input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.935	NA	NA	NA	8934000	8936999	2239	5238	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.4347	NA	NA	NA	8919000	8921999	6754	9753	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	74.5419	NA	NA	NA	27000	29999	11704	14703	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	91.006	NA	NA	NA	15000	17999	27326	30325	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.6449	NA	NA	NA	8955895	8958894	37714	40713	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	96.7762	NA	NA	NA	8958895	8961894	40678	43677	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	95.379	NA	NA	NA	8961895	8964894	43649	46648	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.9687	NA	NA	NA	8964895	8967894	46265	49264	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.3035	NA	NA	NA	8967895	8970894	49192	52191	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.2734	NA	NA	NA	8970895	8973894	52150	55149	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.8605	NA	NA	NA	8973895	8976894	55250	58249	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.4284	NA	NA	NA	8976895	8979894	58618	61617	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.0416	NA	NA	NA	8979895	8982894	61675	64674	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.8155	NA	NA	NA	8982895	8985894	64686	67685	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.5841	NA	NA	NA	8985895	8988894	67702	70701	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.1173	NA	NA	NA	8988895	8991894	70677	73676	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.9242	NA	NA	NA	8991895	8994894	73677	76676	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.5978	NA	NA	NA	8994895	8997894	76681	79680	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	92.3694	NA	NA	NA	8997895	9000894	80379	83378	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	95.7056	NA	NA	NA	9000895	9003894	83453	86452	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	96.4269	NA	NA	NA	9003895	9006894	86437	89436	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	96.5757	NA	NA	NA	9006895	9009894	90018	93017	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.2675	NA	NA	NA	1176000	1178999	102207	105206	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	94.5732	NA	NA	NA	5190000	5192999	105151	108150	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.202	NA	NA	NA	4248000	4250999	108527	111526	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.3737	NA	NA	NA	4245000	4247999	111499	114498	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.2675	NA	NA	NA	4242000	4244999	114496	117495	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	95.6874	NA	NA	NA	4239000	4241999	116885	119884	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.7236	NA	NA	NA	9051895	9054894	133756	136755	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.4069	NA	NA	NA	9054895	9057894	136732	139731	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.6345	NA	NA	NA	9057895	9060894	139684	142683	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	94.2302	NA	NA	NA	9060895	9063894	142730	145729	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	95.3935	NA	NA	NA	9063895	9066894	145784	148783	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	93.2455	NA	NA	NA	9096895	9099894	147180	150179	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	94.8103	NA	NA	NA	9093895	9096894	150098	153097	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	92.496	NA	NA	NA	9090895	9093894	152865	155864	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	91.1197	NA	NA	NA	9087895	9090894	155695	158694	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	89.1988	NA	NA	NA	9084895	9087894	158175	161174	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	93.1564	NA	NA	NA	9075895	9078894	161365	164364	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	95.5116	NA	NA	NA	9111895	9114894	165662	168661	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	89.6719	NA	NA	NA	9114895	9117894	168057	171056	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	91.6094	NA	NA	NA	9117895	9120894	170689	173688	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	93.6886	NA	NA	NA	9120895	9123894	173498	176497	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	96.2496	NA	NA	NA	9123895	9126894	176550	179549	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.3985	NA	NA	NA	9126895	9129894	179498	182497	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	96.3301	NA	NA	NA	9132895	9135894	184425	187424	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	96.3187	NA	NA	NA	9135895	9138894	187090	190089	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	89.941	NA	NA	NA	9141895	9144894	189254	192253	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	94.6685	NA	NA	NA	9144895	9147894	192037	195036	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	96.512	NA	NA	NA	9147895	9150894	194871	197870	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.5226	NA	NA	NA	9150895	9153894	197873	200872	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	94.8571	NA	NA	NA	9153895	9156894	200452	203451	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	96.9743	NA	NA	NA	8370000	8372999	219251	222250	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	89.5533	NA	NA	NA	4329000	4331999	227502	230501	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	95.4515	NA	NA	NA	9156895	9159894	239334	242333	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	96.6232	NA	NA	NA	9159895	9162894	242104	245103	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	93.6775	NA	NA	NA	9162895	9165894	245149	248148	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.1965	NA	NA	NA	9165895	9168894	247989	250988	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.7285	NA	NA	NA	9168895	9171894	250981	253980	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.2074	NA	NA	NA	9171895	9174894	254001	257000	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.2197	NA	NA	NA	9174895	9177894	256575	259574	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.6527	NA	NA	NA	9177895	9180894	259281	262280	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	96.4653	NA	NA	NA	9180895	9183894	263750	266749	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.9027	NA	NA	NA	9183895	9186894	266754	269753	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.9052	NA	NA	NA	9186895	9189894	269741	272740	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.9035	NA	NA	NA	9189895	9192894	272749	275748	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.4127	NA	NA	NA	9192895	9195894	275373	278372	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	94.9837	NA	NA	NA	9201895	9204894	278962	281961	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	84.8349	NA	NA	NA	900000	902999	284563	287562	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	82.1625	NA	NA	NA	903000	905999	287737	290736	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	95.9998	NA	NA	NA	8730000	8732999	292029	295028	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	95.0005	NA	NA	NA	909000	911999	293332	296331	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.2015	NA	NA	NA	6912000	6914999	307238	310237	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.5296	NA	NA	NA	5967000	5969999	313756	316755	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.7656	NA	NA	NA	5172000	5174999	316062	319061	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.2575	NA	NA	NA	5955000	5957999	320030	323029	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.4409	NA	NA	NA	9207895	9210894	324527	327526	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.6159	NA	NA	NA	9210895	9213894	327223	330222	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.6134	NA	NA	NA	9213895	9216894	330235	333234	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	92.9551	NA	NA	NA	9216895	9219894	333155	336154	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.3539	NA	NA	NA	9219895	9222894	336128	339127	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.3175	NA	NA	NA	9222895	9225894	339123	342122	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	93.711	NA	NA	NA	9225895	9228894	341581	344580	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.9544	NA	NA	NA	9252895	9255894	344033	347032	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.1998	NA	NA	NA	9255895	9258894	347043	350042	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	96.9983	NA	NA	NA	9258895	9261894	350061	353060	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	95.4161	NA	NA	NA	9261895	9264894	352948	355947	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	87.8629	NA	NA	NA	9264895	9267894	356348	359347	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.3323	NA	NA	NA	9267895	9270894	359498	362497	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.7274	NA	NA	NA	9270895	9273894	362386	365385	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	95.1203	NA	NA	NA	9276895	9279894	368719	371718	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	94.2732	NA	NA	NA	9279895	9282894	371860	374859	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	95.0447	NA	NA	NA	9282895	9285894	374409	377408	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.8605	NA	NA	NA	9285895	9288894	377063	380062	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	94.9808	NA	NA	NA	9288895	9291894	380203	383202	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	95.7239	NA	NA	NA	9321895	9324894	383209	386208	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.6961	NA	NA	NA	9324895	9327894	385427	388426	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.2992	NA	NA	NA	9327895	9330894	388339	391338	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	93.9111	NA	NA	NA	9330895	9333894	391451	394450	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	95.1476	NA	NA	NA	9333895	9336894	394450	397449	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.5683	NA	NA	NA	9336895	9339894	397463	400462	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	96.653	NA	NA	NA	9339895	9342894	400461	403460	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	91.0805	NA	NA	NA	9342895	9345894	403463	406462	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.7544	NA	NA	NA	9345895	9348894	406313	409312	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.0012	NA	NA	NA	9348895	9351894	409277	412276	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	95.5892	NA	NA	NA	9366895	9369894	413359	416358	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	95.729	NA	NA	NA	9369895	9372894	416352	419351	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.2688	NA	NA	NA	9372895	9375894	419307	422306	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	96.076	NA	NA	NA	9375895	9378894	422269	425268	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	96.4252	NA	NA	NA	9378895	9381894	425356	428355	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	95.2989	NA	NA	NA	9381895	9384894	427888	430887	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.0366	NA	NA	NA	9384895	9387894	430433	433432	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.6419	NA	NA	NA	9387895	9390894	433430	436429	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.0314	NA	NA	NA	9390895	9393894	436223	439222	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.9816	NA	NA	NA	9393895	9396894	438926	441925	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.2822	NA	NA	NA	9426895	9429894	442915	445914	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.5414	NA	NA	NA	9429895	9432894	445924	448923	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.1593	NA	NA	NA	9432895	9435894	448910	451909	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.0313	NA	NA	NA	9435895	9438894	452415	455414	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.1751	NA	NA	NA	9438895	9441894	455297	458296	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	94.9968	NA	NA	NA	9441895	9444894	458270	461269	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.9242	NA	NA	NA	9444895	9447894	461160	464159	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.5568	NA	NA	NA	9447895	9450894	464232	467231	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.4609	NA	NA	NA	9450895	9453894	467185	470184	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.0148	NA	NA	NA	9453895	9456894	470196	473195	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	93.5968	NA	NA	NA	9456895	9459894	473270	476269	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.2734	NA	NA	NA	9459895	9462894	476203	479202	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	95.8368	NA	NA	NA	9462895	9465894	479305	482304	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	95.8567	NA	NA	NA	9465895	9468894	482340	485339	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	96.6798	NA	NA	NA	9468895	9471894	485396	488395	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	92.2376	NA	NA	NA	9471895	9474894	487602	490601	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	86.5758	NA	NA	NA	9498895	9501894	489891	492890	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.7406	NA	NA	NA	9501895	9504894	492229	495228	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.4658	NA	NA	NA	9504895	9507894	495212	498211	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	92.3694	NA	NA	NA	9507895	9510894	498185	501184	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	93.4543	NA	NA	NA	9510895	9513894	501082	504081	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	95.5617	NA	NA	NA	9513895	9516894	503938	506937	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	92.2579	NA	NA	NA	9516895	9519894	507451	510450	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	91.739	NA	NA	NA	9519895	9522894	510597	513596	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	93.7434	NA	NA	NA	9522895	9525894	513312	516311	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	92.4897	NA	NA	NA	9525895	9528894	516684	519683	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	90.6898	NA	NA	NA	9534895	9537894	519659	522658	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.1309	NA	NA	NA	9537895	9540894	521750	524749	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.8029	NA	NA	NA	9546895	9549894	525692	528691	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.4485	NA	NA	NA	9549895	9552894	528621	531620	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	91.8559	NA	NA	NA	9558895	9561894	532087	535086	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	74.6492	NA	NA	NA	7380000	7382999	535425	538424	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	78.5376	NA	NA	NA	7377000	7379999	537028	540027	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	94.4207	NA	NA	NA	9561895	9564894	542494	545493	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	92.7815	NA	NA	NA	9600895	9603894	549388	552387	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.052	NA	NA	NA	9603895	9606894	552401	555400	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.2639	NA	NA	NA	9606895	9609894	555403	558402	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.1314	NA	NA	NA	9609895	9612894	558229	561228	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.2806	NA	NA	NA	9612895	9615894	560916	563915	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.4361	NA	NA	NA	9615895	9618894	564103	567102	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	95.7615	NA	NA	NA	9618895	9621894	566980	569979	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.1805	NA	NA	NA	9621895	9624894	569988	572987	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	95.9338	NA	NA	NA	9624895	9627894	572941	575940	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	94.2509	NA	NA	NA	9627895	9630894	575837	578836	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	96.732	NA	NA	NA	9630895	9633894	578860	581859	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.9206	NA	NA	NA	9633895	9636894	581861	584860	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.2218	NA	NA	NA	9636895	9639894	584844	587843	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.7234	NA	NA	NA	9639895	9642894	587893	590892	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.5736	NA	NA	NA	9642895	9645894	590839	593838	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.4382	NA	NA	NA	9645895	9648894	593869	596868	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.2977	NA	NA	NA	9648895	9651894	596885	599884	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.7472	NA	NA	NA	9651895	9654894	599880	602879	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.3832	NA	NA	NA	9654895	9657894	602873	605872	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.6713	NA	NA	NA	9657895	9660894	605871	608870	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.3988	NA	NA	NA	9660895	9663894	608872	611871	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.5237	NA	NA	NA	9663895	9666894	611691	614690	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.7621	NA	NA	NA	9666895	9669894	615313	618312	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.6923	NA	NA	NA	9669895	9672894	618327	621326	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.7117	NA	NA	NA	9672895	9675894	621319	624318	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.9459	NA	NA	NA	9675895	9678894	624319	627318	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.8963	NA	NA	NA	9678895	9681894	627326	630325	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.9967	NA	NA	NA	9681895	9684894	630259	633258	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.9745	NA	NA	NA	4200000	4202999	635721	638720	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.9874	NA	NA	NA	4191000	4193999	644710	647709	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.4974	NA	NA	NA	9684895	9687894	651626	654625	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	96.0362	NA	NA	NA	9723895	9726894	654661	657660	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.8773	NA	NA	NA	9726895	9729894	656941	659940	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.6102	NA	NA	NA	9729895	9732894	659940	662939	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.188	NA	NA	NA	9732895	9735894	663041	666040	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.063	NA	NA	NA	9735895	9738894	666013	669012	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	94.4685	NA	NA	NA	7050000	7052999	689398	692397	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.7778	NA	NA	NA	7056000	7058999	694866	697865	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.8398	NA	NA	NA	9741895	9744894	717818	720817	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	96.3146	NA	NA	NA	9744895	9747894	720812	723811	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.0314	NA	NA	NA	9747895	9750894	723706	726705	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.6659	NA	NA	NA	9750895	9753894	726707	729706	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.2935	NA	NA	NA	9753895	9756894	729709	732708	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.4251	NA	NA	NA	9756895	9759894	732709	735708	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.5921	NA	NA	NA	9759895	9762894	735719	738718	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.5534	NA	NA	NA	9762895	9765894	738714	741713	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.1654	NA	NA	NA	9765895	9768894	741720	744719	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.5445	NA	NA	NA	9768895	9771894	744724	747723	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.303	NA	NA	NA	9771895	9774894	747725	750724	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	92.5751	NA	NA	NA	9774895	9777894	750014	753013	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.0069	NA	NA	NA	255000	257999	767590	770589	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.3782	NA	NA	NA	852000	854999	782851	785850	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.9475	NA	NA	NA	849000	851999	785650	788649	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.8958	NA	NA	NA	846000	848999	788657	791656	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.7404	NA	NA	NA	843000	845999	791660	794659	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	90.0379	NA	NA	NA	9780895	9783894	799522	802521	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.6986	NA	NA	NA	9783895	9786894	802316	805315	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	96.3146	NA	NA	NA	9786895	9789894	805015	808014	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.6375	NA	NA	NA	11493895	11496894	808072	811071	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	93.5607	NA	NA	NA	11496895	11499894	810992	813991	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.5667	NA	NA	NA	11499895	11502894	813932	816931	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.1013	NA	NA	NA	9789895	9792894	818201	821200	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	96.8973	NA	NA	NA	9792895	9795894	820940	823939	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	92.9932	NA	NA	NA	9834895	9837894	823168	826167	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.6713	NA	NA	NA	9840895	9843894	828303	831302	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.4732	NA	NA	NA	9843895	9846894	831314	834313	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.2865	NA	NA	NA	9846895	9849894	841350	844349	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	96.0814	NA	NA	NA	9849895	9852894	844323	847322	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.639	NA	NA	NA	9852895	9855894	847297	850296	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.7738	NA	NA	NA	9855895	9858894	850302	853301	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.116	NA	NA	NA	9858895	9861894	853238	856237	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.7359	NA	NA	NA	9861895	9864894	856307	859306	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.3226	NA	NA	NA	9864895	9867894	860187	863186	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.4361	NA	NA	NA	9867895	9870894	863151	866150	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.7476	NA	NA	NA	9870895	9873894	866153	869152	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.3924	NA	NA	NA	9873895	9876894	869131	872130	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.3431	NA	NA	NA	9876895	9879894	872150	875149	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.0603	NA	NA	NA	9879895	9882894	875183	878182	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.8485	NA	NA	NA	9882895	9885894	878181	881180	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.1107	NA	NA	NA	9885895	9888894	881155	884154	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	96.3413	NA	NA	NA	9888895	9891894	884174	887173	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.867	NA	NA	NA	9891895	9894894	887397	890396	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.3392	NA	NA	NA	9894895	9897894	890355	893354	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	96.8897	NA	NA	NA	9897895	9900894	893442	896441	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	91.7284	NA	NA	NA	9939895	9942894	896673	899672	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.5547	NA	NA	NA	9942895	9945894	898568	901567	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	96.892	NA	NA	NA	9354895	9357894	907060	910059	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.2929	NA	NA	NA	9945895	9948894	911840	914839	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	95.801	NA	NA	NA	9948895	9951894	914301	917300	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	87.8381	NA	NA	NA	4701000	4703999	915472	918471	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.8754	NA	NA	NA	9951895	9954894	920644	923643	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.2337	NA	NA	NA	9954895	9957894	923650	926649	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.4217	NA	NA	NA	9957895	9960894	926653	929652	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.7645	NA	NA	NA	9960895	9963894	929647	932646	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.2564	NA	NA	NA	9963895	9966894	932649	935648	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.9905	NA	NA	NA	9966895	9969894	935634	938633	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.3752	NA	NA	NA	9969895	9972894	938637	941636	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.9516	NA	NA	NA	9972895	9975894	941652	944651	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.7407	NA	NA	NA	9978895	9981894	947565	950564	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	91.2148	NA	NA	NA	9984895	9987894	956410	959409	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	91.7278	NA	NA	NA	9987895	9990894	960458	963457	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.6241	NA	NA	NA	9990895	9993894	963284	966283	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	96.8073	NA	NA	NA	9993895	9996894	966271	969270	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.3536	NA	NA	NA	9996895	9999894	969261	972260	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.0111	NA	NA	NA	9999895	10002894	972247	975246	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.7076	NA	NA	NA	10002895	10005894	975214	978213	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.2426	NA	NA	NA	10005895	10008894	978800	981799	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.866	NA	NA	NA	10008895	10011894	981804	984803	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.3667	NA	NA	NA	10011895	10014894	984812	987811	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.791	NA	NA	NA	10014895	10017894	987824	990823	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.6573	NA	NA	NA	10017895	10020894	990826	993825	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.5865	NA	NA	NA	10020895	10023894	993682	996681	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.4923	NA	NA	NA	10023895	10026894	996941	999940	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.5257	NA	NA	NA	10026895	10029894	999942	1002941	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.4658	NA	NA	NA	10029895	10032894	1002926	1005925	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.5808	NA	NA	NA	10032895	10035894	1005893	1008892	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.7639	NA	NA	NA	10035895	10038894	1008875	1011874	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	94.2066	NA	NA	NA	10038895	10041894	1011927	1014926	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.2236	NA	NA	NA	10041895	10044894	1014833	1017832	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.6436	NA	NA	NA	10044895	10047894	1017836	1020835	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	96.2537	NA	NA	NA	10047895	10050894	1019632	1022631	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.1908	NA	NA	NA	10053895	10056894	1024241	1027240	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.3253	NA	NA	NA	10056895	10059894	1027168	1030167	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.9504	NA	NA	NA	10059895	10062894	1030197	1033196	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.8545	NA	NA	NA	10062895	10065894	1033183	1036182	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.0937	NA	NA	NA	10065895	10068894	1036194	1039193	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.33	NA	NA	NA	10068895	10071894	1039208	1042207	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.2873	NA	NA	NA	10071895	10074894	1042205	1045204	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.8282	NA	NA	NA	10074895	10077894	1045207	1048206	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.3333	NA	NA	NA	10077895	10080894	1048207	1051206	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.0069	NA	NA	NA	10080895	10083894	1051216	1054215	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.7187	NA	NA	NA	10083895	10086894	1054198	1057197	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.0861	NA	NA	NA	10086895	10089894	1057194	1060193	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.7914	NA	NA	NA	10089895	10092894	1060221	1063220	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.3901	NA	NA	NA	10092895	10095894	1063229	1066228	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	95.8951	NA	NA	NA	10095895	10098894	1066196	1069195	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	93.8556	NA	NA	NA	10098895	10101894	1069176	1072175	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	89.3226	NA	NA	NA	10101895	10104894	1072087	1075086	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	95.7075	NA	NA	NA	10104895	10107894	1074978	1077977	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	96.6545	NA	NA	NA	4485000	4487999	1077553	1080552	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	95.9533	NA	NA	NA	4488000	4490999	1079974	1082973	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	95.1868	NA	NA	NA	4491000	4493999	1083225	1086224	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.8958	NA	NA	NA	4494000	4496999	1086080	1089079	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.4417	NA	NA	NA	4497000	4499999	1089072	1092071	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.5135	NA	NA	NA	4500000	4502999	1092075	1095074	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.502	NA	NA	NA	4503000	4505999	1095061	1098060	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.915	NA	NA	NA	4515000	4517999	1098669	1101668	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.8223	NA	NA	NA	4518000	4520999	1101681	1104680	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.6922	NA	NA	NA	4521000	4523999	1104664	1107663	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.6713	NA	NA	NA	4524000	4526999	1107681	1110680	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.2494	NA	NA	NA	4527000	4529999	1110671	1113670	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.4157	NA	NA	NA	4530000	4532999	1113643	1116642	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	96.1394	NA	NA	NA	4533000	4535999	1116419	1119418	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	88.3738	NA	NA	NA	4536000	4538999	1120218	1123217	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	90.0165	NA	NA	NA	4545000	4547999	1122993	1125992	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.0422	NA	NA	NA	4548000	4550999	1125575	1128574	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.5832	NA	NA	NA	4551000	4553999	1128588	1131587	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.131	NA	NA	NA	4554000	4556999	1131544	1134543	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.2078	NA	NA	NA	4557000	4559999	1134533	1137532	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.8337	NA	NA	NA	4560000	4562999	1137549	1140548	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.8303	NA	NA	NA	4563000	4565999	1140567	1143566	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.4244	NA	NA	NA	4566000	4568999	1143549	1146548	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.0005	NA	NA	NA	4569000	4571999	1146540	1149539	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.2663	NA	NA	NA	4572000	4574999	1149536	1152535	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.3763	NA	NA	NA	4575000	4577999	1152474	1155473	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.8791	NA	NA	NA	4578000	4580999	1155599	1158598	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.9582	NA	NA	NA	4581000	4583999	1158529	1161528	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.5688	NA	NA	NA	4584000	4586999	1161537	1164536	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.9005	NA	NA	NA	4587000	4589999	1164522	1167521	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.0315	NA	NA	NA	4590000	4592999	1167530	1170529	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.4178	NA	NA	NA	4593000	4595999	1170456	1173455	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	87.9507	NA	NA	NA	1158000	1160999	1176028	1179027	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.6301	NA	NA	NA	7866000	7868999	1177562	1180561	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.6801	NA	NA	NA	7863000	7865999	1180561	1183560	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.659	NA	NA	NA	6015000	6017999	1183587	1186586	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.6428	NA	NA	NA	7857000	7859999	1186567	1189566	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	94.8481	NA	NA	NA	7854000	7856999	1189204	1192203	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	74.7584	NA	NA	NA	7944000	7946999	1208272	1211271	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	96.7819	NA	NA	NA	252000	254999	1213726	1216725	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	94.8187	NA	NA	NA	5166000	5168999	1231031	1234030	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.9393	NA	NA	NA	7017000	7019999	1236698	1239697	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.1339	NA	NA	NA	5976000	5978999	1238373	1241372	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.22	NA	NA	NA	8763000	8765999	1239868	1242867	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	94.5573	NA	NA	NA	7251000	7253999	1243075	1246074	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	91.312	NA	NA	NA	4617000	4619999	1247746	1250745	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.4697	NA	NA	NA	4620000	4622999	1249164	1252163	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.6606	NA	NA	NA	4623000	4625999	1252167	1255166	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.0691	NA	NA	NA	4626000	4628999	1255120	1258119	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.4364	NA	NA	NA	4629000	4631999	1258097	1261096	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.2873	NA	NA	NA	4632000	4634999	1260925	1263924	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.6998	NA	NA	NA	4635000	4637999	1263647	1266646	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.3774	NA	NA	NA	4638000	4640999	1266638	1269637	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.9018	NA	NA	NA	4641000	4643999	1269634	1272633	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.7035	NA	NA	NA	4644000	4646999	1272722	1275721	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.0517	NA	NA	NA	4647000	4649999	1275666	1278665	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.9464	NA	NA	NA	4650000	4652999	1278716	1281715	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.2998	NA	NA	NA	4653000	4655999	1281996	1284995	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.626	NA	NA	NA	4656000	4658999	1285027	1288026	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.7641	NA	NA	NA	4659000	4661999	1288010	1291009	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.4293	NA	NA	NA	4662000	4664999	1290997	1293996	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.249	NA	NA	NA	4665000	4667999	1294005	1297004	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.2403	NA	NA	NA	4668000	4670999	1297071	1300070	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	96.404	NA	NA	NA	4671000	4673999	1300431	1303430	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	96.6313	NA	NA	NA	4674000	4676999	1302431	1305430	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.9004	NA	NA	NA	4677000	4679999	1313607	1316606	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.3518	NA	NA	NA	4680000	4682999	1316249	1319248	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	96.8134	NA	NA	NA	4683000	4685999	1319238	1322237	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	94.5938	NA	NA	NA	4686000	4688999	1322265	1325264	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.0801	NA	NA	NA	4689000	4691999	1325140	1328139	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.7023	NA	NA	NA	4692000	4694999	1345678	1348677	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	95.5292	NA	NA	NA	4695000	4697999	1348684	1351683	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	95.5697	NA	NA	NA	4704000	4706999	1351804	1354803	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	94.1585	NA	NA	NA	4707000	4709999	1354518	1357517	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	91.1433	NA	NA	NA	4710000	4712999	1356997	1359996	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	93.9682	NA	NA	NA	858000	860999	1365471	1368470	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	96.6942	NA	NA	NA	1425000	1427999	1368491	1371490	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.0915	NA	NA	NA	4797000	4799999	1384990	1387989	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.7355	NA	NA	NA	4800000	4802999	1387546	1390545	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.8762	NA	NA	NA	4803000	4805999	1390554	1393553	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.7516	NA	NA	NA	4806000	4808999	1393549	1396548	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.8243	NA	NA	NA	4809000	4811999	1396535	1399534	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.4155	NA	NA	NA	4812000	4814999	1399554	1402553	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.9327	NA	NA	NA	4815000	4817999	1402586	1405585	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.8675	NA	NA	NA	4818000	4820999	1405569	1408568	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.1032	NA	NA	NA	4821000	4823999	1408584	1411583	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.9488	NA	NA	NA	4824000	4826999	1411592	1414591	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	96.4356	NA	NA	NA	4827000	4829999	1414393	1417392	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.1929	NA	NA	NA	4833000	4835999	1418393	1421392	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.2503	NA	NA	NA	4839000	4841999	1430377	1433376	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.06	NA	NA	NA	4842000	4844999	1433182	1436181	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.9974	NA	NA	NA	4845000	4847999	1439392	1442391	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.5074	NA	NA	NA	4848000	4850999	1442534	1445533	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.5993	NA	NA	NA	4851000	4853999	1445464	1448463	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.1222	NA	NA	NA	4854000	4856999	1448459	1451458	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.6468	NA	NA	NA	4857000	4859999	1451475	1454474	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.2553	NA	NA	NA	4863000	4865999	1457571	1460570	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.8805	NA	NA	NA	4866000	4868999	1460508	1463507	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.9429	NA	NA	NA	4869000	4871999	1463494	1466493	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.0768	NA	NA	NA	4872000	4874999	1466525	1469524	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.519	NA	NA	NA	4875000	4877999	1469512	1472511	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.8566	NA	NA	NA	4878000	4880999	1472517	1475516	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.6605	NA	NA	NA	4881000	4883999	1475501	1478500	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.273	NA	NA	NA	4911000	4913999	1480872	1483871	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.1388	NA	NA	NA	4914000	4916999	1482972	1485971	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.1628	NA	NA	NA	4917000	4919999	1485969	1488968	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	96.5913	NA	NA	NA	4920000	4922999	1489502	1492501	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.0786	NA	NA	NA	4923000	4925999	1492513	1495512	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.051	NA	NA	NA	4926000	4928999	1495534	1498533	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.9753	NA	NA	NA	4929000	4931999	1498528	1501527	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.2601	NA	NA	NA	4932000	4934999	1501526	1504525	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.7055	NA	NA	NA	4935000	4937999	1504545	1507544	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.2218	NA	NA	NA	4938000	4940999	1507568	1510567	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.7138	NA	NA	NA	4941000	4943999	1510120	1513119	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.1644	NA	NA	NA	4944000	4946999	1513024	1516023	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.1972	NA	NA	NA	4947000	4949999	1515923	1518922	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.0914	NA	NA	NA	4950000	4952999	1518883	1521882	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.1358	NA	NA	NA	4953000	4955999	1521932	1524931	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.48	NA	NA	NA	4956000	4958999	1524912	1527911	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.1528	NA	NA	NA	4959000	4961999	1527795	1530794	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.4131	NA	NA	NA	4962000	4964999	1530790	1533789	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.5165	NA	NA	NA	4965000	4967999	1533775	1536774	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.5891	NA	NA	NA	4968000	4970999	1536779	1539778	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.7768	NA	NA	NA	4971000	4973999	1539769	1542768	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.9333	NA	NA	NA	4974000	4976999	1542792	1545791	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.8086	NA	NA	NA	4977000	4979999	1545787	1548786	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.9204	NA	NA	NA	4980000	4982999	1548753	1551752	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.1804	NA	NA	NA	4983000	4985999	1551632	1554631	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.3898	NA	NA	NA	5004000	5006999	1554861	1557860	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.4537	NA	NA	NA	5007000	5009999	1557857	1560856	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.2282	NA	NA	NA	5010000	5012999	1560863	1563862	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.8377	NA	NA	NA	5013000	5015999	1563872	1566871	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.6922	NA	NA	NA	5016000	5018999	1566884	1569883	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.8011	NA	NA	NA	5019000	5021999	1569875	1572874	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.5795	NA	NA	NA	5022000	5024999	1572877	1575876	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.7141	NA	NA	NA	5025000	5027999	1575871	1578870	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.9068	NA	NA	NA	5028000	5030999	1578865	1581864	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.9056	NA	NA	NA	5031000	5033999	1581882	1584881	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.7483	NA	NA	NA	5034000	5036999	1584879	1587878	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.8484	NA	NA	NA	5037000	5039999	1587875	1590874	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.6652	NA	NA	NA	5040000	5042999	1590870	1593869	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.6631	NA	NA	NA	5043000	5045999	1593854	1596853	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.6448	NA	NA	NA	5046000	5048999	1596865	1599864	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.0515	NA	NA	NA	5049000	5051999	1599860	1602859	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.1996	NA	NA	NA	5052000	5054999	1602874	1605873	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.5633	NA	NA	NA	5055000	5057999	1605872	1608871	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.7895	NA	NA	NA	5058000	5060999	1608875	1611874	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.9027	NA	NA	NA	5061000	5063999	1611856	1614855	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.8667	NA	NA	NA	5064000	5066999	1614874	1617873	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.6211	NA	NA	NA	5067000	5069999	1617901	1620900	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.8747	NA	NA	NA	5070000	5072999	1620890	1623889	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	5073000	5075999	1623888	1626887	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.9172	NA	NA	NA	5076000	5078999	1626899	1629898	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.8608	NA	NA	NA	5079000	5081999	1629877	1632876	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.7867	NA	NA	NA	5082000	5084999	1632878	1635877	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.9486	NA	NA	NA	5085000	5087999	1635880	1638879	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.9595	NA	NA	NA	5088000	5090999	1638893	1641892	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.9722	NA	NA	NA	5091000	5093999	1641879	1644878	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.8975	NA	NA	NA	5094000	5096999	1644884	1647883	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.8918	NA	NA	NA	5097000	5099999	1647892	1650891	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.8839	NA	NA	NA	5100000	5102999	1650872	1653871	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.8626	NA	NA	NA	5103000	5105999	1653882	1656881	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.8211	NA	NA	NA	5106000	5108999	1656888	1659887	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.9738	NA	NA	NA	5109000	5111999	1659868	1662867	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.8602	NA	NA	NA	5112000	5114999	1662878	1665877	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	5115000	5117999	1665885	1668884	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.9601	NA	NA	NA	5118000	5120999	1668883	1671882	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	96.0229	NA	NA	NA	5127000	5129999	1673485	1676484	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.7374	NA	NA	NA	5130000	5132999	1675250	1678249	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.7641	NA	NA	NA	5133000	5135999	1678265	1681264	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.4128	NA	NA	NA	5136000	5138999	1681259	1684258	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	96.9565	NA	NA	NA	5151000	5153999	1685603	1688602	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.9479	NA	NA	NA	5154000	5156999	1688150	1691149	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.0259	NA	NA	NA	5196000	5198999	1692573	1695572	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.829	NA	NA	NA	5199000	5201999	1695434	1698433	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.9687	NA	NA	NA	5202000	5204999	1698430	1701429	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.2923	NA	NA	NA	5205000	5207999	1701430	1704429	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.516	NA	NA	NA	5208000	5210999	1725051	1728050	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.8197	NA	NA	NA	5211000	5213999	1727485	1730484	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.6051	NA	NA	NA	5214000	5216999	1730485	1733484	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.933	NA	NA	NA	5217000	5219999	1733484	1736483	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.5357	NA	NA	NA	5220000	5222999	1736481	1739480	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.411	NA	NA	NA	5223000	5225999	1739483	1742482	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.986	NA	NA	NA	5226000	5228999	1742488	1745487	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.1959	NA	NA	NA	5229000	5231999	1745490	1748489	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.3783	NA	NA	NA	5232000	5234999	1748482	1751481	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.4247	NA	NA	NA	5235000	5237999	1751486	1754485	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.9103	NA	NA	NA	5238000	5240999	1754493	1757492	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.0459	NA	NA	NA	5241000	5243999	1757636	1760635	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.8243	NA	NA	NA	5244000	5246999	1760688	1763687	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.0695	NA	NA	NA	5247000	5249999	1763684	1766683	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.5265	NA	NA	NA	5250000	5252999	1766712	1769711	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.8094	NA	NA	NA	5253000	5255999	1769714	1772713	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.8931	NA	NA	NA	5256000	5258999	1772724	1775723	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.1279	NA	NA	NA	5259000	5261999	1775721	1778720	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.45	NA	NA	NA	5262000	5264999	1778734	1781733	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.4972	NA	NA	NA	5265000	5267999	1781768	1784767	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.7234	NA	NA	NA	5268000	5270999	1784711	1787710	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.7641	NA	NA	NA	5271000	5273999	1787705	1790704	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	5274000	5276999	1790714	1793713	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.7137	NA	NA	NA	5277000	5279999	1793714	1796713	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.1574	NA	NA	NA	5280000	5282999	1796706	1799705	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.4681	NA	NA	NA	5283000	5285999	1799741	1802740	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	96.4166	NA	NA	NA	5286000	5288999	1808852	1811851	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.591	NA	NA	NA	5289000	5291999	1811631	1814630	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.9611	NA	NA	NA	5292000	5294999	1814635	1817634	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.4043	NA	NA	NA	5295000	5297999	1817633	1820632	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.1034	NA	NA	NA	5298000	5300999	1820641	1823640	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.1829	NA	NA	NA	5301000	5303999	1823645	1826644	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.5766	NA	NA	NA	5304000	5306999	1826628	1829627	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.659	NA	NA	NA	5307000	5309999	1829636	1832635	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.796	NA	NA	NA	5310000	5312999	1832650	1835649	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.1654	NA	NA	NA	5313000	5315999	1835648	1838647	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.3924	NA	NA	NA	5316000	5318999	1838613	1841612	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.1809	NA	NA	NA	5319000	5321999	1841664	1844663	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.3351	NA	NA	NA	5322000	5324999	1844658	1847657	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.6453	NA	NA	NA	5325000	5327999	1847640	1850639	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.1719	NA	NA	NA	5328000	5330999	1850663	1853662	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.7017	NA	NA	NA	5331000	5333999	1853698	1856697	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.6576	NA	NA	NA	5334000	5336999	1856681	1859680	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.9679	NA	NA	NA	5337000	5339999	1859697	1862696	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	93.5051	NA	NA	NA	5340000	5342999	1862694	1865693	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.3599	NA	NA	NA	5343000	5345999	1865673	1868672	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.759	NA	NA	NA	5346000	5348999	1868662	1871661	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.0662	NA	NA	NA	5349000	5351999	1871673	1874672	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.2186	NA	NA	NA	5352000	5354999	1874677	1877676	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.6506	NA	NA	NA	5355000	5357999	1877642	1880641	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.1719	NA	NA	NA	5358000	5360999	1880594	1883593	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.3513	NA	NA	NA	5361000	5363999	1883511	1886510	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	93.4206	NA	NA	NA	5364000	5366999	1886500	1889499	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.8188	NA	NA	NA	5367000	5369999	1889482	1892481	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.9279	NA	NA	NA	5370000	5372999	1892488	1895487	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.4975	NA	NA	NA	5373000	5375999	1895505	1898504	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.9609	NA	NA	NA	5376000	5378999	1898501	1901500	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	5379000	5381999	1901500	1904499	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.8954	NA	NA	NA	5382000	5384999	1904499	1907498	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.9613	NA	NA	NA	5385000	5387999	1907501	1910500	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.0294	NA	NA	NA	5391000	5393999	1910748	1913747	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.6287	NA	NA	NA	5394000	5396999	1913697	1916696	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.7358	NA	NA	NA	5397000	5399999	1916651	1919650	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.5871	NA	NA	NA	5400000	5402999	1919651	1922650	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.5469	NA	NA	NA	5403000	5405999	1922442	1925441	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.7845	NA	NA	NA	5409000	5411999	1927147	1930146	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.7449	NA	NA	NA	5412000	5414999	1930140	1933139	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.7652	NA	NA	NA	5415000	5417999	1933149	1936148	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.8927	NA	NA	NA	5418000	5420999	1936154	1939153	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.7483	NA	NA	NA	5421000	5423999	1939143	1942142	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.502	NA	NA	NA	5424000	5426999	1942140	1945139	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.897	NA	NA	NA	5427000	5429999	1945196	1948195	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.9399	NA	NA	NA	5430000	5432999	1948320	1951319	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.2491	NA	NA	NA	5433000	5435999	1951312	1954311	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.515	NA	NA	NA	5436000	5438999	1954323	1957322	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	96.9464	NA	NA	NA	5439000	5441999	1956790	1959789	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.1442	NA	NA	NA	5451000	5453999	1960721	1963720	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.8656	NA	NA	NA	5454000	5456999	1963708	1966707	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.1739	NA	NA	NA	5457000	5459999	1966691	1969690	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	96.8702	NA	NA	NA	5460000	5462999	1969656	1972655	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.0662	NA	NA	NA	9810895	9813894	1984497	1987496	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.5013	NA	NA	NA	7749000	7751999	1985043	1988042	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	96.6563	NA	NA	NA	5463000	5465999	1996011	1999010	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.8572	NA	NA	NA	5466000	5468999	1998879	2001878	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.8392	NA	NA	NA	5469000	5471999	2001897	2004896	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.9516	NA	NA	NA	5472000	5474999	2004889	2007888	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.8302	NA	NA	NA	5475000	5477999	2007883	2010882	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.3906	NA	NA	NA	5478000	5480999	2010879	2013878	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.2274	NA	NA	NA	5481000	5483999	2013888	2016887	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.847	NA	NA	NA	5484000	5486999	2016864	2019863	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.5506	NA	NA	NA	5487000	5489999	2019538	2022537	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.9736	NA	NA	NA	5520000	5522999	2022725	2025724	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.8832	NA	NA	NA	5523000	5525999	2025745	2028744	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.4043	NA	NA	NA	5526000	5528999	2028734	2031733	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.8815	NA	NA	NA	5529000	5531999	2031726	2034725	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.6102	NA	NA	NA	5532000	5534999	2034727	2037726	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.2494	NA	NA	NA	5535000	5537999	2037721	2040720	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.9299	NA	NA	NA	5538000	5540999	2040721	2043720	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.906	NA	NA	NA	5541000	5543999	2043723	2046722	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	96.1278	NA	NA	NA	5544000	5546999	2045469	2048468	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.8862	NA	NA	NA	5547000	5549999	2047688	2050687	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	95.9758	NA	NA	NA	6465000	6467999	2052610	2055609	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	94.7734	NA	NA	NA	8472000	8474999	2054902	2057901	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.0964	NA	NA	NA	6030000	6032999	2058471	2061470	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.7796	NA	NA	NA	1386000	1388999	2067477	2070476	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.7674	NA	NA	NA	1383000	1385999	2070390	2073389	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.3669	NA	NA	NA	1422000	1424999	2071933	2074932	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.3484	NA	NA	NA	834000	836999	2076805	2079804	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.6811	NA	NA	NA	7623000	7625999	2078263	2081262	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	94.7257	NA	NA	NA	9825895	9828894	2080362	2083361	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	96.0292	NA	NA	NA	2130000	2132999	2085055	2088054	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.6057	NA	NA	NA	5556000	5558999	2089598	2092597	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.2963	NA	NA	NA	5559000	5561999	2092604	2095603	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.4043	NA	NA	NA	5562000	5564999	2095599	2098598	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.5416	NA	NA	NA	5565000	5567999	2098602	2101601	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.4294	NA	NA	NA	5568000	5570999	2101363	2104362	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.3221	NA	NA	NA	5571000	5573999	2104222	2107221	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.4366	NA	NA	NA	5574000	5576999	2107235	2110234	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.4904	NA	NA	NA	5577000	5579999	2110228	2113227	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.746	NA	NA	NA	5580000	5582999	2113234	2116233	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.7248	NA	NA	NA	5583000	5585999	2116237	2119236	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.8481	NA	NA	NA	5586000	5588999	2119073	2122072	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.9432	NA	NA	NA	5589000	5591999	2121764	2124763	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.8188	NA	NA	NA	5592000	5594999	2124786	2127785	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.8575	NA	NA	NA	5595000	5597999	2127756	2130755	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.5806	NA	NA	NA	5598000	5600999	2130731	2133730	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.4288	NA	NA	NA	5601000	5603999	2133751	2136750	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.9602	NA	NA	NA	5604000	5606999	2136764	2139763	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.4757	NA	NA	NA	5607000	5609999	2139762	2142761	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.8614	NA	NA	NA	5610000	5612999	2142760	2145759	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.9449	NA	NA	NA	5613000	5615999	2145756	2148755	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.4301	NA	NA	NA	5616000	5618999	2148766	2151765	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.7923	NA	NA	NA	5619000	5621999	2151762	2154761	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.9	NA	NA	NA	5622000	5624999	2154763	2157762	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.8936	NA	NA	NA	5625000	5627999	2157761	2160760	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.8667	NA	NA	NA	5628000	5630999	2160758	2163757	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.9746	NA	NA	NA	5631000	5633999	2163749	2166748	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	5634000	5636999	2166761	2169760	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.6174	NA	NA	NA	5637000	5639999	2169757	2172756	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.9735	NA	NA	NA	5640000	5642999	2172743	2175742	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.8085	NA	NA	NA	5643000	5645999	2175747	2178746	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.8288	NA	NA	NA	5646000	5648999	2178740	2181739	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.8971	NA	NA	NA	5649000	5651999	2181736	2184735	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	5652000	5654999	2184745	2187744	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.9064	NA	NA	NA	5655000	5657999	2187731	2190730	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.7093	NA	NA	NA	5658000	5660999	2190740	2193739	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.8899	NA	NA	NA	5661000	5663999	2193749	2196748	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.818	NA	NA	NA	5664000	5666999	2196748	2199747	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.8763	NA	NA	NA	5667000	5669999	2199676	2202675	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.2356	NA	NA	NA	5670000	5672999	2202392	2205391	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.5348	NA	NA	NA	5673000	5675999	2205208	2208207	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.4801	NA	NA	NA	5676000	5678999	2208189	2211188	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	96.4166	NA	NA	NA	10413895	10416894	2219964	2222963	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.7256	NA	NA	NA	7032000	7034999	2220418	2223417	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.0729	NA	NA	NA	7029000	7031999	2223391	2226390	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	94.9124	NA	NA	NA	5163000	5165999	2258923	2261922	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	95.4655	NA	NA	NA	7002000	7004999	2263518	2266517	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	96.5397	NA	NA	NA	5748000	5750999	2271830	2274829	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	96.7104	NA	NA	NA	10368895	10371894	2278822	2281821	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.7231	NA	NA	NA	5730000	5732999	2286947	2289946	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.0014	NA	NA	NA	5733000	5735999	2290452	2293451	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	94.8103	NA	NA	NA	10410895	10413894	2295463	2298462	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	96.471	NA	NA	NA	10404895	10407894	2301399	2304398	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	90.3186	NA	NA	NA	5688000	5690999	2303750	2306749	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.8428	NA	NA	NA	10392895	10395894	2311604	2314603	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	90.6253	NA	NA	NA	5799000	5801999	2313960	2316959	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.4856	NA	NA	NA	5802000	5804999	2315873	2318872	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.5566	NA	NA	NA	5805000	5807999	2318857	2321856	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.6992	NA	NA	NA	5808000	5810999	2321879	2324878	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.9743	NA	NA	NA	5811000	5813999	2324864	2327863	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.7588	NA	NA	NA	5814000	5816999	2327852	2330851	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.7807	NA	NA	NA	5817000	5819999	2330880	2333879	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	96.9702	NA	NA	NA	5820000	5822999	2333848	2336847	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.1385	NA	NA	NA	5823000	5825999	2336890	2339889	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.5067	NA	NA	NA	5826000	5828999	2339873	2342872	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.8922	NA	NA	NA	5829000	5831999	2342867	2345866	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.8899	NA	NA	NA	5832000	5834999	2345874	2348873	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.5977	NA	NA	NA	5835000	5837999	2348416	2351415	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.7995	NA	NA	NA	3573000	3575999	2353970	2356969	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.6957	NA	NA	NA	3576000	3578999	2357504	2360503	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.9259	NA	NA	NA	3579000	3581999	2360520	2363519	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.1697	NA	NA	NA	3582000	3584999	2363542	2366541	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.7215	NA	NA	NA	3594000	3596999	2367041	2370040	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.2158	NA	NA	NA	3597000	3599999	2370004	2373003	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.0005	NA	NA	NA	3600000	3602999	2373022	2376021	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.629	NA	NA	NA	3603000	3605999	2375989	2378988	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	94.315	NA	NA	NA	3606000	3608999	2378341	2381340	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.9339	NA	NA	NA	5838000	5840999	2386049	2389048	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.9194	NA	NA	NA	5841000	5843999	2389051	2392050	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.7905	NA	NA	NA	5844000	5846999	2392069	2395068	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.9626	NA	NA	NA	5847000	5849999	2395073	2398072	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.5458	NA	NA	NA	5850000	5852999	2398088	2401087	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.833	NA	NA	NA	5853000	5855999	2401074	2404073	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.8529	NA	NA	NA	5856000	5858999	2404068	2407067	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.8936	NA	NA	NA	5859000	5861999	2407084	2410083	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.7863	NA	NA	NA	5862000	5864999	2410066	2413065	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.8693	NA	NA	NA	5865000	5867999	2413066	2416065	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.416	NA	NA	NA	5868000	5870999	2416077	2419076	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.7931	NA	NA	NA	5871000	5873999	2419090	2422089	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.2158	NA	NA	NA	5874000	5876999	2422068	2425067	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.2387	NA	NA	NA	5877000	5879999	2425062	2428061	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.6218	NA	NA	NA	5880000	5882999	2428086	2431085	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.8188	NA	NA	NA	5883000	5885999	2431084	2434083	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.752	NA	NA	NA	5886000	5888999	2434086	2437085	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.8491	NA	NA	NA	5889000	5891999	2437084	2440083	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.7174	NA	NA	NA	5892000	5894999	2440090	2443089	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	95.8241	NA	NA	NA	5895000	5897999	2477872	2480871	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.7827	NA	NA	NA	5898000	5900999	2480208	2483207	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.5709	NA	NA	NA	5901000	5903999	2483216	2486215	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.5502	NA	NA	NA	5904000	5906999	2486226	2489225	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.8038	NA	NA	NA	5907000	5909999	2488892	2491891	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.6539	NA	NA	NA	5910000	5912999	2491427	2494426	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.8844	NA	NA	NA	5913000	5915999	2494438	2497437	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.1296	NA	NA	NA	5916000	5918999	2497429	2500428	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.7682	NA	NA	NA	5919000	5921999	2500426	2503425	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.0917	NA	NA	NA	5922000	5924999	2503422	2506421	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.903	NA	NA	NA	5925000	5927999	2506461	2509460	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.7058	NA	NA	NA	5928000	5930999	2509487	2512486	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.1614	NA	NA	NA	5931000	5933999	2512215	2515214	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.184	NA	NA	NA	5934000	5936999	2515354	2518353	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.1034	NA	NA	NA	5937000	5939999	2518532	2521531	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.7104	NA	NA	NA	5940000	5942999	2521531	2524530	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.7524	NA	NA	NA	5943000	5945999	2524527	2527526	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.2449	NA	NA	NA	5946000	5948999	2527522	2530521	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.7476	NA	NA	NA	5949000	5951999	2530567	2533566	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	95.8043	NA	NA	NA	5952000	5954999	2534161	2537160	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	96.521	NA	NA	NA	9540895	9543894	2536950	2539949	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	92.0377	NA	NA	NA	4389000	4391999	2540588	2543587	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.6743	NA	NA	NA	7266000	7268999	2542906	2545905	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.4974	NA	NA	NA	7263000	7265999	2545905	2548904	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.7872	NA	NA	NA	7260000	7262999	2548908	2551907	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.4974	NA	NA	NA	4404000	4406999	2552790	2555789	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.5977	NA	NA	NA	7254000	7256999	2554871	2557870	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.72	NA	NA	NA	10488895	10491894	2557384	2560383	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.5345	NA	NA	NA	10485895	10488894	2560012	2563011	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.1571	NA	NA	NA	10482895	10485894	2563602	2566601	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.1134	NA	NA	NA	10479895	10482894	2566567	2569566	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.2168	NA	NA	NA	5988000	5990999	2571167	2574166	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.579	NA	NA	NA	5985000	5987999	2571760	2574759	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.8671	NA	NA	NA	6039000	6041999	2576336	2579335	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.443	NA	NA	NA	6042000	6044999	2579149	2582148	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.4004	NA	NA	NA	6045000	6047999	2582157	2585156	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.8536	NA	NA	NA	6048000	6050999	2586205	2589204	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.0567	NA	NA	NA	6051000	6053999	2589168	2592167	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.6523	NA	NA	NA	6054000	6056999	2592123	2595122	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.2778	NA	NA	NA	6057000	6059999	2595118	2598117	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.911	NA	NA	NA	6060000	6062999	2598119	2601118	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.6951	NA	NA	NA	6063000	6065999	2601113	2604112	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.7923	NA	NA	NA	6066000	6068999	2604098	2607097	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.1399	NA	NA	NA	6069000	6071999	2607105	2610104	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.2878	NA	NA	NA	6072000	6074999	2610247	2613246	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.7778	NA	NA	NA	6075000	6077999	2613237	2616236	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.2627	NA	NA	NA	6078000	6080999	2616228	2619227	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.8204	NA	NA	NA	6081000	6083999	2619195	2622194	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	96.1726	NA	NA	NA	6084000	6086999	2622215	2625214	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.2158	NA	NA	NA	6087000	6089999	2625199	2628198	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.8094	NA	NA	NA	6090000	6092999	2628219	2631218	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.3545	NA	NA	NA	6093000	6095999	2631194	2634193	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.5506	NA	NA	NA	6096000	6098999	2633732	2636731	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.7349	NA	NA	NA	6120000	6122999	2636520	2639519	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.8853	NA	NA	NA	6123000	6125999	2639146	2642145	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.7737	NA	NA	NA	6126000	6128999	2642152	2645151	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.4764	NA	NA	NA	6129000	6131999	2645150	2648149	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.2494	NA	NA	NA	6132000	6134999	2648136	2651135	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.6491	NA	NA	NA	6135000	6137999	2651129	2654128	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.4921	NA	NA	NA	6138000	6140999	2654114	2657113	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.4732	NA	NA	NA	6141000	6143999	2657122	2660121	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.7542	NA	NA	NA	6144000	6146999	2660090	2663089	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.3508	NA	NA	NA	6147000	6149999	2663091	2666090	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.9913	NA	NA	NA	6150000	6152999	2666070	2669069	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.5846	NA	NA	NA	6153000	6155999	2669075	2672074	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.9291	NA	NA	NA	6156000	6158999	2672108	2675107	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.7923	NA	NA	NA	6159000	6161999	2675104	2678103	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.828	NA	NA	NA	6162000	6164999	2678099	2681098	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.1021	NA	NA	NA	6165000	6167999	2681103	2684102	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.5517	NA	NA	NA	6168000	6170999	2684112	2687111	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.7149	NA	NA	NA	6171000	6173999	2687118	2690117	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.4997	NA	NA	NA	6174000	6176999	2690086	2693085	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.5022	NA	NA	NA	6177000	6179999	2693112	2696111	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.8557	NA	NA	NA	6180000	6182999	2696123	2699122	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.4972	NA	NA	NA	6183000	6185999	2699110	2702109	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.6297	NA	NA	NA	6186000	6188999	2702124	2705123	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.7751	NA	NA	NA	6189000	6191999	2705116	2708115	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	94.7451	NA	NA	NA	6210000	6212999	2707616	2710615	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.6102	NA	NA	NA	6213000	6215999	2709717	2712716	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.7449	NA	NA	NA	6216000	6218999	2712713	2715712	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.8548	NA	NA	NA	6219000	6221999	2715711	2718710	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.7133	NA	NA	NA	6222000	6224999	2718715	2721714	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.4101	NA	NA	NA	6225000	6227999	2721736	2724735	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.5581	NA	NA	NA	6228000	6230999	2724710	2727709	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.0366	NA	NA	NA	6231000	6233999	2727719	2730718	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.8252	NA	NA	NA	6234000	6236999	2730569	2733568	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.5514	NA	NA	NA	6237000	6239999	2733371	2736370	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.4901	NA	NA	NA	6240000	6242999	2736420	2739419	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.8773	NA	NA	NA	6243000	6245999	2739432	2742431	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.3152	NA	NA	NA	6246000	6248999	2742427	2745426	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.5408	NA	NA	NA	6249000	6251999	2745279	2748278	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.0317	NA	NA	NA	6261000	6263999	2748781	2751780	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.8085	NA	NA	NA	6264000	6266999	2751775	2754774	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.5628	NA	NA	NA	6267000	6269999	2754775	2757774	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.7908	NA	NA	NA	6270000	6272999	2757835	2760834	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	96.9747	NA	NA	NA	6111000	6113999	2761861	2764860	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.3843	NA	NA	NA	6114000	6116999	2764849	2767848	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	93.296	NA	NA	NA	6276000	6278999	2770795	2773794	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.7505	NA	NA	NA	6279000	6281999	2773259	2776258	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.5976	NA	NA	NA	6282000	6284999	2776243	2779242	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	96.7274	NA	NA	NA	6285000	6287999	2779268	2782267	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.2533	NA	NA	NA	6288000	6290999	2782261	2785260	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.7609	NA	NA	NA	6291000	6293999	2785250	2788249	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.9595	NA	NA	NA	6294000	6296999	2788272	2791271	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.1308	NA	NA	NA	6297000	6299999	2791033	2794032	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	96.0251	NA	NA	NA	6309000	6311999	2793141	2796140	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.9729	NA	NA	NA	6312000	6314999	2795314	2798313	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	95.3388	NA	NA	NA	6321000	6323999	2798228	2801227	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.8656	NA	NA	NA	6315000	6317999	2801612	2804611	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.1045	NA	NA	NA	6324000	6326999	2804482	2807481	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.4956	NA	NA	NA	6327000	6329999	2807357	2810356	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.04	NA	NA	NA	6330000	6332999	2810403	2813402	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	96.1984	NA	NA	NA	6333000	6335999	2816990	2819989	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.439	NA	NA	NA	6336000	6338999	2819745	2822744	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.8147	NA	NA	NA	6339000	6341999	2822739	2825738	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.5667	NA	NA	NA	6342000	6344999	2825738	2828737	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.2312	NA	NA	NA	6345000	6347999	2828727	2831726	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.0861	NA	NA	NA	6348000	6350999	2831746	2834745	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.5303	NA	NA	NA	6351000	6353999	2834736	2837735	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.4135	NA	NA	NA	6354000	6356999	2846444	2849443	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.3836	NA	NA	NA	6357000	6359999	2849255	2852254	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.3221	NA	NA	NA	6360000	6362999	2852270	2855269	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.3437	NA	NA	NA	6363000	6365999	2855241	2858240	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.0821	NA	NA	NA	6366000	6368999	2858242	2861241	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.8447	NA	NA	NA	6369000	6371999	2861250	2864249	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.4128	NA	NA	NA	6372000	6374999	2864283	2867282	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	94.1917	NA	NA	NA	6378000	6380999	2868572	2871571	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	95.9568	NA	NA	NA	6381000	6383999	2871495	2874494	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	94.252	NA	NA	NA	5685000	5687999	2877174	2880173	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.6075	NA	NA	NA	8373000	8375999	2975962	2978961	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	93.7313	NA	NA	NA	8478000	8480999	2977640	2980639	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	96.9983	NA	NA	NA	8379000	8381999	2986876	2989875	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.6063	NA	NA	NA	8382000	8384999	2989760	2992759	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.3541	NA	NA	NA	8421000	8423999	3018529	3021528	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.0865	NA	NA	NA	6984000	6986999	3020162	3023161	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	92.6964	NA	NA	NA	6423000	6425999	3032489	3035488	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.4832	NA	NA	NA	6426000	6428999	3035128	3038127	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.4408	NA	NA	NA	6429000	6431999	3038051	3041050	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.1504	NA	NA	NA	6432000	6434999	3041085	3044084	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.6863	NA	NA	NA	6435000	6437999	3044077	3047076	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.6702	NA	NA	NA	6438000	6440999	3047080	3050079	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.6961	NA	NA	NA	6441000	6443999	3049951	3052950	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.8252	NA	NA	NA	6444000	6446999	3053086	3056085	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.7437	NA	NA	NA	6447000	6449999	3056076	3059075	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.4387	NA	NA	NA	6450000	6452999	3059065	3062064	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.9843	NA	NA	NA	6453000	6455999	3062041	3065040	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	96.4061	NA	NA	NA	6456000	6458999	3064835	3067834	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	94.36	NA	NA	NA	6459000	6461999	3066967	3069966	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	90.1915	NA	NA	NA	5148000	5150999	3071157	3074156	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.8056	NA	NA	NA	6462000	6464999	3073628	3076627	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	96.723	NA	NA	NA	4908000	4910999	3077482	3080481	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.2615	NA	NA	NA	6387000	6389999	3079269	3082268	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.1889	NA	NA	NA	6468000	6470999	3083744	3086743	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.7768	NA	NA	NA	6471000	6473999	3085921	3088920	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	6474000	6476999	3088913	3091912	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.7886	NA	NA	NA	6477000	6479999	3091921	3094920	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.726	NA	NA	NA	6480000	6482999	3094920	3097919	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.8424	NA	NA	NA	6483000	6485999	3097919	3100918	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	96.2635	NA	NA	NA	6486000	6488999	3100370	3103369	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	94.336	NA	NA	NA	5706000	5708999	3116723	3119722	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.8832	NA	NA	NA	9816895	9819894	3126067	3129066	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.746	NA	NA	NA	3372000	3374999	3135790	3138789	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.2319	NA	NA	NA	333000	335999	3140695	3143694	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.3671	NA	NA	NA	1059000	1061999	3147496	3150495	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.1448	NA	NA	NA	1056000	1058999	3150483	3153482	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.8614	NA	NA	NA	6489000	6491999	3157332	3160331	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.8879	NA	NA	NA	6492000	6494999	3160333	3163332	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.4072	NA	NA	NA	6495000	6497999	3163322	3166321	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.0111	NA	NA	NA	6498000	6500999	3166304	3169303	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.684	NA	NA	NA	6501000	6503999	3169307	3172306	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.5902	NA	NA	NA	6504000	6506999	3172317	3175316	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.0265	NA	NA	NA	6507000	6509999	3175297	3178296	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.7796	NA	NA	NA	6510000	6512999	3178252	3181251	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	95.3935	NA	NA	NA	6513000	6515999	3182186	3185185	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.2222	NA	NA	NA	6516000	6518999	3185202	3188201	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.1127	NA	NA	NA	6519000	6521999	3188191	3191190	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.4358	NA	NA	NA	6522000	6524999	3191209	3194208	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.9221	NA	NA	NA	6525000	6527999	3194217	3197216	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.0795	NA	NA	NA	6528000	6530999	3197193	3200192	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.3602	NA	NA	NA	6531000	6533999	3200167	3203166	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	92.192	NA	NA	NA	6534000	6536999	3203214	3206213	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	93.8831	NA	NA	NA	6537000	6539999	3206249	3209248	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.8212	NA	NA	NA	6540000	6542999	3209257	3212256	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.9352	NA	NA	NA	6543000	6545999	3212246	3215245	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.7751	NA	NA	NA	6546000	6548999	3215256	3218255	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.6243	NA	NA	NA	6549000	6551999	3218247	3221246	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.4437	NA	NA	NA	6552000	6554999	3221245	3224244	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.9972	NA	NA	NA	6555000	6557999	3224264	3227263	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.9466	NA	NA	NA	6558000	6560999	3227255	3230254	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.8464	NA	NA	NA	6561000	6563999	3230242	3233241	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.8362	NA	NA	NA	6564000	6566999	3233247	3236246	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.6738	NA	NA	NA	6567000	6569999	3236256	3239255	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.7692	NA	NA	NA	6570000	6572999	3239249	3242248	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.1929	NA	NA	NA	6573000	6575999	3242254	3245253	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.6419	NA	NA	NA	6576000	6578999	3245270	3248269	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	95.1741	NA	NA	NA	6579000	6581999	3248736	3251735	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	96.8073	NA	NA	NA	6582000	6584999	3251661	3254660	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	96.0921	NA	NA	NA	6585000	6587999	3254695	3257694	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	95.2425	NA	NA	NA	6588000	6590999	3257759	3260758	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.2663	NA	NA	NA	6591000	6593999	3260805	3263804	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.0152	NA	NA	NA	6594000	6596999	3263739	3266738	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.6054	NA	NA	NA	6597000	6599999	3266737	3269736	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.5305	NA	NA	NA	6600000	6602999	3269780	3272779	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.9531	NA	NA	NA	6603000	6605999	3272747	3275746	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.3752	NA	NA	NA	6606000	6608999	3275790	3278789	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.6211	NA	NA	NA	6609000	6611999	3278738	3281737	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.7747	NA	NA	NA	6612000	6614999	3281750	3284749	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.9068	NA	NA	NA	6615000	6617999	3284750	3287749	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.922	NA	NA	NA	6618000	6620999	3287756	3290755	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.6802	NA	NA	NA	6621000	6623999	3290752	3293751	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.151	NA	NA	NA	6624000	6626999	3293756	3296755	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.2543	NA	NA	NA	6627000	6629999	3296764	3299763	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	96.9562	NA	NA	NA	6630000	6632999	3299790	3302789	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	95.9921	NA	NA	NA	6633000	6635999	3302772	3305771	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.8076	NA	NA	NA	6636000	6638999	3305772	3308771	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.209	NA	NA	NA	6639000	6641999	3308744	3311743	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.3801	NA	NA	NA	6642000	6644999	3311722	3314721	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.73	NA	NA	NA	6645000	6647999	3314732	3317731	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.7559	NA	NA	NA	6648000	6650999	3317736	3320735	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.906	NA	NA	NA	6651000	6653999	3320722	3323721	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.9738	NA	NA	NA	6654000	6656999	3323726	3326725	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.7492	NA	NA	NA	6657000	6659999	3326786	3329785	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.9863	NA	NA	NA	6660000	6662999	3329794	3332793	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.8011	NA	NA	NA	6663000	6665999	3332802	3335801	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.628	NA	NA	NA	6666000	6668999	3335792	3338791	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	6669000	6671999	3338796	3341795	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.3608	NA	NA	NA	6672000	6674999	3341796	3344795	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.0478	NA	NA	NA	6675000	6677999	3348687	3351686	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.9204	NA	NA	NA	6678000	6680999	3350825	3353824	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.6003	NA	NA	NA	6681000	6683999	3353813	3356812	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.109	NA	NA	NA	6684000	6686999	3356593	3359592	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.752	NA	NA	NA	6687000	6689999	3360132	3363131	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.9594	NA	NA	NA	6690000	6692999	3363125	3366124	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.7933	NA	NA	NA	6693000	6695999	3366122	3369121	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.563	NA	NA	NA	6696000	6698999	3369133	3372132	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.9877	NA	NA	NA	6699000	6701999	3372131	3375130	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.7413	NA	NA	NA	6702000	6704999	3375113	3378112	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.7816	NA	NA	NA	6705000	6707999	3378110	3381109	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.9091	NA	NA	NA	6708000	6710999	3381118	3384117	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	6711000	6713999	3384108	3387107	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	6714000	6716999	3387105	3390104	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.9321	NA	NA	NA	6717000	6719999	3390114	3393113	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	6720000	6722999	3393107	3396106	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.9457	NA	NA	NA	6723000	6725999	3396117	3399116	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	6726000	6728999	3399125	3402124	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.9859	NA	NA	NA	6729000	6731999	3402117	3405116	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	6732000	6734999	3405110	3408109	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.9741	NA	NA	NA	6735000	6737999	3408126	3411125	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.9602	NA	NA	NA	6738000	6740999	3411112	3414111	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	6741000	6743999	3414120	3417119	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	6744000	6746999	3417107	3420106	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.9615	NA	NA	NA	6747000	6749999	3420109	3423108	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.9031	NA	NA	NA	6750000	6752999	3423109	3426108	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	6753000	6755999	3426110	3429109	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.1122	NA	NA	NA	6756000	6758999	3429123	3432122	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.9607	NA	NA	NA	6759000	6761999	3431738	3434737	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.9324	NA	NA	NA	6762000	6764999	3434744	3437743	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.469	NA	NA	NA	6765000	6767999	3437740	3440739	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.9875	NA	NA	NA	6768000	6770999	3440744	3443743	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.18	NA	NA	NA	6771000	6773999	3443200	3446199	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.865	NA	NA	NA	6774000	6776999	3445961	3448960	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	6777000	6779999	3448941	3451940	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.9579	NA	NA	NA	6780000	6782999	3451962	3454961	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.2645	NA	NA	NA	6783000	6785999	3460863	3463862	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.8746	NA	NA	NA	6786000	6788999	3463110	3466109	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.9612	NA	NA	NA	6792000	6794999	3476526	3479525	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.9052	NA	NA	NA	6795000	6797999	3479540	3482539	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	6798000	6800999	3482523	3485522	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.7835	NA	NA	NA	6801000	6803999	3485532	3488531	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.8407	NA	NA	NA	6804000	6806999	3488540	3491539	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.6051	NA	NA	NA	6807000	6809999	3491450	3494449	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.161	NA	NA	NA	6300000	6302999	3495203	3498202	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	96.3224	NA	NA	NA	840000	842999	3501897	3504896	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	6810000	6812999	3505487	3508486	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.974	NA	NA	NA	6813000	6815999	3508498	3511497	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	6816000	6818999	3511483	3514482	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.4465	NA	NA	NA	6819000	6821999	3514501	3517500	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.2776	NA	NA	NA	6822000	6824999	3517495	3520494	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.3991	NA	NA	NA	6825000	6827999	3520501	3523500	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.4951	NA	NA	NA	6828000	6830999	3523492	3526491	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.8864	NA	NA	NA	6831000	6833999	3526492	3529491	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.9048	NA	NA	NA	6834000	6836999	3529487	3532486	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.8011	NA	NA	NA	6837000	6839999	3532501	3535500	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.9741	NA	NA	NA	6840000	6842999	3535489	3538488	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.3449	NA	NA	NA	6843000	6845999	3538470	3541469	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.3074	NA	NA	NA	6846000	6848999	3541475	3544474	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.8543	NA	NA	NA	6849000	6851999	3544507	3547506	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.7546	NA	NA	NA	6852000	6854999	3547458	3550457	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.816	NA	NA	NA	6855000	6857999	3550476	3553475	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.9349	NA	NA	NA	6858000	6860999	3553495	3556494	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.8666	NA	NA	NA	6861000	6863999	3556492	3559491	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.0315	NA	NA	NA	6864000	6866999	3559489	3562488	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.4629	NA	NA	NA	6867000	6869999	3562475	3565474	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.9	NA	NA	NA	6870000	6872999	3565474	3568473	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.8196	NA	NA	NA	6873000	6875999	3568489	3571488	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.6896	NA	NA	NA	6876000	6878999	3571483	3574482	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.882	NA	NA	NA	6879000	6881999	3574489	3577488	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.0011	NA	NA	NA	6882000	6884999	3577495	3580494	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.7805	NA	NA	NA	6885000	6887999	3580164	3583163	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.2984	NA	NA	NA	6888000	6890999	3583128	3586127	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	6891000	6893999	3586122	3589121	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	6894000	6896999	3589130	3592129	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.8491	NA	NA	NA	6897000	6899999	3592130	3595129	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.1293	NA	NA	NA	6900000	6902999	3595145	3598144	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.5467	NA	NA	NA	6903000	6905999	3598137	3601136	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.7565	NA	NA	NA	6906000	6908999	3600987	3603986	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.3877	NA	NA	NA	6918000	6920999	3604620	3607619	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	96.8442	NA	NA	NA	3375000	3377999	3609636	3612635	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.0698	NA	NA	NA	2136000	2138999	3614485	3617484	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.9124	NA	NA	NA	4299000	4301999	3615275	3618274	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.4774	NA	NA	NA	2142000	2144999	3620472	3623471	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.7727	NA	NA	NA	3363000	3365999	3620703	3623702	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	96.349	NA	NA	NA	6930000	6932999	3626500	3629499	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.4476	NA	NA	NA	6936000	6938999	3630382	3633381	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	95.3119	NA	NA	NA	10473895	10476894	3633206	3636205	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.4004	NA	NA	NA	7059000	7061999	3636461	3639460	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.6882	NA	NA	NA	7062000	7064999	3639469	3642468	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.9587	NA	NA	NA	7065000	7067999	3642499	3645498	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.2977	NA	NA	NA	7068000	7070999	3647453	3650452	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.7427	NA	NA	NA	6939000	6941999	3650846	3653845	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.7816	NA	NA	NA	6942000	6944999	3653840	3656839	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	6945000	6947999	3656837	3659836	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.0097	NA	NA	NA	6948000	6950999	3659844	3662843	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.2274	NA	NA	NA	6951000	6953999	3662890	3665889	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.8548	NA	NA	NA	6954000	6956999	3665960	3668959	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	6957000	6959999	3668955	3671954	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	6960000	6962999	3671962	3674961	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.9	NA	NA	NA	6963000	6965999	3674954	3677953	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.7505	NA	NA	NA	6966000	6968999	3677942	3680941	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.3478	NA	NA	NA	6969000	6971999	3680938	3683937	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.6908	NA	NA	NA	6972000	6974999	3683972	3686971	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.2415	NA	NA	NA	6975000	6977999	3686948	3689947	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.4178	NA	NA	NA	6978000	6980999	3689944	3692943	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.7036	NA	NA	NA	6420000	6422999	3693117	3696116	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	84.8349	NA	NA	NA	9024895	9027894	3697344	3700343	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	91.1768	NA	NA	NA	9021895	9024894	3699035	3702034	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.5209	NA	NA	NA	7020000	7022999	3707355	3710354	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	95.1676	NA	NA	NA	10416895	10419894	3714399	3717398	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.4491	NA	NA	NA	7071000	7073999	3717540	3720539	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.3024	NA	NA	NA	7074000	7076999	3720559	3723558	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	96.6067	NA	NA	NA	7077000	7079999	3723265	3726264	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	96.0467	NA	NA	NA	7080000	7082999	3729930	3732929	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.0053	NA	NA	NA	7083000	7085999	3732730	3735729	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.9689	NA	NA	NA	7086000	7088999	3735736	3738735	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.5886	NA	NA	NA	7014000	7016999	3740486	3743485	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	89.8693	NA	NA	NA	8817000	8819999	3743875	3746874	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.3588	NA	NA	NA	7089000	7091999	3746859	3749858	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.2827	NA	NA	NA	7092000	7094999	3749735	3752734	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.5414	NA	NA	NA	7095000	7097999	3752746	3755745	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.7346	NA	NA	NA	7098000	7100999	3755744	3758743	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	7101000	7103999	3758744	3761743	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.9227	NA	NA	NA	7104000	7106999	3761745	3764744	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	7107000	7109999	3764739	3767738	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	7110000	7112999	3767746	3770745	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.9095	NA	NA	NA	7113000	7115999	3770747	3773746	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.9741	NA	NA	NA	7116000	7118999	3773733	3776732	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	92.3514	NA	NA	NA	9564895	9567894	3777214	3780213	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.9581	NA	NA	NA	7122000	7124999	3781154	3784153	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.9327	NA	NA	NA	7125000	7127999	3784158	3787157	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.9437	NA	NA	NA	7128000	7130999	3787159	3790158	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.4209	NA	NA	NA	7131000	7133999	3790154	3793153	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.2929	NA	NA	NA	7134000	7136999	3793147	3796146	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.8799	NA	NA	NA	7137000	7139999	3796171	3799170	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.8815	NA	NA	NA	7140000	7142999	3799157	3802156	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.9035	NA	NA	NA	7143000	7145999	3802168	3805167	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.8899	NA	NA	NA	7146000	7148999	3805146	3808145	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.8958	NA	NA	NA	7149000	7151999	3808152	3811151	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.7692	NA	NA	NA	7152000	7154999	3811151	3814150	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.6028	NA	NA	NA	7155000	7157999	3814144	3817143	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.4333	NA	NA	NA	7158000	7160999	3817146	3820145	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.7737	NA	NA	NA	7161000	7163999	3820117	3823116	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.7374	NA	NA	NA	7164000	7166999	3823108	3826107	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	89.3681	NA	NA	NA	7167000	7169999	3824833	3827832	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.5688	NA	NA	NA	7176000	7178999	3834465	3837464	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.8608	NA	NA	NA	7179000	7181999	3837457	3840456	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.2964	NA	NA	NA	7182000	7184999	3842307	3845306	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.7231	NA	NA	NA	7185000	7187999	3844912	3847911	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.7215	NA	NA	NA	7194000	7196999	3848027	3851026	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	7197000	7199999	3851011	3854010	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	7200000	7202999	3853998	3856997	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	7203000	7205999	3857007	3860006	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	7206000	7208999	3860002	3863001	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	96.7696	NA	NA	NA	7209000	7211999	3863015	3866014	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.9753	NA	NA	NA	7212000	7214999	3866101	3869100	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.9457	NA	NA	NA	7215000	7217999	3869097	3872096	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.9868	NA	NA	NA	7218000	7220999	3872088	3875087	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	93.5126	NA	NA	NA	7221000	7223999	3877423	3880422	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.5323	NA	NA	NA	7284000	7286999	3880384	3883383	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.3208	NA	NA	NA	7287000	7289999	3883371	3886370	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.73	NA	NA	NA	7290000	7292999	3886408	3889407	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.7511	NA	NA	NA	7293000	7295999	3889413	3892412	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.4098	NA	NA	NA	7296000	7298999	3892378	3895377	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	95.2482	NA	NA	NA	7299000	7301999	3895379	3898378	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.4182	NA	NA	NA	7302000	7304999	3898308	3901307	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.8583	NA	NA	NA	7305000	7307999	3901312	3904311	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.7297	NA	NA	NA	7308000	7310999	3904311	3907310	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.4549	NA	NA	NA	7311000	7313999	3907320	3910319	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.8839	NA	NA	NA	7314000	7316999	3910325	3913324	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.9427	NA	NA	NA	7320000	7322999	3915608	3918607	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.882	NA	NA	NA	7323000	7325999	3918603	3921602	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.2118	NA	NA	NA	7326000	7328999	3921580	3924579	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.6282	NA	NA	NA	1131000	1133999	3950135	3953134	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	80.1372	NA	NA	NA	3903000	3905999	3995642	3998641	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	95.6876	NA	NA	NA	969000	971999	3997326	4000325	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.8463	NA	NA	NA	1809000	1811999	4003787	4006786	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.7747	NA	NA	NA	1818000	1820999	4006930	4009929	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.9966	NA	NA	NA	7332000	7334999	4025701	4028700	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.7816	NA	NA	NA	7335000	7337999	4028704	4031703	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.8273	NA	NA	NA	7338000	7340999	4031688	4034687	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.8954	NA	NA	NA	7341000	7343999	4034680	4037679	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.6977	NA	NA	NA	7344000	7346999	4037696	4040695	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.6951	NA	NA	NA	7347000	7349999	4040697	4043696	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.8673	NA	NA	NA	7350000	7352999	4043700	4046699	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.539	NA	NA	NA	7353000	7355999	4046680	4049679	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.2187	NA	NA	NA	7356000	7358999	4049692	4052691	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.5855	NA	NA	NA	7359000	7361999	4052606	4055605	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	96.5422	NA	NA	NA	7368000	7370999	4055548	4058547	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	96.6002	NA	NA	NA	7371000	7373999	4063712	4066711	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	96.159	NA	NA	NA	7374000	7376999	4066138	4069137	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.9606	NA	NA	NA	7386000	7388999	4069667	4072666	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.9614	NA	NA	NA	7389000	7391999	4072669	4075668	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.9612	NA	NA	NA	7392000	7394999	4075655	4078654	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.9595	NA	NA	NA	7395000	7397999	4078666	4081665	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.5157	NA	NA	NA	7398000	7400999	4081647	4084646	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	94.9727	NA	NA	NA	7401000	7403999	4084607	4087606	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.0869	NA	NA	NA	7404000	7406999	4088535	4091534	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.2603	NA	NA	NA	7407000	7409999	4091284	4094283	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	92.9551	NA	NA	NA	7410000	7412999	4094270	4097269	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.628	NA	NA	NA	7413000	7415999	4096879	4099878	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	7416000	7418999	4099860	4102859	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	7419000	7421999	4102876	4105875	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.8876	NA	NA	NA	7422000	7424999	4105867	4108866	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.0265	NA	NA	NA	7425000	7427999	4108868	4111867	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.2888	NA	NA	NA	7428000	7430999	4111904	4114903	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.9638	NA	NA	NA	7431000	7433999	4114929	4117928	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.0589	NA	NA	NA	7434000	7436999	4117909	4120908	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.2639	NA	NA	NA	7437000	7439999	4120943	4123942	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.0464	NA	NA	NA	7440000	7442999	4123948	4126947	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.1735	NA	NA	NA	7443000	7445999	4126929	4129928	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.8971	NA	NA	NA	7446000	7448999	4129947	4132946	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.9897	NA	NA	NA	7449000	7451999	4132940	4135939	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.7222	NA	NA	NA	7452000	7454999	4135941	4138940	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.202	NA	NA	NA	7455000	7457999	4138933	4141932	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.7588	NA	NA	NA	7458000	7460999	4141961	4144960	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.8717	NA	NA	NA	7461000	7463999	4144953	4147952	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.1967	NA	NA	NA	7464000	7466999	4147952	4150951	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.8025	NA	NA	NA	7467000	7469999	4150973	4153972	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.6397	NA	NA	NA	7470000	7472999	4154293	4157292	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.3186	NA	NA	NA	7473000	7475999	4157421	4160420	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.9032	NA	NA	NA	7476000	7478999	4160377	4163376	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.3732	NA	NA	NA	7479000	7481999	4163357	4166356	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.1654	NA	NA	NA	7482000	7484999	4166375	4169374	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.8726	NA	NA	NA	7485000	7487999	4169374	4172373	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	7488000	7490999	4172347	4175346	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	7491000	7493999	4175363	4178362	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	7494000	7496999	4178361	4181360	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.8815	NA	NA	NA	7497000	7499999	4181359	4184358	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	7500000	7502999	4184357	4187356	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.9625	NA	NA	NA	7503000	7505999	4187361	4190360	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.8554	NA	NA	NA	7506000	7508999	4190360	4193359	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.7737	NA	NA	NA	7512000	7514999	4195637	4198636	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.8734	NA	NA	NA	7515000	7517999	4198647	4201646	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.8794	NA	NA	NA	7518000	7520999	4201642	4204641	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.9966	NA	NA	NA	7521000	7523999	4204652	4207651	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.0974	NA	NA	NA	7524000	7526999	4207647	4210646	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.791	NA	NA	NA	7527000	7529999	4210738	4213737	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.8085	NA	NA	NA	7530000	7532999	4213944	4216943	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.8941	NA	NA	NA	7533000	7535999	4216953	4219952	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.8784	NA	NA	NA	7536000	7538999	4219936	4222935	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.796	NA	NA	NA	7539000	7541999	4222959	4225958	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.7865	NA	NA	NA	7542000	7544999	4225948	4228947	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.6142	NA	NA	NA	7545000	7547999	4228958	4231957	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	96.2807	NA	NA	NA	7548000	7550999	4232026	4235025	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.3292	NA	NA	NA	7551000	7553999	4235037	4238036	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.6174	NA	NA	NA	7554000	7556999	4238026	4241025	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.9604	NA	NA	NA	7557000	7559999	4241034	4244033	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.8311	NA	NA	NA	7560000	7562999	4244017	4247016	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.057	NA	NA	NA	7563000	7565999	4247003	4250002	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.6216	NA	NA	NA	7566000	7568999	4250031	4253030	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.3309	NA	NA	NA	7569000	7571999	4253033	4256032	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.8536	NA	NA	NA	7572000	7574999	4256060	4259059	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.6331	NA	NA	NA	7575000	7577999	4259040	4262039	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.1396	NA	NA	NA	7578000	7580999	4261975	4264974	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.8894	NA	NA	NA	7581000	7583999	4264694	4267693	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.5897	NA	NA	NA	7587000	7589999	4269709	4272708	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.573	NA	NA	NA	7590000	7592999	4272750	4275749	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.9302	NA	NA	NA	7593000	7595999	4275182	4278181	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	86.6491	NA	NA	NA	8784000	8786999	4276396	4279395	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	96.1624	NA	NA	NA	7605000	7607999	4279866	4282865	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.8811	NA	NA	NA	7608000	7610999	4284343	4287342	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.5099	NA	NA	NA	7611000	7613999	4287383	4290382	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.5169	NA	NA	NA	7614000	7616999	4290547	4293546	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	93.1782	NA	NA	NA	3306000	3308999	4296297	4299296	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.4094	NA	NA	NA	7635000	7637999	4297992	4300991	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.6998	NA	NA	NA	7638000	7640999	4300962	4303961	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.4714	NA	NA	NA	7641000	7643999	4303973	4306972	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.3138	NA	NA	NA	7644000	7646999	4306955	4309954	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.5846	NA	NA	NA	3300000	3302999	4311226	4314225	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	91.4839	NA	NA	NA	7224000	7226999	4336166	4339165	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.2645	NA	NA	NA	7647000	7649999	4342781	4345780	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.4497	NA	NA	NA	7650000	7652999	4345721	4348720	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.8112	NA	NA	NA	7653000	7655999	4348714	4351713	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.464	NA	NA	NA	7656000	7658999	4351704	4354703	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.5832	NA	NA	NA	7659000	7661999	4354710	4357709	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.7291	NA	NA	NA	7662000	7664999	4357750	4360749	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.7951	NA	NA	NA	7665000	7667999	4360739	4363738	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.0488	NA	NA	NA	7668000	7670999	4363449	4366448	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.197	NA	NA	NA	7680000	7682999	4367435	4370434	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.0669	NA	NA	NA	7683000	7685999	4370429	4373428	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.9169	NA	NA	NA	7686000	7688999	4373459	4376458	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.7369	NA	NA	NA	7689000	7691999	4376446	4379445	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.0753	NA	NA	NA	7692000	7694999	4379451	4382450	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.0586	NA	NA	NA	7695000	7697999	4382295	4385294	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	96.3187	NA	NA	NA	7698000	7700999	4385253	4388252	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.1504	NA	NA	NA	7701000	7703999	4387618	4390617	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.185	NA	NA	NA	5553000	5555999	4398199	4401198	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	95.3045	NA	NA	NA	165000	167999	4400744	4403743	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	94.2732	NA	NA	NA	7026000	7028999	4403773	4406772	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.5337	NA	NA	NA	174000	176999	4407400	4410399	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.6353	NA	NA	NA	171000	173999	4410415	4413414	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.5357	NA	NA	NA	861000	863999	4415040	4418039	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	96.759	NA	NA	NA	1137000	1139999	4417715	4420714	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.6919	NA	NA	NA	7704000	7706999	4421581	4424580	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.9206	NA	NA	NA	7707000	7709999	4424212	4427211	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.0139	NA	NA	NA	7710000	7712999	4427155	4430154	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.2327	NA	NA	NA	7713000	7715999	4434081	4437080	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.8662	NA	NA	NA	7716000	7718999	4437067	4440066	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.8119	NA	NA	NA	7719000	7721999	4440081	4443080	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	91.7053	NA	NA	NA	7722000	7724999	4441899	4444898	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	94.5549	NA	NA	NA	7755000	7757999	4444956	4447955	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.9284	NA	NA	NA	4194000	4196999	4478737	4481736	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	95.9037	NA	NA	NA	4203000	4205999	4487662	4490661	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.089	NA	NA	NA	7758000	7760999	4495528	4498527	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	96.9471	NA	NA	NA	7761000	7763999	4498539	4501538	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.3445	NA	NA	NA	7764000	7766999	4501819	4504818	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.3401	NA	NA	NA	7767000	7769999	4504800	4507799	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.8936	NA	NA	NA	7770000	7772999	4507774	4510773	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.9599	NA	NA	NA	7773000	7775999	4510794	4513793	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.9381	NA	NA	NA	7776000	7778999	4513747	4516746	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.1056	NA	NA	NA	7779000	7781999	4516812	4519811	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.5646	NA	NA	NA	7782000	7784999	4519792	4522791	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.7346	NA	NA	NA	7785000	7787999	4522809	4525808	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.8512	NA	NA	NA	7788000	7790999	4525809	4528808	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.1408	NA	NA	NA	7791000	7793999	4528904	4531903	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.8614	NA	NA	NA	7794000	7796999	4532153	4535152	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.2858	NA	NA	NA	7797000	7799999	4535155	4538154	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.3602	NA	NA	NA	7800000	7802999	4538129	4541128	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.5583	NA	NA	NA	168000	170999	4546226	4549225	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	95.6678	NA	NA	NA	6021000	6023999	4568681	4571680	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.8605	NA	NA	NA	7803000	7805999	4597874	4600873	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.3588	NA	NA	NA	6393000	6395999	4602027	4605026	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.4684	NA	NA	NA	6396000	6398999	4605043	4608042	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.1127	NA	NA	NA	6399000	6401999	4608041	4611040	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.4625	NA	NA	NA	6402000	6404999	4611044	4614043	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	96.483	NA	NA	NA	7806000	7808999	4613453	4616452	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.4751	NA	NA	NA	7833000	7835999	4618725	4621724	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	96.3569	NA	NA	NA	7836000	7838999	4621245	4624244	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.4227	NA	NA	NA	7929000	7931999	4626147	4629146	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.3246	NA	NA	NA	7932000	7934999	4629146	4632145	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	85.6571	NA	NA	NA	7935000	7937999	4631071	4634070	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.3318	NA	NA	NA	7956000	7958999	4635911	4638910	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	94.9216	NA	NA	NA	7959000	7961999	4641451	4644450	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	95.6088	NA	NA	NA	258000	260999	4645833	4648832	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.7588	NA	NA	NA	7962000	7964999	4658097	4661096	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	7965000	7967999	4661077	4664076	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	7968000	7970999	4664089	4667088	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	7971000	7973999	4667085	4670084	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	7974000	7976999	4670081	4673080	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	7977000	7979999	4673097	4676096	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.947	NA	NA	NA	7980000	7982999	4676078	4679077	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	7983000	7985999	4679096	4682095	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	7986000	7988999	4682094	4685093	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.9309	NA	NA	NA	7989000	7991999	4685096	4688095	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.184	NA	NA	NA	7992000	7994999	4688089	4691088	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.2076	NA	NA	NA	7998000	8000999	4692027	4695026	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.8418	NA	NA	NA	8001000	8003999	4695470	4698469	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.9315	NA	NA	NA	8004000	8006999	4698468	4701467	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.7245	NA	NA	NA	8007000	8009999	4701473	4704472	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.8094	NA	NA	NA	8010000	8012999	4704475	4707474	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.4602	NA	NA	NA	8013000	8015999	4707472	4710471	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.5466	NA	NA	NA	8016000	8018999	4710131	4713130	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.5709	NA	NA	NA	8019000	8021999	4712989	4715988	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.7603	NA	NA	NA	8022000	8024999	4715996	4718995	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.9022	NA	NA	NA	8025000	8027999	4719000	4721999	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.8903	NA	NA	NA	8028000	8030999	4722000	4724999	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.9321	NA	NA	NA	8031000	8033999	4724987	4727986	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.9475	NA	NA	NA	8034000	8036999	4728007	4731006	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.9142	NA	NA	NA	8037000	8039999	4731002	4734001	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	8040000	8042999	4734002	4737001	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.1702	NA	NA	NA	8043000	8045999	4743545	4746544	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.9324	NA	NA	NA	8046000	8048999	4745413	4748412	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.3337	NA	NA	NA	8049000	8051999	4748434	4751433	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	96.218	NA	NA	NA	8052000	8054999	4751353	4754352	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.2674	NA	NA	NA	8055000	8057999	4754559	4757558	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.6801	NA	NA	NA	8058000	8060999	4757561	4760560	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	96.9702	NA	NA	NA	8061000	8063999	4760548	4763547	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.9504	NA	NA	NA	8064000	8066999	4764603	4767602	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.4831	NA	NA	NA	8067000	8069999	4767540	4770539	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.0422	NA	NA	NA	8070000	8072999	4771658	4774657	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.0806	NA	NA	NA	8073000	8075999	4774380	4777379	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.9194	NA	NA	NA	8076000	8078999	4777416	4780415	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.92	NA	NA	NA	8079000	8081999	4780413	4783412	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.8108	NA	NA	NA	8082000	8084999	4783400	4786399	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.6953	NA	NA	NA	8085000	8087999	4786399	4789398	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.0254	NA	NA	NA	8088000	8090999	4789362	4792361	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	95.5198	NA	NA	NA	8091000	8093999	4792117	4795116	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.45	NA	NA	NA	8097000	8099999	4798343	4801342	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.2066	NA	NA	NA	8100000	8102999	4801256	4804255	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.2837	NA	NA	NA	8103000	8105999	4804243	4807242	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.0915	NA	NA	NA	8106000	8108999	4807267	4810266	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	96.7956	NA	NA	NA	8109000	8111999	4810036	4813035	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.1358	NA	NA	NA	8112000	8114999	4814055	4817054	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.9579	NA	NA	NA	8115000	8117999	4817076	4820075	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.9486	NA	NA	NA	8118000	8120999	4820063	4823062	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	8121000	8123999	4823065	4826064	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.9214	NA	NA	NA	8124000	8126999	4826069	4829068	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.9444	NA	NA	NA	8127000	8129999	4829062	4832061	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	8130000	8132999	4832069	4835068	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.9606	NA	NA	NA	8133000	8135999	4835063	4838062	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.1786	NA	NA	NA	8136000	8138999	4838011	4841010	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.4471	NA	NA	NA	8139000	8141999	4841053	4844052	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.4655	NA	NA	NA	8142000	8144999	4844039	4847038	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.8673	NA	NA	NA	8145000	8147999	4847052	4850051	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.9604	NA	NA	NA	8148000	8150999	4850065	4853064	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.915	NA	NA	NA	8151000	8153999	4853062	4856061	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.7086	NA	NA	NA	8154000	8156999	4856055	4859054	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.9333	NA	NA	NA	8157000	8159999	4859066	4862065	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.7779	NA	NA	NA	8160000	8162999	4862052	4865051	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.8428	NA	NA	NA	4749000	4751999	4868658	4871657	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.9773	NA	NA	NA	9822895	9825894	4874918	4877917	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.8343	NA	NA	NA	4758000	4760999	4877284	4880283	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.5871	NA	NA	NA	6027000	6029999	4879875	4882874	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.7111	NA	NA	NA	10476895	10479894	4881523	4884522	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	74.5954	NA	NA	NA	5442000	5444999	4886758	4889757	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	84.9005	NA	NA	NA	936000	938999	4888002	4891001	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.1453	NA	NA	NA	8163000	8165999	4894691	4897690	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.7006	NA	NA	NA	8166000	8168999	4897540	4900539	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.8732	NA	NA	NA	8169000	8171999	4900526	4903525	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.7995	NA	NA	NA	8172000	8174999	4903519	4906518	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.5497	NA	NA	NA	8175000	8177999	4906527	4909526	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.8263	NA	NA	NA	8178000	8180999	4909531	4912530	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.2985	NA	NA	NA	8181000	8183999	4918822	4921821	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.9928	NA	NA	NA	8184000	8186999	4921819	4924818	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	96.0568	NA	NA	NA	8187000	8189999	4924450	4927449	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.7171	NA	NA	NA	8190000	8192999	4930917	4933916	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.8418	NA	NA	NA	8193000	8195999	4933915	4936914	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.8491	NA	NA	NA	8196000	8198999	4936927	4939926	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.8155	NA	NA	NA	8199000	8201999	4939913	4942912	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.9452	NA	NA	NA	8202000	8204999	4942885	4945884	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.8954	NA	NA	NA	8205000	8207999	4945878	4948877	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	8208000	8210999	4948875	4951874	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.6572	NA	NA	NA	8211000	8213999	4951887	4954886	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.9318	NA	NA	NA	8214000	8216999	4954884	4957883	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.6396	NA	NA	NA	8217000	8219999	4957857	4960856	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.4476	NA	NA	NA	8220000	8222999	4960857	4963856	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	95.5457	NA	NA	NA	8223000	8225999	4963482	4966481	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	94.6639	NA	NA	NA	8226000	8228999	4965841	4968840	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	95.8741	NA	NA	NA	8229000	8231999	4968810	4971809	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.8477	NA	NA	NA	8232000	8234999	4971782	4974781	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.9106	NA	NA	NA	8235000	8237999	4974786	4977785	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.1714	NA	NA	NA	8238000	8240999	4977829	4980828	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	96.2942	NA	NA	NA	8241000	8243999	4980422	4983421	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	91.6177	NA	NA	NA	5964000	5966999	4997777	5000776	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	96.5757	NA	NA	NA	438000	440999	5008100	5011099	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.0615	NA	NA	NA	4335000	4337999	5011549	5014548	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.2302	NA	NA	NA	4332000	4334999	5014553	5017552	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.6428	NA	NA	NA	462000	464999	5018087	5021086	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	93.1337	NA	NA	NA	465000	467999	5020966	5023965	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.6536	NA	NA	NA	9582895	9585894	5023779	5026778	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.4339	NA	NA	NA	1392000	1394999	5025973	5028972	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.8074	NA	NA	NA	5970000	5972999	5027951	5030950	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.4764	NA	NA	NA	4755000	4757999	5031205	5034204	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.4127	NA	NA	NA	4752000	4754999	5034197	5037196	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	95.5135	NA	NA	NA	7023000	7025999	5036414	5039413	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	79.9575	NA	NA	NA	1146000	1148999	5045663	5048662	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	95.9552	NA	NA	NA	960000	962999	5052599	5055598	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	96.6912	NA	NA	NA	8259000	8261999	5066658	5069657	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.8554	NA	NA	NA	8262000	8264999	5069591	5072590	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.1416	NA	NA	NA	8265000	8267999	5072587	5075586	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.2561	NA	NA	NA	8268000	8270999	5075582	5078581	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.8447	NA	NA	NA	8271000	8273999	5078563	5081562	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.6691	NA	NA	NA	8274000	8276999	5081705	5084704	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.5247	NA	NA	NA	8277000	8279999	5084804	5087803	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.5676	NA	NA	NA	8280000	8282999	5087802	5090801	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.4663	NA	NA	NA	8283000	8285999	5090801	5093800	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	96.8375	NA	NA	NA	8286000	8288999	5093811	5096810	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	95.5135	NA	NA	NA	8289000	8291999	5096688	5099687	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	88.6544	NA	NA	NA	8292000	8294999	5099607	5102606	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	81.1734	NA	NA	NA	8295000	8297999	5105465	5108464	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	94.4366	NA	NA	NA	9045895	9048894	5111089	5114088	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.6433	NA	NA	NA	3312000	3314999	5124533	5127532	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	95.5292	NA	NA	NA	9936895	9939894	5127266	5130265	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	91.9623	NA	NA	NA	8298000	8300999	5129263	5132262	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	96.5307	NA	NA	NA	8301000	8303999	5132374	5135373	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.1336	NA	NA	NA	8304000	8306999	5135260	5138259	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	94.1266	NA	NA	NA	8310000	8312999	5138278	5141277	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	96.1739	NA	NA	NA	8313000	8315999	5146440	5149439	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.8318	NA	NA	NA	8316000	8318999	5148107	5151106	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.6057	NA	NA	NA	8319000	8321999	5151007	5154006	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.5966	NA	NA	NA	8322000	8324999	5153832	5156831	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.3789	NA	NA	NA	8325000	8327999	5156821	5159820	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	96.6258	NA	NA	NA	8331000	8333999	5160651	5163650	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.8699	NA	NA	NA	8334000	8336999	5163069	5166068	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.7334	NA	NA	NA	8337000	8339999	5165984	5168983	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.7738	NA	NA	NA	8340000	8342999	5169671	5172670	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.9686	NA	NA	NA	8343000	8345999	5172711	5175710	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.9519	NA	NA	NA	8346000	8348999	5175697	5178696	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	96.8422	NA	NA	NA	8349000	8351999	5178671	5181670	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	96.4501	NA	NA	NA	8352000	8354999	5181757	5184756	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.2917	NA	NA	NA	8355000	8357999	5184295	5187294	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.1813	NA	NA	NA	8358000	8360999	5187678	5190677	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.5334	NA	NA	NA	8361000	8363999	5190630	5193629	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.3337	NA	NA	NA	8364000	8366999	5193597	5196596	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.8141	NA	NA	NA	8367000	8369999	5196643	5199642	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.1976	NA	NA	NA	8385000	8387999	5202725	5205724	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.8866	NA	NA	NA	8397000	8399999	5205703	5208702	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	93.2625	NA	NA	NA	8400000	8402999	5207441	5210440	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	91.7636	NA	NA	NA	942000	944999	5214623	5217622	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.734	NA	NA	NA	8796000	8798999	5215197	5218196	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	96.244	NA	NA	NA	1071000	1073999	5219283	5222282	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.4318	NA	NA	NA	5979000	5981999	5223291	5226290	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	96.0663	NA	NA	NA	7011000	7013999	5224454	5227453	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	94.9933	NA	NA	NA	8403000	8405999	5229882	5232881	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.9811	NA	NA	NA	8406000	8408999	5231852	5234851	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.5387	NA	NA	NA	5181000	5183999	5233397	5236396	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.9449	NA	NA	NA	8424000	8426999	5235903	5238902	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.3097	NA	NA	NA	8427000	8429999	5239596	5242595	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.2179	NA	NA	NA	8430000	8432999	5242490	5245489	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.1543	NA	NA	NA	8433000	8435999	5245496	5248495	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.1227	NA	NA	NA	8436000	8438999	5248479	5251478	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	96.2565	NA	NA	NA	8439000	8441999	5251319	5254318	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.3085	NA	NA	NA	8451000	8453999	5256570	5259569	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.2943	NA	NA	NA	8454000	8456999	5259595	5262594	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.8655	NA	NA	NA	8457000	8459999	5262575	5265574	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.5019	NA	NA	NA	8460000	8462999	5265579	5268578	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.5525	NA	NA	NA	8463000	8465999	5268527	5271526	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.1593	NA	NA	NA	8466000	8468999	5271571	5274570	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.6475	NA	NA	NA	8469000	8471999	5274579	5277578	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.0017	NA	NA	NA	8484000	8486999	5283750	5286749	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.5076	NA	NA	NA	8487000	8489999	5286811	5289810	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.5808	NA	NA	NA	8490000	8492999	5289802	5292801	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.3895	NA	NA	NA	8493000	8495999	5292824	5295823	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.971	NA	NA	NA	8496000	8498999	5296093	5299092	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.348	NA	NA	NA	8499000	8501999	5299093	5302092	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.3323	NA	NA	NA	8505000	8507999	5304150	5307149	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.7209	NA	NA	NA	8508000	8510999	5307138	5310137	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.1323	NA	NA	NA	8511000	8513999	5309974	5312973	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.6087	NA	NA	NA	8514000	8516999	5312143	5315142	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.0442	NA	NA	NA	8517000	8519999	5314931	5317930	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	96.7029	NA	NA	NA	8520000	8522999	5320800	5323799	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.2763	NA	NA	NA	8523000	8525999	5322928	5325927	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	94.9715	NA	NA	NA	8559000	8561999	5328979	5331978	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	93.7313	NA	NA	NA	8553000	8555999	5333936	5336935	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.7492	NA	NA	NA	3249000	3251999	5336343	5339342	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.6527	NA	NA	NA	4296000	4298999	5349594	5352593	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	96.6708	NA	NA	NA	10419895	10422894	5360900	5363899	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	89.5768	NA	NA	NA	8850000	8852999	5362922	5365921	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.3562	NA	NA	NA	1173000	1175999	5366690	5369689	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.131	NA	NA	NA	8823000	8825999	5369291	5372290	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.3048	NA	NA	NA	9930895	9933894	5370208	5373207	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.1339	NA	NA	NA	6405000	6407999	5373548	5376547	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.6659	NA	NA	NA	6408000	6410999	5376495	5379494	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.2963	NA	NA	NA	8550000	8552999	5386333	5389332	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.9843	NA	NA	NA	8547000	8549999	5389318	5392317	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	89.8491	NA	NA	NA	8544000	8546999	5392231	5395230	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	96.9524	NA	NA	NA	8541000	8543999	5396091	5399090	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.1416	NA	NA	NA	8538000	8540999	5398535	5401534	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.9544	NA	NA	NA	8535000	8537999	5401535	5404534	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.2337	NA	NA	NA	8532000	8534999	5404501	5407500	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.4697	NA	NA	NA	6927000	6929999	5407479	5410478	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.8309	NA	NA	NA	8529000	8531999	5410867	5413866	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	95.9432	NA	NA	NA	8526000	8528999	5413569	5416568	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.1781	NA	NA	NA	9690895	9693894	5422369	5425368	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.8536	NA	NA	NA	4302000	4304999	5427688	5430687	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.8517	NA	NA	NA	3369000	3371999	5431279	5434278	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.9763	NA	NA	NA	9717895	9720894	5436346	5439345	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.0846	NA	NA	NA	8562000	8564999	5442953	5445952	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.2718	NA	NA	NA	8565000	8567999	5451062	5454061	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.9625	NA	NA	NA	8568000	8570999	5453721	5456720	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.8436	NA	NA	NA	8571000	8573999	5456728	5459727	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.1323	NA	NA	NA	8577000	8579999	5466363	5469362	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.7616	NA	NA	NA	8580000	8582999	5469335	5472334	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.5258	NA	NA	NA	8583000	8585999	5472317	5475316	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	93.9431	NA	NA	NA	3438000	3440999	5475691	5478690	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.9905	NA	NA	NA	8586000	8588999	5478435	5481434	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.7816	NA	NA	NA	8589000	8591999	5481387	5484386	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.683	NA	NA	NA	8592000	8594999	5484371	5487370	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.8484	NA	NA	NA	8595000	8597999	5487388	5490387	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.5648	NA	NA	NA	8598000	8600999	5490367	5493366	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	96.2178	NA	NA	NA	7005000	7007999	5499158	5502157	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.7143	NA	NA	NA	8604000	8606999	5504443	5507442	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.3954	NA	NA	NA	8607000	8609999	5507289	5510288	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.7415	NA	NA	NA	8610000	8612999	5510329	5513328	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.6828	NA	NA	NA	8613000	8615999	5513793	5516792	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.6979	NA	NA	NA	8616000	8618999	5517091	5520090	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.7758	NA	NA	NA	8619000	8621999	5520084	5523083	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.591	NA	NA	NA	8622000	8624999	5523092	5526091	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.9726	NA	NA	NA	8625000	8627999	5526091	5529090	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.9481	NA	NA	NA	8628000	8630999	5529083	5532082	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.9194	NA	NA	NA	8631000	8633999	5532083	5535082	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.895	NA	NA	NA	8634000	8636999	5535094	5538093	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.9607	NA	NA	NA	8637000	8639999	5538087	5541086	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	8640000	8642999	5541084	5544083	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.8862	NA	NA	NA	8643000	8645999	5544090	5547089	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.9341	NA	NA	NA	8646000	8648999	5547086	5550085	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	96.7884	NA	NA	NA	8649000	8651999	5549643	5552642	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	89.9858	NA	NA	NA	8652000	8654999	5552322	5555321	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	95.379	NA	NA	NA	8655000	8657999	5555219	5558218	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.4665	NA	NA	NA	8658000	8660999	5558201	5561200	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.6314	NA	NA	NA	8661000	8663999	5561193	5564192	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.8122	NA	NA	NA	8664000	8666999	5564185	5567184	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.0313	NA	NA	NA	8667000	8669999	5567166	5570165	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.0366	NA	NA	NA	8670000	8672999	5570182	5573181	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.0053	NA	NA	NA	8673000	8675999	5573156	5576155	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.5824	NA	NA	NA	8676000	8678999	5576339	5579338	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.6885	NA	NA	NA	8679000	8681999	5579329	5582328	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	96.5757	NA	NA	NA	8682000	8684999	5581898	5584897	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	78.6649	NA	NA	NA	2985000	2987999	5586138	5589137	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.5683	NA	NA	NA	8685000	8687999	5592100	5595099	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	96.8384	NA	NA	NA	8688000	8690999	5601242	5604241	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.9341	NA	NA	NA	8691000	8693999	5604182	5607181	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.7505	NA	NA	NA	8694000	8696999	5607185	5610184	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.3542	NA	NA	NA	8697000	8699999	5609915	5612914	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.5583	NA	NA	NA	8700000	8702999	5612215	5615214	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	96.1739	NA	NA	NA	8703000	8705999	5615250	5618249	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	88.0423	NA	NA	NA	8748000	8750999	5620780	5623779	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	96.7895	NA	NA	NA	8709000	8711999	5625616	5628615	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.6063	NA	NA	NA	8712000	8714999	5628424	5631423	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.1399	NA	NA	NA	8715000	8717999	5631302	5634301	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.2923	NA	NA	NA	468000	470999	5634797	5637796	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.9698	NA	NA	NA	8445000	8447999	5636528	5639527	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.0464	NA	NA	NA	8718000	8720999	5641174	5644173	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.3333	NA	NA	NA	8721000	8723999	5644192	5647191	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.1371	NA	NA	NA	8724000	8726999	5647200	5650199	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.1249	NA	NA	NA	8556000	8558999	5654790	5657789	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.1399	NA	NA	NA	471000	473999	5656367	5659366	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	94.6907	NA	NA	NA	4233000	4235999	5679927	5682926	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	96.7363	NA	NA	NA	7818000	7820999	5688212	5691211	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.0005	NA	NA	NA	4383000	4385999	5690419	5693418	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.1913	NA	NA	NA	7599000	7601999	5692347	5695346	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	96.4201	NA	NA	NA	7602000	7604999	5695351	5698350	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	78.7686	NA	NA	NA	972000	974999	5707575	5710574	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	96.2669	NA	NA	NA	8829000	8831999	5728855	5731854	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.159	NA	NA	NA	8832000	8834999	5731664	5734663	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	81.8367	NA	NA	NA	8853000	8855999	5734641	5737640	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.1646	NA	NA	NA	8856000	8858999	5736635	5739634	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.4823	NA	NA	NA	8859000	8861999	5739601	5742600	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.1613	NA	NA	NA	8862000	8864999	5742576	5745575	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.4866	NA	NA	NA	8865000	8867999	5745581	5748580	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.0432	NA	NA	NA	8868000	8870999	5748640	5751639	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.0152	NA	NA	NA	8871000	8873999	5751547	5754546	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.8845	NA	NA	NA	8874000	8876999	5754545	5757544	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.7173	NA	NA	NA	8877000	8879999	5757544	5760543	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.4665	NA	NA	NA	8880000	8882999	5760565	5763564	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.229	NA	NA	NA	8886000	8888999	5767413	5770412	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.1611	NA	NA	NA	8889000	8891999	5770262	5773261	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.7865	NA	NA	NA	8892000	8894999	5773248	5776247	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.971	NA	NA	NA	8895000	8897999	5776199	5779198	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.0914	NA	NA	NA	8898000	8900999	5779194	5782193	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.7533	NA	NA	NA	8901000	8903999	5782197	5785196	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.8706	NA	NA	NA	8904000	8906999	5785192	5788191	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.2222	NA	NA	NA	8907000	8909999	5787663	5790662	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	94.6576	NA	NA	NA	8910000	8912999	5793951	5796950	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	89.0288	NA	NA	NA	11541895	11544894	5800190	5803189	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.2555	NA	NA	NA	11538895	11541894	5802021	5805020	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.4835	NA	NA	NA	11535895	11538894	5804967	5807966	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	96.0378	NA	NA	NA	11532895	11535894	5808090	5811089	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.2795	NA	NA	NA	11529895	11532894	5811024	5814023	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.7034	NA	NA	NA	11526895	11529894	5813878	5816877	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.687	NA	NA	NA	11523895	11526894	5816863	5819862	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.3628	NA	NA	NA	11520895	11523894	5819848	5822847	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.1219	NA	NA	NA	11517895	11520894	5822859	5825858	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.5587	NA	NA	NA	11514895	11517894	5825782	5828781	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.7133	NA	NA	NA	11511895	11514894	5828690	5831689	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.8318	NA	NA	NA	11508895	11511894	5831695	5834694	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.3089	NA	NA	NA	11505895	11508894	5834682	5837681	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.7589	NA	NA	NA	11502895	11505894	5837687	5840686	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.7389	NA	NA	NA	11487895	11490894	5842647	5845646	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.8318	NA	NA	NA	11484895	11487894	5845649	5848648	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.7073	NA	NA	NA	11481895	11484894	5848662	5851661	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.796	NA	NA	NA	11478895	11481894	5851659	5854658	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.6643	NA	NA	NA	11475895	11478894	5854677	5857676	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.8695	NA	NA	NA	11472895	11475894	5857689	5860688	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.8341	NA	NA	NA	11469895	11472894	5860678	5863677	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.4904	NA	NA	NA	11466895	11469894	5863689	5866688	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.6419	NA	NA	NA	11463895	11466894	5866696	5869695	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.5045	NA	NA	NA	11460895	11463894	5869674	5872673	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.5411	NA	NA	NA	11457895	11460894	5872679	5875678	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.548	NA	NA	NA	11454895	11457894	5875705	5878704	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.7682	NA	NA	NA	11451895	11454894	5878709	5881708	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.9486	NA	NA	NA	11448895	11451894	5881716	5884715	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.8757	NA	NA	NA	11445895	11448894	5884708	5887707	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.6743	NA	NA	NA	11442895	11445894	5887715	5890714	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.5379	NA	NA	NA	11439895	11442894	5890723	5893722	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.1265	NA	NA	NA	11436895	11439894	5893730	5896729	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.2983	NA	NA	NA	11433895	11436894	5896719	5899718	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.1504	NA	NA	NA	11430895	11433894	5899715	5902714	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.5213	NA	NA	NA	11427895	11430894	5902732	5905731	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.5891	NA	NA	NA	11424895	11427894	5906487	5909486	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.3962	NA	NA	NA	11421895	11424894	5909441	5912440	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.5765	NA	NA	NA	11418895	11421894	5912417	5915416	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.2822	NA	NA	NA	11415895	11418894	5915394	5918393	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.3737	NA	NA	NA	11412895	11415894	5918380	5921379	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.6135	NA	NA	NA	11409895	11412894	5921318	5924317	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	92.6116	NA	NA	NA	11406895	11409894	5923687	5926686	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.451	NA	NA	NA	11394895	11397894	5927018	5930017	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.2361	NA	NA	NA	11391895	11394894	5930017	5933016	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.7887	NA	NA	NA	11388895	11391894	5932996	5935995	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.4399	NA	NA	NA	11385895	11388894	5935988	5938987	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.762	NA	NA	NA	11382895	11385894	5938988	5941987	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.0869	NA	NA	NA	11379895	11382894	5941995	5944994	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.2521	NA	NA	NA	11376895	11379894	5945007	5948006	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.1984	NA	NA	NA	11373895	11376894	5947997	5950996	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.9763	NA	NA	NA	11370895	11373894	5950987	5953986	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.0417	NA	NA	NA	11367895	11370894	5953982	5956981	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.701	NA	NA	NA	11364895	11367894	5956992	5959991	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.7033	NA	NA	NA	11361895	11364894	5959990	5962989	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	11358895	11361894	5963000	5965999	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	11355895	11358894	5966004	5969003	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	11352895	11355894	5968998	5971997	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	11349895	11352894	5971985	5974984	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	11346895	11349894	5974985	5977984	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	11343895	11346894	5977997	5980996	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	11340895	11343894	5980998	5983997	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	11337895	11340894	5983992	5986991	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	11334895	11337894	5987005	5990004	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	11331895	11334894	5990008	5993007	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	11328895	11331894	5993004	5996003	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	11325895	11328894	5996001	5999000	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	11322895	11325894	5999005	6002004	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	11319895	11322894	6002006	6005005	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	11316895	11319894	6005004	6008003	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	11313895	11316894	6008007	6011006	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	11310895	11313894	6010999	6013998	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	11307895	11310894	6013986	6016985	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	11304895	11307894	6017004	6020003	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	11301895	11304894	6020001	6023000	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	11298895	11301894	6023008	6026007	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	11295895	11298894	6025991	6028990	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	11292895	11295894	6029002	6032001	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	11289895	11292894	6031986	6034985	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	11286895	11289894	6035008	6038007	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	11283895	11286894	6038000	6040999	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	11280895	11283894	6040986	6043985	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	11277895	11280894	6044003	6047002	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	11274895	11277894	6046987	6049986	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	11271895	11274894	6049988	6052987	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	11268895	11271894	6052994	6055993	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	11265895	11268894	6055998	6058997	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	11262895	11265894	6059008	6062007	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	11259895	11262894	6061998	6064997	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	11256895	11259894	6065006	6068005	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	11253895	11256894	6068002	6071001	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	11250895	11253894	6070989	6073988	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	11247895	11250894	6074007	6077006	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	11244895	11247894	6077004	6080003	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	11241895	11244894	6080004	6083003	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	11238895	11241894	6082997	6085996	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	11235895	11238894	6086000	6088999	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	11232895	11235894	6088993	6091992	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	11229895	11232894	6092007	6095006	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	11226895	11229894	6094996	6097995	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	11223895	11226894	6098005	6101004	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	11220895	11223894	6101006	6104005	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	11217895	11220894	6104008	6107007	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	11214895	11217894	6106989	6109988	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	11211895	11214894	6109987	6112986	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	11208895	11211894	6112998	6115997	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	11205895	11208894	6115995	6118994	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	11202895	11205894	6118990	6121989	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	11199895	11202894	6122004	6125003	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	11196895	11199894	6124999	6127998	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	11193895	11196894	6128004	6131003	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	11190895	11193894	6130996	6133995	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	11187895	11190894	6133996	6136995	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	11184895	11187894	6137007	6140006	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.8614	NA	NA	NA	11181895	11184894	6139996	6142995	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	11178895	11181894	6142992	6145991	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	11175895	11178894	6146001	6149000	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	11172895	11175894	6148986	6151985	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	11169895	11172894	6152003	6155002	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	11166895	11169894	6155006	6158005	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	11163895	11166894	6157987	6160986	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	11160895	11163894	6161004	6164003	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	11157895	11160894	6163997	6166996	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	11154895	11157894	6166997	6169996	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	11151895	11154894	6170003	6173002	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	11148895	11151894	6172997	6175996	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	11145895	11148894	6176000	6178999	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	11142895	11145894	6179002	6182001	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.9477	NA	NA	NA	11139895	11142894	6181998	6184997	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	11136895	11139894	6184995	6187994	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	11133895	11136894	6187994	6190993	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	11130895	11133894	6190995	6193994	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	11127895	11130894	6194005	6197004	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	11124895	11127894	6197006	6200005	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	11121895	11124894	6199991	6202990	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	11118895	11121894	6202991	6205990	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	11115895	11118894	6206006	6209005	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	11112895	11115894	6208990	6211989	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	11109895	11112894	6211993	6214992	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	11106895	11109894	6215007	6218006	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	11103895	11106894	6218007	6221006	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	11100895	11103894	6220997	6223996	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	11097895	11100894	6224003	6227002	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	11091895	11094894	6230008	6233007	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	11088895	11091894	6232992	6235991	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	11085895	11088894	6236004	6239003	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	11082895	11085894	6239001	6242000	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	11079895	11082894	6242000	6244999	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	11076895	11079894	6245006	6248005	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	11073895	11076894	6248008	6251007	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	11070895	11073894	6251006	6254005	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	11067895	11070894	6253998	6256997	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	11064895	11067894	6256988	6259987	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	11061895	11064894	6259989	6262988	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	11058895	11061894	6262999	6265998	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	11055895	11058894	6266002	6269001	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	11052895	11055894	6269002	6272001	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	11049895	11052894	6271999	6274998	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	11046895	11049894	6275004	6278003	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	11043895	11046894	6278003	6281002	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	11040895	11043894	6281004	6284003	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	11037895	11040894	6283994	6286993	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	11034895	11037894	6287007	6290006	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	11031895	11034894	6290002	6293001	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	11028895	11031894	6293004	6296003	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	11025895	11028894	6296006	6299005	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	11022895	11025894	6298991	6301990	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	11019895	11022894	6302006	6305005	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	11016895	11019894	6305006	6308005	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	11013895	11016894	6307988	6310987	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	11010895	11013894	6310985	6313984	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	11007895	11010894	6313990	6316989	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	11004895	11007894	6317008	6320007	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	11001895	11004894	6319992	6322991	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	10998895	11001894	6323006	6326005	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	10995895	10998894	6325989	6328988	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	10992895	10995894	6328996	6331995	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	10989895	10992894	6332004	6335003	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	10986895	10989894	6335005	6338004	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	10983895	10986894	6337993	6340992	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	10980895	10983894	6341003	6344002	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.9736	NA	NA	NA	10977895	10980894	6344008	6347007	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	10974895	10977894	6346989	6349988	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	10971895	10974894	6350005	6353004	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	10968895	10971894	6352993	6355992	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	10965895	10968894	6355999	6358998	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	10962895	10965894	6359001	6362000	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	10959895	10962894	6362008	6365007	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	10956895	10959894	6365001	6368000	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	10953895	10956894	6368001	6371000	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	10950895	10953894	6371005	6374004	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	10947895	10950894	6374005	6377004	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	10944895	10947894	6376986	6379985	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	10941895	10944894	6380008	6383007	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	10938895	10941894	6382985	6385984	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	10935895	10938894	6386003	6389002	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	10932895	10935894	6389000	6391999	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	10929895	10932894	6391986	6394985	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	10926895	10929894	6394992	6397991	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	10923895	10926894	6397985	6400984	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	10920895	10923894	6400994	6403993	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	10917895	10920894	6403991	6406990	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.9604	NA	NA	NA	10914895	10917894	6406990	6409989	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	10911895	10914894	6409999	6412998	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	10908895	10911894	6413007	6416006	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	10905895	10908894	6415997	6418996	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	10902895	10905894	6419001	6422000	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	10899895	10902894	6421992	6424991	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	10896895	10899894	6424998	6427997	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	10893895	10896894	6428007	6431006	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	10890895	10893894	6431008	6434007	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	10887895	10890894	6434001	6437000	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	10884895	10887894	6437002	6440001	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	10881895	10884894	6439985	6442984	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	10878895	10881894	6442992	6445991	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	10875895	10878894	6446001	6449000	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	10872895	10875894	6448996	6451995	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	10869895	10872894	6451991	6454990	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	10866895	10869894	6455001	6458000	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	10863895	10866894	6458001	6461000	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	10860895	10863894	6460989	6463988	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	10857895	10860894	6463985	6466984	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	10854895	10857894	6466989	6469988	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	10851895	10854894	6470006	6473005	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	10848895	10851894	6472996	6475995	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	10845895	10848894	6475999	6478998	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.9599	NA	NA	NA	10842895	10845894	6478997	6481996	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	10839895	10842894	6481998	6484997	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	10836895	10839894	6484998	6487997	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	10833895	10836894	6487999	6490998	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	10830895	10833894	6491008	6494007	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	10827895	10830894	6494008	6497007	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	10824895	10827894	6496986	6499985	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	10821895	10824894	6499999	6502998	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	10818895	10821894	6503002	6506001	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	10815895	10818894	6506001	6509000	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	10812895	10815894	6508988	6511987	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	10809895	10812894	6511992	6514991	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	10806895	10809894	6514996	6517995	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	10803895	10806894	6518004	6521003	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	10800895	10803894	6521008	6524007	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	10797895	10800894	6523996	6526995	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	10794895	10797894	6526999	6529998	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	10791895	10794894	6529990	6532989	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	10788895	10791894	6533002	6536001	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	10785895	10788894	6536006	6539005	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	10782895	10785894	6538988	6541987	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	10779895	10782894	6542003	6545002	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	10776895	10779894	6544985	6547984	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	10773895	10776894	6547993	6550992	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	10770895	10773894	6550994	6553993	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	10767895	10770894	6553987	6556986	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	10764895	10767894	6556988	6559987	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	10761895	10764894	6559996	6562995	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	10758895	10761894	6562994	6565993	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	10755895	10758894	6566007	6569006	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	10752895	10755894	6569008	6572007	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	10749895	10752894	6572004	6575003	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	10746895	10749894	6574992	6577991	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	10743895	10746894	6578005	6581004	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	10740895	10743894	6580988	6583987	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	10737895	10740894	6584004	6587003	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	10734895	10737894	6586997	6589996	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	10731895	10734894	6589993	6592992	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	10728895	10731894	6593008	6596007	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	10725895	10728894	6595996	6598995	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	10722895	10725894	6599003	6602002	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	10719895	10722894	6601998	6604997	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	10716895	10719894	6605006	6608005	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	10713895	10716894	6607991	6610990	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	10710895	10713894	6610995	6613994	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	10707895	10710894	6613990	6616989	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	10704895	10707894	6617006	6620005	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.9604	NA	NA	NA	10701895	10704894	6619999	6622998	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.9461	NA	NA	NA	10698895	10701894	6622991	6625990	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	10695895	10698894	6625992	6628991	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	10692895	10695894	6628987	6631986	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	10689895	10692894	6631997	6634996	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.9477	NA	NA	NA	10686895	10689894	6635003	6638002	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	10683895	10686894	6638002	6641001	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	10680895	10683894	6640985	6643984	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	10677895	10680894	6643999	6646998	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	10674895	10677894	6646992	6649991	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	10671895	10674894	6650002	6653001	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	10668895	10671894	6652999	6655998	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	10665895	10668894	6656007	6659006	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	10662895	10665894	6659000	6661999	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	10659895	10662894	6662006	6665005	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	10656895	10659894	6665000	6667999	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	10653895	10656894	6668001	6671000	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	10650895	10653894	6671001	6674000	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.4043	NA	NA	NA	10647895	10650894	6673988	6676987	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.2085	NA	NA	NA	10644895	10647894	6677236	6680235	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	95.5488	NA	NA	NA	10635895	10638894	6680195	6683194	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.2857	NA	NA	NA	10632895	10635894	6683132	6686131	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.2497	NA	NA	NA	10629895	10632894	6686523	6689522	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.8404	NA	NA	NA	10626895	10629894	6689532	6692531	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.3194	NA	NA	NA	10623895	10626894	6692512	6695511	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.3961	NA	NA	NA	10620895	10623894	6695491	6698490	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	94.9424	NA	NA	NA	7269000	7271999	6701403	6704402	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.4217	NA	NA	NA	261000	263999	6708368	6711367	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.1433	NA	NA	NA	249000	251999	6714706	6717705	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	93.0164	NA	NA	NA	246000	248999	6717359	6720358	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.5161	NA	NA	NA	10617895	10620894	6719277	6722276	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.2381	NA	NA	NA	10614895	10617894	6722209	6725208	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.629	NA	NA	NA	10611895	10614894	6725202	6728201	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.0442	NA	NA	NA	10608895	10611894	6728184	6731183	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.8662	NA	NA	NA	10605895	10608894	6731145	6734144	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.5484	NA	NA	NA	10602895	10605894	6734129	6737128	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.2468	NA	NA	NA	10599895	10602894	6737151	6740150	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	96.1666	NA	NA	NA	10596895	10599894	6739960	6742959	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.0307	NA	NA	NA	1446000	1448999	6746577	6749576	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	96.789	NA	NA	NA	7887000	7889999	6750072	6753071	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.4629	NA	NA	NA	1452000	1454999	6752434	6755433	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.0416	NA	NA	NA	10569895	10572894	6773156	6776155	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.0508	NA	NA	NA	10566895	10569894	6776162	6779161	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.6193	NA	NA	NA	10563895	10566894	6779160	6782159	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.7848	NA	NA	NA	10560895	10563894	6782164	6785163	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.2857	NA	NA	NA	10557895	10560894	6785229	6788228	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	96.1654	NA	NA	NA	10554895	10557894	6787953	6790952	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.5971	NA	NA	NA	10536895	10539894	6804517	6807516	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.2865	NA	NA	NA	10533895	10536894	6807386	6810385	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.7076	NA	NA	NA	10530895	10533894	6810483	6813482	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.655	NA	NA	NA	10527895	10530894	6813675	6816674	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.199	NA	NA	NA	10524895	10527894	6817092	6820091	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	92.1246	NA	NA	NA	10521895	10524894	6818690	6821689	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.4297	NA	NA	NA	10539895	10542894	6821445	6824444	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.9072	NA	NA	NA	10542895	10545894	6824328	6827327	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.443	NA	NA	NA	7893000	7895999	6827409	6830408	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.3807	NA	NA	NA	7881000	7883999	6831121	6834120	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	94.1266	NA	NA	NA	7878000	7880999	6834143	6837142	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.1636	NA	NA	NA	8418000	8420999	6847067	6850066	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	95.5617	NA	NA	NA	10512895	10515894	6851808	6854807	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.1453	NA	NA	NA	10509895	10512894	6854774	6857773	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.6375	NA	NA	NA	10506895	10509894	6857767	6860766	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.8984	NA	NA	NA	10503895	10506894	6860762	6863761	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	96.1452	NA	NA	NA	10500895	10503894	6863572	6866571	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	92.6655	NA	NA	NA	10497895	10500894	6865997	6868996	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	96.5541	NA	NA	NA	10494895	10497894	6868834	6871833	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	86.3751	NA	NA	NA	10470895	10473894	6871903	6874902	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	94.962	NA	NA	NA	1413000	1415999	6879221	6882220	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	95.9175	NA	NA	NA	10467895	10470894	6890432	6893431	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.0217	NA	NA	NA	10464895	10467894	6893280	6896279	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.1416	NA	NA	NA	10461895	10464894	6896281	6899280	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.542	NA	NA	NA	10458895	10461894	6899268	6902267	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.066	NA	NA	NA	10455895	10458894	6902358	6905357	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.4127	NA	NA	NA	10452895	10455894	6905838	6908837	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.2445	NA	NA	NA	10449895	10452894	6908721	6911720	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	96.0206	NA	NA	NA	4149000	4151999	6911527	6914526	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.5368	NA	NA	NA	4152000	4154999	6914158	6917157	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.5379	NA	NA	NA	10446895	10449894	6918711	6921710	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.6878	NA	NA	NA	10443895	10446894	6921729	6924728	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.6979	NA	NA	NA	10440895	10443894	6924710	6927709	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.9169	NA	NA	NA	10437895	10440894	6927711	6930710	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.5827	NA	NA	NA	10434895	10437894	6930706	6933705	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.0747	NA	NA	NA	10431895	10434894	6933699	6936698	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.4537	NA	NA	NA	10428895	10431894	6936698	6939697	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	95.4513	NA	NA	NA	10425895	10428894	6939732	6942731	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.3542	NA	NA	NA	5517000	5519999	6943083	6946082	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.4963	NA	NA	NA	10386895	10389894	6947300	6950299	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	95.8093	NA	NA	NA	5763000	5765999	6949307	6952306	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	95.5033	NA	NA	NA	10395895	10398894	6954187	6957186	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.9449	NA	NA	NA	5712000	5714999	6954586	6957585	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.3233	NA	NA	NA	10377895	10380894	6959475	6962474	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.962	NA	NA	NA	5727000	5729999	6961805	6964804	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.5799	NA	NA	NA	5745000	5747999	6966027	6969026	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.2533	NA	NA	NA	5742000	5744999	6966826	6969825	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	96.6721	NA	NA	NA	10356895	10359894	6971782	6974781	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.183	NA	NA	NA	10401895	10404894	6974653	6977652	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.5025	NA	NA	NA	10383895	10386894	6975583	6978582	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	90.9924	NA	NA	NA	3189000	3191999	6980092	6983091	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	86.0058	NA	NA	NA	3201000	3203999	6984645	6987644	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.1422	NA	NA	NA	10398895	10401894	6987522	6990521	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	94.446	NA	NA	NA	8757000	8759999	6998974	7001973	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	94.2941	NA	NA	NA	9903895	9906894	6999710	7002709	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	96.7061	NA	NA	NA	10338895	10341894	7002852	7005851	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.7732	NA	NA	NA	10335895	10338894	7005783	7008782	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.5307	NA	NA	NA	10332895	10335894	7008776	7011775	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.4267	NA	NA	NA	10329895	10332894	7011778	7014777	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.5544	NA	NA	NA	10326895	10329894	7014758	7017757	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.4997	NA	NA	NA	10323895	10326894	7017766	7020765	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.7827	NA	NA	NA	10320895	10323894	7020763	7023762	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.757	NA	NA	NA	10317895	10320894	7023781	7026780	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.6459	NA	NA	NA	10314895	10317894	7026774	7029773	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.4973	NA	NA	NA	10311895	10314894	7030068	7033067	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.1675	NA	NA	NA	10308895	10311894	7033061	7036060	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.7282	NA	NA	NA	10305895	10308894	7036229	7039228	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.7585	NA	NA	NA	10302895	10305894	7039237	7042236	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.7768	NA	NA	NA	10299895	10302894	7042238	7045237	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.9344	NA	NA	NA	10296895	10299894	7045232	7048231	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.8789	NA	NA	NA	10293895	10296894	7048238	7051237	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.7099	NA	NA	NA	10290895	10293894	7051238	7054237	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.9599	NA	NA	NA	10287895	10290894	7054231	7057230	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.8164	NA	NA	NA	10284895	10287894	7057222	7060221	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	10281895	10284894	7060235	7063234	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.7717	NA	NA	NA	10278895	10281894	7063236	7066235	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.4363	NA	NA	NA	10275895	10278894	7066230	7069229	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.9072	NA	NA	NA	10272895	10275894	7069219	7072218	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.3957	NA	NA	NA	10269895	10272894	7072236	7075235	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.2957	NA	NA	NA	10266895	10269894	7075240	7078239	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.7096	NA	NA	NA	10263895	10266894	7078208	7081207	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.6214	NA	NA	NA	10260895	10263894	7080531	7083530	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.9698	NA	NA	NA	10257895	10260894	7083299	7086298	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.1929	NA	NA	NA	10254895	10257894	7086292	7089291	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.3927	NA	NA	NA	10251895	10254894	7089272	7092271	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.4575	NA	NA	NA	10248895	10251894	7092303	7095302	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.416	NA	NA	NA	10245895	10248894	7095283	7098282	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.7197	NA	NA	NA	10242895	10245894	7098295	7101294	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.056	NA	NA	NA	10239895	10242894	7101288	7104287	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.4707	NA	NA	NA	10236895	10239894	7104293	7107292	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.9979	NA	NA	NA	10233895	10236894	7107267	7110266	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.993	NA	NA	NA	10230895	10233894	7110308	7113307	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.5607	NA	NA	NA	10227895	10230894	7113333	7116332	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.7402	NA	NA	NA	10224895	10227894	7116315	7119314	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.8957	NA	NA	NA	10221895	10224894	7119273	7122272	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.3701	NA	NA	NA	10218895	10221894	7122361	7125360	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	90.6235	NA	NA	NA	10638895	10641894	7126061	7129060	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	91.917	NA	NA	NA	10641895	10644894	7128699	7131698	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	96.0392	NA	NA	NA	10215895	10218894	7131154	7134153	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.3737	NA	NA	NA	10212895	10215894	7133848	7136847	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.6853	NA	NA	NA	10209895	10212894	7136863	7139862	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.7458	NA	NA	NA	10206895	10209894	7139856	7142855	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.3129	NA	NA	NA	10203895	10206894	7142843	7145842	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.4497	NA	NA	NA	10200895	10203894	7145862	7148861	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.5995	NA	NA	NA	10197895	10200894	7148821	7151820	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.2648	NA	NA	NA	10194895	10197894	7151894	7154893	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.1758	NA	NA	NA	10191895	10194894	7154902	7157901	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.6758	NA	NA	NA	10188895	10191894	7157909	7160908	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.5116	NA	NA	NA	10185895	10188894	7160896	7163895	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.5769	NA	NA	NA	10182895	10185894	7163903	7166902	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.3437	NA	NA	NA	10179895	10182894	7167082	7170081	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.0267	NA	NA	NA	10176895	10179894	7170209	7173208	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.5746	NA	NA	NA	10173895	10176894	7173203	7176202	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.9146	NA	NA	NA	10170895	10173894	7176225	7179224	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.2066	NA	NA	NA	10167895	10170894	7179267	7182266	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.2446	NA	NA	NA	10164895	10167894	7182575	7185574	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.6177	NA	NA	NA	10161895	10164894	7185574	7188573	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.4347	NA	NA	NA	10158895	10161894	7188578	7191577	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.8025	NA	NA	NA	10155895	10158894	7191576	7194575	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.9211	NA	NA	NA	10152895	10155894	7194571	7197570	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.8421	NA	NA	NA	10149895	10152894	7197569	7200568	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.7298	NA	NA	NA	10146895	10149894	7200577	7203576	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.4675	NA	NA	NA	10143895	10146894	7203555	7206554	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.37	NA	NA	NA	10140895	10143894	7206558	7209557	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.2992	NA	NA	NA	10137895	10140894	7209273	7212272	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	76.9445	NA	NA	NA	4986000	4988999	7211667	7214666	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	80.2422	NA	NA	NA	7938000	7940999	7224126	7227125	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.1399	NA	NA	NA	10134895	10137894	7228234	7231233	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.9347	NA	NA	NA	10131895	10134894	7231233	7234232	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.9214	NA	NA	NA	10128895	10131894	7234229	7237228	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.9741	NA	NA	NA	10125895	10128894	7237228	7240227	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.7381	NA	NA	NA	10122895	10125894	7240222	7243221	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.7854	NA	NA	NA	10119895	10122894	7243236	7246235	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.7597	NA	NA	NA	10116895	10119894	7246205	7249204	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.2266	NA	NA	NA	10113895	10116894	7249190	7252189	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.1416	NA	NA	NA	10110895	10113894	7252209	7255208	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.8895	NA	NA	NA	10107895	10110894	7255074	7258073	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.828	NA	NA	NA	4482000	4484999	7259061	7262060	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.7483	NA	NA	NA	4479000	4481999	7262069	7265068	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.9091	NA	NA	NA	4476000	4478999	7265057	7268056	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.8804	NA	NA	NA	4473000	4475999	7268072	7271071	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.7753	NA	NA	NA	4470000	4472999	7271071	7274070	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	96.7079	NA	NA	NA	4467000	4469999	7274042	7277041	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.501	NA	NA	NA	4464000	4466999	7277036	7280035	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.4764	NA	NA	NA	4461000	4463999	7280049	7283048	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.3201	NA	NA	NA	4458000	4460999	7283042	7286041	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	96.8702	NA	NA	NA	4455000	4457999	7286036	7289035	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.326	NA	NA	NA	4452000	4454999	7288968	7291967	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.0563	NA	NA	NA	4449000	4451999	7291923	7294922	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.0624	NA	NA	NA	4446000	4448999	7294916	7297915	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.2461	NA	NA	NA	4443000	4445999	7297933	7300932	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.6937	NA	NA	NA	4440000	4442999	7300916	7303915	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.7538	NA	NA	NA	4437000	4439999	7303907	7306906	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.4901	NA	NA	NA	4434000	4436999	7306929	7309928	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.8799	NA	NA	NA	4431000	4433999	7309918	7312917	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.3599	NA	NA	NA	4428000	4430999	7312932	7315931	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.3175	NA	NA	NA	4425000	4427999	7315846	7318845	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.8423	NA	NA	NA	4419000	4421999	7322314	7325313	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.4444	NA	NA	NA	4416000	4418999	7325255	7328254	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.69	NA	NA	NA	4413000	4415999	7328261	7331260	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	96.2484	NA	NA	NA	4410000	4412999	7330860	7333859	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.1462	NA	NA	NA	4887000	4889999	7334109	7337108	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.72	NA	NA	NA	4890000	4892999	7336583	7339582	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	94.5199	NA	NA	NA	4287000	4289999	7342639	7345638	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.8196	NA	NA	NA	4284000	4286999	7345139	7348138	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.9626	NA	NA	NA	4281000	4283999	7348128	7351127	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.5506	NA	NA	NA	4278000	4280999	7351128	7354127	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.6743	NA	NA	NA	4275000	4277999	7354132	7357131	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.9475	NA	NA	NA	4272000	4274999	7357139	7360138	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.3987	NA	NA	NA	4269000	4271999	7360143	7363142	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.1486	NA	NA	NA	4266000	4268999	7363192	7366191	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.734	NA	NA	NA	4263000	4265999	7366108	7369107	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.7532	NA	NA	NA	3591000	3593999	7379962	7382961	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.0012	NA	NA	NA	7821000	7823999	7381991	7384990	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	94.3143	NA	NA	NA	4380000	4382999	7383877	7386876	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	96.6232	NA	NA	NA	4896000	4898999	7387551	7390550	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	95.2889	NA	NA	NA	6390000	6392999	7390267	7393266	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.9741	NA	NA	NA	4197000	4199999	7395866	7398865	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	93.3026	NA	NA	NA	4257000	4259999	7406499	7409498	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	87.0772	NA	NA	NA	1698000	1700999	7408451	7411450	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.6908	NA	NA	NA	4170000	4172999	7413278	7416277	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.4223	NA	NA	NA	4167000	4169999	7416298	7419297	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.205	NA	NA	NA	4164000	4166999	7419416	7422415	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.7033	NA	NA	NA	4161000	4163999	7422394	7425393	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.2786	NA	NA	NA	4158000	4160999	7425406	7428405	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.8059	NA	NA	NA	4146000	4148999	7431172	7434171	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.5173	NA	NA	NA	4143000	4145999	7434203	7437202	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.7427	NA	NA	NA	5961000	5963999	7439370	7442369	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.5529	NA	NA	NA	9480895	9483894	7440597	7443596	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.359	NA	NA	NA	3237000	3239999	7444987	7447986	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.9053	NA	NA	NA	3240000	3242999	7447457	7450456	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.7076	NA	NA	NA	4137000	4139999	7452118	7455117	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.9415	NA	NA	NA	4134000	4136999	7454970	7457969	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.7056	NA	NA	NA	4131000	4133999	7457940	7460939	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.5957	NA	NA	NA	4128000	4130999	7460938	7463937	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.4852	NA	NA	NA	4125000	4127999	7463917	7466916	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.2935	NA	NA	NA	4122000	4124999	7466915	7469914	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.1781	NA	NA	NA	4119000	4121999	7469910	7472909	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.2187	NA	NA	NA	4116000	4118999	7472912	7475911	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.4043	NA	NA	NA	4113000	4115999	7475909	7478908	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.5788	NA	NA	NA	4110000	4112999	7478921	7481920	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.0664	NA	NA	NA	4107000	4109999	7482150	7485149	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.6637	NA	NA	NA	4104000	4106999	7485266	7488265	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.4807	NA	NA	NA	4101000	4103999	7488270	7491269	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.5167	NA	NA	NA	4098000	4100999	7491284	7494283	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.8295	NA	NA	NA	4095000	4097999	7494261	7497260	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.8139	NA	NA	NA	4092000	4094999	7497274	7500273	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.8815	NA	NA	NA	4089000	4091999	7500261	7503260	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.9194	NA	NA	NA	4086000	4088999	7503278	7506277	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.8667	NA	NA	NA	4083000	4085999	7506274	7509273	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.0134	NA	NA	NA	4080000	4082999	7509260	7512259	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	96.2452	NA	NA	NA	4077000	4079999	7512160	7515159	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.1326	NA	NA	NA	4074000	4076999	7515044	7518043	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.7391	NA	NA	NA	4071000	4073999	7518027	7521026	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.5	NA	NA	NA	4068000	4070999	7521048	7524047	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.1568	NA	NA	NA	4065000	4067999	7524040	7527039	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.0914	NA	NA	NA	4062000	4064999	7527040	7530039	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.9966	NA	NA	NA	4059000	4061999	7530056	7533055	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.5581	NA	NA	NA	4056000	4058999	7533037	7536036	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.3197	NA	NA	NA	4053000	4055999	7536052	7539051	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.1758	NA	NA	NA	4050000	4052999	7539053	7542052	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.2929	NA	NA	NA	4047000	4049999	7542069	7545068	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.9007	NA	NA	NA	4044000	4046999	7545081	7548080	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.0097	NA	NA	NA	4041000	4043999	7548064	7551063	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.559	NA	NA	NA	4038000	4040999	7551062	7554061	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.6964	NA	NA	NA	4032000	4034999	7556150	7559149	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.8147	NA	NA	NA	4029000	4031999	7559154	7562153	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.6527	NA	NA	NA	4026000	4028999	7562158	7565157	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.3773	NA	NA	NA	4023000	4025999	7565165	7568164	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.3398	NA	NA	NA	4020000	4022999	7568111	7571110	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.3539	NA	NA	NA	4017000	4019999	7571227	7574226	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.6666	NA	NA	NA	4014000	4016999	7574160	7577159	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.8059	NA	NA	NA	4011000	4013999	7577193	7580192	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.0981	NA	NA	NA	4008000	4010999	7580214	7583213	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.1997	NA	NA	NA	4005000	4007999	7583283	7586282	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.2858	NA	NA	NA	4002000	4004999	7586281	7589280	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.26	NA	NA	NA	3999000	4001999	7589283	7592282	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.8523	NA	NA	NA	3996000	3998999	7592290	7595289	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.7696	NA	NA	NA	3993000	3995999	7595289	7598288	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.6419	NA	NA	NA	3990000	3992999	7598305	7601304	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.6265	NA	NA	NA	3987000	3989999	7601283	7604282	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.5021	NA	NA	NA	3984000	3986999	7604287	7607286	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.2307	NA	NA	NA	3981000	3983999	7607548	7610547	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.4942	NA	NA	NA	3978000	3980999	7611297	7614296	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.7717	NA	NA	NA	3975000	3977999	7614282	7617281	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.2132	NA	NA	NA	3972000	3974999	7617285	7620284	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.0706	NA	NA	NA	3969000	3971999	7620277	7623276	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.0366	NA	NA	NA	3966000	3968999	7623330	7626329	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.8012	NA	NA	NA	3963000	3965999	7626314	7629313	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.5335	NA	NA	NA	3960000	3962999	7629338	7632337	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.3131	NA	NA	NA	3957000	3959999	7632322	7635321	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.488	NA	NA	NA	3954000	3956999	7635334	7638333	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.7186	NA	NA	NA	3951000	3953999	7638335	7641334	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	93.947	NA	NA	NA	3948000	3950999	7640691	7643690	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.5099	NA	NA	NA	3945000	3947999	7645873	7648872	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.8034	NA	NA	NA	3942000	3944999	7648862	7651861	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.911	NA	NA	NA	3939000	3941999	7651824	7654823	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.0706	NA	NA	NA	3936000	3938999	7654839	7657838	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.5993	NA	NA	NA	3933000	3935999	7657844	7660843	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.6809	NA	NA	NA	3930000	3932999	7660843	7663842	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.752	NA	NA	NA	3927000	3929999	7663842	7666841	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.6347	NA	NA	NA	3924000	3926999	7666848	7669847	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.7353	NA	NA	NA	3846000	3848999	7672585	7675584	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.7559	NA	NA	NA	3843000	3845999	7675575	7678574	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.1528	NA	NA	NA	3840000	3842999	7678562	7681561	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.3794	NA	NA	NA	3837000	3839999	7681573	7684572	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	96.0187	NA	NA	NA	3834000	3836999	7684562	7687561	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	96.7952	NA	NA	NA	3831000	3833999	7686781	7689780	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.5918	NA	NA	NA	3828000	3830999	7692371	7695370	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.8236	NA	NA	NA	3825000	3827999	7695334	7698333	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.6765	NA	NA	NA	3822000	3824999	7698325	7701324	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.9279	NA	NA	NA	3819000	3821999	7701351	7704350	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.2977	NA	NA	NA	3816000	3818999	7704329	7707328	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.1675	NA	NA	NA	3813000	3815999	7707334	7710333	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.7844	NA	NA	NA	3810000	3812999	7710309	7713308	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.3297	NA	NA	NA	3807000	3809999	7713309	7716308	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.4707	NA	NA	NA	3804000	3806999	7716321	7719320	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.9064	NA	NA	NA	3801000	3803999	7719326	7722325	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.9217	NA	NA	NA	3798000	3800999	7722306	7725305	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.9807	NA	NA	NA	3795000	3797999	7725238	7728237	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	96.0078	NA	NA	NA	3780000	3782999	7727872	7730871	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.2562	NA	NA	NA	3777000	3779999	7729960	7732959	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.4655	NA	NA	NA	3774000	3776999	7732939	7735938	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.6621	NA	NA	NA	3771000	3773999	7735941	7738940	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.8444	NA	NA	NA	3768000	3770999	7738937	7741936	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.4832	NA	NA	NA	3765000	3767999	7741929	7744928	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.1847	NA	NA	NA	3762000	3764999	7744922	7747921	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.7659	NA	NA	NA	3759000	3761999	7747916	7750915	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.8419	NA	NA	NA	3756000	3758999	7750965	7753964	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.073	NA	NA	NA	3753000	3755999	7753944	7756943	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	96.5375	NA	NA	NA	3750000	3752999	7756936	7759935	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.6637	NA	NA	NA	3747000	3749999	7759930	7762929	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.7753	NA	NA	NA	3744000	3746999	7762934	7765933	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.9075	NA	NA	NA	3741000	3743999	7766291	7769290	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.8715	NA	NA	NA	3738000	3740999	7769295	7772294	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.1964	NA	NA	NA	3735000	3737999	7771780	7774779	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.4658	NA	NA	NA	3732000	3734999	7774493	7777492	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.1998	NA	NA	NA	3729000	3731999	7777231	7780230	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.8204	NA	NA	NA	3726000	3728999	7780231	7783230	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.5832	NA	NA	NA	3723000	3725999	7783234	7786233	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.7099	NA	NA	NA	3720000	3722999	7786218	7789217	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.4285	NA	NA	NA	3717000	3719999	7789231	7792230	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.7931	NA	NA	NA	3714000	3716999	7792211	7795210	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.5267	NA	NA	NA	3711000	3713999	7795223	7798222	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.1205	NA	NA	NA	3708000	3710999	7798210	7801209	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.5669	NA	NA	NA	3705000	3707999	7801213	7804212	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.4665	NA	NA	NA	3702000	3704999	7804213	7807212	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.2524	NA	NA	NA	3699000	3701999	7807216	7810215	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.6308	NA	NA	NA	3696000	3698999	7810270	7813269	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.9252	NA	NA	NA	3693000	3695999	7813404	7816403	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.1265	NA	NA	NA	3690000	3692999	7816385	7819384	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.6621	NA	NA	NA	3687000	3689999	7819383	7822382	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.4562	NA	NA	NA	3684000	3686999	7822385	7825384	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.051	NA	NA	NA	3681000	3683999	7825376	7828375	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.9095	NA	NA	NA	3678000	3680999	7828383	7831382	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.9733	NA	NA	NA	3675000	3677999	7831391	7834390	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.4245	NA	NA	NA	3672000	3674999	7834378	7837377	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.935	NA	NA	NA	3669000	3671999	7837376	7840375	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.9611	NA	NA	NA	3666000	3668999	7840391	7843390	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.7799	NA	NA	NA	3663000	3665999	7843391	7846390	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.0917	NA	NA	NA	3660000	3662999	7846369	7849368	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.6779	NA	NA	NA	3657000	3659999	7849386	7852385	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.5258	NA	NA	NA	3654000	3656999	7852390	7855389	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.1021	NA	NA	NA	3651000	3653999	7855394	7858393	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.2154	NA	NA	NA	3648000	3650999	7857925	7860924	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.3065	NA	NA	NA	3645000	3647999	7860902	7863901	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.9019	NA	NA	NA	3642000	3644999	7863883	7866882	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.0416	NA	NA	NA	3639000	3641999	7866889	7869888	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.9043	NA	NA	NA	3636000	3638999	7869871	7872870	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.0111	NA	NA	NA	3633000	3635999	7872886	7875885	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.6436	NA	NA	NA	3630000	3632999	7875890	7878889	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.5625	NA	NA	NA	3627000	3629999	7878881	7881880	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.6088	NA	NA	NA	3624000	3626999	7881873	7884872	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.2822	NA	NA	NA	3621000	3623999	7884881	7887880	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.2639	NA	NA	NA	3618000	3620999	7887877	7890876	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.4321	NA	NA	NA	7632000	7634999	7899147	7902146	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.684	NA	NA	NA	3360000	3362999	7899292	7902291	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	91.4672	NA	NA	NA	3615000	3617999	7915699	7918698	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.0366	NA	NA	NA	3612000	3614999	7918533	7921532	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.3776	NA	NA	NA	3567000	3569999	7925597	7928596	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.8541	NA	NA	NA	3564000	3566999	7928589	7931588	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.2356	NA	NA	NA	3561000	3563999	7931581	7934580	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.7886	NA	NA	NA	3558000	3560999	7934587	7937586	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.8517	NA	NA	NA	3555000	3557999	7937583	7940582	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	96.8683	NA	NA	NA	3552000	3554999	7939603	7942602	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.4482	NA	NA	NA	3549000	3551999	7942194	7945193	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.702	NA	NA	NA	3546000	3548999	7945110	7948109	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.3768	NA	NA	NA	3543000	3545999	7948191	7951190	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.4486	NA	NA	NA	3540000	3542999	7951441	7954440	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.1555	NA	NA	NA	3537000	3539999	7954450	7957449	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.73	NA	NA	NA	3534000	3536999	7957454	7960453	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.6922	NA	NA	NA	3531000	3533999	7960455	7963454	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.4484	NA	NA	NA	3528000	3530999	7963447	7966446	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.4301	NA	NA	NA	3525000	3527999	7966509	7969508	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.2206	NA	NA	NA	3522000	3524999	7969508	7972507	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.3618	NA	NA	NA	3519000	3521999	7972497	7975496	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.4197	NA	NA	NA	3516000	3518999	7975494	7978493	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.3323	NA	NA	NA	3513000	3515999	7978479	7981478	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.1492	NA	NA	NA	3510000	3512999	7981480	7984479	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.6161	NA	NA	NA	3507000	3509999	7984489	7987488	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.1632	NA	NA	NA	3504000	3506999	7987504	7990503	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.667	NA	NA	NA	3501000	3503999	7990749	7993748	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	96.2707	NA	NA	NA	3498000	3500999	7993649	7996648	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	88.9065	NA	NA	NA	1044000	1046999	7994690	7997689	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.9583	NA	NA	NA	3495000	3497999	7998245	8001244	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	95.9679	NA	NA	NA	6258000	6260999	8002172	8005171	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.8827	NA	NA	NA	6255000	6257999	8003922	8006921	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.565	NA	NA	NA	3492000	3494999	8008132	8011131	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.9107	NA	NA	NA	3489000	3491999	8010829	8013828	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.8573	NA	NA	NA	3486000	3488999	8013894	8016893	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.8839	NA	NA	NA	3483000	3485999	8016886	8019885	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.8838	NA	NA	NA	3480000	3482999	8019895	8022894	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.0366	NA	NA	NA	3477000	3479999	8022886	8025885	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.2957	NA	NA	NA	3474000	3476999	8025876	8028875	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.6359	NA	NA	NA	3471000	3473999	8028882	8031881	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.4531	NA	NA	NA	3468000	3470999	8031896	8034895	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.4043	NA	NA	NA	3465000	3467999	8034890	8037889	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.4596	NA	NA	NA	3462000	3464999	8037886	8040885	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.3848	NA	NA	NA	3459000	3461999	8040917	8043916	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.4535	NA	NA	NA	3456000	3458999	8043936	8046935	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.8341	NA	NA	NA	3453000	3455999	8046942	8049941	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.4355	NA	NA	NA	3450000	3452999	8049954	8052953	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.0366	NA	NA	NA	3447000	3449999	8052942	8055941	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.9587	NA	NA	NA	3444000	3446999	8055952	8058951	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	96.9513	NA	NA	NA	3441000	3443999	8058940	8061939	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.3895	NA	NA	NA	3417000	3419999	8062748	8065747	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.6606	NA	NA	NA	3414000	3416999	8065748	8068747	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	96.9841	NA	NA	NA	3411000	3413999	8068522	8071521	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.9358	NA	NA	NA	3408000	3410999	8071199	8074198	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.935	NA	NA	NA	3405000	3407999	8074190	8077189	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	3402000	3404999	8077190	8080189	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.6194	NA	NA	NA	3399000	3401999	8080195	8083194	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.8983	NA	NA	NA	3396000	3398999	8083193	8086192	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.4521	NA	NA	NA	3393000	3395999	8086196	8089195	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.4251	NA	NA	NA	3390000	3392999	8089541	8092540	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.8638	NA	NA	NA	3387000	3389999	8092449	8095448	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.6308	NA	NA	NA	3384000	3386999	8095417	8098416	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	96.9988	NA	NA	NA	3381000	3383999	8097744	8100743	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	96.6693	NA	NA	NA	3348000	3350999	8100265	8103264	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.4434	NA	NA	NA	3345000	3347999	8103173	8106172	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.8122	NA	NA	NA	3342000	3344999	8106154	8109153	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.3581	NA	NA	NA	3339000	3341999	8109179	8112178	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	95.927	NA	NA	NA	3336000	3338999	8112177	8115176	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.7654	NA	NA	NA	3333000	3335999	8115212	8118211	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	96.8384	NA	NA	NA	3330000	3332999	8123946	8126945	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	95.5672	NA	NA	NA	3327000	3329999	8126566	8129565	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	92.7958	NA	NA	NA	3324000	3326999	8129990	8132989	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	94.4114	NA	NA	NA	3321000	3323999	8132306	8135305	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	94.4233	NA	NA	NA	3318000	3320999	8135219	8138218	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.5313	NA	NA	NA	3297000	3299999	8138266	8141265	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.4129	NA	NA	NA	3294000	3296999	8141268	8144267	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.116	NA	NA	NA	3291000	3293999	8144215	8147214	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.6838	NA	NA	NA	3288000	3290999	8147157	8150156	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.3704	NA	NA	NA	3285000	3287999	8150149	8153148	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.6014	NA	NA	NA	3282000	3284999	8153151	8156150	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.3399	NA	NA	NA	3279000	3281999	8156139	8159138	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	96.4432	NA	NA	NA	1605000	1607999	8162708	8165707	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.4942	NA	NA	NA	3276000	3278999	8164868	8167867	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.2822	NA	NA	NA	3273000	3275999	8167864	8170863	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.0664	NA	NA	NA	3270000	3272999	8170863	8173862	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.7616	NA	NA	NA	3267000	3269999	8173880	8176879	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.8316	NA	NA	NA	3264000	3266999	8176803	8179802	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.1279	NA	NA	NA	3261000	3263999	8179742	8182741	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	94.5366	NA	NA	NA	3258000	3260999	8182575	8185574	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	95.6678	NA	NA	NA	1791000	1793999	8187421	8190420	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.9464	NA	NA	NA	6417000	6419999	8188574	8191573	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.7902	NA	NA	NA	9909895	9912894	8193674	8196673	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.9449	NA	NA	NA	4782000	4784999	8194674	8197673	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.3774	NA	NA	NA	1800000	1802999	8207664	8210663	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.6301	NA	NA	NA	4779000	4781999	8209694	8212693	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.9459	NA	NA	NA	1803000	1805999	8214180	8217179	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.9594	NA	NA	NA	1806000	1808999	8217192	8220191	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.8684	NA	NA	NA	4773000	4775999	8218208	8221207	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.9732	NA	NA	NA	1812000	1814999	8223187	8226186	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	4767000	4769999	8224189	8227188	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	95.9923	NA	NA	NA	3246000	3248999	8229887	8232886	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.1729	NA	NA	NA	3243000	3245999	8232818	8235817	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	96.8432	NA	NA	NA	3234000	3236999	8235880	8238879	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.0359	NA	NA	NA	1608000	1610999	8241173	8244172	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	93.7881	NA	NA	NA	3231000	3233999	8243176	8246175	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.0567	NA	NA	NA	3228000	3230999	8245762	8248761	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.3545	NA	NA	NA	3225000	3227999	8248728	8251727	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.7677	NA	NA	NA	3222000	3224999	8251749	8254748	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.7612	NA	NA	NA	3219000	3221999	8254754	8257753	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.1854	NA	NA	NA	3216000	3218999	8257745	8260744	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.9479	NA	NA	NA	3213000	3215999	8260747	8263746	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.8636	NA	NA	NA	3210000	3212999	8263742	8266741	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.6729	NA	NA	NA	3207000	3209999	8266740	8269739	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.5143	NA	NA	NA	3165000	3167999	8269835	8272834	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	96.9796	NA	NA	NA	3162000	3164999	8272622	8275621	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.8936	NA	NA	NA	3159000	3161999	8275255	8278254	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.393	NA	NA	NA	3156000	3158999	8278241	8281240	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.5423	NA	NA	NA	3153000	3155999	8281240	8284239	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.3448	NA	NA	NA	3150000	3152999	8284236	8287235	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.2604	NA	NA	NA	3147000	3149999	8287230	8290229	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.7273	NA	NA	NA	3144000	3146999	8290234	8293233	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.8644	NA	NA	NA	3141000	3143999	8293250	8296249	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.9297	NA	NA	NA	3138000	3140999	8296251	8299250	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.8456	NA	NA	NA	3135000	3137999	8299262	8302261	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.5201	NA	NA	NA	3132000	3134999	8302252	8305251	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.5975	NA	NA	NA	3129000	3131999	8305255	8308254	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.3837	NA	NA	NA	3126000	3128999	8308248	8311247	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.8485	NA	NA	NA	3123000	3125999	8311234	8314233	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.6386	NA	NA	NA	3120000	3122999	8314092	8317091	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.9792	NA	NA	NA	3117000	3119999	8317101	8320100	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.5153	NA	NA	NA	3114000	3116999	8320103	8323102	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.7461	NA	NA	NA	3111000	3113999	8323106	8326105	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.8632	NA	NA	NA	3108000	3110999	8326093	8329092	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.1338	NA	NA	NA	3105000	3107999	8329104	8332103	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.6335	NA	NA	NA	3102000	3104999	8332115	8335114	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.4782	NA	NA	NA	3099000	3101999	8335113	8338112	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.3983	NA	NA	NA	3096000	3098999	8338089	8341088	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.8566	NA	NA	NA	3093000	3095999	8341173	8344172	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.0821	NA	NA	NA	3090000	3092999	8344518	8347517	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.8928	NA	NA	NA	3087000	3089999	8347537	8350536	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.3099	NA	NA	NA	3084000	3086999	8350550	8353549	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.4665	NA	NA	NA	3081000	3083999	8353546	8356545	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.5445	NA	NA	NA	3078000	3080999	8356549	8359548	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.7114	NA	NA	NA	3075000	3077999	8359547	8362546	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.6815	NA	NA	NA	3072000	3074999	8362548	8365547	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.6033	NA	NA	NA	3069000	3071999	8365559	8368558	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.9076	NA	NA	NA	3066000	3068999	8368542	8371541	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	3063000	3065999	8371549	8374548	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.908	NA	NA	NA	3060000	3062999	8374553	8377552	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.8992	NA	NA	NA	3057000	3059999	8377543	8380542	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.2206	NA	NA	NA	3054000	3056999	8380535	8383534	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.0887	NA	NA	NA	3051000	3053999	8383529	8386528	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.9897	NA	NA	NA	3048000	3050999	8386538	8389537	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	3045000	3047999	8389530	8392529	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	3042000	3044999	8392544	8395543	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.9602	NA	NA	NA	3039000	3041999	8395535	8398534	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.4877	NA	NA	NA	3036000	3038999	8398543	8401542	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.9027	NA	NA	NA	3033000	3035999	8401544	8404543	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.6489	NA	NA	NA	3030000	3032999	8404549	8407548	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.3399	NA	NA	NA	3027000	3029999	8407551	8410550	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.6403	NA	NA	NA	3024000	3026999	8410535	8413534	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.5294	NA	NA	NA	3021000	3023999	8413534	8416533	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	96.3263	NA	NA	NA	3018000	3020999	8415936	8418935	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	90.5772	NA	NA	NA	1149000	1151999	8462356	8465355	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.3576	NA	NA	NA	3015000	3017999	8557681	8560680	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.3448	NA	NA	NA	3012000	3014999	8560679	8563678	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.2602	NA	NA	NA	3009000	3011999	8563687	8566686	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.9469	NA	NA	NA	3006000	3008999	8566766	8569765	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.7559	NA	NA	NA	3003000	3005999	8569776	8572775	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.7334	NA	NA	NA	3000000	3002999	8572788	8575787	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.1058	NA	NA	NA	2994000	2996999	8578402	8581401	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.4852	NA	NA	NA	2991000	2993999	8581461	8584460	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.3372	NA	NA	NA	2988000	2990999	8584448	8587447	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	83.6565	NA	NA	NA	12000	14999	8585536	8588535	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.1966	NA	NA	NA	2979000	2981999	8587535	8590534	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.9952	NA	NA	NA	2976000	2978999	8590559	8593558	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.6951	NA	NA	NA	2973000	2975999	8593523	8596522	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.7895	NA	NA	NA	2970000	2972999	8596514	8599513	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.4409	NA	NA	NA	2967000	2969999	8599517	8602516	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.9966	NA	NA	NA	2964000	2966999	8602523	8605522	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.5995	NA	NA	NA	2961000	2963999	8605511	8608510	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.6815	NA	NA	NA	2958000	2960999	8608510	8611509	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.4877	NA	NA	NA	2955000	2957999	8611532	8614531	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.8056	NA	NA	NA	2952000	2954999	8614527	8617526	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.9294	NA	NA	NA	2949000	2951999	8617528	8620527	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.7826	NA	NA	NA	2946000	2948999	8620537	8623536	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.856	NA	NA	NA	2943000	2945999	8623537	8626536	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.8068	NA	NA	NA	2940000	2942999	8626534	8629533	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.7933	NA	NA	NA	2937000	2939999	8629532	8632531	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.7588	NA	NA	NA	2934000	2936999	8632530	8635529	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.607	NA	NA	NA	2931000	2933999	8635550	8638549	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.1856	NA	NA	NA	2928000	2930999	8638527	8641526	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.4658	NA	NA	NA	2925000	2927999	8641560	8644559	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.7285	NA	NA	NA	2922000	2924999	8644563	8647562	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.6881	NA	NA	NA	2919000	2921999	8647575	8650574	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.9076	NA	NA	NA	2916000	2918999	8650566	8653565	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.973	NA	NA	NA	2913000	2915999	8653574	8656573	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.7787	NA	NA	NA	2904000	2906999	8657920	8660919	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.7609	NA	NA	NA	2901000	2903999	8660931	8663930	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.9488	NA	NA	NA	2898000	2900999	8663915	8666914	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.3005	NA	NA	NA	2895000	2897999	8666944	8669943	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.1717	NA	NA	NA	2892000	2894999	8669914	8672913	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.5995	NA	NA	NA	2889000	2891999	8672926	8675925	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.0664	NA	NA	NA	2886000	2888999	8675913	8678912	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.9581	NA	NA	NA	2883000	2885999	8678906	8681905	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.9197	NA	NA	NA	2880000	2882999	8681914	8684913	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.8497	NA	NA	NA	2877000	2879999	8684918	8687917	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.9005	NA	NA	NA	2874000	2876999	8687892	8690891	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.9056	NA	NA	NA	2871000	2873999	8690922	8693921	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.8632	NA	NA	NA	2868000	2870999	8693905	8696904	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.7797	NA	NA	NA	2865000	2867999	8696917	8699916	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.8554	NA	NA	NA	2862000	2864999	8699910	8702909	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.8794	NA	NA	NA	2859000	2861999	8702913	8705912	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.7196	NA	NA	NA	2856000	2858999	8705911	8708910	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.822	NA	NA	NA	2853000	2855999	8708899	8711898	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.297	NA	NA	NA	2850000	2852999	8711900	8714899	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.1098	NA	NA	NA	2847000	2849999	8714955	8717954	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.184	NA	NA	NA	2844000	2846999	8718040	8721039	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.6484	NA	NA	NA	2841000	2843999	8721043	8724042	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.4948	NA	NA	NA	2838000	2840999	8724041	8727040	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.9613	NA	NA	NA	2835000	2837999	8727044	8730043	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.5014	NA	NA	NA	2832000	2834999	8730034	8733033	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.509	NA	NA	NA	2829000	2831999	8733047	8736046	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.5312	NA	NA	NA	2826000	2828999	8736043	8739042	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.0366	NA	NA	NA	2823000	2825999	8739035	8742034	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.7895	NA	NA	NA	2820000	2822999	8742031	8745030	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	2817000	2819999	8745036	8748035	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.7502	NA	NA	NA	2814000	2816999	8748052	8751051	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.9733	NA	NA	NA	2811000	2813999	8751055	8754054	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.8196	NA	NA	NA	2808000	2810999	8754054	8757053	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.9321	NA	NA	NA	2805000	2807999	8757055	8760054	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.8491	NA	NA	NA	2802000	2804999	8760050	8763049	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.5878	NA	NA	NA	2799000	2801999	8763039	8766038	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.2396	NA	NA	NA	2796000	2798999	8766044	8769043	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.8971	NA	NA	NA	2793000	2795999	8769051	8772050	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.6214	NA	NA	NA	2790000	2792999	8772043	8775042	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.209	NA	NA	NA	2787000	2789999	8775053	8778052	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.6054	NA	NA	NA	2784000	2786999	8778067	8781066	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.1548	NA	NA	NA	2781000	2783999	8781068	8784067	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.2639	NA	NA	NA	2778000	2780999	8784080	8787079	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.4575	NA	NA	NA	2775000	2777999	8787069	8790068	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.0869	NA	NA	NA	2772000	2774999	8790082	8793081	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.6572	NA	NA	NA	2769000	2771999	8793083	8796082	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.5887	NA	NA	NA	2766000	2768999	8796085	8799084	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.5325	NA	NA	NA	2763000	2765999	8799073	8802072	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.6436	NA	NA	NA	2760000	2762999	8802087	8805086	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.1468	NA	NA	NA	2757000	2759999	8805575	8808574	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.1468	NA	NA	NA	2754000	2756999	8808454	8811453	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.2376	NA	NA	NA	2751000	2753999	8811443	8814442	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.1571	NA	NA	NA	2748000	2750999	8814445	8817444	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.7505	NA	NA	NA	2745000	2747999	8817442	8820441	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.869	NA	NA	NA	2742000	2744999	8820435	8823434	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.7171	NA	NA	NA	2739000	2741999	8823420	8826419	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.7346	NA	NA	NA	2736000	2738999	8826430	8829429	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.4444	NA	NA	NA	2733000	2735999	8829442	8832441	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.2935	NA	NA	NA	2730000	2732999	8832455	8835454	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.7171	NA	NA	NA	2727000	2729999	8835436	8838435	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.0964	NA	NA	NA	2724000	2726999	8838418	8841417	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.9573	NA	NA	NA	2721000	2723999	8841513	8844512	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.6284	NA	NA	NA	2718000	2720999	8844509	8847508	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.5865	NA	NA	NA	2715000	2717999	8847519	8850518	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.7807	NA	NA	NA	2712000	2714999	8850497	8853496	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.9643	NA	NA	NA	2709000	2711999	8853498	8856497	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	96.5825	NA	NA	NA	2706000	2708999	8856578	8859577	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.8768	NA	NA	NA	2703000	2705999	8859829	8862828	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.1805	NA	NA	NA	2700000	2702999	8862743	8865742	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.6576	NA	NA	NA	2697000	2699999	8866418	8869417	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.5093	NA	NA	NA	2694000	2696999	8869426	8872425	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.638	NA	NA	NA	2691000	2693999	8872422	8875421	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.5506	NA	NA	NA	2688000	2690999	8875375	8878374	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.8147	NA	NA	NA	2685000	2687999	8898516	8901515	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.6998	NA	NA	NA	2682000	2684999	8901515	8904514	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.9162	NA	NA	NA	2679000	2681999	8904541	8907540	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.4625	NA	NA	NA	2676000	2678999	8907555	8910554	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.4715	NA	NA	NA	2673000	2675999	8910547	8913546	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.9044	NA	NA	NA	2670000	2672999	8913558	8916557	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.6654	NA	NA	NA	2667000	2669999	8916549	8919548	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.278	NA	NA	NA	2664000	2666999	8919546	8922545	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.8377	NA	NA	NA	2661000	2663999	8922556	8925555	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	2658000	2660999	8925539	8928538	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	2655000	2657999	8928555	8931554	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	2652000	2654999	8931553	8934552	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	2649000	2651999	8934557	8937556	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	2646000	2648999	8937553	8940552	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	2643000	2645999	8940555	8943554	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	2640000	2642999	8943551	8946550	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	2637000	2639999	8946554	8949553	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	2634000	2636999	8949541	8952540	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	2631000	2633999	8952550	8955549	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	2628000	2630999	8955553	8958552	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	2625000	2627999	8958551	8961550	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	2622000	2624999	8961550	8964549	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	2619000	2621999	8964549	8967548	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	2616000	2618999	8967538	8970537	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	2613000	2615999	8970554	8973553	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	2610000	2612999	8973558	8976557	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	2607000	2609999	8976545	8979544	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.9609	NA	NA	NA	2604000	2606999	8979546	8982545	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	2601000	2603999	8982553	8985552	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	2598000	2600999	8985552	8988551	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	2595000	2597999	8988557	8991556	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	2592000	2594999	8991560	8994559	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	2589000	2591999	8994556	8997555	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	2586000	2588999	8997547	9000546	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	2583000	2585999	9000539	9003538	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	2580000	2582999	9003556	9006555	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	2577000	2579999	9006547	9009546	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	2574000	2576999	9009553	9012552	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	2571000	2573999	9012558	9015557	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	2568000	2570999	9015545	9018544	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	2565000	2567999	9018558	9021557	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	2562000	2564999	9021542	9024541	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	2559000	2561999	9024555	9027554	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	2556000	2558999	9027560	9030559	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	2553000	2555999	9030544	9033543	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	2550000	2552999	9033542	9036541	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	2547000	2549999	9036537	9039536	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	2544000	2546999	9039541	9042540	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	2541000	2543999	9042556	9045555	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	2538000	2540999	9045560	9048559	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	2535000	2537999	9048552	9051551	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	2532000	2534999	9051560	9054559	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	2529000	2531999	9054556	9057555	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	2526000	2528999	9057557	9060556	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	2523000	2525999	9060545	9063544	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	2520000	2522999	9063559	9066558	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	2517000	2519999	9066559	9069558	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	2514000	2516999	9069560	9072559	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	2511000	2513999	9072543	9075542	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	2508000	2510999	9075560	9078559	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	2505000	2507999	9078545	9081544	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	2502000	2504999	9081557	9084556	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	2499000	2501999	9084558	9087557	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	2496000	2498999	9087558	9090557	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	2493000	2495999	9090560	9093559	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	2490000	2492999	9093546	9096545	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	2487000	2489999	9096549	9099548	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	2484000	2486999	9099544	9102543	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	2481000	2483999	9102539	9105538	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	2478000	2480999	9105541	9108540	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	2475000	2477999	9108552	9111551	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	2472000	2474999	9111539	9114538	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	2469000	2471999	9114539	9117538	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	2466000	2468999	9117549	9120548	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	2463000	2465999	9120541	9123540	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	2460000	2462999	9123547	9126546	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	2457000	2459999	9126558	9129557	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	2454000	2456999	9129558	9132557	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	2451000	2453999	9132554	9135553	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	2448000	2450999	9135550	9138549	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	2445000	2447999	9138556	9141555	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	2442000	2444999	9141552	9144551	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	2439000	2441999	9144547	9147546	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	2436000	2438999	9147554	9150553	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	2433000	2435999	9150555	9153554	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	2430000	2432999	9153552	9156551	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	2427000	2429999	9156540	9159539	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	2424000	2426999	9159545	9162544	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	2421000	2423999	9162538	9165537	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	2418000	2420999	9165560	9168559	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	2415000	2417999	9168542	9171541	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	2412000	2414999	9171556	9174555	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	2409000	2411999	9174545	9177544	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	2406000	2408999	9177558	9180557	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	2403000	2405999	9180553	9183552	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	2400000	2402999	9183558	9186557	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	2397000	2399999	9186540	9189539	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	2394000	2396999	9189555	9192554	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	2391000	2393999	9192558	9195557	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	2388000	2390999	9195554	9198553	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	2385000	2387999	9198538	9201537	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	2382000	2384999	9201544	9204543	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	2379000	2381999	9204546	9207545	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	2376000	2378999	9207538	9210537	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	2373000	2375999	9210555	9213554	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	2370000	2372999	9213559	9216558	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	2367000	2369999	9216549	9219548	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	2364000	2366999	9219549	9222548	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	2361000	2363999	9222552	9225551	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.9607	NA	NA	NA	2358000	2360999	9225559	9228558	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	2355000	2357999	9228549	9231548	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	2352000	2354999	9231554	9234553	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	2349000	2351999	9234543	9237542	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	2346000	2348999	9237552	9240551	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	2343000	2345999	9240544	9243543	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	2340000	2342999	9243559	9246558	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	2337000	2339999	9246557	9249556	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	2334000	2336999	9249556	9252555	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	2331000	2333999	9252544	9255543	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	2328000	2330999	9255556	9258555	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	2325000	2327999	9258544	9261543	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	2322000	2324999	9261553	9264552	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	2319000	2321999	9264559	9267558	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	2316000	2318999	9267558	9270557	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	2313000	2315999	9270539	9273538	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	2310000	2312999	9273549	9276548	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	2307000	2309999	9276560	9279559	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	2304000	2306999	9279555	9282554	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	2301000	2303999	9282552	9285551	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.822	NA	NA	NA	2298000	2300999	9285552	9288551	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.5325	NA	NA	NA	2295000	2297999	9288544	9291543	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.5368	NA	NA	NA	2292000	2294999	9291543	9294542	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.8335	NA	NA	NA	2289000	2291999	9294373	9297372	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.7198	NA	NA	NA	2286000	2288999	9297198	9300197	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.8377	NA	NA	NA	2283000	2285999	9300209	9303208	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.6992	NA	NA	NA	2280000	2282999	9303209	9306208	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.6033	NA	NA	NA	2277000	2279999	9306187	9309186	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.9739	NA	NA	NA	2274000	2276999	9309186	9312185	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.9588	NA	NA	NA	2271000	2273999	9312192	9315191	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	2268000	2270999	9315196	9318195	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.935	NA	NA	NA	2265000	2267999	9318197	9321196	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.7951	NA	NA	NA	2262000	2264999	9321192	9324191	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	2259000	2261999	9324186	9327185	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.6977	NA	NA	NA	2256000	2258999	9327191	9330190	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.7415	NA	NA	NA	2253000	2255999	9330190	9333189	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.6193	NA	NA	NA	2250000	2252999	9333179	9336178	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.7334	NA	NA	NA	2247000	2249999	9336172	9339171	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.4217	NA	NA	NA	2244000	2246999	9339174	9342173	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.2598	NA	NA	NA	2241000	2243999	9342120	9345119	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.6923	NA	NA	NA	2238000	2240999	9345052	9348051	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.1293	NA	NA	NA	2235000	2237999	9348475	9351474	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.4307	NA	NA	NA	2232000	2234999	9351480	9354479	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.6331	NA	NA	NA	2229000	2231999	9354474	9357473	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.7162	NA	NA	NA	2226000	2228999	9357482	9360481	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.8188	NA	NA	NA	2223000	2225999	9360478	9363477	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.3232	NA	NA	NA	2220000	2222999	9363492	9366491	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.9043	NA	NA	NA	2217000	2219999	9366485	9369484	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.1548	NA	NA	NA	2214000	2216999	9369510	9372509	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.3024	NA	NA	NA	2211000	2213999	9372693	9375692	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.7817	NA	NA	NA	2208000	2210999	9375674	9378673	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.9018	NA	NA	NA	2205000	2207999	9378660	9381659	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.829	NA	NA	NA	2202000	2204999	9381669	9384668	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.359	NA	NA	NA	2199000	2201999	9384678	9387677	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.5358	NA	NA	NA	2196000	2198999	9387670	9390669	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.3217	NA	NA	NA	2193000	2195999	9390662	9393661	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.5116	NA	NA	NA	2190000	2192999	9393680	9396679	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	96.9841	NA	NA	NA	2187000	2189999	9396771	9399770	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.8778	NA	NA	NA	2184000	2186999	9400839	9403838	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.2601	NA	NA	NA	2181000	2183999	9403775	9406774	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	95.379	NA	NA	NA	2112000	2114999	9406213	9409212	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.2346	NA	NA	NA	2109000	2111999	9408377	9411376	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.6936	NA	NA	NA	2106000	2108999	9411522	9414521	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.6511	NA	NA	NA	2103000	2105999	9414519	9417518	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.4222	NA	NA	NA	2100000	2102999	9417553	9420552	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.7652	NA	NA	NA	2097000	2099999	9420509	9423508	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	96.6836	NA	NA	NA	2094000	2096999	9424773	9427772	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.1127	NA	NA	NA	2091000	2093999	9427614	9430613	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.8543	NA	NA	NA	2088000	2090999	9430524	9433523	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	93.8434	NA	NA	NA	4422000	4424999	9433179	9436178	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.7258	NA	NA	NA	2085000	2087999	9436293	9439292	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.7184	NA	NA	NA	2082000	2084999	9439311	9442310	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.388	NA	NA	NA	2079000	2081999	9442309	9445308	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.4904	NA	NA	NA	2076000	2078999	9445337	9448336	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.7393	NA	NA	NA	2073000	2075999	9448328	9451327	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.4493	NA	NA	NA	2070000	2072999	9451323	9454322	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.3348	NA	NA	NA	2067000	2069999	9454320	9457319	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.5749	NA	NA	NA	2064000	2066999	9457322	9460321	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.7804	NA	NA	NA	2061000	2063999	9460318	9463317	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.7146	NA	NA	NA	2058000	2060999	9463321	9466320	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.6668	NA	NA	NA	2055000	2057999	9466341	9469340	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.7683	NA	NA	NA	2052000	2054999	9469327	9472326	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.9937	NA	NA	NA	2049000	2051999	9472329	9475328	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.5213	NA	NA	NA	2046000	2048999	9475325	9478324	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.734	NA	NA	NA	2043000	2045999	9478335	9481334	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.7549	NA	NA	NA	2040000	2042999	9481319	9484318	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.9027	NA	NA	NA	2037000	2039999	9484317	9487316	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.1695	NA	NA	NA	2034000	2036999	9487254	9490253	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.1626	NA	NA	NA	2031000	2033999	9490024	9493023	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.0119	NA	NA	NA	2028000	2030999	9493002	9496001	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.7159	NA	NA	NA	2025000	2027999	9496004	9499003	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.8717	NA	NA	NA	2022000	2024999	9498982	9501981	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.2963	NA	NA	NA	2019000	2021999	9502005	9505004	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.6335	NA	NA	NA	2016000	2018999	9504879	9507878	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.6743	NA	NA	NA	2013000	2015999	9507880	9510879	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.9674	NA	NA	NA	2010000	2012999	9510871	9513870	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.3415	NA	NA	NA	2007000	2009999	9513879	9516878	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.6784	NA	NA	NA	2004000	2006999	9516881	9519880	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.8628	NA	NA	NA	2001000	2003999	9519769	9522768	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.5646	NA	NA	NA	1998000	2000999	9522669	9525668	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.7444	NA	NA	NA	1995000	1997999	9525304	9528303	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.3262	NA	NA	NA	1992000	1994999	9528947	9531946	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.535	NA	NA	NA	1989000	1991999	9531931	9534930	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.495	NA	NA	NA	1986000	1988999	9534934	9537933	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.7277	NA	NA	NA	1983000	1985999	9537718	9540717	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.2036	NA	NA	NA	1980000	1982999	9540144	9543143	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.3868	NA	NA	NA	1977000	1979999	9543135	9546134	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.3368	NA	NA	NA	1974000	1976999	9546146	9549145	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.5109	NA	NA	NA	1971000	1973999	9549160	9552159	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.811	NA	NA	NA	1968000	1970999	9552149	9555148	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.2484	NA	NA	NA	1965000	1967999	9555150	9558149	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.7149	NA	NA	NA	1962000	1964999	9558140	9561139	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.1523	NA	NA	NA	1959000	1961999	9561135	9564134	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.9613	NA	NA	NA	1956000	1958999	9564124	9567123	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.1781	NA	NA	NA	1953000	1955999	9567115	9570114	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.7727	NA	NA	NA	9417895	9420894	9575480	9578479	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	9414895	9417894	9578489	9581488	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	11094895	11097894	9580237	9583236	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	9408895	9411894	9609022	9612021	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.9873	NA	NA	NA	9405895	9408894	9612007	9615006	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.9339	NA	NA	NA	9396895	9399894	9617715	9620714	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.2151	NA	NA	NA	1950000	1952999	9620238	9623237	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.8477	NA	NA	NA	1947000	1949999	9623063	9626062	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.7566	NA	NA	NA	1944000	1946999	9626058	9629057	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.3319	NA	NA	NA	1941000	1943999	9629057	9632056	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.0264	NA	NA	NA	1938000	1940999	9632068	9635067	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.7407	NA	NA	NA	1935000	1937999	9635090	9638089	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.777	NA	NA	NA	1932000	1934999	9638120	9641119	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.874	NA	NA	NA	1929000	1931999	9641121	9644120	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.8077	NA	NA	NA	1926000	1928999	9644118	9647117	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.9095	NA	NA	NA	1923000	1925999	9647119	9650118	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.4417	NA	NA	NA	1920000	1922999	9650111	9653110	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.516	NA	NA	NA	1917000	1919999	9653338	9656337	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.6419	NA	NA	NA	1914000	1916999	9656305	9659304	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.7255	NA	NA	NA	1911000	1913999	9659292	9662291	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.4837	NA	NA	NA	1908000	1910999	9662304	9665303	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.6246	NA	NA	NA	1905000	1907999	9665301	9668300	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.6494	NA	NA	NA	1902000	1904999	9668287	9671286	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.4707	NA	NA	NA	1899000	1901999	9671281	9674280	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.45	NA	NA	NA	1896000	1898999	9674271	9677270	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.3832	NA	NA	NA	1893000	1895999	9676872	9679871	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.9333	NA	NA	NA	1890000	1892999	9679880	9682879	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	79.8322	NA	NA	NA	9249895	9252894	9683926	9686925	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	76.6894	NA	NA	NA	9246895	9249894	9686922	9689921	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	83.2597	NA	NA	NA	9228895	9231894	9710352	9713351	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	96.232	NA	NA	NA	1887000	1889999	9724962	9727961	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.6896	NA	NA	NA	1884000	1886999	9727379	9730378	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.3894	NA	NA	NA	1881000	1883999	9730378	9733377	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.4328	NA	NA	NA	1878000	1880999	9733387	9736386	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.7706	NA	NA	NA	1875000	1877999	9736403	9739402	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	96.2496	NA	NA	NA	1872000	1874999	9740091	9743090	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.7441	NA	NA	NA	1869000	1871999	9742996	9745995	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.9854	NA	NA	NA	1866000	1868999	9746007	9749006	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.9064	NA	NA	NA	1863000	1865999	9749004	9752003	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.9339	NA	NA	NA	1860000	1862999	9752010	9755009	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.8889	NA	NA	NA	1857000	1859999	9754996	9757995	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	1854000	1856999	9757993	9760992	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.1676	NA	NA	NA	1851000	1853999	9761005	9764004	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.3161	NA	NA	NA	1848000	1850999	9763379	9766378	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.6212	NA	NA	NA	1845000	1847999	9766321	9769320	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.8481	NA	NA	NA	1842000	1844999	9769337	9772336	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.5749	NA	NA	NA	1839000	1841999	9772332	9775331	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.1823	NA	NA	NA	1836000	1838999	9775345	9778344	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.3837	NA	NA	NA	1833000	1835999	9778362	9781361	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	95.7239	NA	NA	NA	1830000	1832999	9780777	9783776	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.9797	NA	NA	NA	1785000	1787999	9783992	9786991	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.6347	NA	NA	NA	1782000	1784999	9786998	9789997	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.7787	NA	NA	NA	1779000	1781999	9789975	9792974	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.9739	NA	NA	NA	1776000	1778999	9792971	9795970	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.8424	NA	NA	NA	1773000	1775999	9795971	9798970	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.9076	NA	NA	NA	1770000	1772999	9798963	9801962	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.7306	NA	NA	NA	1767000	1769999	9801978	9804977	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.6824	NA	NA	NA	1764000	1766999	9805012	9808011	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.9613	NA	NA	NA	1761000	1763999	9808009	9811008	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.2284	NA	NA	NA	1758000	1760999	9810991	9813990	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.2639	NA	NA	NA	1755000	1757999	9813970	9816969	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.6331	NA	NA	NA	1752000	1754999	9817000	9819999	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.1261	NA	NA	NA	1749000	1751999	9819989	9822988	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.8574	NA	NA	NA	1746000	1748999	9822970	9825969	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.5852	NA	NA	NA	1743000	1745999	9825981	9828980	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.9733	NA	NA	NA	1740000	1742999	9828976	9831975	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.8348	NA	NA	NA	1737000	1739999	9831982	9834981	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.5165	NA	NA	NA	1734000	1736999	9834751	9837750	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.7334	NA	NA	NA	1731000	1733999	9837202	9840201	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.791	NA	NA	NA	1728000	1730999	9840200	9843199	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.4338	NA	NA	NA	1725000	1727999	9843189	9846188	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.34	NA	NA	NA	1722000	1724999	9846193	9849192	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.4562	NA	NA	NA	1719000	1721999	9849192	9852191	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.6788	NA	NA	NA	1716000	1718999	9852175	9855174	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.4636	NA	NA	NA	1713000	1715999	9855180	9858179	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.5492	NA	NA	NA	1710000	1712999	9858177	9861176	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.4321	NA	NA	NA	1707000	1709999	9861183	9864182	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.1929	NA	NA	NA	1704000	1706999	9864185	9867184	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.9698	NA	NA	NA	1683000	1685999	9867495	9870494	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.2917	NA	NA	NA	1680000	1682999	9870499	9873498	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.1234	NA	NA	NA	1677000	1679999	9873500	9876499	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.8363	NA	NA	NA	1674000	1676999	9876520	9879519	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.0159	NA	NA	NA	1671000	1673999	9879437	9882436	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	95.9432	NA	NA	NA	1668000	1670999	9882513	9885512	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.6443	NA	NA	NA	1665000	1667999	9885492	9888491	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.5408	NA	NA	NA	1662000	1664999	9888516	9891515	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.5411	NA	NA	NA	1659000	1661999	9891493	9894492	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.7928	NA	NA	NA	1656000	1658999	9894508	9897507	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.4537	NA	NA	NA	1653000	1655999	9897504	9900503	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.2628	NA	NA	NA	1650000	1652999	9900548	9903547	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.8514	NA	NA	NA	1647000	1649999	9903544	9906543	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.6731	NA	NA	NA	1644000	1646999	9906539	9909538	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.2112	NA	NA	NA	1641000	1643999	9909535	9912534	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.6284	NA	NA	NA	1638000	1640999	9912536	9915535	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.6157	NA	NA	NA	1635000	1637999	9915545	9918544	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.2244	NA	NA	NA	1632000	1634999	9918531	9921530	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.486	NA	NA	NA	1629000	1631999	9921546	9924545	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.7099	NA	NA	NA	1626000	1628999	9924535	9927534	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	96.68	NA	NA	NA	1623000	1625999	9927480	9930479	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.5727	NA	NA	NA	1620000	1622999	9930590	9933589	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.5948	NA	NA	NA	1617000	1619999	9933567	9936566	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.4549	NA	NA	NA	1614000	1616999	9936585	9939584	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.6211	NA	NA	NA	1611000	1613999	9939571	9942570	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.734	NA	NA	NA	1602000	1604999	9944116	9947115	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.2453	NA	NA	NA	1599000	1601999	9947108	9950107	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.7975	NA	NA	NA	1596000	1598999	9950369	9953368	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	96.9656	NA	NA	NA	1593000	1595999	9952413	9955412	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.5363	NA	NA	NA	1584000	1586999	9956249	9959248	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	96.2313	NA	NA	NA	1581000	1583999	9958468	9961467	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	88.8764	NA	NA	NA	7041000	7043999	9962490	9965489	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.1548	NA	NA	NA	8766000	8768999	9979377	9982376	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.9647	NA	NA	NA	1578000	1580999	9987044	9990043	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.9895	NA	NA	NA	1575000	1577999	9990059	9993058	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.5855	NA	NA	NA	1572000	1574999	9993053	9996052	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	96.3081	NA	NA	NA	1569000	1571999	9996095	9999094	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.7953	NA	NA	NA	1566000	1568999	9999061	10002060	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	96.97	NA	NA	NA	1563000	1565999	10002007	10005006	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.8832	NA	NA	NA	1560000	1562999	10005047	10008046	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.0372	NA	NA	NA	1554000	1556999	10007729	10010728	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.3895	NA	NA	NA	1551000	1553999	10009881	10012880	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.5335	NA	NA	NA	1548000	1550999	10012879	10015878	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.4723	NA	NA	NA	1545000	1547999	10015865	10018864	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.7388	NA	NA	NA	1542000	1544999	10018873	10021872	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.1486	NA	NA	NA	1539000	1541999	10021889	10024888	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.2274	NA	NA	NA	1536000	1538999	10024899	10027898	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.6309	NA	NA	NA	1533000	1535999	10027831	10030830	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.0944	NA	NA	NA	1530000	1532999	10030836	10033835	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.7358	NA	NA	NA	1527000	1529999	10033838	10036837	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.6764	NA	NA	NA	1524000	1526999	10036832	10039831	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.9592	NA	NA	NA	1521000	1523999	10039855	10042854	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.9336	NA	NA	NA	1518000	1520999	10042846	10045845	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.9333	NA	NA	NA	1515000	1517999	10045838	10048837	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.9324	NA	NA	NA	1512000	1514999	10048852	10051851	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.4771	NA	NA	NA	1509000	1511999	10051853	10054852	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.3722	NA	NA	NA	1506000	1508999	10054847	10057846	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.484	NA	NA	NA	1503000	1505999	10057857	10060856	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.4523	NA	NA	NA	1500000	1502999	10060863	10063862	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.6376	NA	NA	NA	1497000	1499999	10063815	10066814	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.1888	NA	NA	NA	1494000	1496999	10066852	10069851	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.6637	NA	NA	NA	1491000	1493999	10069863	10072862	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.1776	NA	NA	NA	1488000	1490999	10072080	10075079	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.8879	NA	NA	NA	1479000	1481999	10075606	10078605	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.9586	NA	NA	NA	1476000	1478999	10078609	10081608	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.9479	NA	NA	NA	1473000	1475999	10081600	10084599	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.8211	NA	NA	NA	1470000	1472999	10084620	10087619	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.1338	NA	NA	NA	1467000	1469999	10087610	10090609	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.9877	NA	NA	NA	1464000	1466999	10090195	10093194	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.393	NA	NA	NA	1461000	1463999	10093022	10096021	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.2603	NA	NA	NA	1443000	1445999	10096525	10099524	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.0974	NA	NA	NA	1440000	1442999	10099559	10102558	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.669	NA	NA	NA	1437000	1439999	10102308	10105307	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.5169	NA	NA	NA	8793000	8795999	10105703	10108702	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.5025	NA	NA	NA	1449000	1451999	10107866	10110865	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.6903	NA	NA	NA	1434000	1436999	10113819	10116818	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.5021	NA	NA	NA	1431000	1433999	10116632	10119631	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.3634	NA	NA	NA	1404000	1406999	10123650	10126649	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	89.1671	NA	NA	NA	3354000	3356999	10126791	10129790	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.4408	NA	NA	NA	8742000	8744999	10139794	10142793	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.6021	NA	NA	NA	1134000	1136999	10140690	10143689	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.0107	NA	NA	NA	1377000	1379999	10145812	10148811	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.3786	NA	NA	NA	1374000	1376999	10149236	10152235	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.8484	NA	NA	NA	1371000	1373999	10152278	10155277	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.3186	NA	NA	NA	1368000	1370999	10155272	10158271	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	96.892	NA	NA	NA	1365000	1367999	10158254	10161253	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.9573	NA	NA	NA	6303000	6305999	10169124	10172123	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	92.9064	NA	NA	NA	1359000	1361999	10175631	10178630	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.4821	NA	NA	NA	1356000	1358999	10178940	10181939	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	77.4883	NA	NA	NA	3423000	3425999	10182345	10185344	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	96.7061	NA	NA	NA	1350000	1352999	10184930	10187929	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.5358	NA	NA	NA	1347000	1349999	10187920	10190919	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.5809	NA	NA	NA	1344000	1346999	10190899	10193898	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.5165	NA	NA	NA	1338000	1340999	10195549	10198548	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.146	NA	NA	NA	1335000	1337999	10198527	10201526	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.6452	NA	NA	NA	1332000	1334999	10201530	10204529	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	96.2807	NA	NA	NA	1329000	1331999	10204543	10207542	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.5897	NA	NA	NA	1326000	1328999	10207488	10210487	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.2073	NA	NA	NA	1323000	1325999	10210576	10213575	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.2206	NA	NA	NA	1320000	1322999	10213531	10216530	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.8602	NA	NA	NA	1317000	1319999	10216542	10219541	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.3336	NA	NA	NA	1314000	1316999	10219499	10222498	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	96.2981	NA	NA	NA	1311000	1313999	10222546	10225545	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.6321	NA	NA	NA	1308000	1310999	10225565	10228564	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.3886	NA	NA	NA	1305000	1307999	10228580	10231579	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.0005	NA	NA	NA	1302000	1304999	10231575	10234574	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.1776	NA	NA	NA	1299000	1301999	10234567	10237566	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.125	NA	NA	NA	1296000	1298999	10237603	10240602	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	96.2997	NA	NA	NA	1293000	1295999	10240648	10243647	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.4776	NA	NA	NA	1290000	1292999	10243658	10246657	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.9076	NA	NA	NA	1287000	1289999	10246670	10249669	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	96.8201	NA	NA	NA	1284000	1286999	10249657	10252656	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.0625	NA	NA	NA	1482000	1484999	10253405	10256404	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	96.1798	NA	NA	NA	1281000	1283999	10260931	10263930	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.9214	NA	NA	NA	1278000	1280999	10263897	10266896	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.2815	NA	NA	NA	1275000	1277999	10266887	10269886	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.6749	NA	NA	NA	1272000	1274999	10269875	10272874	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.2741	NA	NA	NA	1269000	1271999	10272872	10275871	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.1399	NA	NA	NA	1266000	1268999	10275869	10278868	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.5	NA	NA	NA	1263000	1265999	10278884	10281883	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	94.2099	NA	NA	NA	1260000	1262999	10281881	10284880	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.0861	NA	NA	NA	1257000	1259999	10285070	10288069	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	92.6446	NA	NA	NA	1254000	1256999	10292630	10295629	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.5454	NA	NA	NA	1251000	1253999	10295274	10298273	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.4658	NA	NA	NA	1248000	1250999	10298291	10301290	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.2234	NA	NA	NA	1245000	1247999	10301307	10304306	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	96.6909	NA	NA	NA	1242000	1244999	10304316	10307315	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.0515	NA	NA	NA	1239000	1241999	10307317	10310316	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	96.1003	NA	NA	NA	1236000	1238999	10310269	10313268	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.6534	NA	NA	NA	1233000	1235999	10313468	10316467	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.9204	NA	NA	NA	1230000	1232999	10316440	10319439	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.9655	NA	NA	NA	1227000	1229999	10319432	10322431	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.8725	NA	NA	NA	1224000	1226999	10322041	10325040	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.057	NA	NA	NA	1221000	1223999	10324929	10327928	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.4387	NA	NA	NA	1041000	1043999	10328176	10331175	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.4144	NA	NA	NA	1038000	1040999	10331080	10334079	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.3333	NA	NA	NA	1035000	1037999	10334069	10337068	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.8545	NA	NA	NA	1032000	1034999	10337059	10340058	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.2609	NA	NA	NA	1029000	1031999	10340032	10343031	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.1194	NA	NA	NA	1026000	1028999	10343143	10346142	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.9207	NA	NA	NA	1023000	1025999	10346157	10349156	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	96.448	NA	NA	NA	1020000	1022999	10349142	10352141	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	94.1241	NA	NA	NA	1017000	1019999	10352084	10355083	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	95.3299	NA	NA	NA	1014000	1016999	10355040	10358039	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.4658	NA	NA	NA	1011000	1013999	10358044	10361043	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.7475	NA	NA	NA	8769000	8771999	10370898	10373897	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	95.5744	NA	NA	NA	1008000	1010999	10381247	10384246	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.8757	NA	NA	NA	1005000	1007999	10383844	10386843	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	96.3761	NA	NA	NA	1002000	1004999	10386685	10389684	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	83.5557	NA	NA	NA	933000	935999	10389794	10392793	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	96.9656	NA	NA	NA	930000	932999	10392977	10395976	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.7413	NA	NA	NA	927000	929999	10396228	10399227	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.9612	NA	NA	NA	924000	926999	10399231	10402230	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.5162	NA	NA	NA	921000	923999	10402233	10405232	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.3872	NA	NA	NA	918000	920999	10405219	10408218	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.2906	NA	NA	NA	915000	917999	10408232	10411231	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.9302	NA	NA	NA	912000	914999	10410839	10413838	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.516	NA	NA	NA	894000	896999	10413889	10416888	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	96.5397	NA	NA	NA	891000	893999	10416204	10419203	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.0312	NA	NA	NA	888000	890999	10419184	10422183	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.0654	NA	NA	NA	885000	887999	10421999	10424998	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	92.0159	NA	NA	NA	882000	884999	10424984	10427983	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.3232	NA	NA	NA	879000	881999	10427989	10430988	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.258	NA	NA	NA	876000	878999	10430994	10433993	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.8391	NA	NA	NA	873000	875999	10433993	10436992	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	95.1951	NA	NA	NA	870000	872999	10436743	10439742	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	90.6744	NA	NA	NA	8790000	8792999	10440202	10443201	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.9333	NA	NA	NA	795000	797999	10452936	10455935	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.3545	NA	NA	NA	951000	953999	10454335	10457334	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	89.6005	NA	NA	NA	816000	818999	10457521	10460520	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.3318	NA	NA	NA	813000	815999	10459694	10462693	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.9146	NA	NA	NA	810000	812999	10462687	10465686	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.3112	NA	NA	NA	807000	809999	10465719	10468718	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.7845	NA	NA	NA	804000	806999	10468718	10471717	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	96.0814	NA	NA	NA	789000	791999	10483819	10486818	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.8464	NA	NA	NA	786000	788999	10486844	10489843	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.1279	NA	NA	NA	783000	785999	10489852	10492851	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.6359	NA	NA	NA	780000	782999	10492852	10495851	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.7532	NA	NA	NA	777000	779999	10495855	10498854	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.7652	NA	NA	NA	774000	776999	10499219	10502218	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	96.1462	NA	NA	NA	771000	773999	10502152	10505151	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.778	NA	NA	NA	768000	770999	10505137	10508136	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.6811	NA	NA	NA	765000	767999	10508184	10511183	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.7761	NA	NA	NA	762000	764999	10511135	10514134	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.5341	NA	NA	NA	759000	761999	10514150	10517149	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.542	NA	NA	NA	756000	758999	10517152	10520151	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.7522	NA	NA	NA	753000	755999	10520099	10523098	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.3894	NA	NA	NA	750000	752999	10522539	10525538	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.2043	NA	NA	NA	747000	749999	10525522	10528521	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.3795	NA	NA	NA	744000	746999	10528508	10531507	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.2258	NA	NA	NA	741000	743999	10531488	10534487	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.6453	NA	NA	NA	738000	740999	10534546	10537545	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.6211	NA	NA	NA	735000	737999	10537497	10540496	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.9469	NA	NA	NA	732000	734999	10540621	10543620	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.3792	NA	NA	NA	729000	731999	10543675	10546674	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.0659	NA	NA	NA	726000	728999	10546669	10549668	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.6651	NA	NA	NA	723000	725999	10549677	10552676	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.0601	NA	NA	NA	720000	722999	10553025	10556024	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.5502	NA	NA	NA	717000	719999	10556113	10559112	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.5184	NA	NA	NA	714000	716999	10559103	10562102	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.4085	NA	NA	NA	711000	713999	10562155	10565154	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.9347	NA	NA	NA	708000	710999	10565151	10568150	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.2197	NA	NA	NA	705000	707999	10568151	10571150	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.4715	NA	NA	NA	702000	704999	10571156	10574155	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.3394	NA	NA	NA	699000	701999	10574134	10577133	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	90.3563	NA	NA	NA	696000	698999	10576267	10579266	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.4157	NA	NA	NA	693000	695999	10578269	10581268	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.5727	NA	NA	NA	687000	689999	10584095	10587094	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.469	NA	NA	NA	684000	686999	10587084	10590083	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.8196	NA	NA	NA	681000	683999	10590089	10593088	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.9738	NA	NA	NA	678000	680999	10593093	10596092	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.7369	NA	NA	NA	675000	677999	10596091	10599090	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.3801	NA	NA	NA	672000	674999	10599107	10602106	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.8515	NA	NA	NA	669000	671999	10602105	10605104	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.393	NA	NA	NA	663000	665999	10614340	10617339	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.1816	NA	NA	NA	660000	662999	10617319	10620318	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.7046	NA	NA	NA	657000	659999	10620348	10623347	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.3432	NA	NA	NA	654000	656999	10623350	10626349	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.5492	NA	NA	NA	651000	653999	10626327	10629326	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.3617	NA	NA	NA	648000	650999	10629386	10632385	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.1	NA	NA	NA	645000	647999	10632340	10635339	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.4832	NA	NA	NA	642000	644999	10635340	10638339	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.669	NA	NA	NA	639000	641999	10638354	10641353	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.1472	NA	NA	NA	636000	638999	10641370	10644369	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	96.5757	NA	NA	NA	633000	635999	10644327	10647326	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.1512	NA	NA	NA	630000	632999	10647326	10650325	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.6787	NA	NA	NA	627000	629999	10650265	10653264	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.9573	NA	NA	NA	624000	626999	10653275	10656274	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.337	NA	NA	NA	621000	623999	10656248	10659247	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	94.7378	NA	NA	NA	618000	620999	10659291	10662290	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.0549	NA	NA	NA	615000	617999	10662299	10665298	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	96.0952	NA	NA	NA	3378000	3380999	10667293	10670292	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.0414	NA	NA	NA	3357000	3359999	10671215	10674214	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	96.5597	NA	NA	NA	609000	611999	10696014	10699013	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.7424	NA	NA	NA	606000	608999	10698955	10701954	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.8746	NA	NA	NA	603000	605999	10701953	10704952	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.7682	NA	NA	NA	600000	602999	10704951	10707950	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	95.1811	NA	NA	NA	597000	599999	10706879	10709878	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.9489	NA	NA	NA	591000	593999	10710800	10713799	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.8818	NA	NA	NA	588000	590999	10713745	10716744	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.359	NA	NA	NA	585000	587999	10716776	10719775	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.3774	NA	NA	NA	582000	584999	10719768	10722767	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.7129	NA	NA	NA	579000	581999	10722780	10725779	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.7047	NA	NA	NA	576000	578999	10725783	10728782	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.4997	NA	NA	NA	573000	575999	10728787	10731786	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.8879	NA	NA	NA	570000	572999	10731793	10734792	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.6046	NA	NA	NA	567000	569999	10734790	10737789	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.9613	NA	NA	NA	564000	566999	10737782	10740781	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.8488	NA	NA	NA	561000	563999	10740766	10743765	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	96.9834	NA	NA	NA	558000	560999	10743757	10746756	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	96.5772	NA	NA	NA	555000	557999	10746706	10749705	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.5727	NA	NA	NA	552000	554999	10749714	10752713	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.5001	NA	NA	NA	10572895	10575894	10751830	10754829	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	10575895	10578894	10754528	10757527	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.9731	NA	NA	NA	10578895	10581894	10757528	10760527	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.9601	NA	NA	NA	10581895	10584894	10760530	10763529	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.8311	NA	NA	NA	10584895	10587894	10763542	10766541	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.7706	NA	NA	NA	10587895	10590894	10766515	10769514	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.1373	NA	NA	NA	7902000	7904999	10771944	10774943	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.1781	NA	NA	NA	10590895	10593894	10778499	10781498	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.9344	NA	NA	NA	10593895	10596894	10781621	10784620	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.9142	NA	NA	NA	549000	551999	10785736	10788735	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	96.4252	NA	NA	NA	546000	548999	10788625	10791624	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.8566	NA	NA	NA	543000	545999	10792091	10795090	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.2865	NA	NA	NA	540000	542999	10795107	10798106	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.8295	NA	NA	NA	537000	539999	10798107	10801106	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.8418	NA	NA	NA	534000	536999	10801094	10804093	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.4952	NA	NA	NA	531000	533999	10804095	10807094	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.1998	NA	NA	NA	528000	530999	10807085	10810084	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.0467	NA	NA	NA	525000	527999	10810093	10813092	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.2783	NA	NA	NA	522000	524999	10813107	10816106	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.2481	NA	NA	NA	519000	521999	10816102	10819101	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.9674	NA	NA	NA	516000	518999	10819106	10822105	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.9612	NA	NA	NA	513000	515999	10822093	10825092	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	96.8453	NA	NA	NA	510000	512999	10824956	10827955	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	91.9623	NA	NA	NA	507000	509999	10827800	10830799	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	96.1921	NA	NA	NA	504000	506999	10830935	10833934	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	93.4206	NA	NA	NA	501000	503999	10833898	10836897	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	94.6832	NA	NA	NA	498000	500999	10836960	10839959	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	95.8951	NA	NA	NA	495000	497999	10839636	10842635	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	78.8741	NA	NA	NA	9567895	9570894	10843663	10846662	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.4004	NA	NA	NA	7827000	7829999	10855402	10858401	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.8506	NA	NA	NA	429000	431999	10860353	10863352	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.0218	NA	NA	NA	432000	434999	10863250	10866249	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.7761	NA	NA	NA	474000	476999	10873661	10876660	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.7888	NA	NA	NA	477000	479999	10876638	10879637	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.0926	NA	NA	NA	480000	482999	10879628	10882627	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.6937	NA	NA	NA	483000	485999	10882633	10885632	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.8628	NA	NA	NA	486000	488999	10885562	10888561	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.6131	NA	NA	NA	489000	491999	10888561	10891560	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	95.7056	NA	NA	NA	7869000	7871999	10893321	10896320	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	89.5621	NA	NA	NA	9576895	9579894	10897529	10900528	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.3987	NA	NA	NA	7848000	7850999	10902657	10905656	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.9539	NA	NA	NA	7812000	7814999	10904189	10907188	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.0111	NA	NA	NA	426000	428999	10908395	10911394	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.6051	NA	NA	NA	423000	425999	10910959	10913958	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.7099	NA	NA	NA	420000	422999	10913981	10916980	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.9183	NA	NA	NA	417000	419999	10916960	10919959	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	93.4055	NA	NA	NA	414000	416999	10919973	10922972	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	93.5244	NA	NA	NA	411000	413999	10922916	10925915	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.1507	NA	NA	NA	408000	410999	10925946	10928945	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.0307	NA	NA	NA	405000	407999	10928930	10931929	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.8476	NA	NA	NA	402000	404999	10931947	10934946	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.6903	NA	NA	NA	399000	401999	10934957	10937956	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.4363	NA	NA	NA	396000	398999	10937954	10940953	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.3499	NA	NA	NA	393000	395999	10940963	10943962	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.9004	NA	NA	NA	390000	392999	10943974	10946973	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.1294	NA	NA	NA	387000	389999	10947020	10950019	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	95.5424	NA	NA	NA	384000	386999	10949900	10952899	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.3309	NA	NA	NA	381000	383999	10952791	10955790	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	95.4259	NA	NA	NA	378000	380999	10955423	10958422	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.4113	NA	NA	NA	375000	377999	10960780	10963779	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.7149	NA	NA	NA	372000	374999	10963778	10966777	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.3298	NA	NA	NA	369000	371999	10966756	10969755	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.7734	NA	NA	NA	366000	368999	10969801	10972800	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.4306	NA	NA	NA	363000	365999	10972776	10975775	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.2347	NA	NA	NA	360000	362999	10975772	10978771	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.9102	NA	NA	NA	357000	359999	10978772	10981771	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.6846	NA	NA	NA	354000	356999	10981748	10984747	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.2639	NA	NA	NA	351000	353999	10984722	10987721	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.3025	NA	NA	NA	348000	350999	10987748	10990747	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.7215	NA	NA	NA	345000	347999	10990966	10993965	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	96.3341	NA	NA	NA	342000	344999	10993938	10996937	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	95.2631	NA	NA	NA	327000	329999	11004612	11007611	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	91.405	NA	NA	NA	324000	326999	11009872	11012871	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.5886	NA	NA	NA	321000	323999	11012492	11015491	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	94.6316	NA	NA	NA	318000	320999	11015722	11018721	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.4489	NA	NA	NA	315000	317999	11019398	11022397	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.8903	NA	NA	NA	312000	314999	11022381	11025380	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	96.1989	NA	NA	NA	309000	311999	11025282	11028281	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	96.0334	NA	NA	NA	306000	308999	11028281	11031280	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	92.5425	NA	NA	NA	303000	305999	11031217	11034216	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	95.1151	NA	NA	NA	300000	302999	11034191	11037190	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	94.9016	NA	NA	NA	294000	296999	11039666	11042665	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	86.3673	NA	NA	NA	291000	293999	11042083	11045082	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	89.3909	NA	NA	NA	288000	290999	11065830	11068829	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	95.0434	NA	NA	NA	285000	287999	11067539	11070538	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	95.8567	NA	NA	NA	282000	284999	11070002	11073001	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	96.8556	NA	NA	NA	7872000	7874999	11078482	11081481	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.2688	NA	NA	NA	5490000	5492999	11079421	11082420	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.3985	NA	NA	NA	5493000	5495999	11082407	11085406	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.3768	NA	NA	NA	5496000	5498999	11085890	11088889	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.051	NA	NA	NA	5499000	5501999	11088804	11091803	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.4341	NA	NA	NA	7911000	7913999	11092557	11095556	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.8457	NA	NA	NA	7914000	7916999	11095572	11098571	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	96.9524	NA	NA	NA	5508000	5510999	11097846	11100845	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	92.5651	NA	NA	NA	9312895	9315894	11101880	11104879	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	93.5907	NA	NA	NA	9315895	9318894	11104553	11107552	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	89.941	NA	NA	NA	9318895	9321894	11107133	11110132	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	88.4718	NA	NA	NA	279000	281999	11109374	11112373	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	94.7734	NA	NA	NA	273000	275999	11119038	11122037	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	96.6652	NA	NA	NA	270000	272999	11124724	11127723	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	95.1077	NA	NA	NA	267000	269999	11143288	11146287	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	85.9802	NA	NA	NA	264000	266999	11145693	11148692	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	90.5534	NA	NA	NA	450000	452999	11158779	11161778	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.9506	NA	NA	NA	1053000	1055999	11162959	11165958	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	95.7701	NA	NA	NA	945000	947999	11172535	11175534	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.3138	NA	NA	NA	4899000	4901999	11175778	11178777	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	90.1222	NA	NA	NA	237000	239999	11214135	11217134	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	90.4665	NA	NA	NA	234000	236999	11216216	11219215	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.387	NA	NA	NA	231000	233999	11222858	11225857	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	95.4259	NA	NA	NA	228000	230999	11226163	11229162	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	96.4444	NA	NA	NA	225000	227999	11229074	11232073	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	94.5199	NA	NA	NA	222000	224999	11232043	11235042	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	87.2376	NA	NA	NA	204000	206999	11234990	11237989	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.116	NA	NA	NA	201000	203999	11241593	11244592	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.2465	NA	NA	NA	129000	131999	11245426	11248425	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.0177	NA	NA	NA	126000	128999	11248274	11251273	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.4071	NA	NA	NA	123000	125999	11250706	11253705	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.4675	NA	NA	NA	120000	122999	11253713	11256712	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.8134	NA	NA	NA	117000	119999	11256709	11259708	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.1548	NA	NA	NA	114000	116999	11259905	11262904	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.5332	NA	NA	NA	111000	113999	11262920	11265919	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.5303	NA	NA	NA	108000	110999	11265915	11268914	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	92.7348	NA	NA	NA	105000	107999	11268566	11271565	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.7035	NA	NA	NA	102000	104999	11286711	11289710	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.7659	NA	NA	NA	99000	101999	11289092	11292091	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	91.8641	NA	NA	NA	96000	98999	11291931	11294930	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	95.4513	NA	NA	NA	93000	95999	11294964	11297963	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.0981	NA	NA	NA	90000	92999	11297956	11300955	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.3467	NA	NA	NA	87000	89999	11300759	11303758	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.126	NA	NA	NA	84000	86999	11303597	11306596	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.0733	NA	NA	NA	81000	83999	11306416	11309415	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.4658	NA	NA	NA	78000	80999	11309497	11312496	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.313	NA	NA	NA	75000	77999	11313229	11316228	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.7683	NA	NA	NA	72000	74999	11316378	11319377	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.0119	NA	NA	NA	69000	71999	11319224	11322223	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.9396	NA	NA	NA	66000	68999	11322188	11325187	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.1187	NA	NA	NA	63000	65999	11325183	11328182	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.5815	NA	NA	NA	60000	62999	11328363	11331362	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.2899	NA	NA	NA	57000	59999	11331350	11334349	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	97.2465	NA	NA	NA	54000	56999	11334359	11337358	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	96.8384	NA	NA	NA	51000	53999	11337125	11340124	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.3326	NA	NA	NA	48000	50999	11340045	11343044	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.8781	NA	NA	NA	45000	47999	11343074	11346073	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.924	NA	NA	NA	42000	44999	11346080	11349079	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	99.2849	NA	NA	NA	39000	41999	11349097	11352096	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.8477	NA	NA	NA	36000	38999	11352100	11355099	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	98.5738	NA	NA	NA	33000	35999	11355358	11358357	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	95.0372	NA	NA	NA	30000	32999	11358174	11361173	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	94.4887	NA	NA	NA	8946895	8949894	11363861	11366860	NA	NA
input_1/xr1.hap1chr1-2.fa	input_2/xr1.hap2chr1-2.fa	100	NA	NA	NA	6000	8999	11366649	11369648	NA	NA