359 GTGGC 0.172 GTGGG 0.1975 GTGGT 0.2947 GTGTA 0.2514 GTGTC 0.1696 GTGTG 0.247 GTGTT 0.332 GTTAA 0.373 GTTAC 0.1482 GTTAG 0.1781 GTTAT 0.3007 GTTCA 0.3699 GTTCC 0.1783 GTTCG 0.1459 GTTCT 0.3059 GTTGA 0.3429 GTTGC 0.1774 GTTGG 0.2093 GTTGT 0.2704 GTTTA 0.2706 GTTTC 0.1817 GTTTG 0.2019 GTTTT 0.3458 TAAAA 0.3569 TAAAC 0.1423 TAAAG 0.1557 TAAAT 0.3451 TAACA 0.3215 TAACC 0.1864 TAACG 0.138 TAACT 0.3541 TAAGA 0.2973 TAAGC 0.2001 TAAGG 0.1807 TAAGT 0.3219 TAATA 0.2774 TAATC 0.1547 TAATG 0.179 TAATT 0.3889 TACAA 0.3573 TACAC 0.18 TACAG 0.1661 TACAT 0.2967 TACCA 0.3608 TACCC 0.1707 TACCG 0.1297 TACCT 0.3388 TACGA 0.3327 TACGC 0.2139 TACGG 0.1574 TACGT 0.2961 TACTA 0.2419 TACTC 0.1832 TACTG 0.193 TACTT 0.382 TAGAA 0.3717 TAGAC 0.1608 TAGAG 0.1964 TAGAT 0.2711 TAGCA 0.357 TAGCC 0.1857 TAGCG 0.1364 TAGCT 0.3209 TAGGA 0.3271 TAGGC 0.205 TAGGG 0.1753 TAGGT 0.2925 TAGTA 0.268 TAGTC 0.1716 TAGTG 0.2026 TAGTT 0.3578 TATAA 0.3458 TATAC 0.1438 TATAG 0.1408 TATAT 0.3695 TATCA 0.3526 TATCC 0.1768 TATCG 0.1554 TATCT 0.3153 TATGA 0.3332 TATGC 0.2121 TATGG 0.185 TATGT 0.2697 TATTA 0.2443 TATTC 0.1684 TATTG 0.1677 TATTT 0.4196 TCAAA 0.3719 TCAAC 0.1595 TCAAG 0.1657 TCAAT 0.3028 TCACA 0.321 TCACC 0.2029 TCACG 0.1292 TCACT 0.3469 TCAGA 0.3115 TCAGC 0.1903 TCAGG 0.1594 TCAGT 0.3388 TCATA 0.2458 TCATC 0.1766 TCATG 0.1695 TCATT 0.4082 TCCAA 0.3435 TCCAC 0.206 TCCAG 0.1536 TCCAT 0.297 TCCCA 0.3506 TCCCC 0.2313 TCCCG 0.09894 TCCCT 0.3192 TCCGA 0.3377 TCCGC 0.2139 TCCGG 0.1497 TCCGT 0.2986 TCCTA 0.2381 TCCTC 0.2441 TCCTG 0.1634 TCCTT 0.3544 TCGAA 0.3606 TCGAC 0.1541 TCGAG 0.1726 TCGAT 0.3126 TCGCA 0.3366 TCGCC 0.2094 TCGCG 0.1364 TCGCT 0.3176 TCGGA 0.3133 TCGGC 0.1912 TCGGG 0.1726 TCGGT 0.3229 TCGTA 0.2546 TCGTC 0.19 TCGTG 0.1988 TCGTT 0.3567 TCTAA 0.3416 TCTAC 0.1877 TCTAG 0.1565 TCTAT 0.3142 TCTCA 0.3111 TCTCC 0.2215 TCTCG 0.1242 TCTCT 0.3431 TCTGA 0.315 TCTGC 0.2109 TCTGG 0.1701 TCTGT 0.304 TCTTA 0.2369 TCTTC 0.2318 TCTTG 0.1762 TCTTT 0.3551 TGAAA 0.3806 TGAAC 0.141 TGAAG 0.1814 TGAAT 0.297 TGACA 0.3293 TGACC 0.1997 TGACG 0.1418 TGACT 0.3291 TGAGA 0.3233 TGAGC 0.1812 TGAGG 0.1988 TGAGT 0.2966 TGATA 0.2728 TGATC 0.1604 TGATG 0.1891 TGATT 0.3777 TGCAA 0.3375 TGCAC 0.1813 TGCAG 0.1712 TGCAT 0.3099 TGCCA 0.3788 TGCCC 0.1633 TGCCG 0.1225 TGCCT 0.3355 TGCGA 0.3035 TGCGC 0.2159 TGCGG 0.1629 TGCGT 0.3177 TGCTA 0.2588 TGCTC 0.1918 TGCTG 0.1892 TGCTT 0.3602 TGGAA 0.394 TGGAC 0.1381 TGGAG 0.2088 TGGAT 0.2592 TGGCA 0.358 TGGCC 0.1808 TGGCG 0.1508 TGGCT 0.3104 TGGGA 0.342 TGGGC 0.1726 TGGGG 0.1974 TGGGT 0.288 TGGTA 0.2669 TGGTC 0.1779 TGGTG 0.2227 TGGTT 0.3325 TGTAA 0.3606 TGTAC 0.1697 TGTAG 0.173 TGTAT 0.2968 TGTCA 0.3659 TGTCC 0.179 TGTCG 0.1362 TGTCT 0.3189 TGTGA 0.3109 TGTGC 0.2 TGTGG 0.1945 TGTGT 0.2945 TGTTA 0.2504 TGTTC 0.1844 TGTTG 0.1905 TGTTT 0.3747 TTAAA 0.3786 TTAAC 0.1483 TTAAG 0.1518 TTAAT 0.3214 TTACA 0.3182 TTACC 0.1964 TTACG 0.1312 TTACT 0.3543 TTAGA 0.3087 TTAGC 0.2052 TTAGG 0.1701 TTAGT 0.316 TTATA 0.2407 TTATC 0.1651 TTATG 0.1613 TTATT 0.4329 TTCAA 0.3591 TTCAC 0.1758 TTCAG 0.1652 TTCAT 0.2999 TTCCA 0.3677 TTCCC 0.193 TTCCG 0.1158 TTCCT 0.3236 TTCGA 0.3464 TTCGC 0.1873 TTCGG 0.1695 TTCGT 0.2967 TTCTA 0.2481 TTCTC 0.2144 TTCTG 0.1953 TTCTT 0.3421 TTGAA 0.3805 TTGAC 0.1651 TTGAG 0.1735 TTGAT 0.2808 TTGCA 0.3503 TTGCC 0.1956 TTGCG 0.1289 TTGCT 0.3252 TTGGA 0.3155 TTGGC 0.2107 TTGGG 0.1734 TTGGT 0.3004 TTGTA 0.2571 TTGTC 0.1833 TTGTG 0.2181 TTGTT 0.3414 TTTAA 0.3646 TTTAC 0.1632 TTTAG 0.144 TTTAT 0.3282 TTTCA 0.3589 TTTCC 0.1963 TTTCG 0.1405 TTTCT 0.3043 TTTGA 0.3325 TTTGC 0.1965 TTTGG 0.1828 TTTGT 0.2882 TTTTA 0.2872 TTTTC 0.1999 TTTTG 0.1955 TTTTT 0.3174 [4] # (a,c,g,t)= (0.176, 0.324, 0.324, 0.176) # # Probabilities file for the intergenic region model # # k = 4 # The P_l's [P_ls] # l= 0 # Values A 0.324 C 0.176 G 0.176 T 0.325 # l= 1 # Values AA 0.119 AC 0.0511 AG 0.0557 AT 0.0989 CA 0.0621 CC 0.0328 CG 0.0249 CT 0.0557 GA 0.0582 GC 0.0334 GG 0.0328 GT 0.0511 TA 0.0855 TC 0.0582 TG 0.0621 TT 0.119 # l= 2 # Values AAA 0.0436 AAC 0.0172 AAG 0.0198 AAT 0.0381 ACA 0.0171 ACC 0.00951 ACG 0.00739 ACT 0.0171 AGA 0.0179 AGC 0.0103 AGG 0.0104 AGT 0.0171 ATA 0.0269 ATC 0.0158 ATG 0.0181 ATT 0.0381 CAA 0.022 CAC 0.0113 CAG 0.0107 CAT 0.0181 CCA 0.012 CCC 0.00631 CCG 0.00407 CCT 0.0104 CGA 0.00851 CGC 0.0049 CGG 0.00407 CGT 0.0074 CTA 0.0139 CTC 0.0113 CTG 0.0107 CTT 0.0198 GAA 0.022 GAC 0.00903 GAG 0.0113 GAT 0.0158 GCA 0.0121 GCC 0.00617 GCG 0.0049 GCT 0.0103 GGA 0.0108 GGC 0.00617 GGG 0.00631 GGT 0.00951 GTA 0.0135 GTC 0.00904 GTG 0.0113 GTT 0.0172 TAA 0.0312 TAC 0.0135 TAG 0.0139 TAT 0.0269 TCA 0.0209 TCC 0.0108 TCG 0.00851 TCT 0.018 TGA 0.0209 TGC 0.0121 TGG 0.012 TGT 0.0171 TTA 0.0312 TTC 0.022 TTG 0.022 TTT 0.0436 # l= 3 # Values AAAA 0.0148 AAAC 0.00624 AAAG 0.00721 AAAT 0.0153 AACA 0.00583 AACC 0.00305 AACG 0.00261 AACT 0.00576 AAGA 0.00609 AAGC 0.00368 AAGG 0.00373 AAGT 0.00627 AATA 0.0112 AATC 0.00579 AATG 0.00731 AATT 0.0139 ACAA 0.00603 ACAC 0.00309 ACAG 0.00313 ACAT 0.00484 ACCA 0.0035 ACCC 0.00167 ACCG 0.00131 ACCT 0.00303 ACGA 0.00246 ACGC 0.00154 ACGG 0.0012 ACGT 0.0022 ACTA 0.0042 ACTC 0.00311 ACTG 0.00347 ACTT 0.00627 AGAA 0.00666 AGAC 0.00277 AGAG 0.00372 AGAT 0.0048 AGCA 0.0038 AGCC 0.00188 AGCG 0.00151 AGCT 0.00311 AGGA 0.00342 AGGC 0.00202 AGGG 0.00195 AGGT 0.00303 AGTA 0.00466 AGTC 0.00286 AGTG 0.00378 AGTT 0.00576 ATAA 0.00981 ATAC 0.00385 ATAG 0.00426 ATAT 0.00902 ATCA 0.00573 ATCC 0.0027 ATCG 0.00253 ATCT 0.0048 ATGA 0.00612 ATGC 0.00362 ATGG 0.0035 ATGT 0.00484 ATTA 0.00981 ATTC 0.00638 ATTG 0.00665 ATTT 0.0153 CAAA 0.00838 CAAC 0.00346 CAAG 0.00348 CAAT 0.00665 CACA 0.00379 CACC 0.00221 CACG 0.00151 CACT 0.00379 CAGA 0.00354 CAGC 0.00199 CAGG 0.00172 CAGT 0.00347 CATA 0.00452 CATC 0.00311 CATG 0.00314 CATT 0.00731 CCAA 0.00429 CCAC 0.0024 CCAG 0.00183 CCAT 0.0035 CCCA 0.00219 CCCC 0.00151 CCCG 0.000653 CCCT 0.00196 CCGA 0.00144 CCGC 0.000834 CCGG 0.000603 CCGT 0.0012 CCTA 0.00249 CCTC 0.00248 CCTG 0.00172 CCTT 0.00373 CGAA 0.0032 CGAC 0.00132 CGAG 0.00146 CGAT 0.00253 CGCA 0.00171 CGCC 0.000981 CGCG 0.000704 CGCT 0.00151 CGGA 0.00133 CGGC 0.000771 CGGG 0.000653 CGGT 0.00131 CGTA 0.00189 CGTC 0.00138 CGTG 0.00152 CGTT 0.00261 CTAA 0.00492 CTAC 0.00255 CTAG 0.00216 CTAT 0.00426 CTCA 0.00373 CTCC 0.00244 CTCG 0.00146 CTCT 0.00372 CTGA 0.00359 CTGC 0.00217 CTGG 0.00183 CTGT 0.00313 CTTA 0.00487 CTTC 0.00423 CTTG 0.00348 CTTT 0.00721 GAAA 0.00841 GAAC 0.00301 GAAG 0.00423 GAAT 0.00638 GACA 0.00313 GACC 0.00166 GACG 0.00138 GACT 0.00286 GAGA 0.00386 GAGC 0.00188 GAGG 0.00248 GAGT 0.00311 GATA 0.00444 GATC 0.00243 GATG 0.00311 GATT 0.00579 GCAA 0.00416 GCAC 0.00213 GCAG 0.00217 GCAT 0.00362 GCCA 0.00239 GCCC 0.000988 GCCG 0.000771 GCCT 0.00202 GCGA 0.00154 GCGC 0.000989 GCGG 0.000834 GCGT 0.00154 GCTA 0.00275 GCTC 0.00188 GCTG 0.00199 GCTT 0.00368 GGAA 0.00423 GGAC 0.00147 GGAG 0.00244 GGAT 0.0027 GGCA 0.00226 GGCC 0.00105 GGCG 0.000981 GGCT 0.00188 GGGA 0.00214 GGGC 0.000988 GGGG 0.00151 GGGT 0.00167 GGTA 0.00259 GGTC 0.00166 GGTG 0.00221 GGTT 0.00305 GTAA 0.00493 GTAC 0.00215 GTAG 0.00255 GTAT 0.00386 GTCA 0.00348 GTCC 0.00147 GTCG 0.00132 GTCT 0.00277 GTGA 0.00368 GTGC 0.00213 GTGG 0.0024 GTGT 0.00309 GTTA 0.00455 GTTC 0.00301 GTTG 0.00346 GTTT 0.00624 TAAA 0.012 TAAC 0.00455 TAAG 0.00487 TAAT 0.00981 TACA 0.00434 TACC 0.00259 TACG 0.00189 TACT 0.00466 TAGA 0.00445 TAGC 0.00275 TAGG 0.00249 TAGT 0.0042 TATA 0.00683 TATC 0.00444 TATG 0.00452 TATT 0.0112 TCAA 0.00748 TCAC 0.00368 TCAG 0.00359 TCAT 0.00612 TCCA 0.00394 TCCC 0.00214 TCCG 0.00133 TCCT 0.00342 TCGA 0.00307 TCGC 0.00154 TCGG 0.00144 TCGT 0.00247 TCTA 0.00445 TCTC 0.00387 TCTG 0.00354 TCTT 0.0061 TGAA 0.00793 TGAC 0.00348 TGAG 0.00373 TGAT 0.00573 TGCA 0.00431 TGCC 0.00226 TGCG 0.00171 TGCT 0.0038 TGGA 0.00394 TGGC 0.00238 TGGG 0.00219 TGGT 0.0035 TGTA 0.00434 TGTC 0.00313 TGTG 0.00379 TGTT 0.00583 TTAA 0.0115 TTAC 0.00493 TTAG 0.00492 TTAT 0.00981 TTCA 0.00793 TTCC 0.00423 TTCG 0.0032 TTCT 0.00666 TTGA 0.00748 TTGC 0.00416 TTGG 0.00429 TTGT 0.00603 TTTA 0.012 TTTC 0.00841 TTTG 0.00838 TTTT 0.0148 # l= 4 # Values AAAAA 0.00472 AAAAC 0.00216 AAAAG 0.00248 AAAAT 0.00548 AAACA 0.00219 AAACC 0.00109 AAACG 0.00105 AAACT 0.00192 AAAGA 0.00217 AAAGC 0.00137 AAAGG 0.00136 AAAGT 0.00231 AAATA 0.00469 AAATC 0.00227 AAATG 0.00305 AAATT 0.00529 AACAA 0.00206 AACAC 0.00103 AACAG 0.00113 AACAT 0.00161 AACCA 0.00117 AACCC 0.000538 AACCG 0.000465 AACCT 0.000883 AACGA 0.000882 AACGC 0.000548 AACGG 0.00045 AACGT 0.00073 AACTA 0.00151 AACTC 0.00105 AACTG 0.00122 AACTT 0.00198 AAGAA 0.00228 AAGAC 0.000943 AAGAG 0.00125 AAGAT 0.00162 AAGCA 0.00137 AAGCC 0.000684 AAGCG 0.000568 AAGCT 0.00106 AAGGA 0.00121 AAGGC 0.000757 AAGGG 0.000681 AAGGT 0.00108 AAGTA 0.00178 AAGTC 0.00107 AAGTG 0.00144 AAGTT 0.00198 AATAA 0.00425 AATAC 0.00156 AATAG 0.00182 AATAT 0.00352 AATCA 0.00217 AATCC 0.000991 AATCG 0.000979 AATCT 0.00165 AATGA 0.0025 AATGC 0.00147 AATGG 0.00141 AATGT 0.00192 AATTA 0.00383 AATTC 0.00233 AATTG 0.00245 AATTT 0.00529 ACAAA 0.00241 ACAAC 0.000935 ACAAG 0.000951 ACAAT 0.00173 ACACA 0.00112 ACACC 0.000575 ACACG 0.000442 ACACT 0.000954 ACAGA 0.00108 ACAGC 0.000607 ACAGG 0.000504 ACAGT 0.000948 ACATA 0.00122 ACATC 0.000856 ACATG 0.000844 ACATT 0.00192 ACCAA 0.00129 ACCAC 0.000709 ACCAG 0.000545 ACCAT 0.000959 ACCCA 0.000632 ACCCC 0.000343 ACCCG 0.000203 ACCCT 0.000496 ACCGA 0.000464 ACCGC 0.00027 ACCGG 0.000201 ACCGT 0.000376 ACCTA 0.000729 ACCTC 0.0007 ACCTG 0.000519 ACCTT 0.00108 ACGAA 0.000952 ACGAC 0.000383 ACGAG 0.000441 ACGAT 0.00069 ACGCA 0.000543 ACGCC 0.000302 ACGCG 0.000235 ACGCT 0.000459 ACGGA 0.000399 ACGGC 0.000238 ACGGG 0.000183 ACGGT 0.000376 ACGTA 0.000559 ACGTC 0.000431 ACGTG 0.000475 ACGTT 0.00073 ACTAA 0.00156 ACTAC 0.000745 ACTAG 0.000675 ACTAT 0.00123 ACTCA 0.00111 ACTCC 0.000609 ACTCG 0.00045 ACTCT 0.000949 ACTGA 0.00122 ACTGC 0.000702 ACTGG 0.000608 ACTGT 0.000948 ACTTA 0.00157 ACTTC 0.00128 ACTTG 0.00111 ACTTT 0.00231 AGAAA 0.00256 AGAAC 0.000921 AGAAG 0.00133 AGAAT 0.00185 AGACA 0.000998 AGACC 0.000499 AGACG 0.000464 AGACT 0.00081 AGAGA 0.00133 AGAGC 0.000614 AGAGG 0.000827 AGAGT 0.000949 AGATA 0.0014 AGATC 0.000739 AGATG 0.00102 AGATT 0.00165 AGCAA 0.00135 AGCAC 0.000658 AGCAG 0.00071 AGCAT 0.00108 AGCCA 0.000741 AGCCC 0.000319 AGCCG 0.000229 AGCCT 0.000594 AGCGA 0.00049 AGCGC 0.000295 AGCGG 0.000265 AGCGT 0.000459 AGCTA 0.000884 AGCTC 0.000563 AGCTG 0.000607 AGCTT 0.00106 AGGAA 0.00137 AGGAC 0.000476 AGGAG 0.000774 AGGAT 0.000796 AGGCA 0.000757 AGGCC 0.000333 AGGCG 0.000338 AGGCT 0.000594 AGGGA 0.000684 AGGGC 0.000324 AGGGG 0.000452 AGGGT 0.000496 AGGTA 0.000879 AGGTC 0.000551 AGGTG 0.000713 AGGTT 0.000883 AGTAA 0.00175 AGTAC 0.000738 AGTAG 0.000925 AGTAT 0.00125 AGTCA 0.00115 AGTCC 0.000464 AGTCG 0.000437 AGTCT 0.00081 AGTGA 0.00128 AGTGC 0.000718 AGTGG 0.000836 AGTGT 0.000954 AGTTA 0.00161 AGTTC 0.00101 AGTTG 0.00122 AGTTT 0.00192 ATAAA 0.00392 ATAAC 0.00137 ATAAG 0.00154 ATAAT 0.00298 ATACA 0.00129 ATACC 0.000717 ATACG 0.000598 ATACT 0.00125 ATAGA 0.0014 ATAGC 0.000837 ATAGG 0.000796 ATAGT 0.00123 ATATA 0.00253 ATATC 0.00143 ATATG 0.00153 ATATT 0.00352 ATCAA 0.0021 ATCAC 0.00102 ATCAG 0.00104 ATCAT 0.00157 ATCCA 0.00102 ATCCC 0.000494 ATCCG 0.000386 ATCCT 0.000796 ATCGA 0.000961 ATCGC 0.000455 ATCGG 0.000428 ATCGT 0.00069 ATCTA 0.00121 ATCTC 0.00101 ATCTG 0.00097 ATCTT 0.00162 ATGAA 0.00238 ATGAC 0.00107 ATGAG 0.0011 ATGAT 0.00157 ATGCA 0.00134 ATGCC 0.000662 ATGCG 0.000538 ATGCT 0.00108 ATGGA 0.00118 ATGGC 0.000719 ATGGG 0.000646 ATGGT 0.000959 ATGTA 0.00129 ATGTC 0.000891 ATGTG 0.00106 ATGTT 0.00161 ATTAA 0.0037 ATTAC 0.0015 ATTAG 0.00163 ATTAT 0.00298 ATTCA 0.00236 ATTCC 0.00117 ATTCG 0.001 ATTCT 0.00185 ATTGA 0.00227 ATTGC 0.00126 ATTGG 0.0014 ATTGT 0.00173 ATTTA 0.00413 ATTTC 0.00285 ATTTG 0.00284 ATTTT 0.00548 CAAAA 0.00289 CAAAC 0.00126 CAAAG 0.00139 CAAAT 0.00284 CAACA 0.00111 CAACC 0.000645 CAACG 0.000486 CAACT 0.00122 CAAGA 0.00107 CAAGC 0.000637 CAAGG 0.000659 CAAGT 0.00111 CAATA 0.00186 CAATC 0.00112 CAATG 0.00121 CAATT 0.00245 CACAA 0.00131 CACAC 0.000758 CACAG 0.000666 CACAT 0.00106 CACCA 0.000776 CACCC 0.000438 CACCG 0.000279 CACCT 0.000713 CACGA 0.000488 CACGC 0.000326 CACGG 0.000226 CACGT 0.000475 CACTA 0.000849 CACTC 0.000749 CACTG 0.000744 CACTT 0.00144 CAGAA 0.0013 CAGAC 0.000583 CAGAG 0.00069 CAGAT 0.00097 CAGCA 0.000717 CAGCC 0.000391 CAGCG 0.00027 CAGCT 0.000607 CAGGA 0.000558 CAGGC 0.000355 CAGGG 0.00029 CAGGT 0.000519 CAGTA 0.000896 CAGTC 0.000609 CAGTG 0.000744 CAGTT 0.00122 CATAA 0.00158 CATAC 0.000711 CATAG 0.0007 CATAT 0.00153 CATCA 0.00108 CATCC 0.000552 CATCG 0.000465 CATCT 0.00102 CATGA 0.00103 CATGC 0.000649 CATGG 0.000611 CATGT 0.000844 CATTA 0.00175 CATTC 0.0013 CATTG 0.00121 CATTT 0.00305 CCAAA 0.00152 CCAAC 0.000721 CCAAG 0.000651 CCAAT 0.0014 CCACA 0.000736 CCACC 0.00052 CCACG 0.000308 CCACT 0.000836 CCAGA 0.0006 CCAGC 0.000323 CCAGG 0.000299 CCAGT 0.000608 CCATA 0.000834 CCATC 0.000639 CCATG 0.000611 CCATT 0.00141 CCCAA 0.000742 CCCAC 0.000472 CCCAG 0.000335 CCCAT 0.000646 CCCCA 0.000431 CCCCC 0.000505 CCCCG 0.00012 CCCCT 0.000452 CCCGA 0.000247 CCCGC 0.00013 CCCGG 9.29e-05 CCCGT 0.000183 CCCTA 0.000435 CCCTC 0.000549 CCCTG 0.00029 CCCTT 0.000681 CCGAA 0.00054 CCGAC 0.000235 CCGAG 0.000233 CCGAT 0.000428 CCGCA 0.000276 CCGCC 0.000188 CCGCG 0.000104 CCGCT 0.000265 CCGGA 0.0002 CCGGC 0.000109 CCGGG 9.29e-05 CCGGT 0.000201 CCGTA 0.000296 CCGTC 0.000225 CCGTG 0.000226 CCGTT 0.00045 CCTAA 0.000835 CCTAC 0.000474 CCTAG 0.000383 CCTAT 0.000796 CCTCA 0.000738 CCTCC 0.000622 CCTCG 0.000292 CCTCT 0.000827 CCTGA 0.00057 CCTGC 0.00035 CCTGG 0.000299 CCTGT 0.000504 CCTTA 0.000876 CCTTC 0.000836 CCTTG 0.000659 CCTTT 0.00136 CGAAA 0.00118 CGAAC 0.000437 CGAAG 0.000583 CGAAT 0.001 CGACA 0.000426 CGACC 0.000258 CGACG 0.000195 CGACT 0.000437 CGAGA 0.000479 CGAGC 0.000241 CGAGG 0.000292 CGAGT 0.00045 CGATA 0.000687 CGATC 0.000403 CGATG 0.000465 CGATT 0.000979 CGCAA 0.000534 CGCAC 0.000356 CGCAG 0.000278 CGCAT 0.000538 CGCCA 0.000359 CGCCC 0.000165 CGCCG 0.000119 CGCCT 0.000338 CGCGA 0.000209 CGCGC 0.000156 CGCGG 0.000104 CGCGT 0.000235 CGCTA 0.000375 CGCTC 0.000295 CGCTG 0.00027 CGCTT 0.000568 CGGAA 0.00049 CGGAC 0.00019 CGGAG 0.000269 CGGAT 0.000386 CGGCA 0.000275 CGGCC 0.000147 CGGCG 0.000119 CGGCT 0.000229 CGGGA 0.000212 CGGGC 0.000119 CGGGG 0.00012 CGGGT 0.000203 CGGTA 0.000336 CGGTC 0.000232 CGGTG 0.000279 CGGTT 0.000465 CGTAA 0.000645 CGTAC 0.000307 CGTAG 0.000336 CGTAT 0.000598 CGTCA 0.000493 CGTCC 0.000232 CGTCG 0.000195 CGTCT 0.000464 CGTGA 0.000475 CGTGC 0.00029 CGTGG 0.000308 CGTGT 0.000442 CGTTA 0.000625 CGTTC 0.000449 CGTTG 0.000486 CGTTT 0.00105 CTAAA 0.00171 CTAAC 0.000806 CTAAG 0.00077 CTAAT 0.00163 CTACA 0.000747 CTACC 0.000544 CTACG 0.000336 CTACT 0.000925 CTAGA 0.000693 CTAGC 0.000405 CTAGG 0.000383 CTAGT 0.000675 CTATA 0.000957 CTATC 0.000783 CTATG 0.0007 CTATT 0.00182 CTCAA 0.00129 CTCAC 0.00069 CTCAG 0.000639 CTCAT 0.0011 CTCCA 0.00082 CTCCC 0.000576 CTCCG 0.000269 CTCCT 0.000774 CTCGA 0.000528 CTCGC 0.00026 CTCGG 0.000233 CTCGT 0.000441 CTCTA 0.00087 CTCTC 0.000901 CTCTG 0.00069 CTCTT 0.00125 CTGAA 0.00131 CTGAC 0.000599 CTGAG 0.000639 CTGAT 0.00104 CTGCA 0.000736 CTGCC 0.000447 CTGCG 0.000278 CTGCT 0.00071 CTGGA 0.000603 CTGGC 0.000348 CTGGG 0.000335 CTGGT 0.000545 CTGTA 0.000719 CTGTC 0.000617 CTGTG 0.000666 CTGTT 0.00113 CTTAA 0.00174 CTTAC 0.000813 CTTAG 0.00077 CTTAT 0.00154 CTTCA 0.00143 CTTCC 0.000878 CTTCG 0.000583 CTTCT 0.00133 CTTGA 0.00124 CTTGC 0.00064 CTTGG 0.000651 CTTGT 0.000951 CTTTA 0.00185 CTTTC 0.00148 CTTTG 0.00139 CTTTT 0.00248 GAAAA 0.00296 GAAAC 0.00113 GAAAG 0.00148 GAAAT 0.00285 GAACA 0.00107 GAACC 0.000477 GAACG 0.000449 GAACT 0.00101 GAAGA 0.00141 GAAGC 0.000699 GAAGG 0.000836 GAAGT 0.00128 GAATA 0.00187 GAATC 0.000885 GAATG 0.0013 GAATT 0.00233 GACAA 0.0011 GACAC 0.000523 GACAG 0.000617 GACAT 0.000891 GACCA 0.000621 GACCC 0.000257 GACCG 0.000232 GACCT 0.000551 GACGA 0.000466 GACGC 0.000262 GACGG 0.000225 GACGT 0.000431 GACTA 0.000719 GACTC 0.000465 GACTG 0.000609 GACTT 0.00107 GAGAA 0.00142 GAGAC 0.000533 GAGAG 0.000901 GAGAT 0.00101 GAGCA 0.000727 GAGCC 0.000297 GAGCG 0.000295 GAGCT 0.000563 GAGGA 0.00083 GAGGC 0.0004 GAGGG 0.000549 GAGGT 0.0007 GAGTA 0.000851 GAGTC 0.000465 GAGTG 0.000749 GAGTT 0.00105 GATAA 0.00161 GATAC 0.000607 GATAG 0.000783 GATAT 0.00143 GATCA 0.000915 GATCC 0.000373 GATCG 0.000403 GATCT 0.000739 GATGA 0.00108 GATGC 0.000543 GATGG 0.000639 GATGT 0.000856 GATTA 0.00151 GATTC 0.000885 GATTG 0.00112 GATTT 0.00227 GCAAA 0.00165 GCAAC 0.000612 GCAAG 0.00064 GCAAT 0.00126 GCACA 0.000757 GCACC 0.000366 GCACG 0.00029 GCACT 0.000718 GCAGA 0.000745 GCAGC 0.000375 GCAGG 0.00035 GCAGT 0.000702 GCATA 0.000959 GCATC 0.000543 GCATG 0.000649 GCATT 0.00147 GCCAA 0.000904 GCCAC 0.000414 GCCAG 0.000348 GCCAT 0.000719 GCCCA 0.000378 GCCCC 0.000168 GCCCG 0.000119 GCCCT 0.000324 GCCGA 0.000275 GCCGC 0.000149 GCCGG 0.000109 GCCGT 0.000238 GCCTA 0.000509 GCCTC 0.0004 GCCTG 0.000355 GCCTT 0.000757 GCGAA 0.000599 GCGAC 0.000225 GCGAG 0.00026 GCGAT 0.000455 GCGCA 0.000368 GCGCC 0.00017 GCGCG 0.000156 GCGCT 0.000295 GCGGA 0.000284 GCGGC 0.000149 GCGGG 0.00013 GCGGT 0.00027 GCGTA 0.000403 GCGTC 0.000262 GCGTG 0.000326 GCGTT 0.000548 GCTAA 0.00101 GCTAC 0.000504 GCTAG 0.000405 GCTAT 0.000837 GCTCA 0.000675 GCTCC 0.000354 GCTCG 0.000241 GCTCT 0.000614 GCTGA 0.00068 GCTGC 0.000375 GCTGG 0.000323 GCTGT 0.000607 GCTTA 0.000971 GCTTC 0.000699 GCTTG 0.000637 GCTTT 0.00137 GGAAA 0.00164 GGAAC 0.000534 GGAAG 0.000878 GGAAT 0.00117 GGACA 0.00056 GGACC 0.000212 GGACG 0.000232 GGACT 0.000464 GGAGA 0.000855 GGAGC 0.000354 GGAGG 0.000622 GGAGT 0.000609 GGATA 0.000782 GGATC 0.000373 GGATG 0.000552 GGATT 0.000991 GGCAA 0.00081 GGCAC 0.000338 GGCAG 0.000447 GGCAT 0.000662 GGCCA 0.000429 GGCCC 0.000138 GGCCG 0.000147 GGCCT 0.000333 GGCGA 0.000321 GGCGC 0.00017 GGCGG 0.000188 GGCGT 0.000302 GGCTA 0.00051 GGCTC 0.000297 GGCTG 0.000391 GGCTT 0.000684 GGGAA 0.000813 GGGAC 0.000256 GGGAG 0.000576 GGGAT 0.000494 GGGCA 0.000367 GGGCC 0.000138 GGGCG 0.000165 GGGCT 0.000319 GGGGA 0.000492 GGGGC 0.000168 GGGGG 0.000505 GGGGT 0.000343 GGGTA 0.00044 GGGTC 0.000257 GGGTG 0.000438 GGGTT 0.000538 GGTAA 0.000964 GGTAC 0.000367 GGTAG 0.000544 GGTAT 0.000717 GGTCA 0.000692 GGTCC 0.000212 GGTCG 0.000258 GGTCT 0.000499 GGTGA 0.000745 GGTGC 0.000366 GGTGG 0.00052 GGTGT 0.000575 GGTTA 0.000843 GGTTC 0.000477 GGTTG 0.000645 GGTTT 0.00109 GTAAA 0.00194 GTAAC 0.000672 GTAAG 0.000813 GTAAT 0.0015 GTACA 0.000733 GTACC 0.000367 GTACG 0.000307 GTACT 0.000738 GTAGA 0.000831 GTAGC 0.000504 GTAGG 0.000474 GTAGT 0.000745 GTATA 0.000979 GTATC 0.000607 GTATG 0.000711 GTATT 0.00156 GTCAA 0.00123 GTCAC 0.000583 GTCAG 0.000599 GTCAT 0.00107 GTCCA 0.000544 GTCCC 0.000256 GTCCG 0.00019 GTCCT 0.000476 GTCGA 0.000472 GTCGC 0.000225 GTCGG 0.000235 GTCGT 0.000383 GTCTA 0.000712 GTCTC 0.000533 GTCTG 0.000583 GTCTT 0.000943 GTGAA 0.00139 GTGAC 0.000583 GTGAG 0.00069 GTGAT 0.00102 GTGCA 0.000778 GTGCC 0.000338 GTGCG 0.000356 GTGCT 0.000658 GTGGA 0.000808 GTGGC 0.000414 GTGGG 0.000472 GTGGT 0.000709 GTGTA 0.00078 GTGTC 0.000523 GTGTG 0.000758 GTGTT 0.00103 GTTAA 0.0017 GTTAC 0.000672 GTTAG 0.000806 GTTAT 0.00137 GTTCA 0.00111 GTTCC 0.000534 GTTCG 0.000437 GTTCT 0.000921 GTTGA 0.00119 GTTGC 0.000612 GTTGG 0.000721 GTTGT 0.000935 GTTTA 0.00169 GTTTC 0.00113 GTTTG 0.00126 GTTTT 0.00216 TAAAA 0.00427 TAAAC 0.00169 TAAAG 0.00185 TAAAT 0.00413 TAACA 0.00146 TAACC 0.000843 TAACG 0.000625 TAACT 0.00161 TAAGA 0.00145 TAAGC 0.000971 TAAGG 0.000876 TAAGT 0.00157 TAATA 0.00273 TAATC 0.00151 TAATG 0.00175 TAATT 0.00383 TACAA 0.00155 TACAC 0.00078 TACAG 0.000719 TACAT 0.00129 TACCA 0.000936 TACCC 0.00044 TACCG 0.000336 TACCT 0.000879 TACGA 0.000629 TACGC 0.000403 TACGG 0.000296 TACGT 0.000559 TACTA 0.00113 TACTC 0.000851 TACTG 0.000896 TACTT 0.00178 TAGAA 0.00166 TAGAC 0.000712 TAGAG 0.00087 TAGAT 0.00121 TAGCA 0.000984 TAGCC 0.00051 TAGCG 0.000375 TAGCT 0.000884 TAGGA 0.000816 TAGGC 0.000509 TAGGG 0.000435 TAGGT 0.000729 TAGTA 0.00113 TAGTC 0.000719 TAGTG 0.000849 TAGTT 0.00151 TATAA 0.00237 TATAC 0.000979 TATAG 0.000957 TATAT 0.00253 TATCA 0.00157 TATCC 0.000782 TATCG 0.000687 TATCT 0.0014 TATGA 0.00151 TATGC 0.000959 TATGG 0.000834 TATGT 0.00122 TATTA 0.00273 TATTC 0.00187 TATTG 0.00186 TATTT 0.00469 TCAAA 0.00279 TCAAC 0.00119 TCAAG 0.00124 TCAAT 0.00227 TCACA 0.00118 TCACC 0.000745 TCACG 0.000475 TCACT 0.00128 TCAGA 0.00112 TCAGC 0.00068 TCAGG 0.00057 TCAGT 0.00122 TCATA 0.00151 TCATC 0.00108 TCATG 0.00103 TCATT 0.0025 TCCAA 0.00136 TCCAC 0.000808 TCCAG 0.000603 TCCAT 0.00118 TCCCA 0.000752 TCCCC 0.000492 TCCCG 0.000212 TCCCT 0.000684 TCCGA 0.000451 TCCGC 0.000284 TCCGG 0.0002 TCCGT 0.000399 TCCTA 0.000816 TCCTC 0.00083 TCCTG 0.000558 TCCTT 0.00121 TCGAA 0.00111 TCGAC 0.000472 TCGAG 0.000528 TCGAT 0.000961 TCGCA 0.00052 TCGCC 0.000321 TCGCG 0.000209 TCGCT 0.00049 TCGGA 0.000451 TCGGC 0.000275 TCGGG 0.000247 TCGGT 0.000464 TCGTA 0.000629 TCGTC 0.000466 TCGTG 0.000488 TCGTT 0.000882 TCTAA 0.00152 TCTAC 0.000831 TCTAG 0.000693 TCTAT 0.0014 TCTCA 0.00121 TCTCC 0.000855 TCTCG 0.000479 TCTCT 0.00133 TCTGA 0.00112 TCTGC 0.000745 TCTGG 0.0006 TCTGT 0.00108 TCTTA 0.00145 TCTTC 0.00141 TCTTG 0.00107 TCTTT 0.00217 TGAAA 0.00303 TGAAC 0.00111 TGAAG 0.00143 TGAAT 0.00236 TGACA 0.00115 TGACC 0.000692 TGACG 0.000493 TGACT 0.00115 TGAGA 0.00121 TGAGC 0.000675 TGAGG 0.000738 TGAGT 0.00111 TGATA 0.00157 TGATC 0.000915 TGATG 0.00108 TGATT 0.00217 TGCAA 0.00146 TGCAC 0.000778 TGCAG 0.000736 TGCAT 0.00134 TGCCA 0.000856 TGCCC 0.000367 TGCCG 0.000275 TGCCT 0.000757 TGCGA 0.00052 TGCGC 0.000368 TGCGG 0.000276 TGCGT 0.000543 TGCTA 0.000984 TGCTC 0.000727 TGCTG 0.000717 TGCTT 0.00137 TGGAA 0.00156 TGGAC 0.000544 TGGAG 0.00082 TGGAT 0.00102 TGGCA 0.000856 TGGCC 0.000429 TGGCG 0.000359 TGGCT 0.000741 TGGGA 0.000752 TGGGC 0.000378 TGGGG 0.000431 TGGGT 0.000632 TGGTA 0.000936 TGGTC 0.000621 TGGTG 0.000776 TGGTT 0.00117 TGTAA 0.00157 TGTAC 0.000733 TGTAG 0.000747 TGTAT 0.00129 TGTCA 0.00115 TGTCC 0.00056 TGTCG 0.000426 TGTCT 0.000998 TGTGA 0.00118 TGTGC 0.000757 TGTGG 0.000736 TGTGT 0.00112 TGTTA 0.00146 TGTTC 0.00107 TGTTG 0.00111 TGTTT 0.00219 TTAAA 0.00437 TTAAC 0.0017 TTAAG 0.00174 TTAAT 0.0037 TTACA 0.00157 TTACC 0.000964 TTACG 0.000645 TTACT 0.00175 TTAGA 0.00152 TTAGC 0.00101 TTAGG 0.000835 TTAGT 0.00156 TTATA 0.00237 TTATC 0.00161 TTATG 0.00158 TTATT 0.00425 TTCAA 0.00286 TTCAC 0.00139 TTCAG 0.00131 TTCAT 0.00238 TTCCA 0.00156 TTCCC 0.000813 TTCCG 0.00049 TTCCT 0.00137 TTCGA 0.00111 TTCGC 0.000599 TTCGG 0.00054 TTCGT 0.000952 TTCTA 0.00166 TTCTC 0.00142 TTCTG 0.0013 TTCTT 0.00228 TTGAA 0.00286 TTGAC 0.00123 TTGAG 0.00129 TTGAT 0.0021 TTGCA 0.00146 TTGCC 0.00081 TTGCG 0.000534 TTGCT 0.00135 TTGGA 0.00136 TTGGC 0.000904 TTGGG 0.000742 TTGGT 0.00129 TTGTA 0.00155 TTGTC 0.0011 TTGTG 0.00131 TTGTT 0.00206 TTTAA 0.00437 TTTAC 0.00194 TTTAG 0.00171 TTTAT 0.00392 TTTCA 0.00303 TTTCC 0.00164 TTTCG 0.00118 TTTCT 0.00256 TTTGA 0.00279 TTTGC 0.00165 TTTGG 0.00152 TTTGT 0.00241 TTTTA 0.00427 TTTTC 0.00296 TTTTG 0.00289 TTTTT 0.00472 [EMISSION] # Vector size (4^(k+1)) 1024 # Probabilities AAAAA 0.3174 AAAAC 0.1463 AAAAG 0.1682 AAAAT 0.3681 AAACA 0.3503 AAACC 0.175 AAACG 0.1682 AAACT 0.3064 AAAGA 0.3008 AAAGC 0.1907 AAAGG 0.189 AAAGT 0.3194 AAATA 0.3062 AAATC 0.1488 AAATG 0.2003 AAATT 0.3447 AACAA 0.3533 AACAC 0.177 AACAG 0.1949 AACAT 0.2748 AACCA 0.3815 AACCC 0.1771 AACCG 0.1526 AACCT 0.2889 AACGA 0.3374 AACGC 0.2106 AACGG 0.1727 AACGT 0.2794 AACTA 0.2617 AACTC 0.1828 AACTG 0.213 AACTT 0.3426 AAGAA 0.3735 AAGAC 0.1552 AAGAG 0.2069 AAGAT 0.2645 AAGCA 0.3723 AAGCC 0.1865 AAGCG 0.1546 AAGCT 0.2865 AAGGA 0.3249 AAGGC 0.2033 AAGGG 0.1833 AAGGT 0.2886 AAGTA 0.284 AAGTC 0.1705 AAGTG 0.2311 AAGTT 0.3144 AATAA 0.3809 AATAC 0.1401 AATAG 0.1641 AATAT 0.3148 AATCA 0.3743 AATCC 0.1719 AATCG 0.1697 AATCT 0.2841 AATGA 0.3422 AATGC 0.2009 AATGG 0.1943 AATGT 0.2625 AATTA 0.2751 AATTC 0.1681 AATTG 0.1773 AATTT 0.3795 ACAAA 0.3992 ACAAC 0.1557 ACAAG 0.1586 ACAAT 0.2864 ACACA 0.3618 ACACC 0.1866 ACACG 0.1436 ACACT 0.3081 ACAGA 0.3431 ACAGC 0.1941 ACAGG 0.1611 ACAGT 0.3018 ACATA 0.2514 ACATC 0.1778 ACATG 0.175 ACATT 0.3958 ACCAA 0.3679 ACCAC 0.2033 ACCAG 0.1559 ACCAT 0.273 ACCCA 0.3773 ACCCC 0.2058 ACCCG 0.1212 ACCCT 0.2958 ACCGA 0.3535 ACCGC 0.2065 ACCGG 0.1541 ACCGT 0.286 ACCTA 0.2404 ACCTC 0.2324 ACCTG 0.1717 ACCTT 0.3555 ACGAA 0.3849 ACGAC 0.1558 ACGAG 0.1799 ACGAT 0.2794 ACGCA 0.3524 ACGCC 0.1968 ACGCG 0.1537 ACGCT 0.2972 ACGGA 0.3327 ACGGC 0.2002 ACGGG 0.1535 ACGGT 0.3136 ACGTA 0.2543 ACGTC 0.1967 ACGTG 0.2174 ACGTT 0.3316 ACTAA 0.3696 ACTAC 0.178 ACTAG 0.1609 ACTAT 0.2915 ACTCA 0.3546 ACTCC 0.1965 ACTCG 0.1451 ACTCT 0.3038 ACTGA 0.3492 ACTGC 0.2023 ACTGG 0.1758 ACTGT 0.2726 ACTTA 0.2496 ACTTC 0.2056 ACTTG 0.1777 ACTTT 0.367 AGAAA 0.3835 AGAAC 0.1386 AGAAG 0.2014 AGAAT 0.2765 AGACA 0.3596 AGACC 0.1806 AGACG 0.1677 AGACT 0.292 AGAGA 0.357 AGAGC 0.1648 AGAGG 0.2237 AGAGT 0.2545 AGATA 0.2909 AGATC 0.1542 AGATG 0.213 AGATT 0.3418 AGCAA 0.3547 AGCAC 0.1741 AGCAG 0.1876 AGCAT 0.2836 AGCCA 0.393 AGCCC 0.1696 AGCCG 0.1223 AGCCT 0.3152 AGCGA 0.3241 AGCGC 0.1965 AGCGG 0.1763 AGCGT 0.3031 AGCTA 0.2842 AGCTC 0.1814 AGCTG 0.1957 AGCTT 0.3387 AGGAA 0.3997 AGGAC 0.1398 AGGAG 0.2282 AGGAT 0.2323 AGGCA 0.3735 AGGCC 0.1654 AGGCG 0.1677 AGGCT 0.2933 AGGGA 0.3493 AGGGC 0.1651 AGGGG 0.2323 AGGGT 0.2533 AGGTA 0.29 AGGTC 0.1825 AGGTG 0.2363 AGGTT 0.2913 AGTAA 0.3739 AGTAC 0.1592 AGTAG 0.1996 AGTAT 0.2673 AGTCA 0.4007 AGTCC 0.1625 AGTCG 0.1531 AGTCT 0.2837 AGTGA 0.3369 AGTGC 0.1898 AGTGG 0.2218 AGTGT 0.2515 AGTTA 0.2794 AGTTC 0.1758 AGTTG 0.2127 AGTTT 0.332 ATAAA 0.3993 ATAAC 0.1401 ATAAG 0.1579 ATAAT 0.3027 ATACA 0.3345 ATACC 0.1865 ATACG 0.1554 ATACT 0.3236 ATAGA 0.3279 ATAGC 0.1967 ATAGG 0.1876 ATAGT 0.2879 ATATA 0.2799 ATATC 0.1599 ATATG 0.1707 ATATT 0.3896 ATCAA 0.366 ATCAC 0.1785 ATCAG 0.1817 ATCAT 0.2737 ATCCA 0.3788 ATCCC 0.1835 ATCCG 0.1433 ATCCT 0.2944 ATCGA 0.3791 ATCGC 0.1797 ATCGG 0.1693 ATCGT 0.2719 ATCTA 0.2508 ATCTC 0.2112 ATCTG 0.2022 ATCTT 0.3358 ATGAA 0.3877 ATGAC 0.1752 ATGAG 0.1809 ATGAT 0.2562 ATGCA 0.3691 ATGCC 0.1832 ATGCG 0.1493 ATGCT 0.2984 ATGGA 0.3348 ATGGC 0.2061 ATGGG 0.1855 ATGGT 0.2736 ATGTA 0.2658 ATGTC 0.1842 ATGTG 0.2194 ATGTT 0.3306 ATTAA 0.3764 ATTAC 0.1536 ATTAG 0.1674 ATTAT 0.3025 ATTCA 0.3689 ATTCC 0.1845 ATTCG 0.1575 ATTCT 0.2891 ATTGA 0.3403 ATTGC 0.189 ATTGG 0.2107 ATTGT 0.26 ATTTA 0.2697 ATTTC 0.1869 ATTTG 0.186 ATTTT 0.3574 CAAAA 0.3446 CAAAC 0.1506 CAAAG 0.167 CAAAT 0.3378 CAACA 0.3195 CAACC 0.1874 CAACG 0.1409 CAACT 0.3522 CAAGA 0.3076 CAAGC 0.1835 CAAGG 0.19 CAAGT 0.3189 CAATA 0.2794 CAATC 0.1699 CAATG 0.1829 CAATT 0.3678 CACAA 0.3446 CACAC 0.201 CACAG 0.176 CACAT 0.2784 CACCA 0.3516 CACCC 0.1993 CACCG 0.1266 CACCT 0.3225 CACGA 0.3215 CACGC 0.216 CACGG 0.1492 CACGT 0.3133 CACTA 0.2239 CACTC 0.199 CACTG 0.1968 CACTT 0.3803 CAGAA 0.3659 CAGAC 0.1655 CAGAG 0.1953 CAGAT 0.2733 CAGCA 0.3605 CAGCC 0.1975 CAGCG 0.1367 CAGCT 0.3053 CAGGA 0.3234 CAGGC 0.2063 CAGGG 0.1693 CAGGT 0.301 CAGTA 0.258 CAGTC 0.1756 CAGTG 0.2149 CAGTT 0.3514 CATAA 0.348 CATAC 0.1583 CATAG 0.1554 CATAT 0.3383 CATCA 0.3459 CATCC 0.1777 CATCG 0.1496 CATCT 0.3268 CATGA 0.3291 CATGC 0.2068 CATGG 0.1952 CATGT 0.2689 CATTA 0.239 CATTC 0.1781 CATTG 0.1665 CATTT 0.4163 CCAAA 0.3542 CCAAC 0.1686 CCAAG 0.1524 CCAAT 0.3248 CCACA 0.3058 CCACC 0.2178 CCACG 0.1285 CCACT 0.3478 CCAGA 0.3274 CCAGC 0.177 CCAGG 0.1636 CCAGT 0.3319 CCATA 0.2377 CCATC 0.1833 CCATG 0.1751 CCATT 0.4039 CCCAA 0.337 CCCAC 0.2163 CCCAG 0.1529 CCCAT 0.2938 CCCCA 0.2846 CCCCC 0.3371 CCCCG 0.07959 CCCCT 0.2987 CCCGA 0.3779 CCCGC 0.1998 CCCGG 0.1425 CCCGT 0.2798 CCCTA 0.2217 CCCTC 0.2822 CCCTG 0.1486 CCCTT 0.3475 CCGAA 0.376 CCGAC 0.164 CCGAG 0.1626 CCGAT 0.2975 CCGCA 0.3319 CCGCC 0.2264 CCGCG 0.1243 CCGCT 0.3174 CCGGA 0.3304 CCGGC 0.1801 CCGGG 0.1548 CCGGT 0.3347 CCGTA 0.2471 CCGTC 0.1889 CCGTG 0.1893 CCGTT 0.3747 CCTAA 0.3348 CCTAC 0.1915 CCTAG 0.1541 CCTAT 0.3196 CCTCA 0.2966 CCTCC 0.2522 CCTCG 0.1178 CCTCT 0.3333 CCTGA 0.3302 CCTGC 0.2033 CCTGG 0.1741 CCTGT 0.2924 CCTTA 0.2343 CCTTC 0.2254 CCTTG 0.1771 CCTTT 0.3632 CGAAA 0.3673 CGAAC 0.1371 CGAAG 0.1831 CGAAT 0.3125 CGACA 0.3233 CGACC 0.1962 CGACG 0.1489 CGACT 0.3316 CGAGA 0.3273 CGAGC 0.1647 CGAGG 0.2003 CGAGT 0.3078 CGATA 0.2708 CGATC 0.1592 CGATG 0.1843 CGATT 0.3858 CGCAA 0.3117 CGCAC 0.2104 CGCAG 0.1632 CGCAT 0.3147 CGCCA 0.3648 CGCCC 0.169 CGCCG 0.1216 CGCCT 0.3445 CGCGA 0.2963 CGCGC 0.2229 CGCGG 0.147 CGCGT 0.3338 CGCTA 0.2481 CGCTC 0.1966 CGCTG 0.18 CGCTT 0.3754 CGGAA 0.3658 CGGAC 0.1427 CGGAG 0.2023 CGGAT 0.2891 CGGCA 0.3566 CGGCC 0.191 CGGCG 0.1548 CGGCT 0.2976 CGGGA 0.3235 CGGGC 0.1813 CGGGG 0.185 CGGGT 0.3102 CGGTA 0.2554 CGGTC 0.1774 CGGTG 0.2134 CGGTT 0.3538 CGTAA 0.3408 CGTAC 0.1643 CGTAG 0.1789 CGTAT 0.316 CGTCA 0.3553 CGTCC 0.1679 CGTCG 0.1415 CGTCT 0.3353 CGTGA 0.3124 CGTGC 0.1917 CGTGG 0.2042 CGTGT 0.2918 CGTTA 0.2395 CGTTC 0.1727 CGTTG 0.1871 CGTTT 0.4008 CTAAA 0.347 CTAAC 0.1643 CTAAG 0.157 CTAAT 0.3317 CTACA 0.2921 CTACC 0.2142 CTACG 0.1318 CTACT 0.3619 CTAGA 0.3212 CTAGC 0.1881 CTAGG 0.178 CTAGT 0.3127 CTATA 0.2241 CTATC 0.1846 CTATG 0.1647 CTATT 0.4266 CTCAA 0.3461 CTCAC 0.1865 CTCAG 0.1717 CTCAT 0.2957 CTCCA 0.3349 CTCCC 0.2375 CTCCG 0.1101 CTCCT 0.3175 CTCGA 0.3605 CTCGC 0.1786 CTCGG 0.1593 CTCGT 0.3015 CTCTA 0.2335 CTCTC 0.2434 CTCTG 0.1856 CTCTT 0.3374 CTGAA 0.3638 CTGAC 0.1677 CTGAG 0.1789 CTGAT 0.2897 CTGCA 0.3379 CTGCC 0.2066 CTGCG 0.1284 CTGCT 0.3272 CTGGA 0.3294 CTGGC 0.1898 CTGGG 0.1836 CTGGT 0.2972 CTGTA 0.2289 CTGTC 0.1971 CTGTG 0.2133 CTGTT 0.3607 CTTAA 0.3567 CTTAC 0.1677 CTTAG 0.159 CTTAT 0.3166 CTTCA 0.3378 CTTCC 0.2081 CTTCG 0.1383 CTTCT 0.3157 CTTGA 0.3541 CTTGC 0.184 CTTGG 0.188 CTTGT 0.2739 CTTTA 0.2564 CTTTC 0.2057 CTTTG 0.1938 CTTTT 0.3441 GAAAA 0.3508 GAAAC 0.1349 GAAAG 0.1765 GAAAT 0.3378 GAACA 0.3562 GAACC 0.159 GAACG 0.1497 GAACT 0.3352 GAAGA 0.3327 GAAGC 0.1652 GAAGG 0.1988 GAAGT 0.3032 GAATA 0.2927 GAATC 0.1393 GAATG 0.2042 GAATT 0.3638 GACAA 0.3515 GACAC 0.1675 GACAG 0.1973 GACAT 0.2837 GACCA 0.3735 GACCC 0.1554 GACCG 0.1399 GACCT 0.3311 GACGA 0.3369 GACGC 0.1892 GACGG 0.1633 GACGT 0.3107 GACTA 0.2514 GACTC 0.1632 GACTG 0.2132 GACTT 0.3722 GAGAA 0.3669 GAGAC 0.1384 GAGAG 0.2339 GAGAT 0.2608 GAGCA 0.3856 GAGCC 0.1584 GAGCG 0.1576 GAGCT 0.2985 GAGGA 0.3341 GAGGC 0.1617 GAGGG 0.2223 GAGGT 0.2818 GAGTA 0.2726 GAGTC 0.1497 GAGTG 0.2419 GAGTT 0.3358 GATAA 0.3628 GATAC 0.1373 GATAG 0.1773 GATAT 0.3226 GATCA 0.3766 GATCC 0.1539 GATCG 0.1659 GATCT 0.3036 GATGA 0.3451 GATGC 0.1744 GATGG 0.2056 GATGT 0.2749 GATTA 0.2608 GATTC 0.1535 GATTG 0.1952 GATTT 0.3905 GCAAA 0.3949 GCAAC 0.1482 GCAAG 0.1547 GCAAT 0.3022 GCACA 0.3553 GCACC 0.1722 GCACG 0.1363 GCACT 0.3362 GCAGA 0.3429 GCAGC 0.1732 GCAGG 0.1613 GCAGT 0.3226 GCATA 0.2643 GCATC 0.1508 GCATG 0.1799 GCATT 0.405 GCCAA 0.3784 GCCAC 0.174 GCCAG 0.146 GCCAT 0.3016 GCCCA 0.3829 GCCCC 0.1707 GCCCG 0.1199 GCCCT 0.3265 GCCGA 0.3552 GCCGC 0.1944 GCCGG 0.1406 GCCGT 0.3098 GCCTA 0.2515 GCCTC 0.1991 GCCTG 0.1756 GCCTT 0.3738 GCGAA 0.388 GCGAC 0.1468 GCGAG 0.1702 GCGAT 0.295 GCGCA 0.3711 GCGCC 0.1714 GCGCG 0.159 GCGCT 0.2985 GCGGA 0.3405 GCGGC 0.1795 GCGGG 0.1566 GCGGT 0.3235 GCGTA 0.2612 GCGTC 0.1703 GCGTG 0.2131 GCGTT 0.3554 GCTAA 0.3654 GCTAC 0.1842 GCTAG 0.1474 GCTAT 0.3031 GCTCA 0.3577 GCTCC 0.1892 GCTCG 0.1282 GCTCT 0.3249 GCTGA 0.3419 GCTGC 0.1893 GCTGG 0.1634 GCTGT 0.3055 GCTTA 0.2637 GCTTC 0.1903 GCTTG 0.1737 GCTTT 0.3723 GGAAA 0.3881 GGAAC 0.1267 GGAAG 0.2083 GGAAT 0.2769 GGACA 0.3809 GGACC 0.145 GGACG 0.1585 GGACT 0.3156 GGAGA 0.3491 GGAGC 0.1453 GGAGG 0.2563 GGAGT 0.2492 GGATA 0.2893 GGATC 0.1386 GGATG 0.2053 GGATT 0.3668 GGCAA 0.3582 GGCAC 0.1505 GGCAG 0.199 GGCAT 0.2924 GGCCA 0.4097 GGCCC 0.1317 GGCCG 0.1405 GGCCT 0.3182 GGCGA 0.3272 GGCGC 0.1728 GGCGG 0.1926 GGCGT 0.3074 GGCTA 0.2706 GGCTC 0.1584 GGCTG 0.2083 GGCTT 0.3627 GGGAA 0.3788 GGGAC 0.1199 GGGAG 0.2712 GGGAT 0.23 GGGCA 0.3707 GGGCC 0.1396 GGGCG 0.1678 GGGCT 0.3218 GGGGA 0.3253 GGGGC 0.111 GGGGG 0.3372 GGGGT 0.2265 GGGTA 0.2626 GGGTC 0.154 GGGTG 0.2625 GGGTT 0.321 GGTAA 0.3709 GGTAC 0.1419 GGTAG 0.2115 GGTAT 0.2757 GGTCA 0.4164 GGTCC 0.1279 GGTCG 0.1552 GGTCT 0.3006 GGTGA 0.3366 GGTGC 0.166 GGTGG 0.2373 GGTGT 0.2601 GGTTA 0.2758 GGTTC 0.1563 GGTTG 0.2123 GGTTT 0.3555 GTAAA 0.3932 GTAAC 0.1368 GTAAG 0.1657 GTAAT 0.3044 GTACA 0.3411 GTACC 0.1711 GTACG 0.1441 GTACT 0.3437 GTAGA 0.3246 GTAGC 0.198 GTAGG 0.1862 GTAGT 0.2913 GTATA 0.2533 GTATC 0.1581 GTATG 0.1856 GTATT 0.403 GTCAA 0.3528 GTCAC 0.1678 GTCAG 0.1725 GTCAT 0.307 GTCCA 0.3699 GTCCC 0.1754 GTCCG 0.1298 GTCCT 0.325 GTCGA 0.3585 GTCGC 0.1716 GTCGG 0.179 GTCGT 0.2908 GTCTA 0.2564 GTCTC 0.1932 GTCTG 0.2109 GTCTT 0.3395 GTGAA 0.3761 GTGAC 0.1585 GTGAG 0.1888 GTGAT 0.2765 GTGCA 0.364 GTGCC 0.1589 GTGCG 0.1683 GTGCT 0.3088 GTGGA 0.3359 GTGGC 0.172 GTGGG 0.1975 GTGGT 0.2947 GTGTA 0.2514 GTGTC 0.1696 GTGTG 0.247 GTGTT 0.332 GTTAA 0.373 GTTAC 0.1482 GTTAG 0.1781 GTTAT 0.3007 GTTCA 0.3699 GTTCC 0.1783 GTTCG 0.1459 GTTCT 0.3059 GTTGA 0.3429 GTTGC 0.1774 GTTGG 0.2093 GTTGT 0.2704 GTTTA 0.2706 GTTTC 0.1817 GTTTG 0.2019 GTTTT 0.3458 TAAAA 0.3569 TAAAC 0.1423 TAAAG 0.1557 TAAAT 0.3451 TAACA 0.3215 TAACC 0.1864 TAACG 0.138 TAACT 0.3541 TAAGA 0.2973 TAAGC 0.2001 TAAGG 0.1807 TAAGT 0.3219 TAATA 0.2774 TAATC 0.1547 TAATG 0.179 TAATT 0.3889 TACAA 0.3573 TACAC 0.18 TACAG 0.1661 TACAT 0.2967 TACCA 0.3608 TACCC 0.1707 TACCG 0.1297 TACCT 0.3388 TACGA 0.3327 TACGC 0.2139 TACGG 0.1574 TACGT 0.2961 TACTA 0.2419 TACTC 0.1832 TACTG 0.193 TACTT 0.382 TAGAA 0.3717 TAGAC 0.1608 TAGAG 0.1964 TAGAT 0.2711 TAGCA 0.357 TAGCC 0.1857 TAGCG 0.1364 TAGCT 0.3209 TAGGA 0.3271 TAGGC 0.205 TAGGG 0.1753 TAGGT 0.2925 TAGTA 0.268 TAGTC 0.1716 TAGTG 0.2026 TAGTT 0.3578 TATAA 0.3458 TATAC 0.1438 TATAG 0.1408 TATAT 0.3695 TATCA 0.3526 TATCC 0.1768 TATCG 0.1554 TATCT 0.3153 TATGA 0.3332 TATGC 0.2121 TATGG 0.185 TATGT 0.2697 TATTA 0.2443 TATTC 0.1684 TATTG 0.1677 TATTT 0.4196 TCAAA 0.3719 TCAAC 0.1595 TCAAG 0.1657 TCAAT 0.3028 TCACA 0.321 TCACC 0.2029 TCACG 0.1292 TCACT 0.3469 TCAGA 0.3115 TCAGC 0.1903 TCAGG 0.1594 TCAGT 0.3388 TCATA 0.2458 TCATC 0.1766 TCATG 0.1695 TCATT 0.4082 TCCAA 0.3435 TCCAC 0.206 TCCAG 0.1536 TCCAT 0.297 TCCCA 0.3506 TCCCC 0.2313 TCCCG 0.09894 TCCCT 0.3192 TCCGA 0.3377 TCCGC 0.2139 TCCGG 0.1497 TCCGT 0.2986 TCCTA 0.2381 TCCTC 0.2441 TCCTG 0.1634 TCCTT 0.3544 TCGAA 0.3606 TCGAC 0.1541 TCGAG 0.1726 TCGAT 0.3126 TCGCA 0.3366 TCGCC 0.2094 TCGCG 0.1364 TCGCT 0.3176 TCGGA 0.3133 TCGGC 0.1912 TCGGG 0.1726 TCGGT 0.3229 TCGTA 0.2546 TCGTC 0.19 TCGTG 0.1988 TCGTT 0.3567 TCTAA 0.3416 TCTAC 0.1877 TCTAG 0.1565 TCTAT 0.3142 TCTCA 0.3111 TCTCC 0.2215 TCTCG 0.1242 TCTCT 0.3431 TCTGA 0.315 TCTGC 0.2109 TCTGG 0.1701 TCTGT 0.304 TCTTA 0.2369 TCTTC 0.2318 TCTTG 0.1762 TCTTT 0.3551 TGAAA 0.3806 TGAAC 0.141 TGAAG 0.1814 TGAAT 0.297 TGACA 0.3293 TGACC 0.1997 TGACG 0.1418 TGACT 0.3291 TGAGA 0.3233 TGAGC 0.1812 TGAGG 0.1988 TGAGT 0.2966 TGATA 0.2728 TGATC 0.1604 TGATG 0.1891 TGATT 0.3777 TGCAA 0.3375 TGCAC 0.1813 TGCAG 0.1712 TGCAT 0.3099 TGCCA 0.3788 TGCCC 0.1633 TGCCG 0.1225 TGCCT 0.3355 TGCGA 0.3035 TGCGC 0.2159 TGCGG 0.1629 TGCGT 0.3177 TGCTA 0.2588 TGCTC 0.1918 TGCTG 0.1892 TGCTT 0.3602 TGGAA 0.394 TGGAC 0.1381 TGGAG 0.2088 TGGAT 0.2592 TGGCA 0.358 TGGCC 0.1808 TGGCG 0.1508 TGGCT 0.3104 TGGGA 0.342 TGGGC 0.1726 TGGGG 0.1974 TGGGT 0.288 TGGTA 0.2669 TGGTC 0.1779 TGGTG 0.2227 TGGTT 0.3325 TGTAA 0.3606 TGTAC 0.1697 TGTAG 0.173 TGTAT 0.2968 TGTCA 0.3659 TGTCC 0.179 TGTCG 0.1362 TGTCT 0.3189 TGTGA 0.3109 TGTGC 0.2 TGTGG 0.1945 TGTGT 0.2945 TGTTA 0.2504 TGTTC 0.1844 TGTTG 0.1905 TGTTT 0.3747 TTAAA 0.3786 TTAAC 0.1483 TTAAG 0.1518 TTAAT 0.3214 TTACA 0.3182 TTACC 0.1964 TTACG 0.1312 TTACT 0.3543 TTAGA 0.3087 TTAGC 0.2052 TTAGG 0.1701 TTAGT 0.316 TTATA 0.2407 TTATC 0.1651 TTATG 0.1613 TTATT 0.4329 TTCAA 0.3591 TTCAC 0.1758 TTCAG 0.1652 TTCAT 0.2999 TTCCA 0.3677 TTCCC 0.193 TTCCG 0.1158 TTCCT 0.3236 TTCGA 0.3464 TTCGC 0.1873 TTCGG 0.1695 TTCGT 0.2967 TTCTA 0.2481 TTCTC 0.2144 TTCTG 0.1953 TTCTT 0.3421 TTGAA 0.3805 TTGAC 0.1651 TTGAG 0.1735 TTGAT 0.2808 TTGCA 0.3503 TTGCC 0.1956 TTGCG 0.1289 TTGCT 0.3252 TTGGA 0.3155 TTGGC 0.2107 TTGGG 0.1734 TTGGT 0.3004 TTGTA 0.2571 TTGTC 0.1833 TTGTG 0.2181 TTGTT 0.3414 TTTAA 0.3646 TTTAC 0.1632 TTTAG 0.144 TTTAT 0.3282 TTTCA 0.3589 TTTCC 0.1963 TTTCG 0.1405 TTTCT 0.3043 TTTGA 0.3325 TTTGC 0.1965 TTTGG 0.1828 TTTGT 0.2882 TTTTA 0.2872 TTTTC 0.1999 TTTTG 0.1955 TTTTT 0.3174